研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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OBSTETRICS AND GYNECOLOGY
2024 Sep 26
DavidViveros-Carreño...
Survival After Simple Compared With Radical Hysterectomy for Patients With Early-Stage Cervical Cancer.
OBSTETRICS AND GYNECOLOGY
为了评估早期宫颈癌患者的单纯子宫切除术和淋巴结分期与根治性子宫切除术和淋巴结分期对总生存率的影响。我们对国家癌症数据库中诊断为早期宫颈癌的患者进行了一项回顾性队列研究。 2010年至2019年期间,直径为2厘米或更小(IA1期,通过IIA1,国际妇产科联合会分期,有淋巴管间隙侵犯)。经过1:1倾向评分匹配,我们比较了接受单纯子宫切除术和淋巴结分期的患者与接受根治性子宫切除术的患者。子宫切除术并进行淋巴结分期。用于匹配的变量包括年龄、肿瘤大小、种族和民族、淋巴管间隙侵犯、诊断年份、Charlson-Deyo 合并症评分、组织学和手术方法。主要结局是随访结束时的总生存率。次要结局包括30天再入院率以及30天和90天死亡率。总共有4,167名患者符合纳入标准,其中2,637名患者(63.3%)接受了根治性子宫切除术和淋巴结分期,1,530名患者(36.7%)接受了根治性子宫切除术和淋巴结分期。接受了简单的子宫切除术和淋巴结分期。经过倾向评分匹配后,每组均纳入 1,529 名患者。接受单纯子宫切除术的患者与接受根治性子宫切除术的患者的总生存率没有统计学差异(风险比1.25,95% CI,0.91-1.73,P=.17)。根据组织学、淋巴管间隙侵犯、肿瘤大小和手术方法进行的亚组分析并未显示不同子宫切除类型的总生存率存在统计学显着差异。子宫切除术组在 30 天再入院率(4.6% vs 4.2%,P=.73)、30 天死亡率(0.1% vs 0%,P=.14)或 90 天死亡率方面也没有显着差异。率(0.1% vs 0.1%,P=.93)。低风险宫颈癌患者可以接受较少的根治性手术,而不会对肿瘤结果产生负面影响。版权所有 © 2024 美国妇产科学院。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版。保留所有权利。
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OBSTETRICS AND GYNECOLOGY
2024 Oct 10
OhadRotenberg,Georgi...
Combining Ultrasonography and Endometrial Aspiration as a One-Stop Screening for Endometrial Neoplasia.
OBSTETRICS AND GYNECOLOGY
为了评估同步子宫内膜抽吸和子宫超声造影筛查 50 岁或以上女性子宫内膜癌或增生的效果。我们于 2014 年 2 月至 2020 年 10 月在一家大型城市学术医疗中心的超声科进行了一项前瞻性研究。该研究纳入了 1,635 名 50 岁或以上的女性,进行子宫内膜评估,随访至 2021 年 1 月。参与者接受了盐水输注宫腔超声造影结合超声引导子宫内膜抽吸术。测量的主要结果是筛查后一年内诊断出子宫内膜癌或增生。评估了联合评估方法的诊断准确性,包括敏感性、特异性、阳性预测值 (PPV) 和阴性预测值 (NPV)。 在完成研究方案的 1,170 名女性中,82 名 (7.0%) 患有子宫内膜癌,并且42 名(3.6%)患有子宫内膜增生。在随访期间发生癌症的所有患者中,85.5% 在评估后 1 年内被诊断出来。同时应用子宫内膜抽吸和子宫超声造影显示敏感性为 99.1%,特异性为 24.9%,PPV 为 11.8%,NPV 为 99.6%。使用理论序贯方法,假设仅在子宫超声检查确定为高风险的患者中进行子宫内膜抽吸,结果显示敏感性为 93.4%,特异性为 99.9%,PPV 为 99.0%,NPV 为 99.3%。同时子宫内膜抽吸和子宫超声造影是一种有效的一站式门诊筛查工具,用于检测 50 岁或以上女性的子宫内膜癌和增生。通过将两种筛查方式整合到一个程序中,同时进行子宫内膜抽吸和宫腔超声造影可以克服目前推荐的每种方法各自固有的局限性,有可能改善患者预后并简化诊断过程。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2024 Oct 16
WenCao,JiaxinHe,Jing...
miRNASNP-v4: a comprehensive database for miRNA-related SNPs across 17 species.
