据推测，肿瘤组织微生物组是促进或抑制肿瘤获得某些癌症特征的能力的有利特征之一。这强调了它在致癌、癌症进展和治疗反应中的至关重要性。然而，表征肿瘤微生物组极具挑战性，因为它们的生物量低，并且控制实验室传播的污染物非常困难，而由于缺乏全面有效的计算方法来识别与癌症相关的独特或丰富的微生物种类，这进一步加剧了这种情况。在这里，我们利用 Ma (2024) 最近的计算框架，称为宏基因组比较 (MC) 框架 (MCF)，它可以检测治疗特异性、独特或丰富的 OMU（操作宏基因组单元）或 US/ES（独特/丰富的物种）当适应本研究时。我们应用 MCF 重新分析了四个肺癌组织微生物组数据集，其中包括来自肺腺癌 (LUAD)、肺鳞状细胞癌 (LUSC) 及其邻近正常组织 (NT) 对照的样本。我们的分析围绕三个不同的方案进行： 方案 I - 分别检测四个肺癌微生物组数据集中每一个的 US/ES；方案II-四个数据集的合并，然后在合并的数据集中检测US/ES；方案三——根据前两个方案的结果构造US/ES的并集和交集。生成的 US/ES 列表（包括丰富的微生物门）可能对开发肺癌风险评估的诊断和预后生物标志物、提高免疫疗法的疗效以及在肺癌研究中设计基于微生物组的新型疗法具有重要的生物医学价值。版权所有 © 2024 年。由爱思唯尔有限公司出版。

肺腺癌（LUAD）是原发性肺癌最常见的组织学亚型，其治疗效果仍然不足，准确的预后评估构成了重大挑战。本研究试图通过综合多组学方法阐明 LUAD 中线粒体相关基因的预后意义，旨在制定个性化治疗策略。利用转录组和单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据以及来自公开数据库的临床信息，我们首先将降维和聚类技术应用于 LUAD 单细胞数据集，重点关注成纤维细胞、上皮细胞和T细胞。随后使用 TCGA-LUAD 数据识别线粒体相关的预后基因，并通过共识聚类将 LUAD 病例分层为不同的分子亚型，从而可以探索不同亚型的基因表达谱和临床特征分布。通过利用机器学习算法的集合，我们开发了基于线粒体相关基因的人工智能衍生的预后特征（AIDPS）模型，并在多个独立数据集中验证了其预后准确性。 AIDPS 模型对 LUAD 患者的结局表现出强大的预测能力，揭示了免疫疗法和化疗反应的显着差异，以及风险组之间生存结局的显着差异。此外，我们对肿瘤突变负荷（TMB）、免疫微环境特征和全基因组关联研究（GWAS）数据进行了全面分析，为线粒体相关基因在 LUAD 发病机制中的机制作用提供了更多见解。这项研究不仅提供了一种改善 LUAD 预后评估的新方法，而且还为个性化治疗干预措施的发展奠定了坚实的基础。© 2024。作者。

妊娠区蛋白 (PZP) 是一种抗蛋白酶抗性免疫抑制剂，属于 α-巨球蛋白 (αM) 蛋白家族。 PZP 由肝脏分泌，并被发现在怀孕期间血浆中表达上调。 α-2-巨球蛋白 (α2M) 与 PZP 具有 71% 的序列同源性，但低 PZP 水平不会导致妊娠期 A2M 水平升高。 PZP 可以与多种因子相互作用，例如低密度脂蛋白受体相关蛋白 (LRP)、转化生长因子-β (TGF-β)、78kDa 葡萄糖调节蛋白 (GRP78) 和糖苷 A (GdA)。 PZP 参与糖脂代谢紊乱、支气管扩张、阿尔茨海默病 (AD)、类风湿性关节炎 (RA)、心肌梗死 (MI) 和炎症性肠病 (IBD) 的发生。 PZP 还与乳腺癌 (BC)、同源肝细胞癌 (HCC)、肺腺癌 (LAC) 和结直肠癌 (CRC) 等肿瘤发生的进展相关。因此，本综述分析了 PZP 在各种疾病病理生理学中的作用。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。

空气污染显着影响肺癌的进展，但缺乏与空气污染相关的临床样本的全面分子特征。在这里，我们对宣威地区 169 名从不吸烟的女性（XWLC 队列）进行了肺腺癌 (LUAD) 的蛋白质组学分析，煤烟是宣威地区肺癌高发病率的主要原因。基因组突变分析显示，XWLC 是 LUAD 的一种独特亚型，与吸烟或内源性因素相关的病例不同。突变特征分析表明苯并[a]芘 (BaP) 是 XWLC 的主要危险因素。 BaP 诱导的突变热点 EGFR-G719X 存在于 20% 的 XWLC 中，这使得 XWLC 的 MAPK 通路激活升高，并且与常见 EGFR 突变相比，结果更差。 XWLC 的多组学聚类确定了四种临床相关亚型。这些亚组在生物过程、遗传改变、代谢需求、免疫景观和放射组学特征方面表现出独特的特征。最后，MAD1 和 TPRN 被确定为 XWLC 中新的潜在治疗靶点。我们的研究为研究人员和临床医生探索空气污染相关肺癌的预防和治疗策略提供了宝贵的资源。© 2024，Zhang、Liu、Wang 等人。

