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Journal of Translational Medicine
2024 Jul 04

KavindraNath,Pradeep...
Impact of therapeutic inhibition of oncogenic cell signaling tyrosine kinase on cell metabolism: in vivo-detectable metabolic biomarkers of inhibition.
Journal of Translational Medicine
激酶抑制是针对各种类型癌症的不断扩展的治疗方法。通常,考虑到激酶抑制剂的主要细胞抑制性质,至少当用作单一药物时,治疗反应的评估是通过标准的体积成像程序完成的,在治疗开始后数周至数月进行。因此,临床迫切需要开发新的监测方法来更迅速地检测对激酶抑制的反应。无创 1H 磁共振波谱 (MRS) 可以测量关键代谢物的体外和体内浓度,这些代谢物可能作为激酶抑制反应的生物标志物。我们采用了套细胞淋巴瘤 (MCL) 细胞系,显示出对布鲁顿酪氨酸抑制的显着不同的敏感性激酶 (BTK) 的生长情况,并深入研究了抑制对细胞代谢各个方面的影响,包括使用代谢组学的代谢物合成、通过 Seahorse XF 技术进行的葡萄糖和氧化代谢,以及指标代谢物乳酸、丙氨酸、总胆碱和牛磺酸的浓度通过 1H MRS。有效的 BTK 抑制可深刻抑制关键细胞代谢途径,最重要的是嘧啶和嘌呤合成、柠檬酸 (TCA) 循环、糖酵解以及丙酮酸和谷氨酰胺/丙氨酸代谢。它还抑制糖酵解和氨基酸相关的氧化代谢。最后,在 MCL 异种移植模型中,它在体外和体内均显着而快速地降低了乳酸(主要是糖酵解的产物)和丙氨酸(氨基酸代谢指标)的浓度,以及不太普遍的总胆碱浓度。这种减少与淋巴瘤细胞扩增和肿瘤生长的抑制程度直接相关。我们的结果表明,BTK 抑制对细胞代谢产生广泛而深刻的抑制作用,受影响的指标代谢物如乳酸、丙氨酸可能作为早期、敏感的代谢物。 ,以及可通过基于无创 MRS 的成像方法检测到的淋巴瘤患者的可靠抑制生物标志物。这种基于成像的检测也可能适用于其他激酶抑制剂,以及多种淋巴和非淋巴恶性肿瘤。© 2024。这是美国政府的作品,在美国不受版权保护;外国版权保护可能适用。
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Journal of Translational Medicine
2024 Jul 04

JidaWang,BeitianJia,...
An novel effective and safe model for the diagnosis of nonalcoholic fatty liver disease in China: gene excavations, clinical validations, and mechanism elucidation.
Journal of Translational Medicine
非酒精性脂肪肝病(NAFLD)是最常见的慢性肝病之一。 NAFLD会导致肝纤维化和肝细胞癌,并且还具有与代谢疾病、心血管疾病、慢性肾脏疾病和恶性肿瘤相关的全身影响。因此,早期诊断 NAFLD 以防止这些不良影响非常重要。从 Gene Expression Omnibus 数据库下载 GSE89632 数据集,然后使用 lasso 和支持向量机递归特征消除(SVM- RFE)。计算诊断 NAFLD 的最佳基因的 ROC 值。使用 DECONVOLUTION 算法 CIBERSORT 确定最佳基因和免疫细胞之间的关系。最后,通过检测 320 名 NAFLD 患者的血液样本和 12 只小鼠的肝脏样本中诊断基因的表达来验证诊断基因的特异性和敏感性。通过机器学习,我们确定 FOSB、GPAT3、RGCC 和 RNF43 是关键的诊断基因。 NAFLD 的基因,并通过受试者工作特征曲线分析进一步证明了它们。我们发现这四种基因的联合诊断可以很好地从正常样本中识别出NAFLD样本(AUC = 0.997)。 FOSB、GPAT3、RGCC 和 RNF43 与免疫细胞浸润密切相关。我们还通过实验检测了这些基因在NAFLD患者和NAFLD小鼠中的表达,结果表明这些基因具有高度的特异性和敏感性。临床和动物研究的数据证明了FOSB、GPAT3、RGCC的高敏感性、特异性和安全性RNF43 用于诊断 NAFLD。诊断关键基因与免疫细胞浸润之间的关系可能有助于了解 NAFLD 的发展。该研究于2021年经天津市第二人民医院伦理委员会审查并批准(ChiCTR1900024415)。© 2024。作者。
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Molecular Cancer
2024 Jul 04

