研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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CANCER IMAGING
2024 Jul 04
RuiyuWang,ShuHuang,P...
Bibliometric analysis of the application of deep learning in cancer from 2015 to 2023.
CANCER IMAGING
近年来,深度学习(DL)的应用在各个领域取得了巨大进展,特别是在癌症研究方面。然而,迄今为止,关于深度学习在癌症中应用的文献计量分析还很少。因此,本研究旨在探讨DL在癌症中应用的研究现状和热点。我们从Web of Science数据库Core Collection数据库中检索了DL在癌症中应用的所有文章。使用 Biblioshiny、VOSviewer 和 CiteSpace 通过分析数字、引用、国家、机构、作者、期刊、参考文献和关键词来进行文献计量分析。我们发现了 6,016 篇关于 DL 在癌症中应用的原创文章。年度发文量和总被引次数总体呈上升趋势。中国发表的文章数量最多,美国的总引用量最高,沙特阿拉伯的中心度最高。中国科学院是生产力最高的机构。田杰发表文章数量最多,何凯明为共同被引次数最多的作者。 IEEE Access 是最受欢迎的期刊。参考文献和关键词分析表明,DL主要用于乳腺癌、肺癌、皮肤癌的预测、检测、分类和诊断。总体而言,DL在癌症中应用的文章数量逐渐增多。未来,进一步扩大和提高深度学习应用的应用范围和准确性,并将深度学习与蛋白质预测、基因组学和癌症研究相结合可能是研究趋势。© 2024。作者。
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EUROPEAN UROLOGY ONCOLOGY
2024 Jul 03
EmmanuelSAntonarakis...
Current Treatment Paradigms and Clinical Outcomes in Oligometastatic Prostate Cancer Patients: A Targeted Literature Review.
EUROPEAN UROLOGY ONCOLOGY
前列腺癌是美国和欧洲男性最常见的非皮肤恶性肿瘤。寡转移性前列腺癌 (omPC) 尚无共识定义,通常被认为分为同步(从头)和异时(寡复发)两个亚组,并且可能包括转移性疾病负担较低的患者。总结流行病学、疾病定义同步、异时和混合亚型(即同步和异时或未定义类型)omPC 以及低负担疾病状态患者的临床试验和现实环境中的死亡率/生存结果以及治疗特征。我们搜索了 MEDLINE 和 Embase,以找到有关 omPC 流行病学、疾病定义、临床结果和治疗特征的出版物。对灰色文献来源(例如,ClinicalTrials.gov)进行了搜索以查找正在进行的试验。我们确定了 105 篇出版物。不同出版物和 omPC 亚型的疾病定义在病变数量和位置、所用影像类型以及寡转移疾病类型方面有所不同。大多数研究将 omPC 定义为五个或更少的转移病灶。有关 omPC 流行病学的数据有限。同步 omPC 队列与异时 omPC 队列相比,死亡率和总生存率往往更差。同步 omPC 队列的无进展生存期通常比异时 omPC 队列更长,但在较长时间点更相似。还提供了正在进行的针对 omPC 男性的各种局部、针对转移和全身治疗的临床试验总结。寡转移性疾病的定义取决于所使用的成像技术。 omPC 的流行病学数据很少。同步队列和异时队列之间的生存率不同,不同的治疗模式会导致不同的结果。我们期待并需要使用现代成像技术进行正在进行的临床试验。寡转移性前列腺癌 (omPC) 的定义因所使用的成像技术而异。不同的治疗模式会导致不同的结果。缺乏可靠的 omPC 流行病学数据。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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EUROPEAN UROLOGY ONCOLOGY
2024 Jul 03
EmersonLee,LiaDePaul...
PTEN Loss Is Associated with Adverse Outcomes in the Setting of Salvage Radiation Therapy.
