胃肠道 (GI) 癌症很常见，在转移情况下，它们的预后很差。目前胃肠道癌症的主要治疗方法是化疗。然而，生物标志物导向的治疗格局正在不断发展。 HER-2 在部分胃肠道癌症中过度表达，是一个新兴的治疗靶点，最近 FDA 批准了曲妥珠单抗 deruxtecan（与肿瘤无关）。胃肠道癌症中 HER-2 表达的检测尚未标准化，随着 HER-2 靶向治疗进入治疗领域，方法需要进一步优化和标准化。在转移性胃癌的一线治疗中使用 HER-2 靶向治疗的基本原理已明确，并且不断出现的证据对胆管癌、胰腺癌和结直肠癌具有不同的益处。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。

空间转录组数据在癌症研究中发挥着至关重要的作用，提供了对肿瘤组织内基因表达的空间组织的细致了解。揭示基因表达的空间动态可以揭示肿瘤异质性的关键见解，并有助于识别潜在的治疗靶点。然而，在许多大规模癌症研究中，空间转录组学数据有限，批量 RNA-seq 和相应的全切片图像 (WSI) 数据更为常见（例如 TCGA 项目）。为了解决这一差距，迫切需要开发能够根据现有 WSI 和批量 RNA-seq 数据以近细胞（点）水平分辨率估计基因表达的方法。这种方法对于重新分析广泛的队列研究和发现在初始评估中被忽视的新生物标志物至关重要。在这项研究中，我们提出了 STGAT（空间转录组图注意网络），这是一种利用图注意网络（GAT）来辨别点之间的空间依赖性的新方法。 STGAT 基于空间转录组数据进行训练，旨在以点级分辨率估计基因表达谱，并预测每个点是否代表肿瘤组织或非肿瘤组织，特别是在仅可获得 WSI 和批量 RNA-seq 数据的患者样本中。对两个乳腺癌空间转录组数据集的综合测试表明，STGAT 在准确预测基因表达方面优于现有方法。使用 TCGA 乳腺癌数据集进行的进一步分析表明，从仅肿瘤点估计的基因表达（由 STGAT 预测）为乳腺癌亚型和肿瘤分期预测提供了更准确的分子特征，并且还可以提高患者的生存率和无病生存率分析。可用性：代码可在 https://github.com/compbiolabucf/STGAT 获取。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。

嵌合抗原受体 T 细胞 (CAR-T) 疗法通过靶向 CD19 在治疗晚期 B 细胞恶性肿瘤方面显示出显着疗效，但抗原阴性复发和鼠源抗体引发的免疫反应仍然是重大挑战，因此需要开发新型人源化疗法多靶点 CAR-T 疗法。在这里，我们设计了第二代基于 4-1BB-CD3ze 的 CAR 构建体，其中包含人源化 CD19 单链可变片段 (scFv) 和重链 (VHH) 上的 BAFFR 单变量结构域（也称为纳米抗体）。由此产生的具有不同结构的 CAR-T 细胞在体外和体内进行了功能比较。我们发现，最佳的串联和双顺反子（BI）结构保留了各自的抗原结合能力，并且在靶细胞刺激时均表现出特异性激活。同时，BI CAR-T细胞（BI CAR）比单靶点CAR-T细胞表现出更强的肿瘤杀伤能力以及更好的白细胞介素2和肿瘤坏死因子-α分泌能力。此外，BI CAR 在重复抗原刺激后表现出较少的耗竭表型，并在小鼠异种移植模型中表现出更有效和持久的抗肿瘤作用。总体而言，我们开发了一种基于 scFv 和 VHH 组合的新型人源化 CD19/BAFFR 双顺反子 CAR (BI CAR)，其在体外和体内均显示出有效且持续的抗肿瘤能力，包括针对具有 CD19 或 BAFFR 缺陷的肿瘤。© 2024英国血液学会和约翰·威利

目前针对主动监测 (AS) 下的前列腺癌患者的风险分层工具可能不足以识别需要治疗的患者。我们研究了 DNA 倍体和 PTEN 作为预测 AS 患者侵袭性疾病的潜在生物标志物。我们通过图像细胞术评估了 DNA 倍体，并通过免疫组织化学评估了挪威当地医院 558 名 AS 患者的 3197 个含肿瘤组织块中的 DNA 倍体和 PTEN 蛋白表达。主要终点是治疗，治疗失败（生化复发或开始挽救治疗）作为次要终点。在单变量和多变量分析中，诊断时的组合 DNA 倍体和 PTEN (DPP) 状态与无治疗生存期相关， DPP 异常与 DPP 正常肿瘤的 HR 分别为 2.12 (p< 0.0001) 和 1.94 (p< 0.0001)。 DNA 倍体和 PTEN 状态与前列腺癌风险评估 (CAPRA) 评分的整合改善了风险分层（c 指数差异 = 0.025；p = 0.0033）。在接受治疗的患者中，患有 DPP 异常肿瘤的患者表现出治疗失败的可能性显着较高（HR 2.01；p = 0.027）。DNA 倍体和 PTEN 可以作为额外的生物标志物来识别 AS 患者发生侵袭性疾病的风险增加，从而使对最终将接受当前方案治疗的近 50% 的患者进行早期干预。© 2024。作者。