Galectin-3 (Gal-3) 与许多疾病/病症中的先天免疫细胞激活有关。我们发现了一种独特的反应，即人类嗜碱性粒细胞与 A549 细胞（一种肺腺癌）共培养时会分泌 IL-4/IL-13。虽然显示的参数与标准 IgE 依赖性激活一致，但这些 Galectin-3 依赖性反应是在缺乏特定 IgE/过敏原且需要细胞间接触的情况下发生的。我们现在假设这种激活模式也会影响 A549 的功能。我们的研究结果表明，嗜碱性粒细胞/A549 共培养物中会诱导细胞因子，特别是 IL-6，而单独培养任一细胞时均检测不到。如先前针对 IL-4/IL-13 所示，IL-6 的产生也需要细胞间接触，并且依赖于 A549-Gal-3，因为缺乏这种凝集素的克隆诱导的细胞因子较少。使用培养物衍生的嗜碱性粒细胞 (CDBA)，我们证明在 CDBA/A549 共培养物中诱导 IL-6 反应和另一种致瘤因子 VEGF-A 的产生，但仅在用 IgE 以某种方式被动敏化 CDBA 后才被诱导。与IL-4/IL-13相似。然而，单独培养的嗜碱性粒细胞/CDBA的IgE依赖性激活未能诱导IL-6/VEGF。重要的是，IL-3 引发的嗜碱性粒细胞，即使是用多聚甲醛固定的嗜碱性粒细胞，也很容易在共培养物中诱导 IL-6/VEGF-A，从而验证这些细胞因子源自 A549。总体而言，这些结果表明了一种复杂的机制，IL-3 引发的嗜碱性粒细胞和 A549 之间的 Gal-3/IgE 相互作用有可能调节两种细胞的细胞因子产生。 Gal-3 与从哮喘到癌症等许多疾病有关，而且与伤口愈合等正常生理条件有关，预计这些发现将有助于深入了解这种凝集素（和 IgE）在这些过程中发挥作用的分子机制。 © 作者 2024。由牛津大学出版社代表白细胞生物学学会出版。版权所有。如需商业重复使用，请联系 reprints@oup.com 获取转载和转载的翻译权。所有其他权限都可以通过我们网站文章页面上的权限链接通过我们的 RightsLink 服务获得 - 如需了解更多信息，请联系journals.permissions@oup.com。

对于完全切除 (R0) IB 期非小细胞肺癌 (NCLSC) 患者，辅助治疗的益处仍存在争议。在本研究中，我们旨在探讨 IB 期 NSCLC 患者的潜在预后因素。本研究包括 215 名 R0 IB 期肺腺癌 (LUAD) 患者（肿瘤大小：3-4 cm）。使用一组 9 个驱动基因对 126 名患者的手术样本进行 DNA 测序。通过14基因定量聚合酶链反应测定评估分子风险分层。在215名患者中，67.9%的肿瘤以微乳头/实体（MIP/SOL）为主。 126 名患者中有 75 名 (59.5%) 检测到表皮生长因子受体 (EGFR) 突变。与其他组织学模式相比，MIP/SOL 肿瘤的 EGFR 突变较少见（50.6% vs. 79.5%，P=0.003）。 99 例患者成功进行分子风险分层，其中高危、中危和低危分别占 37.4%、26.3% 和 36.4%。 MIP/SOL 模式与较短的无病生存期 (DFS) 相关[风险比 (HR) =2.16，95% 置信区间：1.28-3.67； P=0.01]。分子高危患者的DFS短于低危患者（HR=2.93，P=0.01）和中危患者（HR=2.35，P=0.06）。分子风险分层的预后价值在 MIP/SOL 子集中也很显着（中位 DFS 高风险：45 个月，低风险和中风险：未达到；P=0.03）。我们的研究表明，MIP/SOL 模式和分子高危类别是 IB 期 NSCLC 患者的不良预后因素。我们的结果表明，结合组织学分类和分子风险分层可能有助于识别预后不良的患者子集。2024 AME 出版公司。版权所有。

