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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Jul 03

KatelynLDonahue,Hann...
Oncogenic KRAS-dependent stromal interleukin-33 directs the pancreatic microenvironment to promote tumor growth.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
胰腺癌的特点是广泛的纤维炎症微环境。在癌发生过程中,正常基质细胞转化为细胞因子高的癌症相关成纤维细胞(CAF)。这种转化的机制,包括成纤维细胞衍生的细胞因子的调节和功能,人们知之甚少。因此,迄今为止,针对 CAF 进行治疗的努力都失败了。在这里,我们发现来自表达致癌 KRAS(胰腺癌标志性突变)的上皮细胞发出的信号激活成纤维细胞自分泌信号,从而驱动细胞因子白细胞介素 33 (IL-33) 的表达。在整个癌变过程中,间质 IL-33 表达保持高水平并依赖于上皮 KRAS;反过来,环境压力会诱导 IL-33 分泌。使用区室特异性 IL-33 敲除小鼠,我们观察到基质 IL-33 的缺乏会导致胰腺肿瘤微环境的多个成分(包括 CAF、骨髓细胞和淋巴细胞)发生深刻的重编程。值得注意的是,基质 IL-33 的缺失会导致 CD8 T 细胞浸润和激活增加,并最终减少肿瘤生长。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Jul 05

DheerajSoni,Francesc...
From hit to vial: Precision discovery and development of an imidazopyrimidine TLR7/8 agonist adjuvant formulation.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
疫苗接种可以帮助预防感染,还可以用于治疗癌症、过敏,甚至可能治疗药物过量。佐剂可以增强疫苗反应,但目前,其进步和发展的道路是渐进的。我们使用 THP-1 细胞进行表型小分子筛选来鉴定核因子-κB (NF-κB) 激活分子,然后使用原代人外周血单核细胞通过定量肿瘤坏死因子免疫分析对先导靶标库进行反筛选。对原代细胞的筛选鉴定出一种咪唑并嘧啶,称为 PVP-037。此外,虽然 PVP-037 没有明显激活 THP-1 细胞,但它表现出广泛的先天免疫激活作用,包括体外原代人白细胞的 NF-κB 和细胞因子诱导,以及流感和 SARS-CoV-2 抗原特异性的增强小鼠的体液反应。多项从头合成结构增强迭代提高了 PVP-037 的体外功效、效力、物种特异性活性和体内佐剂性。总体而言,我们发现咪唑并嘧啶 Toll 样受体 7/8 佐剂与水包油乳剂协同作用,可增强免疫反应。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Jul 05

WellesRobinson,Joshu...
Identification of intracellular bacteria from multiple single-cell RNA-seq platforms using CSI-Microbes.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
肿瘤微生物组的研究日益受到关注。我们开发了一个计算管道 (CSI-Microbes),用于从单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据中识别微生物读数并分析类群的差异丰度。通过一系列对照实验和分析,我们对通过多种 scRNA-seq 技术恢复微生物独特分子标识符的功效进行了首次系统评估,确定较新的 10x 化学方法(3' v3 和 5')是最适合的方法。我们分析了食管癌和结直肠癌患者,发现来自不同属的读数往往在同一宿主细胞中同时出现,证明了可能的细胞内多种微生物相互作用。骨髓细胞内的微生物读数异常丰富,可上调 IL1B 和 CXCL8 等促炎细胞因子,而受感染的肿瘤细胞则上调抗原加工和呈递途径。这些结果表明,被细菌吞噬的骨髓细胞是肿瘤微环境 (TME) 内细菌 RNA 的主要来源,可能会导致 TME 发炎并影响免疫治疗反应。
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Stem Cell Research & Therapy
2024 Jun 12

MarinnaMadrid,UmaLak...
Considerations for the development of iPSC-derived cell therapies: a review of key challenges by the JSRM-ISCT iPSC Committee.
Stem Cell Research & Therapy
自 2007 年首次生产以来,人类诱导多能干细胞 (iPSC) 为开发针对一系列疾病的各种细胞疗法提供了一个新颖的平台,从罕见的遗传性眼部疾病到癌症治疗。然而,基于 iPSC 的细胞疗法要进入市场并在全球范围内获得更广泛的采用,必须解决一些挑战。本白皮书由日本再生医学会 (JSRM) - 国际细胞治疗学会 (ISCT) iPSC 委员会撰写,深入探讨了在追求安全且经济可行的基于 iPSC 的疗法中遇到的障碍,特别是从细胞治疗行业。它讨论了全球指南和监管框架的差异,概述了确保细胞疗法安全所需的一系列质量控制测试,并提供了有关商品成本 (COG) 的详细信息和重要考虑因素,包括自动化先进制造的影响。版权© 2024 国际细胞学会
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Stem Cell Research & Therapy
2024 Jul 03