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
microRNA (miRNA) 内的单核苷酸多态性 (SNP) 及其靶结合位点可以影响 miRNA 的生物合成和靶标调控,从而参与多种疾病和生物过程。目前的 miRNA 相关 SNP 数据库通常仅限于物种或基于过时的数据。因此,我们通过更新数据、将物种从智人扩展到 17 个物种并引入一些新功能,将 miRNASNP 数据库更新到版本 4。在 miRNASNP-v4 中,鉴定了 17 个物种的 miRNA 中的 82 580 个 SNP 和 3'UTR 中的 24 836 179 个 SNP,并表征了它们对 miRNA 二级结构和靶标结合的潜在影响。此外,与上一个版本相比,miRNASNP-v4还包括以下改进:(i)对获得或丢失的miRNA靶基因进行基因富集分析; (ii) 鉴定与人类癌症中的药物反应和免疫浸润相关的 miRNA 相关 SNP; (iii) 纳入实验支持的免疫相关 miRNA,以及 (iv) 17 种动物物种的在线预测工具。凭借广泛的数据和用户友好的网络界面,miRNASNP-v4 将成为多个物种中 SNP 和 miRNA 功能研究的宝贵资源。该数据库可通过 http://gong_lab.hzau.edu.cn/miRNASNP/ 免费访问。© 作者 2024。由牛津大学出版社代表 Nucleic Acids Research 出版。
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NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2024 Oct 17
MarkJAWever,Francesc...
Structure-based discovery of first inhibitors targeting the helicase activity of human PIF1.
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
PIF1 是一种保守的解旋酶和 G4 DNA 结合和解旋酶,在基因组稳定性中发挥作用。人们对人类 PIF1 (hPIF1) 知之甚少,但在癌基因驱动的复制应激期间,其功能对于肿瘤细胞的生存至关重要。在这里,我们报告了通过 X 射线晶体片段筛选 (XChem) 发现的 hPIF1 DNA 结合和解旋抑制剂。获得了一种结构,其中 4-苯基噻唑-2-胺片段结合在解旋酶结构域 2A 和 2B 之间的口袋中,并与结构域 1A 的缬氨酸 258 额外接触。该化合物可产生特定的相互作用,特别是通过亮氨酸 548 和丙氨酸 551,限制结构域 2A 和 2B 之间的构象调整,而此前这些调整与 ATP 水解和 DNA 解旋有关。接下来,我们合成了一系列相关化合物,并在体外表征了它们对 hPIF1 DNA 结合和解旋酶活性的影响,扩展了围绕初始命中的结构活性关系 (SAR)。本文还对临床癌症数据库进行了系统分析,支持 hPIF1 上调可能代表特定癌细胞脆弱性的观点。研究表明,hPIF1 是一个易于处理的靶点,通过 4-苯基噻唑-2-胺衍生物作为其解旋酶作用的抑制剂,为创建一类新型抗癌疗法奠定了基础。© 作者 2024。出版者牛津大学出版社代表核酸研究。
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NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2024 Oct 18
HaochenLi,TianxingMa...
scTML: a pan-cancer single-cell landscape of multiple mutation types.