EUROPEAN UROLOGY ONCOLOGY
挽救性放射治疗(SRT)是根治性前列腺切除术后生化复发的主要治疗方法;然而,很少有研究在这方面检查基因组生物标志物。我们描述了先前发现的有害分子表型(PTEN、ERG 表达和 TP53 突变的缺失)对接受 SRT 的患者的预后影响。我们利用了 320 名 SRT 患者的机构数据库可用的组织和后续行动。使用组织微阵列进行基因验证的免疫组织化学测定。所有男性均接受了有或没有雄激素剥夺治疗的 SRT 结果测量和统计分析:单变量和多变量 Cox 比例风险模型评估了分子表型与生化无复发 (bRFS) 和转移之间的关联SRT 后无 (MFS) 存活率。PTEN 缺失(n = 123,43%)和 ERG 表达(n = 118,39%)在该队列中很常见,而 p53 过度表达(表示 TP53 错义突变)并不常见(n = 118,39%)。 = 21, 7%)。在单变量分析中,PTEN 的任何丢失都预示着更差的 bRFS(风险比 [HR] 1.86;95% 置信区间 1.36-2.57)和 MFS(HR 1.89;1.21-2.94),同质 PTEN 丢失与 MFS 的最高风险相关。 (HR 2.47;1.54-3.95)。同样,p53 过度表达预测 bRFS(HR 1.95;1.14-3.32)和 MFS(HR 2.79;1.50-5.19)更差。 ERG 表达仅与较差的 MFS 相关(HR 1.6;1.03-2.48)。在调整已知预后特征的多变量分析中,同质 PTEN 丢失仍然可以预测不良 bRFS(HR 1.82;1.12-2.96)和 MFS(HR 2.08;1.06-4.86)。该研究因其回顾性和单一机构设计而受到限制。免疫组织化学检测发现 PTEN 缺失是接受 SRT 治疗的前列腺癌患者 bRFS 和 MFS 的独立不良预后因素。未来的试验将确定治疗具有不良分子预后特征的 SRT 患者的最佳方法。PTEN 抑癌蛋白的缺失与挽救性放射治疗后的较差结果相关,与其他临床或病理患者特征无关。版权所有 © 2024 欧洲泌尿外科协会。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。
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Stem Cell Reviews and Reports
2024 Jul 05
SiTao,XingxingQiu,Yi...
Effect of Post-transplant Dietary Restriction on Hematopoietic Reconstitution and Maintenance of Reconstitution Capacity of Hematopoietic Stem Cells.
Stem Cell Reviews and Reports
造血细胞移植(HCT)是许多血液恶性肿瘤以及一些非恶性疾病的重要治疗方法。移植后造血受多种因素影响,移植后造血延迟的机制仍知之甚少。由于预处理治疗引起的并发症,接受 HCT 的患者常常会出现食物摄入量显着减少的情况。在这里,我们使用饮食限制(DR)小鼠模型来研究移植后饮食减少对造血和造血干细胞(HSC)的影响。我们发现移植后 DR 显着抑制原代受体小鼠的淋巴细胞生成和骨髓生成。然而,当将来自初级受体小鼠的骨髓细胞(BMC)连续移植到二级和三级受体小鼠中时,来自暴露于移植后DR的初级受体小鼠的HSC表现出更高的重建能力。纯化的 HSC 移植实验表明,移植后 DR 极大地抑制了造血干细胞 (HSC) 的扩增。此外,移植后 DR 重塑了受体小鼠的肠道微生物群,抑制了炎症反应,因此可能有助于维持 HSC 功能。我们的研究结果可能对临床工作具有重要意义,因为接受 HCT 的患者食物摄入量减少以及消化和吸收问题很常见。© 2024。作者。
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BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
2024 Jun 29
QuratUABukhari,Flavi...
Laser-assembled conductive 3D nanozyme film-based nitrocellulose sensor for real-time detection of H2O2 released from cancer cells.
