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Cell Death & Disease
2024 Jul 08

NanaXu,JiebangJiang,...
CircCDC42-encoded CDC42-165aa regulates macrophage pyroptosis in Klebsiella pneumoniae infection through Pyrin inflammasome activation.
Cell Death & Disease
环状RNA(circRNA)家族是一组内源性非编码RNA(ncRNA),在炎症、癌症和心血管疾病等多种生理和病理过程中具有关键功能。然而,它们在调节先天免疫反应中的作用仍不清楚。在这里,我们定义了细胞分裂周期 42 (CDC42)-165aa,这是一种由 circRNA circCDC42 编码的蛋白质,在肺炎克雷伯菌 (KP) 感染的肺泡巨噬细胞中过度表达。高水平的CDC42-165aa会诱导Pyrin炎症小体过度激活,加重肺泡巨噬细胞焦亡,而抑制CDC42-165aa则通过抑制Pyrin炎症小体介导的焦亡来减轻KP感染后小鼠的肺损伤。总体而言,这些结果表明 CDC42-165aa 通过抑制 CDC42 GTPase 激活来刺激 Pyrin 炎症小体,并为临床实践中的病原菌感染提供潜在的临床靶标。© 2024。作者。
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Cell Death & Disease
2024 Jul 08

ShivangiAgarwal,Mona...
Dysregulated gene subnetworks in breast invasive carcinoma reveal novel tumor suppressor genes.
Cell Death & Disease
乳腺浸润性癌(BRCA)是女性最恶性和最主要的死亡原因。全球正在努力改善早期发现、预防和治疗。在此背景下,对 1097 个 BRCA 样本和 114 个正常邻近组织的 RNA 测序数据进行了全面分析,以识别不同临床阶段 BRCA 主要分子类别中失调的基因。已鉴定出 BRCA 不同分子类别中显着富集的途径。干扰素信号传导、色氨酸降解、粒细胞粘附等途径
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Cell Death & Disease
2024 Jul 08

LinzhiHan,JingyiHe,H...
Pan-cell death-related signature reveals tumor immune microenvironment and optimizes personalized therapy alternations in lung adenocarcinoma.
Cell Death & Disease
本研究对消除异常细胞和重塑肿瘤微环境(TME)的细胞死亡模块进行了全面分析。基于 4 种细胞死亡预后基因对 490 名肺腺癌 (LUAD) 患者进行了共识分析。交叉法将这些LUAD样本分为5个细胞死亡风险(CDR)簇,并使用COX回归分析构建具有风险评分的CDR特征(CDRSig)。在不同的CDR簇中观察到TME表型、临床因素、基因组变异、放射敏感性和免疫治疗敏感性的显着差异。 CDRSig 中风险评分较高的患者往往被免疫排除或免疫沙漠,而风险评分较低的患者对放疗和免疫治疗更敏感。小鼠模型的结果表明,高危基因 PFKP 的强烈表达与放疗和抗 PD-L1 治疗时 CD8 T 细胞浸润较低有关。体外缺陷测定证实,PFKP 下调增强了 LUAD 细胞中 cGAS/STING 通路的激活和放射敏感性。总之,我们的研究最初进行了全面的细胞死亡分析,表明 CDR 模式在 TME 重编程中的重要性,并为 LUAD 个性化疗法提供新线索。© 2024。作者。
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TROPICAL MEDICINE & INTERNATIONAL HEALTH
2024 Jul 09

