腹部肿瘤分割是肿瘤筛查和诊断过程中至关重要但具有挑战性的步骤。虽然 3D 分割模型提供了强大的性能，但它们需要大量的计算资源。此外，在 3D 数据中，肿瘤通常只占一小部分，导致数据不平衡，并可能忽略关键信息。相反，2D分割模型具有轻量级结构，但忽略了切片间的相关性，存在边缘切片中肿瘤丢失的风险。为了应对这些挑战，本文提出了一种新颖的位置感知和关键切片特征共享二维肿瘤分割模型（PAKS-Net）。利用 Swin-Transformer，我们有效地对每个切片内的全局特征进行建模，从而促进基本信息的提取。此外，我们引入了位置感知模块来捕获肿瘤与其相应器官之间的空间关系，从而减轻周围器官组织的噪声和干扰。为了提高边缘切片分割的准确性，我们使用关键切片来辅助其他切片的分割，以优先考虑肿瘤区域。通过对三个腹部肿瘤分割CT数据集和一个肺部肿瘤分割CT数据集的广泛实验，PAKS-Net表现出了优越的性能，在KiTS19、LiTS17、胰腺和LOTUS数据集上达到0.893、0.769、0.598和0.738肿瘤DSC，超越了3D分割模型，同时用更少的参数保持计算效率。版权所有 © 2024。由 Elsevier Ltd 出版。

免疫检查点抑制剂 (ICIs) 改变了癌症治疗，改善了许多患者的治疗结果。然而，被称为免疫相关不良事件 (irAE) 的毒性是这些革命性治疗方法的局限性。这些 irAE 可能会随着治疗或 ICI 停止而缓解（急性），或者在治疗停止后持续数月（慢性）。急性 irAE 是最先被认识到的，因此得到了更深入的研究。然而，慢性 irAE 近年来备受关注，并正在成为更深入研究的主题。人们注意到这些慢性 irAE 会影响许多不同的器官系统，包括内分泌、风湿、胃肠、皮肤、神经和心血管系统。在这篇综述中，我们讨论了有关影响各种器官系统的慢性 irAE 的频率、时间过程和风险因素的当前知识、治疗方法和未来方向。© 作者（或其雇主）2024 年。 Re - CC BY-NC 允许使用。不得商业再利用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。

结直肠癌 (CRC) 是死亡的主要原因，也是第三大最常确定的恶性肿瘤。尽管检测和治疗方面取得了进步，结直肠癌（CRC）仍然是癌症相关发病率和死亡率的最大驱动因素。现代习惯和饮食疏忽可能是癌症患病率增加的原因之一。因此，饮食习惯的改变将会产生更好的影响，并有助于找到更好的结直肠癌治疗方法。最初，CRC 被视为一种遗传事件，目前，研究重点是 CRC 细胞中染色质和 microRNA (miRNA) 的表观遗传修饰。人们从遗传、表观遗传和 miRNA 修饰的角度对姜黄素、白藜芦醇、类黄酮和鞣花单宁等天然产物进行了探索，这些化合物将具有未来的治疗作用。此外，这些关键参与者及其类似物的提取物将干预涉及癌症增殖、细胞凋亡、细胞周期停滞以及表观遗传和 miRNA 修饰的信号通路激活。这些 miRNA 的调节以及全局修饰可能会对 CRC 进展和癌症肿瘤细胞敏感性产生影响。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC（Springer Nature 旗下子公司）的独家许可。

转座元件 (TE) 作为吸引转录因子和表观遗传调节因子的顺式调节元件，有助于基因表达调节。本研究旨在探讨转座元件相关分子事件在肝细胞癌中的功能和临床意义，重点研究肝脏特异性可及TE（liver-TE）调节邻近基因表达的机制。我们的研究结果表明，HNF4A 的表达受到邻近肝脏 TE 的反向调节，从而促进肝癌细胞增殖。从机制上讲，肝脏 TE 主要被组蛋白去甲基化酶 KDM1A 占据。 KDM1A 对肝脏 TE 的组蛋白 H3 Lys4 (H3K4) 甲基化产生负面影响，导致 HNF4A 表达的表观遗传沉默。 KDM1A 介导的 HNF4A 抑制可促进肝癌细胞增殖。总之，这项研究揭示了促进肝癌生长的肝脏-TE/KDM1A/HNF4A 调节轴，并强调 KDM1A 作为一个有前途的治疗靶点。我们的研究结果提供了对肝癌进展的转座元件相关分子机制的深入了解。© 2024。作者。

