基于深度学习的病理图像分析的进步引发了对癌症预测的巨大见解。尽管如此，缺乏可解释性仍然是临床应用的重大障碍。我们建立了肝内胆管癌（iCCA）的综合预后神经网络，以对全幻灯片图像的结构和细粒度信息进行综合评估。然后，利用多模态数据，我们对模型进行了广泛的询问方法，以提取和可视化与临床结果和潜在分子改变最相关的形态特征。这些模型是针对我们中心的 373 名 iCCA 患者开发和优化的在内部 (n = 213) 和外部 (n = 168) 队列中表现出一致的准确性和稳健性。闭塞敏感性图显示三级淋巴结构的分布、浸润边缘的几何特征、肿瘤实质和间质的相对组成、坏死范围、播散灶的存在以及肿瘤邻近的微血管是影响预后的决定性架构特征。 CellProfiler 提取的可量化形态学向量表明，来自高危患者的肿瘤细胞核表现出明显更大的尺寸、更扭曲的形状，但核膜和纹理对比度不太明显。多组学数据（n = 187）进一步揭示了网络可能参与的关键分子改变留下的形态印记，包括糖酵解、缺氧、顶端连接、mTORC1信号传导和免疫浸润。我们提出了一个可解释的深度学习框架深入了解 iCCA 的生物学行为。网络感知到的大多数重要形态预测因子都是人类思维可以理解的。© 2024。作者。

对于诊断为新发同步转移性激素敏感性前列腺癌 (mHSPC) 的患者来说，细胞减灭治疗比全身治疗可带来更多的生存获益，但这些可能会导致毒性和发病率增加。我们的目标是确定患者对额外的前列腺细胞减灭术和转移导向干预措施的偏好和权衡。2020年12月3日至2023年1月25日期间，在英国30家医院进行了一项前瞻性多中心离散选择实验试验（NCT04590976）。如果个体在开始雄激素剥夺治疗后 4 个月内被诊断患有新发同步 mHSPC 并且体能状态为 0-2，则有资格入选。开发了一种离散选择实验仪器，以引起患者对前列腺细胞减灭放疗、前列腺切除术、前列腺消融和立体定向消融性身体放疗对转移的偏好。患者根据七个属性选择他们首选的治疗方法。使用误差分量条件 Logit 模型来估计治疗属性之间的偏好和权衡。共有 352 名患者入组，其中 303 名完成了研究。中位年龄为 70 岁（四分位距 [IQR] 64-76），前列腺特异性抗原为 94 ng/ml（IQR 28-370）。转移期为 M1a 10.9% (33/303)、M1b 79.9% (242/303) 和 M1c 7.6% (23/303)。患者更喜欢具有较长生存期和无进展期的治疗。除非与转移导向治疗相结合，否则患者不太可能赞成细胞减灭性前列腺切除术联合全身治疗（系数 -0.448；[95% 置信区间 {CI} -0.60 至 -0.29]；p < 0.001）。前列腺细胞减灭放疗或全身治疗消融、医院就诊次数、“日间病例”手术的使用或立体定向消融性身体放疗的添加均不会影响治疗选择。患者愿意接受额外的细胞减灭治疗，尿失禁和疲劳风险增加 10 个百分点，总生存期分别延长 3.4 个月 (95% CI 2.8-4.3) 和 2.7 个月 (95% CI 2.3-3.1) .患者正在接受额外的细胞减灭治疗，以提高 mHSPC 的生存获益，优先考虑保留泌尿功能和避免疲劳。我们进行了一项大型研究，以确定患有晚期（转移性）前列腺癌的患者在首次诊断时如何做出有关额外可用治疗的决定针对前列腺和癌症沉积物（转移）的治疗。治疗不能治愈，但可以减轻癌症负担（细胞减灭术）、延长生命并延长癌症不进展的时间。我们报告说，大多数患者愿意接受额外的治疗以获得生存益处，特别是保留泌尿功能和减少疲劳的治疗。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。