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
研究突变,包括单核苷酸变异 (SNV)、基因融合、选择性剪接和拷贝数变异 (CNV),是癌症研究的基础。最近的计算方法和生物学研究已经证明了从单细胞转录组数据中检测突变的可靠性和生物学意义。然而,缺乏包含所有类型癌症的全面突变信息的单细胞水平数据库。从大量新兴的单细胞转录组数据中建立单细胞突变景观可以为阐明肿瘤发生和进化机制提供关键资源。在这里,我们开发了 scTML (http://sctml.xglab.tech/),这是第一个提供多种突变类型的泛癌单细胞景观的数据库。它包括 SNV、插入/删除、基因融合、选择性剪接和 CNV,以及基因表达、细胞状态和其他表型信息。数据来自 74 个包含 2 582 633 个细胞的数据集,包括 35 个全长(Smart-seq2)转录组单细胞数据集(所有公开数据均带有原始测序文件)、来自 10X 技术的 23 个数据集和 16 个空间转录组数据集。 scTML 使用户能够交互式地探索跨肿瘤或细胞类型的多种突变景观,分析单细胞水平的突变表型关联并检测感兴趣的细胞亚群。 scTML 是一种重要资源,将显着促进破译肿瘤内和肿瘤间异质性,以及突变如何塑造细胞表型。© 作者 2024。由牛津大学出版社代表核酸研究出版。
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NMR IN BIOMEDICINE
2024 Sep 25
NichlasVousChristens...
Differentiating leukemia subtypes based on metabolic signatures using hyperpolarized 13C NMR.
NMR IN BIOMEDICINE
白血病是一组血癌,分为四大类。在这四个类别中,存在许多不同的亚型,它们具有相似的起源、基因突变和成熟水平,这使得它们难以区分。尽管它们有相似之处,但它们对治疗的反应可能不同,因此区分它们至关重要。紊乱的代谢表型(瓦尔堡效应)经常出现在癌细胞(包括白血病细胞)中,并且越来越成为改进诊断和治疗的目标。在本研究中,使用超极化 13C NMR 光谱来表征六种白血病细胞系 ML-1、CCRF-CEM、THP-1、MOLT-4、HL-60 和 K562 的代谢特征。这是使用[1-13C]丙酮酸和[1-13C]丙氨酸作为生物探针,对经过和未经2-脱氧-D-葡萄糖处理的培养细胞进行下游代谢物定量和动力学分析来完成的。类似白血病亚型的代谢特征可以很容易地区分。这包括ML-1和THP-1,它们属于相似的M4和M5 AML亚型,CCRF-CEM和MOLT-4,它们在不同成熟状态下属于相似的T-ALL谱系,以及HL-60和K562,它们属于密切相关的 M1 和 M2 AML 亚型。这里提供的数据证明了超极化 13C NMR 波谱作为区分相似起源的白血病亚型的方法的潜力。将此方法与生物反应器设置相结合可能会实现更好的白血病疾病管理,因为可以通过重复实验和干预从单次活检中获取代谢特征。© 2024 作者。约翰·威利 (John Wiley) 出版的《生物医学中的核磁共振》
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NMR IN BIOMEDICINE
2024 Oct 05
NehaYadav,AnkitMohan...
Fractal dimension and lacunarity measures of glioma subcomponents are discriminative of the grade of gliomas and IDH status.