MonaAshry,ShaimaaSha...
Prevalence and risk factors of human papilloma virus infection among women living with HIV, Egypt, a cross sectional study.
TROPICAL MEDICINE & INTERNATIONAL HEALTH
HPV 被认为是最常见的性传播感染。全球 70% 的宫颈癌都是由它引起的。 HIV 感染与 HPV 感染率增加有关。感染艾滋病毒 (WLWH) 的女性患宫颈癌的风险是普通女性的 6 倍。本研究旨在评估埃及 WLWH 与 HIV 阴性女性相比的 HPV 感染率并确定其基因型,并确定相关危险因素。该研究在初级保健妇科诊所登记的 251 名 WLWH 和 268 名 HIV 阴性女性中进行。来自埃及九个省的护理中心。使用结构化访谈问卷收集参与者的数据,并收集宫颈样本进行 HPV DNA 检测和基因分型。HPV 感染的总体患病率为 13.5%,HIV 阴性女性为 3.4%,WLWH 为 24.4%。从 71% 的感染女性中分离出基因型 16 和 18 以外的 HR-HPV。女性年龄、初婚年龄、终生婚姻次数和吸毒成瘾是 HPV 感染的重要预测因素(赔率分别为 0.96、0.91、2.06、2.01)。HPV 感染在 WLWH 中更为普遍。除基因型 16 和 18 外,HR-HPV 感染在两组感染女性中最为普遍。年轻时、生命早期的性行为、一生中拥有一个以上的性伴侣以及吸毒成瘾是 HPV 感染的独立预测因素。丈夫有其他性伴侣与感染显着相关。© 2024。作者。
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PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jul 08

HaiyanZhou,YongyanJi...
Predictive modeling of lower extreme deep vein thrombosis following radical gastrectomy for gastric cancer: based on multiple machine learning methods.
PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
术后静脉血栓栓塞事件(VTE),例如下肢深静脉血栓(DVT),是胃癌(GC)患者根治性胃切除术后的主要危险因素。准确预测和管理这些风险对于最佳患者护理至关重要。 这项回顾性病例对照研究纳入了我院693例接受根治性胃切除术的胃癌患者。我们收集了丰富而全面的临床指标,包括总共49项基线、术前、手术和病理临床数据。使用单变量逻辑回归,我们确定了潜在的风险因素,然后通过 Boruta 算法进行特征选择。然后,我们使用多元逻辑回归构建了最终的预测模型,并使用受试者工作特征(ROC)曲线分析、校准图、决策曲线分析和其他方法对其进行评估。此外,我们应用了各种机器学习技术,包括决策树和随机森林,来评估我们模型的预测强度。 这项回顾性病例对照研究纳入了我院693例接受根治性胃切除术的胃癌患者。我们收集了丰富而全面的临床指标,包括总共49项基线、术前、手术和病理临床数据。使用单变量逻辑回归,我们确定了潜在的风险因素,然后通过 Boruta 算法进行特征选择。然后,我们使用多元逻辑回归构建了最终的预测模型,并使用受试者工作特征(ROC)曲线分析、校准图、决策曲线分析和其他方法对其进行评估。此外,我们应用了各种机器学习技术,包括决策树和随机森林,来评估我们模型的预测强度。 单变量 Logistic 分析揭示了与术后下肢 DVT 相关的 14 个危险因素。基于Boruta算法,选择了6个重要的临床因素,即年龄、D-二聚体(D-D)水平、低密度脂蛋白、CA125以及钙和氯离子水平。使用多元逻辑回归分析的结果开发了列线图。预测模型显示出较高的准确性,训练集的曲线下面积为 0.936,验证集的曲线下面积为 0.875。各种机器学习算法证实了其强大的预测能力。 MR 分析揭示了关键临床因素与 DVT 风险之间有意义的因果关系。 基于各种机器学习方法,我们开发了一种有效的GC患者术后下肢DVT预测诊断模型。该模型在训练和验证集中都表现出了出色的预测价值。这种新颖的模型是临床医生识别和管理该患者群体血栓形成风险的宝贵工具。© 2024。作者。
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PHARMACOLOGICAL RESEARCH
2024 Jul 06

