研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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HEART & LUNG
2024 Jul 05
NathanASamuel,Alista...
Prognostic significance of troponin in patients with malignancy (NIHR Health Informatics Collaborative TROP-MALIGNANCY study).
HEART & LUNG
患有恶性肿瘤的患者心肌肌钙蛋白通常会升高。肌钙蛋白升高对这些患者的预后意义尚不清楚。我们试图在一个大型、特征明确的患者队列中研究肌钙蛋白与死亡率之间的关系,这些患者定期测量肌钙蛋白并初步诊断为恶性肿瘤。我们使用了美国国立卫生研究院的数据研究 (NIHR) 健康信息学合作数据涉及 5571 名患者,这些患者于 2010 年至 2017 年间在英国 5 个心脏中心测量了肌钙蛋白水平,并初步诊断为恶性肿瘤。患者被分为实体瘤或血液恶性肿瘤亚组。峰值肌钙蛋白水平被标准化为每个实验室的正常值 99% 上限 (xULN) 的倍数。4649 名患者被诊断患有实体瘤,922 名患者被诊断患有血液恶性肿瘤。肌钙蛋白升高是所有患者(肌钙蛋白 > 10与<1调整后HR 2.01,95% CI 1.73至2.34)、实体瘤(HR 1.84,95% CI 1.55至2.19)和血液恶性肿瘤患者死亡率的独立预测因子(HR 2.72,95% CI 1.99 至 3.72)。在所有三个亚组中,肌钙蛋白类别的死亡风险均呈显着增加趋势 (p<0.001)。无论癌症亚型如何,肌钙蛋白水平升高与初次诊断为恶性肿瘤的患者死亡率增加相关。对于肌钙蛋白水平低于 ULN 的患者,死亡风险是稳定的,但在不存在急性冠状动脉综合征的情况下,随着肌钙蛋白水平升高至高于 ULN,死亡风险会增加。© 2024。作者。
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GYNECOLOGIC ONCOLOGY
2024 Jul 04
DavidIShalowitz,Alex...
Refining research on access to gynecologic cancer care: The DIMeS framework.
GYNECOLOGIC ONCOLOGY
尽管它很重要,但对于获得护理的机会还没有达成共识的定义,并且有关获得护理的几个基本哲学问题仍未得到解答。缺乏明确性阻碍了旨在开发和测试纠正准入障碍的方法的干预研究。为了帮助解决这个问题,我们提出了一个概念框架来帮助指导有关获得妇科癌症护理的实证研究。回顾和分析了相关的哲学和实证文献,以突出完善有关获得护理的研究所需的关键要素。DIMeS 框架涉及 1 ) 选择并论证获得癌症护理的定义将指导研究; 2) 确定基本妇科癌症护理服务的获取差异在道德上是不可接受的; 3) 定量测量影响获得护理的具体参数; 4) 选择测量参数的目标阈值,高于该阈值的访问是可接受的。DIMeS 框架为寻求开发和测试干预措施以改善癌症健康公平性的研究人员提供了清晰度和可重复性。应考虑将该框架用于妇科癌症护理的研究。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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GUT
2024 Jul 05
Xiao-BoHuang,QiangHu...
KLHL21 suppresses gastric tumourigenesis via maintaining STAT3 signalling equilibrium in stomach homoeostasis.
GUT
癌前化生转变为不典型增生会带来随后发生肠型胃腺癌的风险。然而,化生细胞向癌细胞转化的分子基础仍然知之甚少。通过单细胞RNA测序和免疫染色,对患者胃组织中与化生、不典型增生相关的基因进行了综合分析、验证和表征。建立了多种小鼠模型,包括纯合条件敲除 Klhl21-floxed 小鼠,以研究 Klhl21 缺失在干性、DNA 损伤和肿瘤形成中的作用。基于质谱的蛋白质组学和核糖体测序被用来阐明潜在的分子机制。Kelch 样蛋白 21 (KLHL21) 的表达在化生、不典型增生和癌症中逐渐降低。 Klhl21 的基因缺失增强了 Mist1 细胞及其后代细胞的快速增殖。化生过程中 Klhl21 的丢失有助于通过 STAT3 信号传导将受损细胞招募到细胞周期中。在缺乏 KLHL21 的癌细胞中证实了 STAT3 活性增加,从而促进自我更新和致瘤性。从机制上讲,KLHL21 的缺失通过稳定 PABPC1-eIF4G 复合物来促进 PIK3CB mRNA 翻译,随后引起 STAT3 激活。 TTI-101 药理学 STAT3 抑制可引发抗癌作用,有效阻止化生向异型增生的转变。在胃癌患者中,低水平的 KLHL21 生存率较短,对辅助化疗的反应较差。我们的研究结果强调,KLHL21 缺失会通过 PABPC1 介导的 PIK3CB 翻译激活触发 STAT3 重新激活,而靶向 STAT3 可以逆转 KLHL21 的癌前化生。胃部缺陷。© 作者(或其雇主)2024。禁止商业重复使用。请参阅权利和权限。由英国医学杂志出版。
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Molecular Cancer
2024 Jul 05
LenkaHovorkova,Lucie...
