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IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics
2024 Jul 03

ZiweiHu,JianchaoWang...
Weakly Supervised Classification for Nasopharyngeal Carcinoma with Transformer in Whole Slide Images.
IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics
鼻咽癌的病理检查是诊断、指导临床治疗和判断预后不可缺少的因素。传统且完全监督的 NPC 诊断算法需要在数十亿像素的整个幻灯片图像 (WSI) 上手动描绘感兴趣区域,然而,这是费力且经常存在偏差的。在本文中,我们提出了一种基于 Tokens-to-Token Vision Transformer (WS-T2T-ViT) 的弱监督框架,用于仅使用滑动级标签进行准确的 NPC 分类。平铺图像的标签继承自其幻灯片级别标签。具体来说,WS-T2T-ViT由多分辨率金字塔、T2T-ViT和多尺度注意力模块组成。多分辨率金字塔旨在模仿手动病理分析从粗到细的过程,以学习不同放大级别的特征。 T2T模块捕获局部和全局特征以克服全局信息的缺乏。多尺度注意力模块通过加权不同粒度级别的贡献来提高分类性能。在 802 名患者的 NPC 和 CAMELYON16 数据集上进行了广泛的实验。 WS-T2T-ViT 在 NPC 数据集上实现 NPC 分类的受试者工作特征曲线 (AUC) 下面积为 0.989。 CAMELYON16数据集的实验结果证明了WS-T2T-ViT在WSI级别分类中的鲁棒性和泛化性。
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IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics
2024 Jul 03

ChenchuXu,ShijieTian...
Common-Unique Decomposition Driven Diffusion Model for Contrast-Enhanced Liver MR Images Multi-Phase Interconversion.
IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics
所有三个造影增强 (CE) 时相(例如动脉期、门静脉期和延迟期)对于诊断肝脏肿瘤至关重要。然而,由于造影剂 (CA) 风险、成像时间长和严格的成像标准,获取所有三个阶段受到限制。在本文中,我们提出了一种新颖的通用唯一分解驱动扩散模型(CUDD-DM),能够将三个阶段中的任意两个输入阶段转换为剩余一个阶段,从而减少患者等待时间,节省医疗资源,并减少使用CA 的数量。 1)公共-独特特征分解模块,通过利用谱分解来捕获不同输入之间的共同特征和独特特征,不仅学习两个输入相位之间高度相似区域的相关性,而且还学习不同区域的差异,从而为剩余相的合成。 2)多尺度时间重置门模块,通过双向比较当前切片和多个历史切片中的病变,在没有病变时最大化对先前切片的依赖,并在存在病变时最小化这种依赖,从而防止连续切片之间的干扰。 3)扩散模型驱动的病变细节合成模块,通过采用连续渐进的生成过程,准确捕获数据分布之间的细节特征,从而避免传统方法(例如GAN)过度关注全局分布而导致的细节丢失。对广义 CE 肝脏肿瘤数据集的大量实验表明,我们的 CUDD-DM 实现了最先进的性能(与七种领先方法相比,SSIM 提高了至少 2.2%(病变面积 5.3%))。这些结果表明,CUDD-DM 推进了 CE 肝脏肿瘤成像技术。
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Immunity & Ageing
2024 Jul 03

WinsonCai,KentoTanak...
Augmenting CAR T Cell Functions with LIGHT.
Immunity & Ageing
嵌合抗原受体 (CAR) T 细胞疗法在治疗 B 细胞恶性肿瘤方面取得了显着的临床成功。然而,其在实体瘤中的临床疗效有限,主要受到靶抗原异质性的限制。为了克服抗原异质性,我们开发了过度表达 LIGHT 的 CAR T 细胞,LIGHT 是癌细胞上 LTβR 和免疫细胞上 HVEM 的配体。表达 LIGHT 的 CAR T 细胞表现出由 CAR 介导的抗原导向的细胞毒性,以及通过 LIGHT 与癌细胞上的 LTβR 相互作用介导的抗原非依赖性杀伤作用。此外,表达 LIGHT 的 CAR T 细胞具有免疫刺激特性,可以改善细胞的增殖和细胞溶解特性。这些数据表明表达 LIGHT 的 CAR T 细胞可能提供一种消除抗原阴性肿瘤细胞以防止抗原阴性疾病复发的方法。
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Immunity & Ageing
2024 Jul

