Infinium DNA 甲基化 BeadChip 广泛用于群体规模的全基因组 DNA 甲基化分析。最近对 EPIC 版本 2 (EPICv2) 阵列中的探测内容和命名约定进行的更新使新数据与以前的 Infinium 阵列平台（例如 MmethylationEPIC (EPIC) 和 HumanMmethylation450 (HM450) BeadChip）的集成变得复杂。友好的工具，可协调不同 Infinium 平台上的探针 ID、甲基化水平和信号强度数据。它管理探针重复、缺失数据插补和特定于平台的偏差，以实现准确的数据转换。我们通过将基于 HM450 的癌症分类器应用于 EPICv2 癌症数据来验证该工具，实现了高精度。此外，我们成功地将 EPICv2 健康组织数据与传统 HM450 数据集成以进行组织身份分析，并在癌细胞中生成一致的拷贝数图谱。mLiftOver 在 R 中实现，可在 Bioconductor 包 SeSAMe（版本 1.21.13）中使用：https://bioconductor .org/packages/release/bioc/html/sesame.html。有关 EPIC 和 EPICv2 平台特定偏差和高置信度映射的分析，请访问 https://github.com/zhou-lab/InfiniumAnnotationV1/raw/main/Anno/EPICv2/EPICv2ToEPIC_conversion.tsv.gz。源代码可在 MIT 许可下在 https://github.com/zwdzwd/sesame/blob/devel/R/mLiftOver.R 上获取。补充数据可在 Bioinformatics online 上获取。© 作者 2024。出版者牛津大学出版社。

目前还没有适合决策和普遍使用的皮肤鳞状细胞癌（cSCC）分期系统。专家有无意识地将临床情况的异质性简化为几个相关组以推动他们的治疗决策。因此，我们使用专家对真实病例进行无监督聚类来生成 cSCC 的操作分类，这种方法在基底细胞癌中取得了成功。生成一致且可操作的 cSCC 分类。对 248 例被认为困难的 cSCC 病例进行无监督独立聚类-治疗。来自不同专业的 18 位国际专家将这些病例分类为他们认为对管理有用的同类集群，每个集群都可以自由选择集群标准。使用相似矩阵、K 均值方法和平均轮廓方法分析聚类之间的收敛和发散。使用数学模型来寻找最佳的共识聚类。派生分类的可操作性在 23 名新从业者身上得到了验证。尽管临床病例存在高度异质性，但仍观察到了数学共识。它最好的表示方式是分为五个集群，这似乎是后验描述不同的临床场景。新从业者和 18 名专家之间的病例分配具有良好的一致性（94%），这表明了这种分类的适用性。纳入了另一组易于治疗的鳞状细胞癌，最终分为六组：易于治疗/由于肿瘤和/或患者特征而治疗复杂/多发/局部晚期/区域疾病/内脏转移鉴于专家对病例进行无指导直观聚类的收敛性的方法，这种新的分类与临床实践相关。它不与分期系统竞争，但它们可以相互补充，无论目标是在肿瘤委员会中选择最佳治疗方法还是设计同质试验组。© 2024 作者。约翰·威利出版的欧洲皮肤病学和性病学会杂志

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肠道菌群与结直肠癌（CRC）发生、发展和治疗之间的相关性或因果关系的研究越来越受到重视。与此同时，结直肠癌的发病率和死亡率因个体和地区的不同而存在差异，肠道微生物群也存在差异。为了更好地了解CRC患者肠道菌群的特征以及不同地区之间的差异，我们首先使用16S比较了中国中部地区（湖北省）的25名CRC患者和26名健康对照者的肠道菌群rRNA高通量测序技术。结果显示，结直肠癌患者体内棒状杆菌、肠球菌、乳酸菌和埃希氏菌志贺菌显着富集。此外，我们还利用PICRUSt的功能预测分析比较了CRC组和健康对照组之间功能通路的潜在差异。然后，我们将其与来自中国不同地区（包括华中、华东和东北）的五项队列研究进行了分析和比较。我们发现地理因素可能影响结直肠癌患者肠道微生物群的组成。肠道微生物群的组成是影响结直肠癌筛查、早期检测和预测结直肠癌治疗结果的重要信息。这强调了在中国不同地区开展结直肠癌相关肠道微生物群研究的重要性。版权所有 © 2024 Shi、Shen、Huang、Zhan、Chen、Zhou、Lv、Xiong、Jiang、Chen 和 Liu。