NMR IN BIOMEDICINE
由于整个神经胶质瘤块及其子成分——增强区域(肿瘤的恶性部分)、非增强区域(侵袭性较小的肿瘤细胞)、坏死核心(死亡细胞)和水肿(水沉积)——是复杂且不规则的结构,因此-需要欧几里得几何度量,例如分形维数(FD或“分形”)和空隙度来量化其结构复杂性。分形性衡量结构不规则的程度,而空隙性衡量空间分布或间隙。神经胶质瘤亚成分的复杂几何图案可能与级别和分子景观密切相关。因此,我们测量了神经胶质瘤亚成分中的 FD 和腔隙性,并开发了机器学习模型来区分肿瘤分级和异柠檬酸脱氢酶 (IDH) 基因状态。使用从癌症基因组图谱 (TCGA) 和加州大学旧金山分校获得的术前结构 MRI 测量增强、非增强加坏死核心和水肿子成分的 3D 分形维数 (FD3D) 和腔隙性 (Lac3D)弥漫性神经胶质瘤 MRI (UCSF-PDGM) 神经胶质瘤队列。然后比较肿瘤亚成分的 FD3D 和 Lac3D 测量值(HGG:高级别神经胶质瘤与 LGG:低级别神经胶质瘤)和 IDH 状态(突变型与野生型)。利用这些措施,开发了区分神经胶质瘤级别和 IDH 状态的机器学习平台。 Kaplan-Meier 生存分析用于评估 FD3D 和 Lac3D 测量的预后意义。与 LGG 相比,HGG 在增强子组件中表现出显着更高的分形性和更低的空隙性,并且在非增强子组件中表现出更低的分形性。这表明增强子组件中高度不规则且复杂的几何形状是 HGG 的一个特征。 IDH 野生型和 IDH 突变型神经胶质瘤之间 FD3D 和 Lac3D 的比较显示,突变型神经胶质瘤在增强子成分中 FD3D 降低约 2.5 倍,在非增强子成分中 FD3D 较高,而 Lac3D 较低,这表明突变神经胶质瘤的复杂性较低,且在非增强子成分中具有较低的 Lac3D。 IDH 突变神经胶质瘤的特征是平滑增强子成分和更连续的非增强子成分。使用来自增强子组件和非增强子组件的 FD3D 的监督 ML 模型在区分神经胶质瘤等级 (~97.9%) 和 IDH 状态 (~94.4%) 方面表现出高灵敏度。使用 MR 图像对增强和非增强子成分进行组合分形估计可以作为区分神经胶质瘤分级和 IDH 状态的非侵入性、精确和定量测量。 2-羟基戊二酸-磁共振波谱 (2HG-MRS) 与 FD3D 和 Lac3D 定量相结合,可以作为神经胶质瘤亚型分型的可靠成像特征。© 2024 John Wiley
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NMR IN BIOMEDICINE
2024 Oct 10
ZahraShams,WybeJMvan...
31P multi-echo MRSI with low B1 + dual-band refocusing RF pulses.
NMR IN BIOMEDICINE
31P 磁共振波谱 (MRS) 可以对参与磷脂代谢的代谢物进行光谱解析,其水平在许多癌症中发生改变。超高场有助于检测磷酸单酯 (PME) 和磷酸二酯 (PDE),同时提高信噪比和光谱分辨率。利用多回波 MR 光谱成像 (MRSI) 进一步增强 SNR,并能够估计每个代谢物的 T2 信息。为了解决多回波磷成像中与高功率要求的绝热或复合块脉冲相关的比吸收率 (SAR) 挑战,我们提出了一种双频带重聚焦射频脉冲,设计用于在 14.8 μT 的 B1 幅度下运行,该脉冲具有整合到多回波序列中。在 7 Tesla 的大脑中进行的模型和体内实验验证了这种低功率双频射频脉冲的有效性。此外,我们将双频带 RF 脉冲实现到多回波 MRSI 序列中,与高功率绝热实现相比,它有可能在相同的采集时间内增加回波脉冲的数量,证明了其可行性和实用性。© 2024作者。约翰·威利 (John Wiley) 出版的《生物医学中的核磁共振》
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NEUROSURGERY
2024 Oct 01
MatthewCFindlay,SamT...
Predictors of Durable Remission After Successful Surgery for Cushing Disease: Results From the Multicenter RAPID Registry.