Byung-SunPark,HeejuJ...
Polyamine and EIF5A hypusination downstream of c-Myc confers targeted therapy resistance in BRAF mutant melanoma.
Molecular Cancer
BRAF抑制剂广泛用于治疗带有BRAF V600E突变的黑色素瘤。然而,耐药性的发展损害了它们的治疗效果。在 BRAF 抑制剂耐药性黑色素瘤中发现了多种基因组和转录组改变,迫切需要收敛的可药物靶点来逆转具有不同耐药机制的耐药性肿瘤。进行 CRISPR-Cas9 筛选以鉴定新的靶基因,其抑制选择性靶向 A375VR(一种BRAF V600E 突变细胞系对维莫非尼具有获得性耐药性。进行了各种体外和体内测定,包括细胞竞争测定、水溶性四唑(WST)测定、活死测定和异种移植测定,以确认协同细胞死亡。液相色谱-质谱分析定量分析维莫非尼耐药黑色素瘤中的多胺生物合成和蛋白质组变化。通过 O-炔丙基嘌呤霉素标记测定、mitotracker、mitoSOX 标记和海马测定来测定 EIF5A hypusination 依赖性蛋白翻译以及线粒体生物合成和活性的后续变化。使用生物信息学分析来确定多胺生物合成与黑色素瘤患者队列中 BRAF 抑制剂耐药性和不良预后的关系。我们阐明了多胺生物合成及其在促进 BRAF 抑制剂耐药性中的调节机制。利用 CRISPR-Cas9 筛选,我们确定了 AMD1(S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶 1)(一种多胺生物合成的关键酶)作为药物靶标,其抑制作用可降低维莫非尼耐药性。代谢组学和蛋白质组学分析表明,在威罗非尼耐药的癌症中,多胺生物合成上调,导致 EIF5A 抑制、线粒体蛋白翻译和氧化磷酸化增强。我们还发现,维莫非尼耐药癌症中持续的 c-Myc 水平是导致多胺生物合成升高的原因。抑制多胺生物合成或 c-Myc 可逆转体外细胞系模型和体内异种移植模型中的威罗非尼耐药性。在黑色素瘤队列中,多胺生物合成特征与 BRAF/MAPK 抑制剂治疗后的不良预后和较短的无进展生存期相关,突出了我们研究结果的临床相关性。我们的研究结果描绘了涉及多胺-EIF5A 抑制-线粒体呼吸途径赋予 BRAF 抑制剂耐药性的分子机制在黑色素瘤中。这些靶点将作为有效的治疗靶点,可以最大限度地提高现有 BRAF 抑制剂的治疗效果。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 02

Wen-JingLiu,JunLu,We...
MLH1 Inhibits Metastatic Potential of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma via Downregulation of GPRC5C.
GENES & DEVELOPMENT
DNA错配修复基因MutL同源物-1(MLH1)在许多癌症中具有不同的作用,然而,其对胰腺导管腺癌(PDAC)转移的影响仍不清楚。在本研究中,建立了MLH1稳定过表达(OE)和敲低(KD)亚系。使用伤口愈合和 Transwell 测定来评估细胞迁移/侵袭。在原位植入模型(SCID 小鼠)中研究了体内转移。采用RT-qPCR和蛋白质印迹法显示基因/蛋白质表达。通过转录组测序筛选MLH1下游基因。应用基于组织微阵列的免疫组织化学来测定人类样本中的蛋白质表达。在成功生成的亚系中,与对照相比,OE细胞表现出较弱的迁移/侵袭能力,而在KD细胞中,这些能力明显更强。 MLH1 的转移抑制作用也在小鼠中观察到。从机制上讲,G蛋白偶联受体C5C(GPRC5C)是PDAC细胞中MLH1的关键下游基因。随后,短暂的 GPRC5C 沉默有效抑制了细胞迁移/侵袭,并显着逆转了 KD 细胞中 MLH1 敲低的促侵袭作用。在动物模型和人类 PDAC 组织中,肿瘤 GPRC5C 表达与 MLH1 表达呈负相关,与组织学分级、血管侵袭和较差的癌症特异性生存呈正相关。总之,MLH1 通过下调 GPRC5C 抑制 PDAC 的转移潜力。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 Jul 02