Distinct pattern of genomic breakpoints in CML and BCR::ABL1-positive ALL: analysis of 971 patients.
Molecular Cancer
BCR::ABL1 是慢性粒细胞白血病 (CML) 的标志,也存在于急性淋巴细胞白血病 (ALL) 中。 BCR 一侧的大多数基因组断裂发生在两个区域 - 主要和次要 - 分别导致 p210 和 p190 融合蛋白。通过多重长距离 PCR 或下一代测序技术,我们对 971 名患者的 BCR::ABL1 基因组融合进行了表征(成人和儿童,患有 CML 和 ALL:儿科 ALL:n = 353 名;儿科 CML:n = 197 名;成人 ALL:n = 166 名;成人 CML:n = 255 名患者)并设计了“Break-App”网络工具,允许断点的可视化和各种分析。使用 Pearson 卡方检验、Kolmogorov-Smirnov 检验和逻辑回归进行统计分析。详细分析显示,两个 BCR 区域的断裂均非随机分布,而 ABL1 断裂分布更为均匀。然而,我们发现 CML 和 ALL 之间的休息分布存在显着差异。我们发现断点与任何类型的散布重复序列或 DNA 基序没有关联。除少数例外,融合的一级结构表明非同源末端连接导致了 BCR 和 ABL1 基因融合。对 453 名患者的相互 ABL1::BCR 融合的分析显示,大部分是平衡易位,没有重大缺失或重复。总之,我们的数据表明,物理共定位和染色质可接近性随着细胞的发育阶段而变化(因此 ALL 和 ALL 之间的差异) CML),是比特定 DNA 基序的存在更影响断点定位的关键因素。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 05
Hsing-WuChen,Wen-Hun...
Interaction of base excision repair gene polymorphism and estrogen-DNA adducts in breast cancer risk among East Asian women.
GENES & DEVELOPMENT
在东亚,乳腺癌的发病率一直在迅速增加,特别是在绝经前女性中。雌激素-DNA 加合物比例升高与乳腺癌风险升高相关。本研究探讨了碱基切除修复(BER)基因多态性和雌激素-DNA加合物之间的相互作用对乳腺癌风险的影响。我们进行了一项病例对照研究,包括健康志愿者和患有良性乳腺疾病的个体(对照组,n = 176)和浸润性癌或原位癌患者(病例组,n = 177)。对 BER 相关基因(包括 SMUG1、OGG1、ERCC5 和 APEX1)进行了基因分型。使用逻辑回归模型,结合基因多态性、雌激素-DNA加合物比率和临床变量之间的相互作用来确定乳腺癌的危险因素。单变量分析表明乳腺癌风险与 APEX1 rs1130409 T > G 之间存在边际关联(P = 0.057) 和 APEX1 rs1760944 T > G (P = 0.065)。多变量回归分析显示,APEX1_rs1130409(GT/GG 与 TT)的乳腺癌风险增加与雌激素-DNA 加合物比率的自然对数值(估计 OR 1.164,P = 0.023)和雌激素-DNA 绝经前状态显着相关加合物比率 > 2.93(估计OR 2.433,P = 0.001)。 APEX1_rs1130409(GT/GG 与 TT)多态性与 BER 活性降低相关,加上雌激素-DNA 加合物比率增加,增加乳腺癌风险东亚女性。© 2024。作者获得施普林格自然旗下 Springer Science Business Media, LLC 的独家许可。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 05
FlorianaJessicaDiPao...