XufeiChen,CuntaoWei,...
Carnosic acid: an effective phenolic diterpenoid for prevention and management of cancers via targeting multiple signaling pathways.
PHARMACOLOGICAL RESEARCH
癌症是一个严重的全球公共卫生问题,人们已经进行了大量的研究来治疗癌症。其中,发现有效抗癌的有前景的化合物一直是药物研究的主要关注点。鼠尾草酸 (CA) 是一种酚类二萜化合物,广泛存在于迷迭香 (Rosmarinus officinalis L.) 等唇形科植物中。近年来,越来越多的证据表明CA具有显着的抗癌活性,如白血病、结直肠癌、乳腺癌、肺癌、肝癌、胰腺癌、胃癌、淋巴瘤、前列腺癌、口腔癌等。 CA涉及的潜在机制包括抑制细胞增殖、抑制转移、诱导细胞凋亡、刺激自噬、调节免疫系统、减少炎症、调节肠道微生物群以及增强其他抗癌药物的作用。本文对CA的生物合成、药代动力学和代谢、安全性和毒性以及抗癌活性的分子机制和信号通路进行综述。这将有助于开发用于预防和治疗癌症的CA或含CA功能食品,为癌症治疗策略的推进提供重要进展。版权所有©2024作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。
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PATHOLOGY
2024 Jun 20

ZitongZhao,ShingLihW...
Intraoperative frozen section evaluation of ovarian sex cord-stromal tumours and their mimics: a study of 121 cases with emphasis on potential diagnostic pitfalls.
PATHOLOGY
卵巢性索间质肿瘤(SCST)由于形态多样,在冰冻切片(FS)咨询期间存在诊断困难。本研究旨在评估我机构SCST FS评估的准确性,并探讨导致FS诊断不正确的原因。还强调了模仿 SCST 并在 FS 期间诊断为此类的病例。我们分析了 121 例卵巢 SCST 病例及其模拟病例,这些病例在 10 年的时间内接受了 FS 咨询,以评估 FS 的准确性、推迟的原因和差异。与最终诊断相比,FS 诊断一致、延迟和不一致的病例分别为 50 例(41.3%)、39 例(32.2%)和 32 例(26.5%)。主要差异(9/121,7.4%)主要与成人颗粒细胞瘤(AGCT)的诊断有关。纤维瘤性 AGCT 在 FS 上被误解为纤维瘤,而囊性 AGCT 被称为良性囊肿。相反,中肾样腺癌、梭状子宫内膜样癌和卵泡膜瘤在 FS 上被误解为 AGCT。另一个不一致的病例是具有明显纤维瘤基质的克鲁肯伯格肿瘤,其中恶性印戒细胞被忽视并被误解为纤维瘤。较小的差异主要与纤维瘤相关(21/23,91.3%),其中由于采样问题和误解为平滑肌瘤,遗漏了较小但可能有影响的细节,例如细胞纤维瘤和有丝分裂活跃的细胞纤维瘤。卵巢 SCST 的 FS 评估显示良性、不确定/低恶性潜力和恶性类别的总体准确度分别为 78.5%、81.0% 和 81.8%。在所有具有可用随访信息的病例中(120/121 例),均未出现与 FS 相关的不良临床影响。卵巢 SCST 的术中 FS 评估具有挑战性。少数案例被误解,其中 AGCT 是发生错误的主要群体。了解常见的诊断陷阱和困难,并应用逐步方法,包括(1)获取全面的临床信息,(2)彻底的宏观检查和定向取样,(3)仔细的显微镜检查,考虑陷阱和模仿,(4)在疑难病例中与外科医生进行有效沟通,以及 (5) 在具有挑战性的病例中与专科同事进行协商,将提高病理学家未来报告的准确性和对此类病例的管理。版权所有 © 2024 澳大利亚皇家病理学家学院。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。
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Nature Reviews Urology
2024 Jul 08