活检发现的前列腺癌的范围以及前列腺癌分级和基因组测试可以影响临床决策。这些因素对患有良性前列腺癌的男性的初始治疗方法和随后的患者结果的影响尚未在人群水平上确定。我们的目的是探讨 Decipher 22 基因基因组分类器 (GC) 活检测试与初次使用保守治疗与根治性前列腺切除术 (RP) 之间的关联，并确定 GC 评分对 RP 病理结果的独立影响。 总共 87 2016 年至 2018 年间，根据监测、流行病学和最终结果登记数据诊断出 140 名 1 级和 2 级前列腺癌患者，这些患者与 GC 检测结果相关联（2576 例接受了 GC 检测，84564 例未接受 GC 检测）。感兴趣的主要终点是接受保守治疗或 RP、病理升级（病理分级组 3-5）、分期（病理≥T3b）和不良病理特征（病理升级、分期或淋巴结侵犯）。多变量逻辑回归量化了变量与感兴趣结果的关联。GC 测试的患者更有可能在活检中获得 2 级（51% vs 46%，p < 0.001）和较低的前列腺特异性抗原（6.1 vs 6.3，p = 0.016）。 2016 年至 2018 年期间，GC 测试人群和未测试人群的保守治疗比例分别从 37% 增加到 39%，从 22% 增加到 24%。 GC 测试与保守治疗的几率增加显着相关（优势比 [OR] 2.1，95% 置信区间 [CI] 1.9-2.4，p < 0.001）。活检GC风险分布如下：45%低风险，30%中风险，25%高风险。在调整分析中，较高的 GC（每 0.1 增量）得分（OR 1.24，95% CI 1.17-1.31，p < 0.001）和阳性核心百分比（1.07，95% CI 1.02-1.12，p = 0.009）与收到RP。较高的 GC 评分与所有不良结果显着相关（病理升级 [OR 1.29，95% CI 1.12-1.49，p < 0.001]、升期 [OR 1.31，95% CI 1.05-1.62，p = 0.020] 和不良病理[OR 1.27，95% CI 1.12-1.45，p < 0.001]）。局限性包括与回顾性研究设计相关的观察偏差。接受 GC 检测的男性更有可能接受保守治疗。活检时的GC检测是基于大规模人群的登记中不良病理结果的预后。在这项对患有有利风险前列腺癌的男性的人群分析中，那些在活检时接受基因组检测的人更有可能接受保守治疗。在最初接受根治性前列腺切除术的男性中，较高的基因组风险与不良病理结果相关，但与肿瘤体积无关。在前列腺活检中使用基因组测试可以改善风险分层，并且比单独使用肿瘤体积可以更好地为治疗决策提供信息。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。

虹彩病毒是一组双链DNA病毒，对各种水生动物构成重大威胁，给水产养殖造成巨大的经济损失并影响生态系统健康。早期、准确地检测这些病毒对于有效的疾病管理和控制至关重要。传统的诊断方法，包括聚合酶链反应（PCR）和病毒分离，通常需要专门的实验室、熟练的人员和大量的时间。这凸显了对虹彩病毒检测快速、灵敏且经济高效的诊断工具的需求。单层石墨烯是一种二维材料，具有高表面积、优异的导电性和化学稳定性等独特性能，已成为生物传感应用的多功能平台。本文探讨了采用单层石墨烯开发生物纳米传感器以灵敏、快速检测虹彩病毒的潜力。本研究的目的是通过分析附着微生物的单层石墨烯片（SLGS）的振动响应来开发传感器。基于石墨烯的病毒传感器通常依赖于病毒与石墨烯表面之间的相互作用，这会导致石墨烯频率响应的变化。测量这种变化并用于检测病毒的存在。其高表面积与体积比以及对其频率变化的敏感性使其成为高度灵敏的病毒检测平台。我们采用有限元法（FEM）分析来模拟传感器的性能并优化其设计参数。模拟结果凸显了该传感器实现虹彩病毒高灵敏度和快速检测的潜力。通过在 SLG 结构末端应用滚子支撑边界条件进行桥接和简单支撑。已经进行了模拟，以了解 SLG 在用作传感器时的行为方式。长度为 50 nm 的单层石墨烯扶手椅 SLG (5,5) 的最高振动频率为 8.66 × 106 Hz，质量为 1.2786 Zg。相比之下，具有 (18,0) 配置的 zigzag-SLG 的最低振动频率为 2.82 × 105 Hz。这有助于理解检测阈值以及尺寸和边界条件等因素对传感器有效性的影响。这些生物传感器在生物科学和医学领域特别有用，因为它们在临床环境中使用时可以显着改善患者的治疗、癌症早期诊断和病原体识别。© 2024。作者，获得 Springer 的独家许可-Verlag GmbH 德国，施普林格自然集团的一部分。