木犀草素 (LUT) 是一种天然存在的黄酮类化合物，存在于蔬菜、水果和草药中，其药理活性已被广泛研究，包括对各种癌细胞系的抗增殖和抗癌作用。它还表现出有效的抗氧化特性和针对人类癌症的促凋亡活性。然而，其治疗潜力因其在水中的溶解度差（45°C 下为 5 μg/ml）和生物利用度低而受到阻碍。这项开发木犀草素纳米载体的研究旨在克服这些局限性，从而为癌症治疗开辟新的可能性。本文涵盖了几种旨在提高 LUT 溶解度和生物利用度的纳米制剂。影响木犀草素溶解度和生物利用度的纳米制剂的理化特性已成为更深入研究的主题。此外，它还研究了 LUT 的抗炎和抗氧化特性如何帮助减轻化疗的副作用。大多数纳米制剂，包括植物体、脂质纳米颗粒、脂质体、蛋白质纳米颗粒、聚合物胶束、纳米乳液和金属纳米颗粒，在改善LUT 的溶解度和生物利用度。这是增强 LUT 在癌症治疗中的治疗潜力方面向前迈出的重要一步。此外，研究发现LUT清除自由基的能力可以显着减少癌症治疗的副作用，进一步凸显其改善患者治疗效果的潜力。纳米制剂由于其独特的表面和理化特性，提高了LUT的溶解度和生物利用度。然而，为了在肿瘤学中实现 LUT 的良好临床表现，需要解决纳米制剂较差的体外和体内相关性和可扩展性问题。版权所有 © Bentham Science Publishers；如有任何疑问，请发送电子邮件至 epub@benthamscience.net。

阿霉素是常见的化疗药物，已用于治疗各种类型的恶性肿瘤，包括治疗软组织和骨肉瘤以及乳腺癌、卵巢、膀胱和甲状腺等重要器官的癌症。它也用于治疗白血病和淋巴瘤，然而，这是一个障碍，因为它们具有显着的副作用，包括心脏毒性和肺纤维化，我们的目标是确定 CoQ10 作为抗氧化剂在阻止阿霉素对组织的有害影响方面的作用退化效应。为此，27 只大鼠被分为 3 组，每组 9 只； CoQ10暴露组、阿霉素暴露组和CoQ10加阿霉素组。研究结束时，处死动物，收获肺和心脏，并制备载玻片用于显微镜下检查。结果表明，阿霉素诱导异常的细胞结构，导致肺和心脏的细胞结构受损，而辅酶Q10则阻止这些损害作用并几乎恢复正常的组织结构。因此，CoQ10 将维持肺和心脏的正常组织。

本研究涉及一种称为根皮素的多酚化合物。根皮素 (Ph) 是一种二氢查尔酮，对伊拉克苹果（苹果）“Ibrahimi”的不同地上部分（包括叶、叶柄、茎、果肉和果皮提取物）进行定性和定量测定。叶子是 Ph 的丰富来源，可通过制备型 HPLC 进行分离和纯化。使用各种分析表征技术确认了分离的根皮素 (Ph2) 的化学结构：TLC、HPLC、FTIR、熔点、CHN 元素分析、1H-NMR 和 13C-NMR。采用DPPH测定法测定Ph2的清除效力。通过 MTT 测定评估对癌细胞系的细胞毒性作用，包括（Hep G2/人肝细胞癌、A549/人肺腺癌、SW480/人结肠癌细胞和 AGS/胃腺癌），以及非癌细胞系（赫克293）。从 18.146 克苹果叶中获得约 1.404 克 Ph2（7.7%）。 DPPH和MTT测定结果表明，纯化的Ph2具有有效的抗氧化活性，对所有癌细胞系均具有显着的抗癌作用。数据表明，从伊拉克苹果叶中纯化的Ph2具有潜在的抗氧化、细胞毒性，可能有益于人类健康。