研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Jul 09
YunxiuQiu,TongGao,Br...
Mechanical deformation and death of circulating tumor cells in the bloodstream.
Cellular & Molecular Immunology
肿瘤细胞通过血流的循环是肿瘤转移的重要步骤。为了更好地了解转移过程,必须探索循环肿瘤细胞(CTC)在循环中的存活情况。尽管近几十年来人们已经对免疫与 CTC 的相互作用进行了研究,但研究尚未充分解释 CTC 在血流中的一些行为。最近进行了与血液中 CTC 机械反应相关的研究,以进一步研究 CTC 可能死亡的条件。虽然实验方法可以评估 CTC 的机械特性和死亡,但正在建立越来越复杂的计算模型来模拟血流中流体剪切应力 (FSS) 下的血流和 CTC 机械变形。有几个因素导致 CTC 的机械变形和死亡。 CTC 流通情况。虽然 FSS 会损害 CTC 结构,但 CTC 和血液成分之间的多种相互作用可能会促进或阻碍下一步转移——远程部位外渗。全面了解这些因素如何影响 CTC 的变形和死亡可以作为未来实验和模拟的基础,使研究人员能够更准确地预测 CTC 死亡。最终,这些努力可以在未来改善转移特异性治疗和诊断。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Jul 09
XiaoyanLiu,XiaojuanH...
Death associated protein like 1 acts as a novel tumor suppressor in melanoma by increasing the stability of P21 protein.
Cellular & Molecular Immunology
黑色素瘤是一种高致死率的原发性恶性肿瘤,好发于皮肤和眼组织,而黑色素瘤发生的分子机制仍知之甚少。在这里,我们发现黑色素瘤组织中死亡相关蛋白样 1 (DAPL1) 的表达低于癌旁组织或痣组织,并且 DAPL1 表达较低的葡萄膜黑色素瘤患者的生存率低于 DAPL1 表达较高的患者。 DAPL1 的过度表达会抑制培养的黑色素瘤细胞的增殖,而 DAPL1 的敲低则会增加细胞增殖。肿瘤移植实验结果还表明,DAPL1在体内抑制裸鼠视网膜下和皮下组织中黑色素瘤细胞的肿瘤发生。最后,DAPL1 通过减少泛素介导的 P21 降解并促进其稳定性来增加 P21 的蛋白水平,从而抑制黑色素瘤细胞的增殖。相反,P21 的敲除中和了 DAPL1 抑制对黑色素瘤细胞增殖的影响,并增强了黑色素瘤肿瘤发生的严重性。这些结果表明 DAPL1 是一种新型黑色素瘤肿瘤抑制基因,因此是黑色素瘤的潜在治疗靶点。© 2024。作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Jul 09
XiaoliTang,YongLi,Ta...
Low-dose X-ray stimulated NO-releasing nanocomposites for closed-loop dual-mode cancer therapy.
Cellular & Molecular Immunology
X射线激发光动力疗法(X-PDT)采用X射线作为能量来源,克服了传统光动力疗法(PDT)的光穿透限制,但受到高能辐射和缺氧肿瘤微环境的限制。低剂量 X 射线激发光动力疗法和减少线粒体耗氧量可以成为克服这些障碍的重大突破。本研究制备了吸附光敏剂MC540并负载α-(硝酸酯)酸(NEAA)的NaLuF4:Tb/Gd (15%/5%)@NaYF4 (ScNP)纳米粒子作为低X射线剂量触发纳米粒子。闪烁体。获得的最终产物是NaLuF4:Tb/Gd (15%/5%)@NaYF4@mSiO2@MC540@NEAA (ScNP-MS@MC540@NEAA)纳米复合材料,表现出强烈的绿色发光。 X-PDT 产生细胞毒性活性氧 (ROS),电离辐射损伤最小。同时,NEAA与谷胱甘肽(GSH)反应生成一氧化氮(NO),对受损的线粒体呼吸链进行气态处理,减少耗氧量,缓解缺氧,增强X-PDT疗效,实现闭环治疗。超氧离子(˙O2-)可以与产生的NO快速反应,形成高细胞毒性的活性氮(RNS)过氧亚硝酸根阴离子(ONOO-),与ROS相比,其具有更高的细胞毒性。此外,GSH还能清除有毒的ROS并维持肿瘤细胞的生理功能。它可以诱导癌细胞过度氧化和亚硝化应激。该工作描述了一种总辐射为50 mGy的低剂量X射线触发X-PDT系统,涉及GSH消耗、自供NO、减轻线粒体损伤、缓解缺氧以产生ROS和RNS,形成封闭的环路抗缺氧双模式系统,协同增强抗肿瘤作用,且无明显生物副作用。为深部肿瘤X-PDT提供了良好的平台,具有广阔的应用前景。
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Experimental Hematology & Oncology
2024 Jul 16
WYYang,XFZhu
[Current situation and prospect of diagnosis and therapy of childhood acute leukemia in China].