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
在这项工作中,通过激光组装直接生产出具有纳米酶特征的纳米结构导电薄膜,并将其集成到完整的硝化纤维素传感器中;纤维素基质允许容纳活细胞,而纳米结构薄膜纳米酶活性确保了对活细胞释放的过氧化氢(H2O2)的无酶实时检测。具体来说,使用CO2激光绘图仪通过氧化石墨烯和铂阳离子的同时还原和图案化,生产了装饰有裸露铂纳米立方体的高度剥离的还原氧化石墨烯3D薄膜;将纳米结构薄膜集成到硝基纤维素基板中,并使用经济实惠的半自动印刷方法制造完整的传感器。直接 H2O2 测定的线性范围为 0.5-80 μM (R2 = 0.9943),检测限为 0.2 μM。活细胞测量是通过将传感器放置在培养基中,确保它们粘附在传感器表面来实现的;两种细胞系分别用作非致瘤(Vero 细胞)和致瘤(SKBR3 细胞)模型。实时检测佛波酯刺激细胞释放的H2O2;硝化纤维传感器返回释放的 H2O2 的现场实时定量信息,证明了有用的灵敏度和选择性,可以区分致瘤细胞。所提出的策略允许使用简单的台式仪器低成本连续半自动生产纸质护理点设备,为轻松且经济地监测癌细胞的细胞病理学状态铺平道路。版权所有 © 2024作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。
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BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
2024 Jun 24
XiaWang,ZheQin,FeiZh...
Label-free electrochemical biosensor based on dual amplification of gold nanoparticles and polycaprolactones for CEA detection.
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
癌胚抗原(CEA)是一种具有人类胚胎抗原特性的酸性糖蛋白,存在于从内胚层细胞分化而来的癌细胞表面。本文提出了一种无标记电化学免疫分析方法,使用载有聚吡咯聚多巴胺(Au/PPy-PDA)和开环聚合(ROP)制备的聚合聚己内酯(Ng-PCL)的金纳米粒子来双扩增检测CEA。首先,将复合材料 Au/PPy-PDA 粘附到电极表面。然后,金纳米颗粒与 Apt1 中的巯基形成 Au-S 键,将其固定在电极表面。随后,电极表面的非特异性结合位点被牛血清白蛋白(BSA)封闭。接下来,将CEA滴到电极表面,通过抗原-抗体特异性识别将其固定化,羧基功能化的Apt2通过特异性识别形成抗体-抗原-抗体的“三明治结构”。聚合物 Ng-PCL 粘附在电极表面,导致电化学阻抗信号增加,从而形成完整的信号分析链。最后,通过电化学阻抗谱(EIS)检测响应信号。在最佳实验条件下,该方法具有灵敏度高、线性范围宽(1 pg mL-1∼100 ng mL-1)等优点,检测下限(LOD)为0.234 pg mL-1。并且具有与真实样品检测同样的高灵敏度、选择性和抗干扰性。因此,它提供了一种关于生物医学和临床诊断的新思维方式。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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BIOORGANIC CHEMISTRY
2024 Jul 01
NataliyaZelisko,Roma...
Structure, unique biological properties, and mechanisms of action of transforming growth factor β.
BIOORGANIC CHEMISTRY
转化生长因子β(TGF-β)是一种结构极其保守、普遍存在的分子,在人体机体中发挥着全身性作用。 TGF-β 是一种同二聚体分子,由通过二硫键连接的两个亚基组成。在哺乳动物中,三个基因编码该细胞因子的 TGF-β1、TGF-β2 和 TGF-β3 亚型,其中 TGF-β1 的表达占主导地位。事实上,所有正常细胞都含有 TGF-β 及其特定受体。考虑到TGF-β在人体许多生理和病理过程中所发挥的精细平衡的特殊作用,该细胞因子可能被提议在医学上用作移植学、伤口愈合和骨修复中的免疫抑制剂。 TGFb 本身是肿瘤学的一个重要靶点。已经考虑将阻断 TGF-β 信号通路成员作为治疗靶点的策略。在这篇综述中,解决了 TGF-β1 作用的信号机制,并描述了它们在生理学和病理学中的作用,主要关注致癌作用。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2024 Jul 04
DouglasAdamoski,Lari...
