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Cell Stem Cell
2024 Jun 25

ChengfangZhou,MeiKua...
Nynrin preserves hematopoietic stem cell function by inhibiting the mitochondrial permeability transition pore opening.
Cell Stem Cell
线粒体是造血干细胞 (HSC) 稳态的关键调节因子。我们的研究确定转录因子 Nynrin 通过调节线粒体功能而成为 HSC 维持的关键调节因子。在稳态和应激条件下,Nynrin 在 HSC 中高度表达。敲除 Nynrin 会降低 HSC 频率、休眠和自我更新,并增加线粒体功能障碍,表现为 mPTP 开放异常、线粒体肿胀和 ROS 水平升高。这些变化降低了 HSC 的辐射耐受性并促进坏死样表型。相比之下,HSC 中 Nynrin 的过度表达可减少辐射 (IR) 诱导的致死率。 Nynrin 的缺失会激活 Ppif,导致亲环蛋白 D (CypD) 过度表达并进一步导致线粒体功能障碍。 Ppif 单倍体不足或 CypD 药理抑制等策略可显着减轻这些影响,恢复 Nynrin 缺陷小鼠的 HSC 功能。这项研究确定 Nynrin 是 HSC 中线粒体功能的关键调节因子,强调了在癌症治疗期间保持干细胞活力的潜在治疗靶点。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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Microbial Cell Factories
2024 Jul 02

OsamaMDarwesh,AhmedM...
Natural dyes developed by microbial-nanosilver to produce antimicrobial and anticancer textiles.
Microbial Cell Factories
开发具有特殊抗菌和抗癌特性的特殊纺织品(例如用于医院患者)是当前工作的主要目标。所开发的纺织品是通过天然(无环境毒)颜料(通过微生物银纳米颗粒修正黑色素)的新配方染色后生产的。圆环状链霉菌分离株OSh10(登录号KX753680.1)被选为棕色天然色素的优质生产者。通过优化过程,在 3 种培养基上培养测试菌株后,观察到一些不同的色素颜色。葡萄糖和麦芽提取物增强了细菌的作用,产生红黑色。然而,甘油作为主要碳源,NaNO3 和天冬酰胺作为氮源被认为最适合生产棕色颜料。在另一个例子中,作为多糖的淀粉是生产深绿色颜料的最佳碳。蛋白胨和NaNO3是生产深绿色颜料的最佳氮源。微生物银纳米粒子由尖镰孢产生,尺寸为 7-21 nm,形状为球形。这些纳米颗粒用于生产颜料纳米复合材料,以改善其有前景的性能。记录了纳米粒子和纳米复合材料染色纺织品对多重耐药病原体的抗菌作用。新型纳米复合材料改善了颜料的染色作用和纺织性能。生产的纺织品对皮肤癌细胞具有抗癌活性,对正常皮肤细胞具有可检测到的非细胞毒性作用。获得的结果表明这些纺织品可以应用于医院病人的衣服。© 2024。作者。
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Experimental Hematology & Oncology
2024 Jul 02

HermanNetskar,AlineP...
Pan-cancer profiling of tumor-infiltrating natural killer cells through transcriptional reference mapping.
Experimental Hematology & Oncology
自然杀伤 (NK) 细胞库的功能多样性源于分化、稳态、受体-配体相互作用以及对病毒感染的适应性反应。在本研究中,我们生成了健康人类血液和组织来源的 NK 细胞的单细胞转录参考图,具有定义 NK 细胞分化的基因调控网络的时间分辨率和命运特异性表达。迁移学习有助于将肿瘤浸润 NK 细胞转录组(39 个数据集、7 个实体瘤、427 名患者)纳入参考图谱中,以分析肿瘤微环境 (TME) 引起的扰动。在确定的六种功能不同的 NK 细胞状态中,易受 TME 诱导的免疫抑制影响的功能失调应激 CD56bright 状态和细胞毒性 TME 抗性效应器 CD56dim 状态通常在肿瘤类型中丰富,其比率可预测恶性黑色素瘤和骨肉瘤。该资源可以为新 NK 细胞疗法的设计提供信息,并且可以通过迁移学习进行扩展,以询问来自实验扰动或疾病条件的新数据集。© 2024。作者。
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Experimental Hematology & Oncology
2024 Jul 02

RenatePichler,JosefF...
Cisplatin eligibility in the neoadjuvant setting of patients with muscle-invasive bladder cancer undergoing radical cystectomy.
Experimental Hematology & Oncology
为了检查不同计算的估计肾小球滤过率 (eGFR) 公式和测量的肌酐清除率 (CrCI) 在初次诊断肌层浸润性膀胱癌 (MIBC) 时的一致性。我们对接受顺铂治疗的 MIBC 患者进行了多中心分析2011 年至 2021 年间,基于新辅助化疗 (NAC) 和根治性膀胱切除术 (RC) 或单独使用 RC。基线 eGFR 使用 4 个计算血清方程计算,包括 Cockcroft-Gault (CG)、MDRD、CKD-EPI 2009 和种族-免费 CKD-EPI 2021。为了检查计算的 eGFR 与测量的 CrCI 之间的关联,对测定了 24 小时尿液 CrCI 的患者进行了亚组分析。不适合顺铂的定义为 CrCI 和/或 eGFR < 60 mL/min 每 1.73 m2。在 956 名患者中,CG、MDRD、CKD 发现 30.0%、33.3%、31.9% 和 27.7% 不适合顺铂-EPI 和无外消旋 CKD-EPI 方程 (P = .052)。计算出的 eGFR 公式之间的一致性被评为显着(Cohen 的 kappa (k):0.66-0.95)。在测量 CrCl 的亚组 (n = 245) 中,37 名 (15.1%) 患者的 CrCI 低于 60 mL/分钟。测量的 CrCl 和计算的 eGFR 之间的一致性较差 (ĸ: 0.29-0.40)。所有计算的 eGFR 公式都明显低估了测量的 CrCI。具体而言,78%-87.5% 计算出的 eGFR 在 40 至 59 mL/分钟之间的患者的 CrCI ≥ 60 mL/分钟。比较计算出的 eGFR 公式,相似百分比的 MIBC 患者被认为不适合顺铂治疗。然而,大量患者可以根据测得的 CrCI 进行顺铂适应升级,特别是当计算出的 eGFR 落在 40-59 mL/分钟的灰色范围内时。© 作者 2024 年。由 Oxford 出版大学出版社。
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BRITISH JOURNAL OF CANCER
2024 Jul 02