AllenBTu,GaddamKrish...
Harnessing Immunomodulatory Polymers for Treatment of Autoimmunity, Allergy, and Transplant Rejection.
Immunity & Ageing
自身免疫、过敏和移植排斥是目前无法治愈的一系列慢性疾病,大大降低了患者的生活质量,并消耗了大量的医疗资源。这些疾病的根本原因是免疫系统失调,导致针对自身或无害抗原的炎症反应加剧。因此,患病患者需要终生坚持多种免疫调节药物的治疗方案,以控制疾病并恢复能力。不幸的是,当前的免疫调节药物与多种副作用和不良事件相关,例如癌症风险增加和严重感染风险增加,这对患者的依从率和生活质量产生负面影响。免疫工程领域是一门新学科,旨在利用基于生物材料的新型策略,利用内源性生物途径来阻止疾病并最大限度地减少副作用。我们重点介绍并讨论具有固有免疫调节特性的聚合物微/纳米颗粒,目前正在研究基于生物材料的疗法,用于治疗自身免疫、过敏和移植排斥。
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Immunity & Ageing
2024 Jun 26

NaNiu,NataliaBuza,Pe...
Mixed Gestational Trophoblastic Tumors-Challenging Clinicopathological Presentations.
Immunity & Ageing
混合性妊娠滋养细胞肿瘤极为罕见,且临床病理表现各异。我们报告了 3 种此类肿瘤,其中包括绒毛膜癌 (CC)、胎盘部位滋养细胞肿瘤 (PSTT) 和上皮样滋养细胞肿瘤 (ETT)。患者年龄从38岁到44岁不等。最初诊断时未考虑混合性滋养细胞肿瘤,所有 3 个肿瘤均通过 DNA 基因分型证明为妊娠起源。 1 号患者的血清人绒毛膜促性腺激素 (hCG) 为 97 mIU/mL,宫颈肿块大小为 5.6 厘米,活检结果最初被解释为 PSTT。子宫切除术显示混合性 PSTT (60%) 和 ETT (40%),仅包含 ETT 成分的宫外转移。多药化疗后 15 个月,肿瘤复发,程序性死亡配体 1 检测呈阳性。患者接受免疫检查点抑制剂治疗,24 个月后保持无病状态。 2 号患者出现阴道出血,血清 hCG 为 46,458 mIU/mL。子宫内膜活检被解释为CC。基于甲氨蝶呤的化疗后,子宫和肺部出现复发。经会诊审查,最终诊断出混合性CC和ETT。 3 号患者出现完全性葡萄胎,血清 hCG 为 744,828 mIU/mL。甲氨蝶呤、放线菌素 D 治疗三个月后,发现子宫肿块。子宫切除术显示混合 CC 和 PSTT。总之,混合滋养细胞肿瘤的罕见性、难以捉摸的表现和广泛的组织学特征使得其诊断极具挑战性。临床治疗和预后取决于肿瘤的每个组成部分。当患者血清 hCG 水平较高时,必须考虑 CC 成分。版权所有 © 2024,国际妇科病理学家协会所有。
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Immunity & Ageing
2024 Jul 03