JieCui,YifanQu,JilvM...
Molluscan pleiotropic FADD involved in innate immune signaling and induces apoptosis.
GENES & DEVELOPMENT
具有死亡结构域的 Fas 相关蛋白 (FADD) 最初被鉴定为死亡受体 (DR) 介导的细胞凋亡途径中的关键接头蛋白。随后,许多研究证实FADD在动物先天免疫和炎症反应中发挥着至关重要的作用。然而,这种多效性分子在软体动物物种中的功能尚未得到很好的探索。本研究成功验证了栉孔扇贝(Chlamys farreri)中FADD的基因序列,并将其命名为CfFADD。 CfFADD 蛋白包含保守的死亡效应子和死亡结构域。系统发育分析表明,CfFADD 是软体动物 FADD 家族的新成员,与软体动物 FADD 亚家族蛋白具有密切的进化关系。各种扇贝组织中的 CfFADD mRNA 表达通过病原体相关分子模式(脂多糖、肽聚糖和聚(I:C))的攻击而显着诱导,表明其在扇贝先天免疫中的作用。免疫共沉淀显示CfFADD与扇贝DR(肿瘤坏死因子受体)和Toll样受体通路中涉及的信号分子(白细胞介素1受体相关激酶)相互作用,证实CfFADD可能参与了DR介导的细胞凋亡和先天免疫信号通路。进一步的研究表明,CfFADD 与 CfCaspase-8 相互作用并激活 caspase-3。 HEK293T 细胞转染 CfFADD 表达质粒后表现出明显的凋亡特征,表明扇贝中存在功能性 DR-FADD-caspase 凋亡途径。 CfFADD 的过度表达导致干扰素 β 和核因子-κB 报告基因的显着剂量依赖性激活,证明了 CfFADD 在先天免疫中的关键作用。总之,我们的研究证实了 CfFADD 在先天免疫和细胞凋亡中的关键作用,并为发展比较免疫学理论提供了有价值的信息。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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GASTROINTESTINAL ENDOSCOPY
2024 Jul 02

YoshiakiAndo,MinoruK...
Risk of stricture after endoscopic submucosal dissection in the cervical esophagus and efficacy of local steroid injection for stricture prevention.
GASTROINTESTINAL ENDOSCOPY
宫颈食管癌内镜粘膜下剥离术(ESD)后狭窄的发生率很高。我们的目的是阐明狭窄的危险因素,并评估类固醇注射预防颈段食管狭窄的疗效。我们回顾性分析了 100 例因颈段食管癌接受 ESD 的患者,目的是:(1)确定与颈段食管狭窄相关的因素。没有接受类固醇注射; (2) 比较接受类固醇注射和未接受类固醇注射的患者狭窄的发生率。在 48 名未接受类固醇注射的患者中,肿瘤大小 (P = .026)、切除时间 (P = .028) 和手术时间有显着差异。狭窄患者 (n = 5) 和无狭窄患者 (n = 43) 之间粘膜缺损的圆周范围 (P = .005)。与未注射类固醇的患者相比,当 ESD 后粘膜缺损 < 3/4 和 ≥ 1/2 时,注射类固醇的患者狭窄发生率显着降低(40% vs 8%,P = .039)。对于ESD后粘膜缺损≥3/4的患者(n = 13),所有患者均进行了局部类固醇注射,其中6例患者(46%)出现狭窄。接受≥1/2环周的患者切除者发生颈段食管狭窄的风险较高。类固醇注射对 < 3/4 和 ≥ 1/2 圆周切除的患者具有预防狭窄的作用,但对于 ≥ 3/4 圆周切除的患者似乎不足以预防狭窄。版权所有 © 2024 美国胃肠内镜学会。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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EUROPEAN RADIOLOGY
2024 Jul 04

AdrianoBDias,Sungmin...
Is MRI ready to replace biopsy during active surveillance?
EUROPEAN RADIOLOGY
主动监测 (AS) 是一种保守的管理选择,建议诊断为低危前列腺癌 (PCa) 的患者和选定的中危 PCa 病例。前列腺 MRI 在初级诊断中的采用引发了人们对其在 AS 期间应用的兴趣。本综述旨在探讨多参数 MRI (mpMRI) 在整个 AS 通路中的作用和性能,从初始分层到随访,也与前列腺癌序贯评估变化放射学估计 (PRECISE) 标准的使用相关。鉴于 mpMRI 在检测有临床意义的 PCa (csPCa) 方面具有较高的阴性预测价值,强有力的证据支持其在诊断或验证性活检时用于患者选择和风险分层。然而,在随访期间使用 MRI 评估疾病进展时,观察到了相互矛盾的结果。需要澄清的关键领域包括解决 MRI 阴性 csPCa 的临床意义、优化 MRI 质量、确定双参数 MRI (bpMRI) 或 mpMRI 方案的作用,以及集成人工智能 (AI) 以提高性能。临床相关性声明:MRI 在前列腺癌主动监测 (AS) 患者的选择、分层和随访中发挥着重要作用。然而,由于现有的局限性,它不能完全取代 AS 的活检。要点:多参数 MRI (mpMRI) 已成为前列腺癌 (PCa) 主动监测 (AS) 的重要工具。关于多参数 MRI 在评估疾病进展方面的功效,观察到了相互矛盾的结果。标准化 MRI 引导方案对于解决当前前列腺癌主动监测的局限性至关重要。© 2024。作者获得欧洲放射学会的独家许可。
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Epigenetics
2024 Dec