金属有机框架（MOF）是一类不断发展的结晶微孔材料，由于其令人惊叹的物理化学性质和简单的制造方法，长期以来引起了人们的研究兴趣。它们巨大的表面积可以成为无数分子粘附的工作场所和潜在传感器矩阵的场所。在过去的十年中，人们一直在探索将它们纳入电化学传感器矩阵中，作为多种疾病的诊断解决方案。本综述重点介绍了基于 MOF 的电化学生物传感器领域的一些最新进展，重点关注各种重要疾病及其对提升传感器性能的重要性。它总结了基于 MOF 的生物传感器，用于监测各种真实基质中与糖尿病、病毒和细菌败血症感染、神经系统疾病、心血管疾病和癌症相关的生物标志物。讨论还补充了大量表格，详细阐述了 MOF 复合探针制造策略及其各自传感参数领域的最新趋势。本文总结了这些材料在生物传感器领域的未来范围，并启发读者了解未来研究范围的最新趋势。本文分类如下：诊断工具 > 生物传感诊断工具 > 诊断纳米设备。© 2024 Wiley periodicals LLC。

免疫检查点阻断（ICB）免疫疗法仍然受到免疫原性不足和高乳酸免疫抑制肿瘤微环境（TME）的阻碍。在此，构建了一种具有靶向代谢重编程能力的纳米抗体工程 NIR-II 纳米佐剂，用于增强 NIR-II 光热铁死亡免疫疗法。具体来说，纳米佐剂（2DG@FS-Nb）是通过金属铁离子介导的D-A-D型NIR-II分子的配位自组装和糖酵解抑制剂2-脱氧-D-葡萄糖（2DG）的负载，然后进行修饰而制备的。含有aPD-L1纳米抗体（Nb），可有效靶向免疫抑制性TME并触发原位免疫检查点封锁。纳米佐剂在酸性 TME 中响应性地释放治疗成分，通过 NIR-II 荧光/光声成像实现肿瘤的精确定位，同时启动 NIR-II 光热铁死亡治疗。显着的 NIR-II 光热效率和升高的谷胱甘肽 (GSH) 消耗进一步使铁死亡变得敏感，诱导严重的脂质过氧化，引发强烈的免疫原性细胞死亡 (ICD)，从而触发抗肿瘤免疫反应。重要的是，释放的 2DG 通过糖酵解障碍显着抑制乳酸生成。乳酸流出量的减少通过抑制 M2 巨噬细胞增殖和下调调节性 T 细胞水平来重塑免疫抑制性 TME。这项工作为将 NIR-II 光治疗和乳酸代谢调节整合到单个纳米平台中提供了新的范例，用于与 ICB 疗法相结合的放大抗肿瘤免疫疗法。© 2024 作者。 《Advanced Science》由 Wiley‐VCH GmbH 出版。