我们研究了临床因素与活检格里森分级组 (GGG) 患者根治性前列腺切除术后未取样高危前列腺癌 (PC) 的存在以及 PC 特异性死亡率 (PCSM) 和全因死亡率 (ACM) 之间的关系。 ) 1 PC。研究人群包括 10228 名接受 GGG1 PC 治疗的患者，这些患者通过经直肠超声 (TRUS) 引导的系统活检 (SBx；n = 9248) 或联合活检 (CBx；SBx TRUS/磁共振图像 [MRI] 融合活检；n = 9248) 进行诊断； n = 980）来自德国汉堡一所大学医院的队列研究。我们使用logistic、Fine and Grays和Cox多变量回归方法来计算不良病理的调整优势比（aOR）和早期前列腺特异性抗原（PSA）失败（≤18个月）、PCSM、和与每个临床因素相关的 ACM。无论采用何种活检方法，活检阳性百分比 (PPB) > 50% 和 PSA > 20 ng/ml 与较高的不良病理风险显着相关（SBx：aOR 1.71 和 3.49；CBx：aOR分别为 1.81 和 2.82）和早期 PSA 失败（SBx：aHR 分别为 1.54 和 4.37；CBx：aHR 分别为 2.88 和 7.81）。在 SBx 组中，PPB > 50% 和 PSA > 20 ng/ml 也与 PCSM（aHR 2.56 和 3.71）和 ACM（aHR 1.47 和 2.00）的较高风险相关（所有 p ≤ 0.04）。该研究受到单机构队列设计的限制。对 GGG1 且 PPB > 50% 或 PSA > 20 ng/ml 的患者维持“癌症”分类，并考虑重新活检以识别未采样的高级疾病，可以最大限度地降低癌症风险对于接受非靶向前列腺活检的患者，大约十二分之一的活检结果为 1 级前列腺癌的患者可能患有比结果显示的更具侵袭性的癌症。非常高的 PSA（前列腺特异性抗原）水平 (>20 ng/ml) 或超过 50% 的活检样本中存在 1 级癌症，可以识别处于危险中的患者。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。

人附睾蛋白 4 (HE4) 是卵巢癌的诊断生物标志物，对于监测疾病的早期阶段至关重要。因此，开发简单、廉价且用户友好的生物传感器来进行灵敏和定量的 HE4 检测非常重要。在此，制备了一种基于普鲁士蓝（PB）作为信号指示剂和功能化金属有机框架纳米复合材料作为高效信号放大器的新型夹心型电化学免疫传感器，用于HE4的定量分析。原则上，科琴黑（KB）和TiMOF修饰的AuNPs（TiMOF-KB@AuNPs）可以加速电极表面的电子转移，并通过交联作为固定抗体的基质，从而提高测定灵敏度。与标记抗体共价结合的 PB 赋予生物传感器强烈的电化学信号。此外，通过监测PB的电活性可以间接检测HE4的浓度。受益于 PB 和 MOF 纳米复合材料的高信号放大能力，该策略表现出较宽的线性范围 (0.1-80 ng mL-1) 和较低的检测限 (0.02 ng mL-1)。因此，这项研究展示了在临床卵巢癌诊断和治疗中的巨大应用前景，并为检测其他癌症生物标志物提供了新的平台。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。

在医学诊断中，仅依靠一种生物标志物不足以准确识别癌症。基于血液的多种癌症早期检测可以帮助从单一血液样本中识别出不止一种类型的癌症。在这项研究中，开发了一种基于三种不同颜色的量子点（QD）与链霉亲和素缀合的超分辨率多光谱成像纳米免疫传感器（srMINI），用于在单分子水平上同时筛查血液中的各种癌症生物标志物。实验中，srMINI芯片用于同时检测三种关键的癌症生物标志物：癌胚抗原（CEA）、C反应蛋白（CRP）和甲胎蛋白（AFP）。由于不存在来自底物的干扰信号，srMINI 芯片对这些癌症生物标志物的检测灵敏度比商业酶联免疫吸附测定试剂盒高 108 倍，为 0.18-0.5 ag/mL (1.1-2.6 zM)，这为多重检测奠定了巨大的潜力检测血液中的癌症生物标志物。因此，使用所开发的具有高诊断精度和准确性的srMINI芯片同时检测各种癌症生物标志物，有望作为单分子生物传感器在早期诊断或社区筛查中发挥决定性作用。

先进的 3D 高分辨率成像技术对于研究生物挑战至关重要，例如完整组织中的神经回路分析和肿瘤微环境。然而，澄清或扩增的生物样品中内源荧光蛋白发出的荧光信号随着重复照射和长时间成像而逐渐减弱，从而损害了其准确描述潜在科学问题的能力。我们开发了一种策略，可以在长时间的高分辨率三维成像过程中保留透明和扩展的组织样本中的荧光。我们评估了不同浓度的各种化合物，以确定它们增强荧光强度和抗光漂白性同时保持组织结构完整性的能力。具体来说，我们研究了 EDTP 利用对 GFP 的影响，因为已观察到它可以显着提高荧光强度、抗光漂白性，并在长期室温储存期间保持荧光。这一突破将促进扩展亲水性和基于水凝胶的透明和扩张方法，通过有效保护组织内的荧光蛋白来实现透明生物组织的长期高分辨率 3D 成像。© 2024。作者。

