内分泌治疗是肿瘤表达雌激素受体α（ERα）的乳腺癌患者最重要的治疗方式。雄激素受体 (AR) 也在绝大多数 (80-90%) ERα 阳性肿瘤中表达。 AR靶向药物尚未用于临床实践，但已在多项试验和临床前研究中进行了评估。我们进行了一项全基因组研究，以确定激素/药物诱导的单核苷酸多态性（SNP）基因型依赖性基因表达，已知作为 PGx-eQTL，由 AR 激动剂（二氢睾酮）或部分拮抗剂（恩杂鲁胺）介导，利用先前充分表征的淋巴细胞系组。然后使用我们已发表的三项全基因组关联 (GWAS) 研究以及 GWAS 目录中的其他研究检查已确定的 SNP 基因对与乳腺癌表型的关联。我们确定了 13 个 DHT 介导的 PGx-eQTL 位点和 23 个Enz 介导的 PGx-eQTL 位点与 ER 拮抗剂或芳香酶抑制剂 (AI) 治疗后的乳腺癌结局相关，或与 AI 的药效 (PD) 效应相关。另外 30 个位点被发现与癌症风险和性激素结合球蛋白水平相关。顶部位点涉及基因 IDH2 和 TMEM9，其表达以 PGx-eQTL SNP 基因型依赖性方式被 DHT 抑制。这两种基因在乳腺癌中都过度表达，并且与较差的预后相关。因此，通过 AR 激动剂抑制这些基因可能会使这些 SNP 具有较小等位基因基因型的患者受益。我们鉴定了与 AR 相关的 PGx-eQTL SNP 基因对，这些基因对与内分泌治疗的风险、结果和 PD 效应相关，可能提供潜在的生物标志物用于乳腺癌的个体化治疗。© 2024。作者。

头颈部鳞状细胞癌的一个亚型仅表现为颈部转移性疾病，且原发性不明 (SCCUP)。大多数原发性肿瘤最终都会被识别出来，通常是在口咽部。在少数情况下，主要部位仍然难以捉摸。在这里，我们研究了辅助测试的作用，包括突变特征分析（MSA），以帮助识别此类病例中可能的主要位点。 10 年期间收集的 22 例颈部 SCCUP 病例，根据形态和病毒状态进行分类；包括通过 p16 免疫组织化学 (IHC) 和 RT-qPCR 进行的人乳头瘤病毒 (HPV) 检测，以及通过 EBER-ISH 进行的 Epstein-Barr 病毒 (EBV) 检测。进行 CD5 和 c-KIT (CD117) IHC 来评估所有病毒阴性病例中可能的胸腺起源。使用全外显子组测序和 MSA 来识别表明皮肤起源的 UV 特征突变。在 22 个肿瘤中的 12 个（54.5%）中发现了 HPV，有利于口咽起源，并且与非角化肿瘤形态密切相关（Fisher 精确检验；p = 0.0002）。一种形态不确定的肿瘤的 HPV 和 p16 状态不一致 (p16 /HPV-)。所有肿瘤均为 EBV 阴性。在 10 个病毒阴性 SCCUP 中的 1 个（10%）中发现了 CD5 和 c-KIT 的弥漫表达，表明可能是异位胸腺起源而不是转移。在 10 个病毒阴性 SCCUP 中的 1 个 (10%) 中发现了表明皮肤起源的 UV 突变特征。该患者治疗后 3 个月出现皮肤耳廓原发性病变。原发性肿瘤在另外 2 例（1 例下咽部、1 例下咽/喉部）中出现临床症状。因此，在随访后，6 个肿瘤仍无法根据可能的起源部位进行分类（27%）。我们的系列中大多数颈部 SCCUP 与 HPV 相关，因此可能源自口咽部。 UV 特征突变分析以及针对可能的胸腺起源的 CD5 和 c-KIT 的额外 IHC 可能有助于进一步对病毒阴性的未知原代进行分类。对下咽粘膜进行密切的临床检查也可能有所帮助，因为原发性肿瘤的一个子集后来出现在该部位。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。