Experimental Hematology & Oncology
急性白血病是儿童最常见的造血干细胞恶性肿瘤,居儿童肿瘤发病率的首位,是影响儿童生长和生存的重大疾病。随着医疗诊疗水平的不断提高和免疫治疗的广泛发展,急性白血病患儿的生存率和生活质量得到显着提高。近年来,我国成立了三个儿童白血病合作组,发表了一系列高水平研究成果。未来应努力推进儿童急性白血病诊疗的标准化、同质化进程,探索敏感残留病的监测目标,寻找难治/复发病例的最佳治疗方案。加快新药临床研究将是儿童急性白血病诊疗领域亟待解决的问题和发展方向。
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Experimental Hematology & Oncology
2024 Jul 16
XLLi,BBZhao,YWan,WBA...
[The safety and efficacy of blinatumomab in the treatment of B-cell acute lymphoblastic leukemia in children].
Experimental Hematology & Oncology
探讨blinatumomab治疗儿童CD19阳性(CD19)B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)的安全性和有效性。血液科对接受blinatumomab治疗的儿童B-ALL患者的临床资料进行回顾性分析
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Experimental Hematology & Oncology
2024 Jul 09
SGretser,MNKinzler,T...
Fluorescence confocal microscopy for evaluation of fresh surgical specimens and consecutive tumor cell isolation in rare pediatric tumors.
Experimental Hematology & Oncology
荧光共焦显微镜 (FCM) 是一种光学技术,使用不同波长的激光光源生成新鲜、未固定组织标本的实时图像。 FCM 可以对新鲜组织样本进行组织学评估,而在冷冻切片后不会产生相关的冷冻伪影。本研究的目的是前瞻性评估儿科肿瘤标本并评估其对新鲜肿瘤取样的适用性。此外,我们的目的是确定在 FCM 成像后,稳定细胞培养的肿瘤细胞分离是否仍然可行。使用 FCM 对儿科肿瘤标本进行成像。评估肿瘤活力和组织取样的适用性,并与 H 进行比较
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 May 23
AleksandrIanevski,Al...
RepurposeDrugs: an interactive web-portal and predictive platform for repurposing mono- and combination therapies.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
Re PurposeDrugs (https://re Purposedrugs.org/) 是一个综合性门户网站,它将独特的药物适应症数据库与机器学习 (ML) 预测器相结合,以发现已批准以及在研单药和联合疗法的新药物适应症关联。该平台提供有关 25 个适应症类别(包括肿瘤和心血管疾病)的治疗状态、疾病适应症和临床试验的详细信息。当前版本包含 4314 种化合物(已批准、终止或研究)和 161 种药物组合,涉及 1756 种适应症/病症,总计 28 148 个药物-疾病对。通过利用已批准和失败的适应症的数据,Re PurposeDrugs 为新药物疾病适应症的批准潜力提供基于机器学习的预测,无论是单一疗法还是组合疗法,在交叉验证中表现出较高的预测准确性。机器学习预测器的有效性通过大量现实案例研究得到验证,证明了其预测能力,可以准确识别重新利用的候选者,并且未来获得批准的可能性很高。据我们所知,Re PurposeDrugs 门户网站是第一个集成数据库和基于 ML 的预测器,用于交互式探索和预测单一药物和组合药物跨适应症的批准可能性。鉴于其广泛的适应症领域和治疗选择,我们预计它将加速许多未来的药物再利用项目。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 May 23
JaeyoonKim,JunheeSeo...