MartinKBakht,Himisha...
Biological determinants of PSMA expression, regulation and heterogeneity in prostate cancer.
Nature Reviews Urology
前列腺特异性膜抗原(PSMA)是前列腺癌重要的细胞表面成像生物标志物和治疗靶点。 PSMA 靶向治疗诊断剂 177Lu-PSMA-617 于 2022 年获得批准,用于治疗 PSMA-PET 阳性转移性去势抵抗性前列腺癌男性。然而,并非所有患者都对 PSMA 放射性配体治疗有反应,部分原因是肿瘤中 PSMA 表达的异质性。 PSMA 调控网络由 PSMA 转录复合物、循环至 FOLH1 (PSMA) 基因启动子的上游增强子、基因间增强子和差异甲基化区域组成。我们对 PSMA 监管网络和 PSMA 抑制机制的理解正在不断发展。在临床上,分子成像为了解治疗过程中和疾病进展中发生的 PSMA 动态提供了一个独特的窗口,尽管由于 PET 分辨率有限而带来了挑战。 PSMA 调节和异质性(包括肿瘤间和患者间异质性、时间变化、谱系动态和肿瘤微环境)影响 PSMA 治疗诊断。 PSMA 对放射配体治疗的反应和耐药性是由许多潜在机制介导的,并且 PSMA 之外的补充生物标志物正在开发中。了解细胞表面靶标调节和异质性的生物决定因素可以为 PSMA 治疗诊断学以及其他新兴疗法的精准医学方法提供信息。© 2024。Springer Nature Limited。
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NATURE MEDICINE
2024 Jul 08

MattieSalim,YueLiu,M...
AI-based selection of individuals for supplemental MRI in population-based breast cancer screening: the randomized ScreenTrustMRI trial.
NATURE MEDICINE
乳房X光检查可降低乳腺癌死亡率,但对阴性筛查后诊断出的间期癌症进行分析的研究表明,许多癌症被遗漏了。使用磁共振成像 (MRI) 进行补充筛查可以减少漏诊癌症的数量。然而,由于缺乏合格的MRI人员,购买设备昂贵且筛查的成本效益可能不令人信服,MRI的使用目前受到限制。因此,需要一种有效的方法来对个体进行补充 MRI 筛查。我们进行了一项随机临床试验 ScreenTrustMRI,使用最近开发的人工智能 (AI) 工具对每张乳房 X 光检查进行评分。我们为筛查乳房 X 光检查呈阴性且 AI 得分较高(前 6.9%)的个人提供了参与试验的机会。同意参加后,受试者被随机分配到两组中的一组:接受补充 MRI 的组和未接受 MRI 的组。 ScreenTrustMRI 的主要终点是晚期乳腺癌,定义为间隔癌、大于 15mm 的侵袭性成分或淋巴结阳性癌症,基于初始筛查后 27 个月的随访时间。次要终点是在主要结果之前报告的研究方案中预先规定的,包括通过补充 MRI 检测到的癌症,这是本论文的重点。与之前临床试验中使用的传统乳腺密度测量相比,当前的 AI 方法在每 1,000 次 MRI 检查中检测到的癌症方面,效率提高了近四倍(64 比 16.5)。大多数检测到的其他癌症都是侵袭性的,其中一些是多灶性的,这表明它们的检测是及时的。总而言之,我们的结果表明,在乳房 X 光检查呈阴性后,使用基于 AI 的评分选择一小部分 (6.9%) 的个体进行补充 MRI 可以检测到许多遗漏的癌症,从而使检测到的每种癌症的成本与筛查乳房 X 光检查相当。 ClinicalTrials.gov 注册:NCT04832594 .© 2024。作者。
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Nature Chemical Biology
2024 Jul 08

GihoonLee,TomWMuir
Distinct phases of cellular signaling revealed by time-resolved protein synthesis.
Nature Chemical Biology
蛋白质功能的翻译后调节参与大多数细胞过程。因此,在这个水平上运行的合成生物学工具为操纵细胞状态提供了机会。在这里,我们部署了邻近触发的蛋白质转拼技术,以实现从预制部件中时间分辨地合成目标蛋白质。该策略的模块化允许根据剪接反应添加或去除各种控制元件,在此过程中允许区分起始材料和产物的细胞位置和/或活性状态。该方法适用于多种蛋白质,包括激酶肿瘤融合断点簇区域 - Abelson (BCR-ABL) 和 DNAJ-PKAc,其中动态细胞磷酸化事件被剖析,揭示信号传导的不同阶段并识别将肿瘤融合与肿瘤融合相关的分子参与者。癌症转化作为癌细胞新的治疗靶点。我们设想,本文开发的工具和控制策略将允许利用天然蛋白质和设计蛋白质的活性进行基础和应用研究。© 2024。作者,获得 Springer Nature America, Inc. 的独家许可。
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