人们越来越关注使用不同的液相色谱技术与质谱联用来定量人血浆中的铂类抗癌药物，从而为癌症化疗提供信息。我们开发、验证和研究了一种使用超高效液相色谱联用电感耦合等离子体质谱 (UHPLC-ICP-MS) 定量人血浆中完整奥沙利铂的方法。从患者处采集血浆样本后立即进行处理，通过甲醇脱蛋白保存奥沙利铂形态，并将稀释的上清液（血浆：甲醇 1:2 v/v）储存在 -80 °C 下。使用 C18 柱和线性梯度流动相（流动相 A：水-甲醇 (97:3 v/v)、0.075 mM 十二烷基硫酸钠、9.79 nM 铊，调整至pH 2.5，三氟甲磺酸；流动相 B：100% 甲醇 (v/v))，采用 ICP-MS 检测，分别在 m/z 195 和 205 处监测铂和铊。甲醇脱蛋白稀释血浆 (1:2 v/v) 中的定量限为 50 nM。在甲醇脱蛋白稀释血浆 (1:2 v/v) 中制备的 50 至 500 nM 范围内的校准标准品以及在含有内标的空白基质中稀释较高浓度样品（最终稀释度 1:29 v/v）建立了线性关系）。日内和日间准确度范围为标称浓度的 96.8% 至 103%，精密度范围为 0.62% 至 2.49% 变异系数。回收已完成，基质效应证实了基质匹配标准品的要求。完整的奥沙利铂在甲醇脱蛋白稀释血浆（1:2 v/v）中储存至少 473 天期间以及分析期间保持稳定。该方法用于测定接受癌症化疗的患者中完整奥沙利铂的血浆浓度，以及奥沙利铂的体外降解研究。这种基于 UHPLC-ICP-MS 的改进方法将能够对人血浆中完整的奥沙利铂进行更特异、高效和可靠的定量。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。

美国国家癌症研究所 (NCI) 发布了 2021 年备忘录，采纳美国临床肿瘤学会 (ASCO) 和癌症研究之友 (Friends) 工作组的建议，以扩大临床研究资格标准。他们建议取消大多数先前癌症治疗的清除期，并在需要时利用基于证据/理由的标准。儿童白血病和淋巴瘤治疗进展 (TACL) 联盟对此指南做出了回应。TACL 工作组审查了该联盟的研究组合、ASCO-Friends、NCI 和美国食品和药物管理局 (FDA) 的相关文献和指导文件，以制定专家共识和基于证据的建议，以现代化、扩大和规范 TACL 研究清除期，同时确保符合儿科伦理和联邦法规。 TACL 的筛查日志经过审查，以估计更新的清除期对患者包容性和招募的影响。在 19 年期间，42 名患者（所有筛查不合格 (n = 287) 患者的 14.6%）被确定为排除在外TACL 早期研究完全是由于不符合洗脱标准。另外六个 (2.1%) 不符合清除标准和至少一项其他排除标准。制定/采用了新的 TACL 清洗指导文件。在未消除洗脱标准的情况下，建立了基于理由/基于证据的标准并引用。为了减少临床试验中不必要的排除，TACL 主要遵循 NCI/ASCO-Friends 建议的指导，制定了基于理由/基于证据的洗脱期标准。这些新的、扩大的资格标准预计将增加 TACL 临床试验的机会，同时保持安全性和科学卓越性。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。版权所有。如需权限，请发送电子邮件至：journals.permissions@oup.com。