ctGAN: combined transformation of gene expression and survival data with generative adversarial network.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
最近的研究广泛使用深度学习算法来分析基因表达,以预测疾病诊断、治疗效果和生存结果。对癌症等高死亡率疾病的生存分析研究是必不可少的。然而,由于相对于大量基因而言样本量有限,深度学习模型受到过度拟合的困扰。因此,最新的风格转移深度生成模型已被用来生成基因表达数据。然而,这些模型在临床用途上的适用性受到限制,因为它们仅生成转录组数据。因此,本研究提出了 ctGAN,它能够使用生成对抗网络(GAN)对基因表达和生存数据进行组合转换。 ctGAN 通过乳腺癌和其他 11 种癌症类型之间的风格转换来增强数据,从而改善生存分析。我们评估了与之前模型相比的一致性指数(C-index)增强,以证明其优越性。在 11 种癌症类型中,有 9 种观察到性能改善。此外,ctGAN 在 11 种癌症类型中的 7 种中表现优于之前的模型,其中结肠腺癌 (COAD) 表现出最显着的改善(中位 C 指数增加约 15.70%)。此外,与仅使用真实 COAD (p 值 = 0.797) 相比,整合生成的 COAD 增强了对数秩 p 值 (0.041)。根据数据分布,我们证明该模型生成了高度可信的数据。在聚类评估中,ctGAN 在大多数情况下表现出最高的性能(89.62%)。这些发现表明,ctGAN 可以有意义地用于预测疾病进展并选择医学领域的个性化治疗。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 May 23
YahuiLei,Xiao-TaiHua...
DeepGRNCS: deep learning-based framework for jointly inferring gene regulatory networks across cell subpopulations.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
推断基因调控网络(GRN)使我们能够更深入地了解细胞功能和疾病发病机制。单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 技术的最新进展提高了 GRN 推断的准确性。然而,许多从 scRNA-seq 数据推断个体 GRN 的方法都是有限的,因为它们忽略了数据中经常存在的细胞间异质性和不同细胞亚群之间的相似性。在这里,我们提出了一个基于深度学习的框架 DeepGRNCS,用于联合推断跨细胞亚群的 GRN。我们遵循普遍接受的假设,即由于潜在的调控关系,可以根据转录因子 (TF) 的表达来预测靶基因的表达。我们最初通过使用等宽方法离散化数据散射来处理 scRNA-seq 数据。然后,我们训练深度学习模型来预测 TF 的目标基因表达。通过从表达矩阵中单独删除每个 TF,我们使用预先训练的深度模型预测来推断 TF 和基因之间的调控关系,从而构建 GRN。对于各种模拟和真实的 scRNA-seq 数据集,我们的方法优于现有的 GRN 推理方法。最后,我们将 DeepGRNCS 应用于非小细胞肺癌 scRNA-seq 数据,以识别每个细胞亚群中的关键基因并分析其生物学相关性。总之,DeepGRNCS 有效地预测了细胞亚群特异性的 GRN。源代码可在 https://github.com/Nastume777/DeepGRNCS 获取。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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Brain Structure & Function
2024 Jul 09
AlirezaSoltaniKhabou...
Stereotactic radiosurgery for intraventricular meningioma: a systematic review and meta-analysis.
Brain Structure & Function
脑室内脑膜瘤(IVM)是颅内脑膜瘤的一种罕见亚型,占所有脑室内肿瘤的9.8%至14%。目前,对于哪些 IVM 患者应该接受保守治疗、手术或立体定向放射外科 (SRS) 尚无明确共识。本研究旨在分析结果,包括接受 SRS 进行 IVM 作为主要或辅助治疗的患者的生存率和复发率。截至 2023 年 6 月 5 日,在 Scopus、Web of Science、PubMed 和 Embase 中进行了系统检索。数据提取由两位独立作者进行。进行随机效应荟萃分析以确定接受 SRS 治疗的 IVM 病例的肿瘤控制比例。对随访时间内患者的无进展生存期(PFS)进行个体患者数据(IPD)荟萃分析。所有分析均使用 R 编程语言进行。在总共 132 条记录中,有 14 条包含在我们的研究中,其中只有 7 条有足够的数据进行荟萃分析。在接受 SRS 进行初次 IVM 的患者中,肿瘤控制比例为 0.92(95% CI,0.69-0.98)。原发病例和辅助病例的总体肿瘤控制率为 0.87(95% CI,0.34-0.99)。两项荟萃分析中异质性均不显着(分别为 P = 0.73 和 P = 0.92)。 71 例患者中有 16 例发生 SRS 后灶周水肿(0.16;95% CI,0.03-0.56),无显着异质性(P = 0.32)。 IPD 荟萃分析显示,2 年随访中的 PFS 为 94.70%。对数秩检验显示,与辅助 SRS 相比,初次 SRS 的 PFS 更好(P < 0.01)。根据这项研究,IVM 患者在接受 SRS 治疗时,无论是否接受 SRS 治疗,都可以实现较高的肿瘤控制率,且并发症风险较低。之前接受过治疗。尽管 SRS 可能是无症状 IVM 的一种有前景的一线治疗选择,但其对有症状患​​者的疗效及其与切除术的比较需要进一步研究。© 2024。作者。
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