TianFang,ShihengHu,X...
Combination of monensin and erlotinib synergistically inhibited the growth and cancer stem cell properties of triple-negative breast cancer by simultaneously inhibiting EGFR and PI3K signaling pathways.
Stem Cell Research & Therapy
三阴性乳腺癌 (TNBC) 中的癌症干细胞 (CSC) 被认为是极具挑战性的细胞亚群,以其高复发倾向和不良预后而闻名。莫能菌素是一种离子导入抗生素,据报道对多种癌症,尤其是癌症干细胞具有显着的治疗功效。厄洛替尼被归类为 EGFR-TKI 之一,之前已被确定为 TNBC 的有前景的治疗靶点。我们的研究旨在评估莫能菌素和厄洛替尼组合作为 TNBC 潜在治疗策略的有效性。通过各种体外测定,包括细胞毒性测定、集落形成测定、伤口愈合,评估莫能菌素和厄洛替尼组合的潜在抗癌活性测定、Transwell 测定、微球形成测定和 CSC 比例测定。此外,利用荷瘤裸鼠进行体内研究,评估莫能菌素与厄洛替尼联合用药对肿瘤生长的抑制作用。结果表明,莫能菌素与厄洛替尼联合用药可协同抑制细胞增殖、迁移率、侵袭能力。并降低体内和体外CSCs比例以及CSC标志物SOX2和CD133。此外,莫能菌素和厄洛替尼在体内和体外联合治疗同时抑制EGFR/ERK和PI3K/AKT信号通路中涉及的主要蛋白。同时抑制EGFR/ERK和PI3K/AKT/mTOR莫能菌素和厄洛替尼组合的信号通路在抑制 TNBC 中的肿瘤增殖和癌细胞干性方面表现出协同作用。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Jul 03

MelinaEMarmarelis,Dy...
Electronic Medical Record-Based Nudge Intervention to Increase Comprehensive Molecular Genotyping in Patients With Metastatic Non-Small Cell Lung Cancer: Results From a Prospective Clinical Trial.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
不到一半的新诊断的转移性非小细胞肺癌(NSCLC)患者接受了全面的分子检测。我们设计了一种基于电子病历(EMR)的“助推干预”,以在初次肿瘤内科咨询时提示进行基于血浆的分子检测。在宾夕法尼亚大学的学术实践和两个附属社区实践中进行了一项非随机前瞻性试验。通过基于组织和/或血浆的下一代测序方法进行分子基因分型。综合检测定义为 EGFR、ALK、BRAF、ROS1、MET、RET、KRAS 和 NTRK 检测。符合指南的治疗被定义为根据国家综合癌症网络 (NCCN) 指南使用适当的一线 (1L) 治疗。使用 Fisher 精确检验或 Pearson 卡方检验,比较干预前和干预后队列之间随时可获得全面分子基因分型结果的患者比例、1L 治疗前可获得的分子结果以及符合指南的 1L 治疗。其中包括 3 名患者,其中 376 名患者属于干预前队列,157 名患者属于干预后队列。实施基于 EMR 的助推后,与干预前队列相比,干预后队列中接受全面分子检测的患者比例更高(100% vs 88%,P = <.001),并且在开始 1L 治疗之前获得了全面分子检测结果(97.3% vs 91.6%,P = .026),并接受了符合 NCCN 指南的护理 (89.8% vs 78.2%,P = .035)。在大型卫生系统的三个实践地点,实施了以提供者团队为中心的服务基于 EMR 的助推干预是可行的,并导致更多的 NSCLC 患者接受全面的分子基因分型。这些发现表明,行为推动可以促进分子检测,并且应该作为改善社区和学术场所指南一致护理的工具进行进一步研究。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 03

EmreNalbant,YelizZAk...
Exploring regulatory mechanisms on miRNAs and their implications in inflammation-related diseases.
Epigenetics & Chromatin
这项全面的探索深入探讨了 microRNA (miRNA) 在复杂的细胞调控过程中的关键作用。作为基因表达的有效协调者,miRNA 在细胞过程中表现出多种功能,将其影响从细胞核延伸到细胞质。 miRNA 生物发生的复杂过程,包括转录、加工和整合到 RNA 诱导的沉默复合物中,展示了它们的多功能性。在细胞质中,成熟的 miRNA 通过调节靶标 mRNA 的表达来微调细胞功能,同时它们的作用范围延伸到细胞核,影响转录调控和表观遗传修饰。 miRNA 的失调在多种病理学中变得明显,例如癌症、自身免疫性疾病和炎症性疾病。 miRNA 对环境信号的适应性、与转录因子的相互作用以及参与复杂的调控网络强调了它们的重要性。 DNA 甲基化和组蛋白修饰加深了对 miRNA 动态调控的理解。与 RNA 结合蛋白竞争、海绵作用以及通过降解和编辑控制 miRNA 水平等机制促成了这一复杂的调节过程。在这篇综述中,我们主要关注 miRNA 表达失调如何与皮肤相关的自身免疫和自身炎症疾病、关节炎、心血管疾病、炎症性肠病、自身免疫和自身炎症疾病以及神经退行性疾病相关。我们还强调 miRNA 的多方面作用,敦促继续研究以揭示其复杂性。控制 miRNA 功能的机制有望在治疗干预方面取得进展,并增强对健康和疾病细胞动力学的了解。© 2024。作者。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul

GerraldALodewijk,Mat...
Emergence of the ZNF675 Gene During Primate Evolution-Influenced Human Neurodevelopment Through Changing HES1 Autoregulation.
Epigenetics & Chromatin
在这项研究中,我们研究了 19p12 基因座中的复发性拷贝数变异 (CNV),这些变异与神经发育障碍相关。该位点中的两个基因 ZNF675 和 ZNF681 是通过灵长类动物中的基因复制产生的,它们在人类的几个病理性 CNV 中的存在表明,这两个基因中的一个或两个是正常人类大脑发育所必需的。 ZNF675 和 ZNF681 是 Krüppel 相关盒锌指 (KZNF) 蛋白家族的成员,该家族是一类对于特定基因组区域的表观遗传沉默非常重要的转录抑制因子。人类基因组中存在大约 170 种灵长类特异性 KZNF。尽管 KZNF 主要与抑制逆转录转座子衍生的 DNA 相关,但越来越多的证据表明它们可以被用于其他基因调控过程。我们发现 ZNF675 的基因缺失会导致皮质类器官的发育缺陷,并且我们的数据表明,观察到的部分神经发育表型是由 ZNF675 对神经发育基因 Hes 家族 BHLH 转录因子 1 (HES1) 启动子的基因调控作用介导的。我们还发现了与神经系统疾病相关的基因(小头磷脂 1 和 sestrin 3)最近进化的调节证据。我们表明 ZNF675 干扰 HES1 自身抑制,这是维持神经祖细胞所必需的过程。作为一些 KZNF 如何整合到预先存在的基因表达网络中的一个引人注目的例子,这些发现表明 ZNF675 的出现导致了 HES1 自身调节平衡的变化。 ZNF675 CNV 与人类发育障碍以及 ZNF675 介导的神经发育基因调节的关联表明,它演变成人类大脑发育的重要因素。© 2024 作者。 《比较神经病学杂志》由 Wiley periodicals LLC 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul 05

KoukiAbe,BrianMaunze...
Downstream-of-gene (DoG) transcripts contribute to an imbalance in the cancer cell transcriptome.
Epigenetics & Chromatin
基因下游 (DoG) 转录本是一类新兴的非编码 RNA。然而,DoG RNA 的产生是如何调节的以及主要癌症中是否存在 DoG RNA 特征的改变仍然很大程度上未知。在这里,通过对匹配的肿瘤和非肿瘤组织以及癌细胞系进行转录组分析,我们揭示了 DoG RNA 特征的全面目录。通过不同的证据,我们支持 DoG RNA 在致癌作用中的生物学重要性。首先,我们展示了肿瘤中 DoG RNA 的组织特异性和阶段特异性差异表达与配对的正常组织及其各自参与肿瘤促进与肿瘤抑制途径的宿主基因的差异。其次,我们发现差异性 DoG RNA 表达与患者生存率低相关。第三,我们确定 DoG RNA 诱导是用拓扑异构酶 I (TOP1) 毒物喜树碱处理结肠癌细胞并在 TOP1 耗尽后的结果。我们的结果证明了 DoG RNA 和 DoG RNA 的 TOP1 依赖性调节在癌症转录组多样化和调节中的重要性。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jul 09

QiyinZhou,HongfeiYu,...
The CRL3KCTD10 ubiquitin ligase-USP18 axis coordinately regulates cystine uptake and ferroptosis by modulating SLC7A11.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
SLC7A11 是一种胱氨酸转运蛋白和铁死亡抑制剂。 E3 连接酶和去泛素化酶 (DUB) 如何协调调节 SLC7A11 的稳定性以响应环境胱氨酸仍然是个谜。在此,我们报告 neddylation 抑制剂 MLN4924 通过灭活 Cullin-RING 连接酶 3 (CRL-3),引起 SLC7A11 积累,从而增加胱氨酸的摄取。我们确定 KCTD10 是 SLC7A11 泛素化的 CRL-3 底物识别亚基,USP18 是 SLC7A11 去泛素化酶。胱氨酸剥夺后,KCTD10 或 USP18 的蛋白水平分别降低或升高,从而促进 SLC7A11 积累。通过破坏或稳定 SLC7A11、KCTD10 或 USP18,反向调节胱氨酸摄取和铁死亡。从生物学角度来看,MLN4924 与 SLC7A11 抑制剂咪唑酮 Erastin (IKE) 组合可增强对肿瘤生长的抑制。在人乳腺肿瘤组织中,SLC7A11水平分别与KCTD10或USP18呈负相关或正相关。总的来说,我们的研究定义了 SLC7A11 和铁死亡如何受 CRL3KCTD10/E3-USP18/DUB 轴协调调节,并为药物组合增强抗癌功效提供了合理的理论依据。
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