炎症与疾病进展直接相关，并显着增加全球疾病负担。 Pothos chinensis (Raf.) Merr. (PCM) 在中国瑶医学中常用来治疗肿瘤和骨科疾病，如膝骨关节炎和风湿性骨不适。前期研究发现PCM具有显着的抗炎特性，通过血清药物化学、网络药理学和血清代谢组学的综合策略，探讨PCM的活性成分及其抗炎药理机制。分别采用UPLC-QTOF-MS/MS和UPLC对PCM的化学成分进行分析，分析了吸收到血液中的PCM的原型成分。根据吸收到血液成分的特征，利用网络药理学发现了PCM抗炎的潜在靶点和信号通路。此外，使用 UPLC-QTOF-MS/MS 进行的代谢组学研究确定了与 PCM 抗炎作用相关的生物标志物和代谢途径。最后，通过体内和体外实验验证了假设的机制。首次鉴定了PCM中的40种化学成分，并对其中7种化学成分进行了定量分析，同时发现了5种血清迁移原型成分。网络药理学KEGG富集分析显示，花生四烯酸代谢、酪氨酸代谢、TNF信号通路、NF-κB信号通路、苯丙氨酸代谢是PCM抗炎的主要信号通路。药效学结果表明，PCM 可改善肝损伤和炎症细胞浸润，并下调肝脏中 IL-1β、NF-κB p65 和 MyD88 的蛋白表达。代谢组学研究鉴定出53种不同的血清代谢物，主要与嘌呤和嘧啶代谢、苯丙氨酸代谢、初级胆汁酸生物合成和甘油磷脂代谢相关。综合结果表明，PCM的抗炎调节网络与PCM的5个代谢物、3个代谢途径、7个靶点和4个活性成分有关。此外，分子对接鉴定了活性成分与核心靶点之间的结合能力，并通过体外实验验证了活性成分的抗炎功效。我们的研究证明了PCM的抗炎作用，这些发现为对 PCM 抗炎活性成分和代谢机制的新见解。版权所有 © 2024。Elsevier B.V. 出版。

从宏基因组中识别病毒是探索人类肠道病毒组成的常见步骤。在这里，我们介绍 VirRep，一种混合​​语言表示学习框架，用于从人类肠道宏基因组中识别病毒。 VirRep 结合了上下文感知编码器和进化感知编码器，通过结合 k-mer 模式和序列同源性来改进序列表示。对不同病毒比例的模拟和真实数据集进行基准测试表明，VirRep 的性能优于最先进的方法。当应用于结直肠癌队列的粪便宏基因组时，VirRep 识别出 39 种与该疾病相关的高质量病毒种类，其中许多病毒无法通过现有方法检测到。© 2024。作者。

心外膜以前被视为心脏周围的被动外层，现在被认为是发育、再生和修复的重要组成部分。在这篇综述中，我们探讨了心外膜的细胞和分子组成，强调了它在斑马鱼和蝾螈心脏再生和修复中的作用，以及它在年轻和成年产后哺乳动物中的激活。我们还研究了用于研究心外膜细胞功能以进行治疗干预的最新技术。对高度再生动物模型的分析表明，心外膜对于调节心肌细胞增殖、短暂纤维化和新血管形成至关重要。然而，尽管心外膜具有独特的细胞程序来解决心脏损伤，但仍不清楚如何在非再生哺乳动物中复制这些过程。在心肌梗塞期间，心外膜细胞分泌调节纤维化、血管和炎症重塑的信号因子，从而不同程度地增强或抑制心脏修复。最近的转录组学研究验证了不同物种和发育阶段的心外膜的细胞和分子异质性，进一步阐明了其在病理条件下的功能。这些研究还为调节心外膜衍生信号分子在各种疾病中的功能提供了见解，这可能会带来新的疗法和修复性心血管医学的进展。此外，通过研究心外膜细胞功能获得的见解启动了新技术的开发，包括使用人类多能干细胞和心脏类器官来模拟心血管系统内的修复过程。对心外膜功能的不断加深的了解有可能开发出创新的治疗策略，旨在解决发育性心脏病、增强再生疗法和减轻心血管疾病的进展。