通过海绵体内注射间充质干细胞（MSC）是治疗糖尿病引起的勃起功能障碍（DMED）的潜在治疗方法。然而，肺栓塞和致瘤性是致命的不良事件，限制了MSC的临床应用。在这项研究中，我们检查了 MSC 衍生的细胞外囊泡 (MSC-EV) 的治疗功效和潜在机制。在这项研究中，使用了 40 只 8 周龄的雄性 SpragueDawley (SD) 大鼠。对照组10只大鼠腹腔注射PBS。其余大鼠腹腔注射STZ（60mg/kg）建立糖尿病（DM）模型。随后将糖尿病大鼠随机分为三组：DM组（海绵体内注射PBS）、EVs组（海绵体内注射MSC-EVs）、EVs-200a组（海绵体内注射miR-200a-3p） -丰富的细胞外囊泡）。通过实时测量海绵体内压力并利用海绵体神经的电刺激来确定勃起功能。通过使用免疫荧光染色、马森三色染色和安乐死后蛋白质印迹对阴茎组织进行研究来评估平滑肌含量。通过 ELISA 测量海绵体中的超氧化物歧化酶 (SOD)、丙二醛 (MDA) 和谷胱甘肽 (GSH) 水平。在体外，过氧化氢（H2O2）用于诱导氧化应激。使用 CCK8 测定法测量有或没有 H2O2 孵育的海绵体平滑肌细胞 (ccSMC) 的活力。使用流式细胞术评估 ccSMC 中的活性氧 (ROS) 水平和细胞凋亡。此外，进行双荧光素酶报告基因测定以验证 miR-200a-3p 和 Keap1 之间的关系。在 EVs 组中观察到勃起功能的逆转，尤其是在 EVs-200a 组中。 DM 增加了 MDA 水平，降低了 SOD 和 GSH 水平。 DM组中α平滑肌肌动蛋白（α-SMA）和平滑肌22α（SM22α）的表达减少，骨桥蛋白（OPN）的表达增加。蛋白质印迹显示海绵体组织中 Nrf2、HO-1 和 Bcl2 表达减少，Keap1、Bax 和 cleaved caspase3 表达增加。富含miR-200a-3p的细胞外囊泡（EVs-200a）逆转了这些变化并抑制平滑肌含量的损失和海绵体纤维化。在体外，H2O2 诱导 ccSMC 中高 ROS 水平并增加细胞凋亡，而这些效应可被 EVs-200a 逆转。 H2O2 降低了 Nrf2、HO-1 和 Bcl2 的表达，并增加了 Keap1、Bax 和 cleaved caspase-3 的表达，这些效应被 MSC-EVs（尤其是 EVs-200a）逆转。双荧光素酶报告基因检测结果表明，miR-200a-3p以阴性方式直接靶向Keap1。MSC-EVs，尤其是EVs-200a，通过调节表型转换、细胞凋亡和纤维化来减轻糖尿病大鼠的勃起功能障碍。从机制上讲，miR-200a-3p 靶向 Keap1/Nrf2 通路以减轻糖尿病大鼠的氧化应激。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier Masson SAS 出版。保留所有权利。

研究人员探讨了 BA.5 感染后灭活疫苗接种所产生的特异性体液免疫反应，以及 BA.5 感染恢复的鼻咽癌 (BA.5-RNPC) 患者中 XBB 变体再次感染的预测因子。 血清 SARS-CoV-使用酶联免疫吸附测定法评估2种特异性抗体水平。进行单变量和多变量二元 Logistic 回归分析，以确定与特异性体液免疫程度和 XBB 变体再次感染易感性相关的因素。我们的数据表明，BA.5-RNPC 之间的 SARS-CoV-2 特异性抗体水平相当患者和 BA.5 感染恢复的非癌性 (BA.5-RNC) 个体。具体而言，抗祖先-S1-IgG、抗祖先核衣壳蛋白(NP)-IgG、抗-BA.5-受体结合域(RBD)-IgG和抗-XBB.1.1.6-RBD的血清水平与先前未感染的患者相比，BA.5-RNPC 患者的 -IgG 较高。与未接种疫苗的 BA.5-RNPC 患者相比，接受灭活疫苗接种的个体表现出显着更高水平的抗祖先-S1-IgG 和抗-XBB.1.16-RBD-IgG。多变量逻辑回归分析显示，灭活疫苗接种是所有测试的 SARS-CoV-2 特异性抗体反应的最重要预测因素。后续分析表明，低球蛋白水平是 BA.5-RNPC 患者 XBB 再次感染的独立危险因素。接种疫苗的 BA.5-RNPC 患者中 SARS-CoV-2 特异性抗体有所改善。然而，基线免疫状态生物标志物 IgG 是 BA.5-RNPC 患者 XBB 变异再感染风险的指标。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。