子宫内膜癌的预后分层涉及分期、子宫危险因素和分子分类的评估。这个过程可以通过预后生物标志物的注释进一步完善，特别是 L1 细胞粘附分子 (L1CAM) 和激素受体。天冬酰胺酶样蛋白 1 (ASRGL1) 的缺失已被证明与子宫内膜癌的不良预后相关。我们的目标是结合其他可用方法评估 ASRGL1 对子宫内膜癌的预后。这是一项针对在单一三级中心接受初级治疗的患者的回顾性研究。通过子宫内膜癌主动分子风险分类器对肿瘤进行分子分类。通过免疫组织化学测定 ASRGL1、L1CAM、雌激素受体和孕激素受体的表达。 ASRGL1 表达强度分为四类。在 775 名患者的队列中，中位监测时间为 81 个月，ASRGL1 表达强度与改善的疾病特异性生存率呈剂量依赖性相关 (P < 0.001)。低表达水平与 II-IV 期疾病和子宫因素的存在相关，即高级别、淋巴管间隙侵犯和深肌层侵犯（所有 P < 0.001）。在分子亚组中，低表达在 p53 异常癌中最为普遍 (P < 0.001)。低 ASRGL1 与 L1CAM 阳性表达和雌激素和孕激素受体阴性表达相关（全部 P < 0.001）。调整分期和子宫因素后，强 ASRGL1 染色强度与癌症相关死亡风险较低相关（风险比 0.56，95% 置信区间 0.32-0.97；P = 0.038）。当根据分期、分子亚组、L1CAM 和激素受体进行调整后，ASRGL1 与结果无关。当在不同分子亚组中单独分析时，ASRGL1 显示与疾病特异性生存相关，特别是在“无特定分子特征”亚型癌症中（P < 0.001）。然而，在控制混杂因素后，这种关联变得不显着。ASRGL1 表达强度低与子宫内膜癌的生存率低相关。当控制分期和子宫因素时，ASRGL1 有助于更准确的预测。然而，当根据阶段和其他生物标志物（包括分子亚组）进行调整时，ASRGL1 不会改善预后分层。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。

CTNNB1编码β-连环蛋白，在Wnt信号通路中起着至关重要的作用。 CTNNB1突变涉及肿瘤发生、原发性醛固酮增多症、神经发育障碍（NDD）等。NDD是一类影响大脑发育和功能的疾病，其表现的症状包括自闭症谱系障碍（ASD）、智力障碍（ID）、精神分裂症等。 SCZ）和癫痫。在这里，我们从一名被诊断患有 NDD 的患者中生成了一个 iPSC 系 (CTUi005-A)，该患者携带 CTNNB1 基因的杂合突变。 CTUi005-A 表现出典型的 iPSC 特征，并具有作为研究 NDD 致病机制的细胞工具的潜力。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。

谱系不明确的白血病由几个松散定义的实体组成，通常没有明确的机制基础。在这里，我们广泛地分析了具有 CpG 岛甲基化表型的此类白血病亚组的表观基因组和转录组。这些白血病表现出类似的混合骨髓/淋巴表观遗传景观，但存在异质遗传改变，这表明它们是由共同的表观遗传特征而不是常见的遗传病变来定义的。基因表达富集揭示了与早期 T 细胞前体急性淋巴细胞白血病和淋巴祖细胞的相似性。与此相符，差异 DNA 甲基化和基因表达的整合显示骨髓转录因子的广泛沉默。此外，造血转录因子（包括 CEBPA、SPI1 和 LEF1）的结合位点在这些白血病中特别难以接近。过度甲基化还会导致 CTCF 结合丧失，并伴有涉及关键转录因子的染色质相互作用的变化。总之，表观遗传失调，而不是遗传病变，解释了这组谱系不明确的白血病的混合表型。这里收集的数据为急性髓系白血病、T 细胞急性淋巴细胞白血病和混合表型白血病的后续研究提供了有用且全面的表观基因组参考。© 2024。作者。

真皮成熟区痣细胞表达雪旺特征的机制和功能尚不清楚。早期生长反应3（EGR3）通过模拟痣成熟的过程，诱导黑色素瘤细胞向雪旺细胞样分化，从而导致细胞强烈的表型转变，包括长突起的形成以及细胞运动、增殖的降低，和黑色素的产生。同时，EGR3 通过与非严格保守基序结合，分别通过 SRY-box 转录因子 10 (SOX10) 依赖和独立机制调节髓磷脂零蛋白 (MPZ) 和 I 型胶原 α 1 链 (COL1A1) 的水平。雪旺细胞样分化在体内和临床研究中都显示出显着的益处。最后，开发了一种 CD86-P2A-EGR3 重组 mRNA 疫苗，通过强制细胞分化和增强免疫浸润来控制肿瘤。总之，这些数据支持重组 mRNA 作为癌症治疗方法的进一步开发。© 2024 作者。 《Advanced Science》由 Wiley‐VCH GmbH 出版。