在比较脓毒症后的结果时，必须考虑患者病例组合以进行公平比较。我们在密歇根医院医学安全脓毒症计划 (HMS-Sepsis) 中开发了一个模型来评估风险调整后的 30 天死亡率。HMS-脓毒症注册数据能否充分预测 30 天死亡风险？使用调整后数据与未调整数据进行的绩效评估是否有所不同？ HMS-脓毒症登记处 (4/2022-9/2023) 中社区发病脓毒症住院的回顾性队列，包含分割推导 (70%) 和验证 (30%) 队列。我们拟合了一个风险调整模型（HMS-脓毒症死亡率模型），该模型结合了急性生理学、人口统计和基线健康数据，并使用 c 统计、Brier 评分以及按风险十分位数比较预测死亡率与观察到的死亡率来评估模型性能。我们使用观察死亡率与调整死亡率来比较医院绩效（第一五分位数、中间五分位数、第五五分位数），以了解风险调整对医院绩效评估的影响程度。 在研究期间，66 家医院的 17,514 例住院患者中，有 12,260 例（70%）因住院治疗而住院。用于模型推导，5,254 (30%) 用于模型验证。整个队列的 30 天死亡率为 19.4%。最终模型包括 13 个生理变量、两个生理相互作用以及 16 个人口统计和慢性健康变量。最重要的变量是年龄、转移性实体瘤、体温、精神状态改变和血小板计数。推导队列的模型 c 统计量为 0.82，验证队列的模型 c 统计量为 0.81，所有评估的亚组的模型 c 统计量均≥0.78。总体校准误差为 0.0%，风险十分位数的平均校准误差为 1.5%。对于 33.9% 的医院，标准化死亡率得出的评估结果与观察到的死亡率不同。HMS-脓毒症死亡率模型具有很强的区分性和充分的校准，并将三分之一的医院重新分类为与未调整死亡率不同的绩效类别。基于其强大的性能，HMS-Sepsis 死亡率模型可以帮助进行公平的医院基准测试、时间变化评估和观察性因果推理分析。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。

Dabrafenib是一种BRAF抑制剂，已被证明对治疗具有BRAF V600E突变的黑色素瘤和非小细胞肺癌患者有效。本研究旨在探讨51种中药对达拉非尼代谢的影响，并进一步探讨欧前胡素的抑制作用。采用基于超高效液相色谱串联质谱 (UPLC-MS/MS) 的灵敏、快速、准确的测定方法对达拉非尼及其代谢物羟基达拉非尼进行定量。体外实验结果显示，20种药物对达拉非尼的代谢抑制超过80%。在进一步研究欧前胡素对达拉非尼的作用时，在大鼠肝微粒体（RLM）和人肝微粒体（HLM）中，欧前胡素对达拉非尼的半数最大抑制浓度（IC50）值分别为0.22μM和3.68μM，而抑制机制分别为非竞争性抑制和混合型抑制。体内实验结果表明，在欧前胡素存在下，达拉非尼的AUC(0-t)、AUC(0-∞)、Cmax和Tmax增加了2.38-、2.26-、1.05-和6.10-倍，而 CLz/F 降低了 67.9%。此外，羟基达拉非尼的 Tmax 增加了 1.4 倍。研究结果表明，欧前胡素在体外和体内对达拉非尼具有一致的抑制作用。当达拉非尼和欧前胡素同时使用不可避免时，临床医生应密切监测潜在的不良事件，并及时调整给药剂量。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。

前列腺癌（PCa）在全球男性中发病率较高，几乎所有PCa患者均进展至雄激素非依赖期，缺乏有效的治疗措施。 PTENP1 是一种长链非编码 RNA，已被证明可以通过竞争性内源 RNA (ceRNA) 机制拯救 PTEN 表达来抑制肿瘤生长。然而，PTENP1由于酶降解速度快、细胞内摄取差、合成的碱基序列过长等原因限制了其在PCa治疗中的应用。考虑到人工纳米材料在药物装载和运输方面的独特优势，本研究采用黑磷（BP）纳米片作为基因药物载体。以PTENP1序列为模板，将其随机分为四个长度片段约1000个核苷酸碱基合成四种不同的RNA片段作为基因药物，并将其负载到聚乙烯亚胺（PEI）修饰的BP纳米片上构建BP-PEI@RNA递送平台。 RNA可以通过BP-PEI纳米片有效地递送到PC3细胞中，并通过竞争性结合靶向PTEN mRNA的microRNA（miRNA）来提高PTEN表达，最终发挥抗肿瘤作用。因此，本研究证明BP-PEI@RNA是一种有前途的 PCa 治疗基因治疗平台。© 2024。作者。