肺腺癌（LUAD）是肺癌中最突出的组织学亚型，是癌症死亡率的主要原因。高突变率和糖酵解率是肺癌中报道的主要改变。在我们的研究中，我们阐明了关键糖酵解酶 3-磷酸甘油醛脱氢酶 (GAPDH) 和相关 SNP 在 LUAD 进展中的结构和功能作用。我们的基因表达分析揭示了 LUAD 中 GAPDH 的高表达。计算机工具和分析用于有害 SNP 的识别和表征。分子对接和动力学模拟 (MDS) 研究表征了优先有害突变的结构后果。基于序列的分析识别 GAPDH 中的 SNP，结果发现 28 个有害 SNP，其中 6 个 SNP 显示出有害和破坏作用。基于结构的分析产生了保守域中 rs ids rs11549328 (D39Y) 和 rs200102749 (S51Y) 的 2 个稳定 SNP。 GAPDH 序列的 IDR 和 PTM 分析得出了 191 至 194 个位置的 IDR 区域，经过 PTM 修饰后，IDR 得分为 0.511、0.520、0.517 和 0.503。已鉴定的有害 SNP（D39Y 和 S51Y）属于功能性和保守性。 GAPDH 的结构域。此外，GAPDH 的 IDR 区域内 PTM 的存在可能有助于增强 LUAD 中的糖酵解活性。我们的研究结果为 LUAD 进展中 GAPDH 的病理学方面提供了潜在的背景有害突变体。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。

尽管免疫检查点抑制剂（ICB）的出现显着延长了一些肺腺癌（LUAD）患者的预期寿命，但其实施和长期有效性却因日益严重的获得性耐药问题而受到阻碍。在此，免疫治疗耐药性 LUAD 患者的生物信息学分析和抗 PD1 耐药小鼠模型的系统分析再次验证了耐药相关的 Wnt/β-catenin 通路为 ICB 致敏提供了一条有希望的途径。因此，采用白蛋白和鼠尾草酸 (CA)（一种 Wnt 抑制剂）之间温和且方便的自组装，开发出一种称为 ABCA 的超分子白蛋白，作为 ICB 的再激活剂。正如预期的那样，ABCA 在体外有效抑制 Wnt/β-catenin 级联反应，显着抑制细胞增殖，同时促进细胞凋亡。最值得注意的是，ABCA 通过重振 T 淋巴细胞介导的适应性免疫反应，恢复了 Anti-PD1 在免疫治疗耐药 LUAD 原位同种异体移植小鼠模型中的抗癌功效。此外，ABCA 在治疗和高剂量毒性测试中表现出最小的不良反应，凸显了其临床转化的巨大潜力。总的来说，目前的工作有可能为针对耐药性的优化免疫疗法的进展提供创新视角，同时也为将 Wnt 抑制剂转化为免疫治疗药物进行临床应用提供了一条有前途的途径。© 2024 作者。小号由 Wiley‐VCH GmbH 出版。

核仁和纺锤体相关蛋白 1 (NUSAP1) 是一种微管相关蛋白，最近被发现表现出与各种癌症类型的恶性肿瘤发生和进展相关的异常表达模式。然而，NUSAP1 在肺腺癌 (LUAD) 中的具体调控机制和潜在的靶向治疗在很大程度上仍不清楚。在本研究中，通过进行生物信息学分析以及体外和体内实验，我们发现 NUSAP1 在 LUAD 中显着上调，与较差的总体生存率、较高的免疫原性和免疫浸润得分以及敏感性增加显着相关LUAD 中的常规化疗药物如紫杉醇、多西紫杉醇和长春瑞滨。从功能上来说，NUSAP1 过表达显着促进 LUAD 细胞增殖，而其敲低则显着抑制这一过程。有趣的是，我们的结果表明 NUSAP1 上调是由雌激素通过 ERβ 激活介导的。此外，我们确定恩替司他是一种新型的 NUSAP1 抑制剂。使用氟维司群（ERβ 拮抗剂）或恩替司他（新型 NUSAP1 抑制剂）以 ERβ/NUSAP1 轴为药理学靶标，可显着降低体外和体内 LUAD 的生长，这可能代表 LUAD 患者的有效替代治疗策略。© 作者。

恶性肿瘤细胞表现出周期昼夜节律调节因子 3 (PER3) 表达减少。然而，癌症中PER3表达变化的潜在机制以及PER3在肿瘤进展中的具体功能仍然知之甚少。我们探索了多个公共数据库，进行了生物信息学分析，并进行了体外和体内实验进行验证。我们发现 PER3 表达在大多数类型的癌症中均下降，并且 PER3 下调与 8 种癌症的不良预后相关。 11 种癌症中 PER3 启动子甲基化水平升高。启动子高甲基化（CpG 岛 [CGI] cg12258811 和 cg14204433）与六种癌症（乳腺浸润性癌、结肠腺癌、头颈鳞状细胞癌、肾肾乳头状细胞癌 [KIRP]、肺腺癌 [LUAD]、和子宫体子宫内膜癌）。 CGI cg12258811 高甲基化与生存时间缩短和晚期癌症阶段相关。此外，亚硫酸氢盐焦磷酸测序测定证实了CGI cg12258811高甲基化及其与PER3表达的负相关。体外和体内实验表明 PER3 抑制 KIRP 和 LUAD 进展。地西他滨通过降低启动子 (cg12258811) 甲基化水平来增强 PER3 表达并抑制 KIRP 细胞功能。我们的研究结果推进了对癌症中 PER3 表达变化的机制理解，并证实了 PER3 高甲基化和下调的肿瘤相关功能。© 2024。作者（ s）。