NEUROSURGERY
库欣病 (CD) 影响死亡率和生活质量,且长期缓解有限,强调需要更好地识别复发风险。经蝶手术后 CD 缓解的手术或影像学预测因素的确定产生了一些不一致的结果,并且受到单中心、单外科医生或荟萃分析研究的限制。我们试图评估美国垂体中心学术中心的垂体腺瘤及相关疾病 (RAPID) 多中心数据库,以评估是否可以阐明稳健的非激素复发预测因子。纳入了 2011 年至 2023 年接受治疗的 CD 患者。使用单变量和多变量分析评估有和没有复发的 CD 患者的围手术期和长期特征。在 26 名外科医生的 383 名 CD 患者中实现术后缓解,其中 288 名 (75.2%) 在最后一次随访时维持缓解,95 名 (24.8%) 维持缓解。 %) 显示复发(中位复发时间 9.99 ± 1.34 年)。复发患者术后住院时间较长(5 ± 3 vs 4 ± 2 天,P = .002),平均肿瘤体积较大(1.76 ± 2.53 cm 3 vs 0.49 ± 1.17 cm 3 ,P = .0001)等之前的治疗通常失败(31.1% vs 14.9%,P = .001),大部分是之前的手术。肿瘤复发的多变量风险预测模型发现,较年轻的年龄(优势比 [OR] = 0.95,P = .002)和 Knosp 0 级(OR = 0.09,参考 Knosp 4 级,P = .03)可以预防复发。 Knosp 0 至 2 级与 3 至 4 级的比较表明,较低的等级可降低复发风险(OR = 0.27,P = .04)。其他因素,如住院时间、外科医生经验、既往肿瘤治疗以及 Knosp 1、2 或 3 级,在多变量分析中未能达到统计显着性水平。这个多中心研究中心表明,复发的最强预测因素包括肿瘤大小/入侵和年龄。这种见解有助于患者咨询和预测。患者需要长期随访,小肿瘤的早期治疗可能会改善预后。版权所有 © 神经外科医生大会 2024。保留所有权利。
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NEUROSURGERY
2024 Sep 26
BrandonMWilkinson,Br...
Sarcopenia Predicts the Development of Early Adjacent Segment Disease After Transforaminal Lumbar Interbody Fusion.
NEUROSURGERY
预测腰椎融合后相邻节段疾病(ASD)的发展将有助于指导术前和术后治疗,以防止再次手术。我们试图评估肌肉减少症是否可以预测经椎间孔腰椎椎间融合术 (TLIF) 后早期 ASD 的发展。回顾性数据收集了 2013 年至 2023 年接受 TLIF 的 109 名患者。其中包括年龄超过 18 岁、接受择期后正中入路 TLIF 的患者。先前接受过腰椎器械融合、外伤、中枢神经系统感染、癌症或长结构胸腰椎畸形矫正的患者以及缺乏足够随访的患者被排除在外。主要结果是手术后 3 年内放射照相 ASD 的发展。腰肌体积测量是根据最近的术前 MRI 记录的。通过逻辑回归分析计算优势比。在 109 名接受选择性 TLIF 的患者中,22 名 (20.2%) 在 3 年内发展为自闭症谱系障碍 (ASD)。性别、体重指数和手术范围与 ASD 的发展无关。多变量分析显示左/右腰肌横截面积和腰肌:椎体比 (P:VBR) 预测早期 ASD (P < .0001)。肌肉减少症进一步分类为双侧 P:VBR ≥1 SD 低于性别平均值(T 得分 -1)。在 18 名肌肉减少症患者中,有 15 名出现早期 ASD (83.33%),而 91 名非肌肉减少症患者中则有 7 名 (7.69%;P < .0001)。术后骨盆倾斜度和腰椎前凸之间的不匹配在单变量分析中可预测 ASD (P = .0480),但在多变量分析中则不然。术后骨盆倾斜和腰椎前凸与早期 ASD 无关。通过腰肌面积减少和 P:VBR 测量的肌肉减少症可预测手术后 3 年内形成 ASD。腰大肌大小的形态测量分析是识别有患 ASD 风险的患者的简单工具。这些信息可能会指导术前和术后治疗,影响手术决策,并有效地为患者提供有关再次手术风险的建议。版权所有 © 神经外科医生大会 2024。保留所有权利。
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