JoanaMatosRodrigues,...
CD163+ macrophages in mantle cell lymphoma induce activation of pro-survival pathways and immune suppression.
Immunity & Ageing
套细胞淋巴瘤 (MCL) 依赖于支持性肿瘤免疫微环境 (TIME),其中 CD163 巨噬细胞的浸润会对预后产生负面影响。本研究探讨了 CD163 细胞的丰度和空间定位与 MCL TIME 生物学的关系。这是通过分别对肿瘤和浸润性 CD163 和 CD3 细胞进行空间多组学研究来实现的。我们分析了 100 名患者的诊断性 MCL 组织。通过 GeoMx® 组织微阵列数字空间分析测量了 63 种蛋白质。在肿瘤丰富和肿瘤稀疏的组织区域中选择感兴趣区域(ROI)。对 CD163 巨噬细胞片段、CD20 MCL 肿瘤细胞片段和 CD3 T 细胞片段进行了分子分析。为了验证蛋白质谱,在 CD20 细胞和两个 T 细胞亚群中测量了 1811 个 mRNA。使用图像分析来提取每个目标细胞的表型和位置,从而可以探索细胞频率和细胞邻域。蛋白质组学研究表明,CD163 细胞根据定位调节其免疫特征,并且免疫抑制分子 VISTA 和 B7-H3 在肿瘤稀疏的组织区域与肿瘤丰富的组织区域相比具有更高的表达,因此应该探索靶向作用。我们发现 CD163 细胞浸润更丰富的 MCL 组织具有更高的丝裂原激活蛋白激酶 (MAPK) 途径关键成分的表达,这一点通过互补 mRNA 分析得到了验证。因此,MAPK通路可能是CD163细胞浸润的MCL患者的可行治疗靶点。我们进一步展示了 CD11c 和 CD163 在既定风险因素之外的独立和综合预后价值。版权所有 © 2024 美国血液学会。
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Bone & Joint Journal
2024 Jul 03

YixinBian,KexinZhao,...
A Se Nanoparticle/MgFe-LDH Composite Nanosheet as a Multifunctional Platform for Osteosarcoma Eradication, Antibacterial and Bone Reconstruction.
Bone & Joint Journal
尽管骨肉瘤的治疗取得了进展,但术后肿瘤复发、假体周围感染和严重骨缺损仍然是严重问题。据报道,硒纳米颗粒(SeNP)在MgFe-LDH纳米片(LDH)上的生长可开发出多功能纳米复合材料(LDH/Se),并在生物活性玻璃支架(BGS)上进一步修饰纳米复合材料以获得多功能平台。 BGS@LDH/Se) 用于术后骨肉瘤的综合管理。带负电荷的SeNPs在LDH表面的均匀分散抑制了毒性诱导的聚集和失活,从而增强了超氧化物歧化酶(SOD)的激活和超氧阴离子自由基(·O2 -)-H2O2的转化。同时,LDH纳米片中的Fe3可以通过消耗肿瘤微环境(TME)中的谷胱甘肽(GSH)而被还原为Fe2,从而可以催化H2O2生成剧毒的活性氧。更重要的是,掺入 SeNPs 显着促进了 BGS@LDH/Se 的抗菌和成骨特性。因此,所开发的BGS@LDH/Se平台可以同时抑制肿瘤复发和假体周围感染,并促进骨再生,从而为需要骨肉瘤切除和支架植入的患者提供术后“一站式”管理的巨大潜力。© 2024 作者。 《Advanced Science》由 Wiley‐VCH GmbH 出版。
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Bone & Joint Journal
2024 Jul 03