HuR controls glutaminase RNA metabolism.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
谷氨酰胺酶 (GLS) 与细胞生长和肿瘤进展直接相关,使其成为癌症治疗的靶点。 RNA 结合蛋白 HuR(由 ELAVL1 基因编码)影响 mRNA 稳定性和选择性剪接。 ELAVL1 过度表达在多种癌症中很常见,包括乳腺癌。在这里,我们证明 HuR 调节乳腺癌中 GLS mRNA 的选择性剪接和异构体翻译/稳定性。 ELAVL1 表达升高与谷氨酰胺酶同工型 C (GAC) 和肾型 (KGA) 水平高相关,这与患者预后不良相关。敲低 ELAVL1 会降低 KGA 并增加 GAC 水平,增强谷氨酰胺回补进入 TCA 循环,并驱动细胞产生谷氨酰胺依赖。此外,我们发现,GLS 的化学抑制与 ELAVL1 沉默相结合可协同减少乳腺癌细胞的生长和侵袭。这些发现表明,GLS 和 HuR 的双重抑制为乳腺癌治疗提供了一种治疗策略。© 2024。作者。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2024 Jun 26
ZhikangWang,JianiMa,...
Dual-stream multi-dependency graph neural network enables precise cancer survival analysis.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
基于组织病理学图像的生存预测旨在提供癌症预后的精确评估,并可以为个性化治疗决策提供信息,以改善患者的治疗结果。然而,现有方法无法自动对每个完整幻灯片图像(WSI)中众多形态不同的斑块之间的复杂相关性进行建模,从而阻碍了它们对患者状态进行更深刻的理解和推断。为了解决这个问题,我们在这里提出了一种新颖的深度学习框架,称为双流多依赖图神经网络(DM-GNN),以实现精确的癌症患者生存分析。具体来说,DM-GNN 由特征更新和全局分析分支构成,以便基于形态亲和力和全局共激活依赖性更好地将每个 WSI 建模为两个图。由于这两个依赖关系从不同但互补的角度描述每个 WSI,因此 DM-GNN 的两个设计分支可以共同实现补丁之间复杂相关性的多视图建模。此外,DM-GNN 还能够通过引入亲和力引导的注意力重新校准模块作为读出函数,提高图构建过程中依赖信息的利用率。这种新颖的模块提高了针对特征扰动的鲁棒性,从而确保了更可靠和稳定的预测。对五个 TCGA 数据集进行的广泛基准测试实验表明,DM-GNN 优于其他最先进的方法,并基于高关注度斑块的形态描述提供可解释的预测见解。总体而言,DM-GNN 是根据组织病理学图像进行个性化癌症预后的强大辅助工具,并且具有帮助临床医生做出个性化治疗决策和改善患者结果的巨大潜力。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2024 Jun 25
XuefanDeng,XiaoranXu...
Anti-tumor therapy through high ROS performance induced by Ag nanoenzyme from boron cluster with halloysite clay nanotubes.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
传统的银纳米粒子(Ag NPs)具有高负载率和堆积现象,导致脱落导致生物毒性和催化效率低。这严重阻碍了它们在生物医学中的应用。在这里,我们通过结合埃洛石粘土纳米管(HNT)和十二氢十二硼酸盐(closo-[B12H12]2-)来改进高度分散的银纳米颗粒和银单原子(SA)的合成,以提高生物相容性并降低负载率。这种新型银单原子纳米酶与银纳米颗粒纳米酶一起避免了高温煅烧,同时通过 closo-[B12H12]2- 和 HNT 的还原性和配位稳定性保持了极高水平的银利用效率。通过理论计算和电子顺磁共振,我们证实HNT@B12H12@Ag纳米酶中的Ag SAzymes和Ag NPs都能够将H2O2分解为羟基自由基(·OH)。为了应用,我们在体外和体内研究了HNT@B12H12@Ag纳米酶在肿瘤细胞中的催化活性和抗肿瘤作用,并证实它通过·OH的生成有效抑制黑色素瘤的生长,且生物毒性有限。本研究提供了一种新颖的银纳米酶合成方法,增加了其临床应用的可能性。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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