Interplay between WNT/PI3K-mTOR axis and the microbiota in APC-driven colorectal carcinogenesis: data from a pilot study and possible implications for CRC prevention.
GENES & DEVELOPMENT
Wnt/β-连环蛋白信号传导损伤占结直肠癌 (CRC) 的 85%,包括散发性和家族性腺瘤性息肉病 (FAP)。 PI3K/mTOR 通路和肠道微生物群的改变也会导致结直肠癌的发生。我们研究了这两条途径之间的相互作用以及CRC癌变每个步骤中的微生物群组成。通过RT-qPCR和IHC在健康粪便免疫化学测试阳性的组织中分析了这两条途径的蛋白质和靶基因(FIT,n = 17), FAP (n = 17) 和 CRC (n = 15) 受试者。通过 NGS 和 Sanger 分析 CRC 相关突变。通过 16 S rRNA 测序分析口腔、粪便和粘膜微生物群。我们发现与 CRC 相比,FAP 病变中 Wnt/β-catenin 和 PI3K/mTOR 通路同时过度激活。 Wnt/β-catenin 分子标记与 FAP 粪便微生物群中的 Clostridium_sensu_stricto_1 呈正相关,与拟杆菌呈负相关。 Alistipes、Lachnospiraceae 和 Ruminococcaceae 在 FAP 粪便和腺瘤中富集,后者还显示出过多的 Lachnoclostridium,其与 cMYC 呈正相关。在 mTOR 突变的 CRC 组织中,p-S6R 与梭杆菌和 Dialister 相关,后者也在粪便生态系统中得到证实。我们的研究揭示了 Wnt/β-catenin 和 PI3K/mTOR 之间的相互作用,其紊乱与特定微生物群相关FAP 和 CRC 患者的特征,并确定新的潜在生物标志物和目标,以改善 CRC 预防、早期腺瘤检测和治疗。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 05
TingLi,ZhipingYang,P...
Genetic variability of human papillomavirus type 18 based on E6, E7 and L1 genes in central China.
GENES & DEVELOPMENT
高危型人乳头瘤病毒(HR-HPV)感染是宫颈癌发生的重要因素。 HPV18是继HPV16之后第二常见的HR-HPV。本研究利用MEGA11软件分析HPV18 E6-E7和L1基因的变异和系统发育树。使用pamlX 估计E6、E7 和L1 基因的选择压力。此外,分别通过ABCpred服务器和IEDB网站预测了HPV18中L1氨基酸序列的B细胞表位和E6-E7氨基酸序列的T细胞表位。在E6-E7序列中总共发现了9个单核苷酸变异,其中2个是非同义变体,7个是同义变体。 L1序列中鉴定出20个单核苷酸变异,其中11个非同义变异和9个同义变异。系统发育分析表明E6-E7和L1序列均分布在A谱系中。在HPV18 E6、E7和L1序列中,未发现正选择位点。 L1 中的非保守取代 R545C 影响假设的 B 细胞表位。 E6中的S82A和E7中的R53Q两个非保守替换影响了多个假设的T细胞表位。HPV18的序列变异数据可能为华中地区的病毒诊断、宫颈癌的进一步研究和疫苗设计奠定基础。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 05
LalehManouchehri,Zah...
Population-Specific gene expression profiles in prostate cancer: insights from Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA).
GENES & DEVELOPMENT
本研究调查了导致非洲裔美国男性 (AAM) 与欧洲裔美国男性 (EAM) 前列腺癌发病率和进展差异的遗传因素。该研究的重点是对从前列腺癌患者获得的公共微阵列数据进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)。该研究利用 WGCNA 来识别具有相关表达模式的基因簇,然后分析它们与人群背景的联系。此外,还进行了通路富集分析,以了解已识别的基因模块在前列腺癌通路中的重要性。利用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)和基于相关性的特征选择(CFS)方法来选择生物标志物基因。结果揭示了 AAM 和 EAM 之间的 353 个差异表达基因 (DEG)。通过 WGCNA 鉴定出六个重要的基因表达模块,显示出与前列腺癌不同程度的相关性。 LASSO 和 CFS 方法精确定位了关键基因,以及两种方法之间的六个共同基因,这表明它们在疾病中的重要作用。 XGBoost 分类器验证了这些发现,实现了令人满意的预测精度。 APRT、CCL2、BEX2、MGC26963 和 PLAU 等基因被确定为与癌症进展显着相关的关键基因。总之,该研究强调了将 AAM 和 EAM 群体多样性纳入基因组研究,特别是癌症研究中的重要性。此外,该研究还强调了将机器学习技术与基因表达分析相结合作为识别癌症研究中关键基因的强大方法的有效性。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 05
MinYu,MengdongNi,Fei...