RHuzaifaSharafat,Aam...
Ectonucleotidase inhibitors: targeting signaling pathways for therapeutic advancement-an in-depth review.
Bone & Joint Journal
外切核苷酸酶抑制剂是一类药理学药物,通过选择性地靶向外切核苷酸酶,对于改变嘌呤能信号通路至关重要。胞外核苷酸和核苷的水解是由这些酶进行的,其中包括外核苷三磷酸二磷酸水解酶(NTPDases)和外切5'-核苷酸酶(CD73)。外核苷酸酶抑制剂可以通过阻断这些酶并减少细胞外腺苷来阻止 ATP 和 ADP 转化为腺苷。这些分子对于嘌呤能信号传导至关重要,嘌呤能信号传导与生理和病理过程的变异性相关。通过改变细胞外核苷酸代谢和改善嘌呤能信号调节,外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶 (ENPP) 抑制剂有可能改善癌症治疗、炎症管理和免疫反应调节。嘌呤能信号传导受到 CD73 抑制剂的影响,因为它们阻止 AMP 转化为腺苷。这些抑制剂可用于癌症治疗和免疫治疗,因为它们可以提高化疗效果并改变免疫反应。嘌呤能信号传导由 NTPDase 抑制剂控制,该抑制剂专门针对参与细胞外核苷酸分解的酶。这些抑制剂有望减少免疫反应、血栓形成和炎症,或许有助于治疗心血管和自身免疫性疾病。碱性磷酸酶 (ALP) 抑制剂会改变参与去磷酸化反应的酶的功能,从而影响多种生物过程。通过改变体内的磷酸盐水平,这些抑制剂可用于治疗包括高磷血症和某些骨骼问题在内的疾病。本文通过阐明外核苷酸酶抑制剂的治疗过程、优点和困难,为希望在各种疾病情况下利用核酸外切核苷酸酶抑制剂的治疗能力的研究人员和临床医生提供了指南。© 2024。作者获得 Springer Nature B.V. 的独家许可。
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Bone & Joint Journal
2024 Jul 03

FaseelaBeegum,Akshay...
Traversing the Terrain: Potential Pitfalls within the AJCC 8th Edition Staging System for Lip and Oral Cavity Cancers.
Bone & Joint Journal
1977年,美国癌症联合委员会(AJCC)推出了首部癌症分期手册,实施了T(肿瘤范围)、N(区域淋巴结状态)和M(是否存在远处转移)分期系统。这种系统方法旨在传达各种癌症类型的疾病程度,为临床医生提供一个实用的框架来规划治疗策略、预测预后和评估结果。自 2018 年 1 月 1 日起生效的第 8 版 AJCC 延续了这一传统。然而,根据临床经验发现,AJCC 第 8 版仍然存在某些缺陷。具体而言,准确评估口腔鳞状细胞癌(例如口腔疣状癌、爪形癌和乳头状鳞状细胞癌)和小唾液腺肿瘤的独特组织学变异的浸润深度面临挑战。此外,对骨侵犯模式的认知和报告实践也存在差异。还需要恶性牙源性肿瘤和口腔多灶性肿瘤的分期指南,并辅以图示。最后,需要制定耳癌、外耳道癌和颞骨癌的综合分期标准。我们主张将这些考虑因素纳入 AJCC 癌症分期手册的未来版本中。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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Cell Reports
2024 Jul 02

HaoChen,ChangqingJin...
Molecular characterization and clinical relevance of metabolic signature subtypes in gastric cancer.
Cell Reports
代谢重编程决定了肿瘤分子属性和治疗潜力。然而,胃癌(GC)的综合代谢特征仍不清楚。在此,基于代谢特征的聚类分析确定了具有不同分子和临床特征的三种亚型:MSC1 显示出更好的预后以及三羧酸 (TCA) 循环和脂质代谢的上调,以及频繁的 TP53 和 RHOA 突变; MSC2 预后中等,核苷酸和氨基酸代谢升高,肠道组织学和错配修复缺陷 (dMMR) 丰富; MSC3 预后不良,聚糖和能量代谢增强,伴有弥漫性组织学和频繁的 CDH1 突变。山东省医院 (SDPH) 内部数据集以及匹配的转录组学、代谢组学和空间代谢组学分析也验证了这些发现。此外,我们构建了代谢亚型相关预后基因(MSPG)评分模型来量化单个肿瘤的活性,并发现与铜凋亡信号呈正相关。总之,对代谢物特征的全面识别可以增强对 GC 多样性和异质性的理解。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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