降低或增加酪氨酸磷酸酶 SHP2（由 PTPN11 编码）活性的突变会通过改变磷酸酶活性而促进发育障碍和多种恶性肿瘤。我们发现 SHP2 是一类独特的表观遗传酶；被激酶 ACK1/TNK2 磷酸化后，pSHP2 被雄激素受体 (AR) 护送至染色质，擦除迄今为止未识别的 pY54-H3（组蛋白 H3 在 Tyr54 处的磷酸化）表观遗传标记，从而触发 AR 的转录程序。多发性雀斑努南综合征 (NSML) 患者、SHP2 敲入小鼠和 ACK1 敲除小鼠的 pY54-H3 显着增加，导致 AR 转录组丢失。相比之下，具有高 pSHP2 和 pACK1 活性的前列腺肿瘤表现出 pY54-H3 水平进行性下调以及与疾病严重程度相关的较高 AR 表达。总体而言，pSHP2/pY54-H3 信号传导充当 AR 稳态的哨兵，不仅解释了 NSML 患者的生长迟缓、生殖器异常和不孕，还解释了前列腺癌患者中 AR 的显着上调。© 2024。作者。

小细胞肺癌（SCLC）传统上被认为是一种预后不佳的顽固性癌症，在过去的几十年里，治疗策略仅取得了有限的进展。 SCLC 的全面基因组评估表明，大多数肿瘤都存在肿瘤抑制基因 TP53 和 RB1 的缺失，但与非小细胞肺癌相比，未能识别出可靶向的改变。在 SCLC 发病机制中起关键作用的四种转录因子的表达状态定义了该疾病的不同分子亚型，有可能实现特定的治疗方法。 MYC 旁系同源物的过度表达和扩增也会影响 SCLC 的生物学和治疗脆弱性。过去几年中出现了其他几个有吸引力的靶点，包括 DNA 损伤反应途径的抑制剂、表观遗传修饰剂、抗体药物偶联物和嵌合抗原受体 T 细胞。然而，治疗耐药性的快速发展和缺乏有效选择 SCLC 患者的生物标志物是持续的挑战。新出现的单细胞 RNA 测序数据为了解 SCLC 的可塑性以及肿瘤内和肿瘤间异质性提供了见解，这些异质性可能与治疗耐药性相关。在这篇综述中，我们全面概述了 SCLC 基因组和转录组学特征的最新进展，特别关注转化为新治疗方法以改善患者预后的机会。© 2024。Springer Nature Limited。

最近的研究强调了 NF-κB 信号通路在癌症发生和进展中的重要作用。此外，长非编码 RNA (lncRNA) 已被确定为维持 NF-κB 信号通路功能的关键调节因子。尽管有这些发现，lncRNA 影响 NF-κB 通路的潜在分子机制在很大程度上仍未被探索。利用生物信息学分析来研究 XTP6 的差异表达和预后意义。通过体外和体内实验方法进一步阐明了 XTP6 的功能作用。为了评估 XTP6 和 NDH2 之间的相互作用，进行了 RNA Pulldown 和 RNA 免疫沉淀 (RIP) 测定。使用 RNA 纯化染色质分离 (ChIRP) 测定法检查 XTP6 和 IκBα 启动子之间的连接。此外，还进行了染色质免疫沉淀 (ChIP) 分析，以分析 c-myc 与 XTP6 启动子的结合亲和力，从而深入了解发挥作用的调节机制。XTP6 在多形性胶质母细胞瘤 (GBM) 组织中显着上调，并与不良预后相关GBM 患者。我们的研究表明，XTP6 在体外和体内均可促进 GBM 的恶性进展。此外，XTP6 通过将 NDH2 招募到 IκBα 启动子来下调 IκBα 表达，从而导致 H3K27me3 水平升高，从而降低 IκBα 的转录活性。此外，c-myc 介导的 XTP6 上调进一步驱动 GBM 的进展，与 IκBα 建立正反馈环，从而永久激活 NF-κB 信号通路。值得注意的是，针对 NF-κB 信号通路的抑制剂的应用有效抑制了 XTP6 诱导的持续激活，从而显着减少了体内肿瘤的形成。结果表明，XTP6 揭示了一种创新的表观遗传机制，有助于持续激活 XTP6。 NF-κB 信号通路，提出了治疗 GBM 的一个有前景的治疗靶点。© 2024。作者。