NSUN6-mediated 5-methylcytosine modification of NDRG1 mRNA promotes radioresistance in cervical cancer.
GENES & DEVELOPMENT
放射抗性是晚期宫颈癌(CC)死亡的主要原因。 RNA 修饰失调最近已成为辐射和耐药性的调节机制。我们的目的是探讨5-甲基胞嘧啶(m5C)在宫颈癌放射敏感性中的生物学功能和临床意义。通过液相色谱-串联质谱法对放疗耐药和敏感CC标本中RNA修饰的丰度进行定量。通过RNA测序筛选与CC放射敏感性相关的必需RNA修饰相关基因。 NSUN6 对放射敏感性的影响在 CC 细胞系、细胞源性异种移植物 (CDX) 和 3D 生物打印患者源性类器官 (PDO) 中得到验证。通过综合m5C测序、mRNA测序和RNA免疫沉淀研究NSUN6调节CC放射敏感性的机制。我们发现在耐药CC样本中m5C修饰丰度较高,NSUN6是与放射敏感性相关的重要m5C调节基因。 NSUN6 过度表达在临床上与宫颈癌的放射抗性和不良预后相关。从功能上讲,较高的 NSUN6 表达与宫颈癌 3D PDO 模型中的放射抗性相关。此外,沉默 NSUN6 会增加 CC 在体内和体外的放射敏感性。从机制上讲,NDRG1 是通过集成 m5C-seq、mRNA-seq 和功能验证鉴定的 NSUN6 下游靶基因之一。 NSUN6促进NDRG1 mRNA的m5C修饰,并且m5C阅读器ALYREF与m5C标记的NDRG1 mRNA明确结合并增强NDRG1 mRNA稳定性。 NDRG1 过表达促进同源重组介导的 DNA 修复,进而导致宫颈癌的放射抵抗。异常的 m5C 高甲基化和 NSUN6 过表达导致宫颈癌对放射治疗的抵抗。 NSUN6 表达升高通过激活 NSUN6/ALYREF-m5C-NDRG1 通路促进宫颈癌的放射抗性。 NSUN6 在宫颈癌中的低表达表明对放疗的敏感性和更好的预后。© 2024。作者。
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GASTROINTESTINAL ENDOSCOPY
2024 Jul 03
ChangKyoOh,HweHoonCh...
Comparing underwater endoscopic submucosal dissection and conventional endoscopic submucosal dissection for large laterally spreading tumor: a randomized controlled trial.
GASTROINTESTINAL ENDOSCOPY
结直肠内镜粘膜下剥离术(ESD)尽管有用,但仍具有挑战性。与传统 ESD (CESD) 相比,水下 ESD (UESD) 提供更好的牵引力和更清晰的粘膜下层视图。本研究比较了 UESD 和 CESD 对于大型(20-50 毫米)横向扩散肿瘤 (LST) 的效率。预先计划的样本量是根据我们之前的经验计算的。结果,分别需要 28 名患者进入 UESD 组或 CESD 组。主要结果是总手术时间,次要结果是解剖速度。共纳入 56 名患者,每组总共 28 名患者。 UESD 和 CESD 组的 LST 平均尺寸分​​别为 31.6 mm 和 31.3 mm。 UESD 和 CESD 组中 67.9% 和 60.7% 的患者观察到纤维化。 UESD 组的总手术时间(平均值 [SD])分别显着短于 CESD 组(49.5 分钟 [20.3] vs 75.7 分钟 [36.1];平均差,-26.2 分钟;95% CI,-42.0至-10.5)。 UESD 组的解剖速度明显快于 CESD 组(21.9 mm2/min [6.9] vs 15.2 mm2/min [7.3];平均差,6.7 mm2/min;95% CI,2.8-10.4)。各组之间的 R0 切除率或整块切除率没有差异。两组均未观察到穿孔。UESD 在总手术时间和解剖速度方面优于 CESD。 UESD 可被推荐作为切除大 LST 的首选方法。版权所有 © 2024 美国胃肠内镜协会。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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