HunterJMelton,Zichen...
MIMOSA: a resource consisting of improved methylome prediction models increases power to identify DNA methylation-phenotype associations.
Epigenetics
尽管 DNA 甲基化 (DNAm) 与许多复杂疾病的发病机制有关,从癌症到心血管疾病再到自身免疫性疾病,但在这些过程中发挥关键作用的确切甲基化位点仍然难以捉摸。识别假定因果 CpG 位点并增强疾病病因学理解的一种策略是进行全甲基化关联研究 (MWAS),其中可以识别与复杂疾病相关的预测 DNA 甲基化。然而,当前的MWAS模型主要使用单个研究的数据进行训练,从而限制了甲基化预测的准确性和后续关联研究的力量。在这里,我们引入了一种新资源,MWAS 估算甲基化组义务摘要级 mQTL 和相关 LD 矩阵 (MIMOSA),这是一组模型,可通过使用大型摘要级大幅提高 DNA 甲基化和后续 MWAS 预测的准确性。 mQTL 数据集由 DNA 甲基化联盟 (GoDMC) 提供。通过对 28 种复杂性状和疾病的 GWAS(全基因组关联研究)汇总统计分析,我们证明 MIMOSA 显着提高了全血 DNA 甲基化预测的准确性,针对低遗传力 CpG 位点构建了卓有成效的预测模型,并显着确定了全血 DNA 甲基化预测的准确性。比之前的方法有更多的 CpG 位点-表型关联。最后,我们使用 MIMOSA 进行高胆固醇案例研究,查明 146 个假定的因果 CpG 位点。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Jul 02

AnthonyLteif,WassimS...
Lebanese Cannabis Oil as a Potential Treatment for Acute Myeloid Leukemia: In Vitro and In Vivo Evaluations.
DIABETES & METABOLISM
大麻 L. ssp。 indica (Lam.) 植物历史上一直被用作治疗多种疾病的天然草药。在黎巴嫩,大麻提取物长期以来一直被用于治疗关节炎、糖尿病和癌症。当前的研究旨在利用 WEHI-3 细胞研究黎巴嫩大麻油提取物 (COE) 对急性髓性白血病的抗癌特性,并利用WEHI-3诱导的白血病小鼠模型。用增加浓度的COE处理WEHI-3细胞,以确定处理后24、48和72小时后的IC50。利用流式细胞术来鉴定细胞死亡的模式。进行蛋白质印迹测定以评估凋亡标记蛋白。将WEHI-3细胞接种BALB/c小鼠建立体内模型,接种后10天开始治疗,持续3周。COE表现出显着的细胞毒性,IC50分别为7.76、3.82和3.34 μg/mL分别在治疗后24小时、48小时和72小时。 COE 治疗通过抑制 MAPK/ERK 途径诱导细胞凋亡,并通过独立于 ROS 产生的外在和内在模式触发 caspase 依赖性细胞凋亡。用 COE 治疗的动物表现出显着更高的存活率、脾脏重量以及白细胞计数的减少。COE 在体外和体内均表现出针对 AML 细胞的有效抗癌活性。这些发现强调了 COE 作为化疗辅助剂治疗急性髓系白血病的潜在应用。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Jul 02

SivaSankarSana,Chait...
State-of-the-art progress on locust bean gum polysaccharide for sustainable food packaging and drug delivery applications: A review with prospectives.
DIABETES & METABOLISM
刺槐豆胶 (LBG) 是一种基于多糖的天然聚合物,正在被广泛研究作为各种产品的合适添加剂,包括食品、无麸质配方、药物、纸张、纺织品、油井钻探、化妆品和医疗用途。药物输送工具、包装、电池和催化载体都是生物聚合物材料的热门应用。本综述讨论了 LBG 的可持续食品包装和药物输送应用。鉴于 LBG 多糖作为膳食纤维来源的好处,人们还正在研究它作为许多健康疾病的潜在治疗方法,包括结直肠癌、糖尿病和胃肠道困难。 LBG 多糖的灵活性使其能够与水分子形成氢键,这是生物材料的关键特性,而 LBG 的成膜特性对于食品包装应用至关重要。 LBG 的提取过程对粘度和凝胶形成特性等性能起着重要作用。此外,还存在温度、压力、pH等多种因素。基于LBG的功能复合膜可有效提高保质期以及监测水果、肉类和其他加工食品的新鲜度。基于LBG的水凝胶是优异的药物载体,可用于缓慢且可持续地释放药物中的活性成分。因此,本次综述的主要目的是对LBG多糖的组成、性质、加工、食品包装和药物输送应用等方面的文献进行综合评价。因此,我们研究了 LBG 多糖的化学成分、提取和特性,这些多糖是其在食品包装和药物输送领域的应用基础。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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