生物钟（CC）对神经胶质瘤具有生物学和临床意义。大多数研究集中在CC对肿瘤微环境的影响和时间疗法的应用。本研究重点关注 CC 基因表达模式和细胞内致癌活性。神经胶质瘤基因表达数据来自人类癌症基因组图谱 (TCGA) 项目。应用纳入和排除标准后，我们​​从 TCGA-GBM 和 TCGA-LGG 项目中选择了 666 名患者，并纳入了重要的临床病理变量。对整个队列进行聚类分析，并根据统计、生物学和临床标准分为 CC1 和 CC2 亚型。 CC2 胶质瘤表现出较高的 BMAL1 和 CRY1 表达以及较低的 CRY2 和 PER2 表达（调整后的 P < .001）。 CC2 神经胶质瘤具有更高的细胞增殖、代谢重编程、血管生成、缺氧和许多致癌信号活性 (P < .001)。 CC2 亚型胶质母细胞瘤比例较高 (P < .001)，且预后较差 (P < .001)。分层 Kaplan-Meier 和多变量 Cox 分析表明，CC 亚型是临床病理特征 (P < .001)、遗传畸变 (P = .006) 和生物过程 (P < .001) 的独立预后因素。因此，这项研究显示了成人神经胶质瘤中 CC 亚型及其生物学和临床病理学意义的统计证据。© 作者 2024。由牛津大学出版社代表美国神经病理学家协会出版。保留所有权利。如需权限，请发送电子邮件至：journals.permissions@oup.com。

核形状的维持对于细胞稳态至关重要，这一过程的破坏与各种病理状况有关，包括癌症、核纤层蛋白病和衰老。尽管核形状很重要，但控制它的精确分子机制尚未完全了解。在这项研究中，我们确定了包含 YEATS 结构域的蛋白 4 (GAS41) 是一种先前未识别的参与调节核形态的因子。结直肠癌细胞中 GAS41 的基因消除导致核形状显着异常，并在体外和体内抑制癌细胞增殖。恢复实验表明，野生型 GAS41，而非缺乏组蛋白 H3 赖氨酸 27 乙酰化或巴豆酰化 (H3K27ac/cr) 结合的 YEATS 结构域突变体，挽救了 GAS41 缺陷细胞中的异常核表型，这凸显了 GAS41 与 H3K27ac 结合的重要性/cr 参与核形状调节。进一步的实验表明，GAS41 与 H3K27ac/cr 相互作用，调节关键核形状调节因子的表达，包括 LMNB1、LMNB2、SYNE4 和 LEMD2。从机制上讲，GAS41 将 BRD2 和介导复合物招募到这些调节因子的基因位点，促进它们的转录激活。 GAS41-H3K27ac/cr 结合的破坏导致 BRD2、MED14 和 MED23 从基因位点解离，导致核形状异常。总体而言，我们的研究结果表明，GAS41 与 BRD2 和介导复合体合作来控制关键核形状调节因子的表达。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。

耐药性仍然是胰腺癌治疗中的重大挑战。耐药细胞系的开发对于了解耐药性的潜在机制和开发新药以改善临床结果至关重要。在此，建立了一种源自中国患者的新型胰腺癌细胞系 PDAC-X1。 PDAC-X1的特征包括免疫表型、生物学、遗传学、分子特征和致瘤性。体外分析显示，PDAC-X1 细胞表现出上皮形态和细胞标志物（CK7 和 CK19），表达癌症相关标志物（E-cadherin、Vimentin、Ki-67、CEA、CA19-9），并产生胰腺癌样细胞悬浮培养的器官。体内分析表明，PDAC-X1细胞保持致瘤性，成瘤率100%。该细胞系表现出复杂的核型，以亚三倍体核型为主。此外，PDAC-X1细胞对多种药物表现出内在的多药耐药性，包括吉西他滨、紫杉醇、5-氟尿嘧啶和奥沙利铂。总之，PDAC-X1 细胞系已经建立并进行了表征，代表了一个有用且有价值的临床前模型，可用于研究耐药性的潜在机制并开发新的药物疗法以改善患者的治疗结果。© 2024。作者。