TiandongLi,GuiyingSu...
ESCCPred: a machine learning model for diagnostic prediction of early esophageal squamous cell carcinoma using autoantibody profiles.
BRITISH JOURNAL OF CANCER
食管鳞状细胞癌(ESCC)是一种致命的癌症,临床上没有理想的早期诊断生物标志物。本研究的目的是开发和验证一种用户友好的诊断工具,用于早期 ESCC 检测。该研究分为三个阶段:发现、验证和确认,总共包括 1309 名受试者。使用 HuProtTM 人类蛋白质组微阵列分析血清自身抗体,并使用酶联免疫吸附测定 (ELISA) 测量自身抗体水平。采用十二种机器学习算法构建诊断模型,并使用受试者工作特征曲线下面积(AUC)进行评估。该模型应用是通过 R Shiny 提供的图形界面来促进的。在模型中鉴定了 13 种针对 TAA 的自身抗体(CAST、FAM131A、GABPA、HDAC1、HDGFL1、HSF1、ISM2、PTMS、RNF219、SMARCE1、SNAP25、SRPK2 和 ZPR1)。发现阶段。随后的验证和验证阶段确定了 5 种 TAAb(抗 CAST、抗 HDAC1、抗 HSF1、抗 PTMS 和抗 ZPR1),它们在 ESCC 和对照受试者之间表现出显着差异(P<0.05)。支持向量机 (SVM) 模型表现出稳健的性能,训练集中的 AUC 为 0.86(95% CI:0.82-0.89),测试集中的 AUC 为 0.83(95% CI:0.78-0.88)。对于早期 ESCC,SVM 模型在训练集中的 AUC 为 0.83(95% CI:0.79-0.88),在测试集中的 AUC 为 0.83(95% CI:0.77-0.90)。值得注意的是,对于高级别上皮内瘤变观察到了有希望的结果,AUC 为 0.87(95% CI:0.77-0.98)。早期 ESCC 诊断工具的基于网络的实现可在 https://litdong.shinyapps.io/ESCCPred/ 上公开访问。这项研究为早期 ESCC 检测提供了一种有前途且易于使用的诊断预测模型。它有望改善早期检测策略,并对公共健康具有潜在影响。© 2024。作者,获得 Springer Nature Limited 的独家许可。
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Brain Structure & Function
2024 Jul

MathewDaniel,SadikSa...
Disseminated Nocardia cyriacigeorgica Infection Disguised as a Metastatic Adrenal Gland Malignancy in a Healthy Patient.
Brain Structure & Function
诺卡氏菌通常被认为是影响免疫功能低下个体的罕见机会性病原体,在涉及免疫功能正常宿主感染的各种病例报告中也有记录。通过吸入或接种到受损皮肤来传播。随后,它可以通过血行传播导致播散性感染,影响几乎所有与中枢神经系统有特殊亲和力的器官。播散至肾上腺的情况极为罕见,仅报告了少数病例。在本报告中,我们提出了一个罕见的播散性诺卡氏菌病例,最初类似于健康个体中的转移性肾上腺恶性肿瘤。该患者表现出非特异性症状,多组血培养呈阴性,临床结果提示潜在的肾上腺恶性肿瘤,并且缺乏可识别的诺卡氏菌危险因素,这给诊断带来了重大挑战。此外,我们回顾了有关肾上腺诺卡氏菌病的现有文献。该病例是文献中第三例报告的诺卡氏菌肾上腺脓肿病例。版权所有 © 2024,Daniel 等人。
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Brain Structure & Function
2024

PalaniThanarajKrishn...
Enhancing brain tumor detection in MRI with a rotation invariant Vision Transformer.
Brain Structure & Function
旋转不变视觉变换器(RViT)是一种专为使用 MRI 扫描进行脑肿瘤分类而定制的新型深度学习模型。RViT 结合了旋转补丁嵌入,以提高脑肿瘤识别的准确性。对 Kaggle 脑肿瘤 MRI 数据集的评估证明了 RViT 的卓越性能灵敏度 (1.0)、特异性 (0.975)、F1 分数 (0.984)、马修相关系数 (MCC) (0.972),总体准确度为 0.986。RViT 优于标准 Vision Transformer 模型和多种现有技术,凸显了其功效在医学影像领域。该研究证实,集成旋转贴片嵌入可提高模型处理不同方向的能力,这是肿瘤成像中的常见挑战。 RViT 的专业架构和旋转不变性方法有可能增强当前的脑肿瘤检测方法,并扩展到其他复杂的成像任务。版权所有 © 2024 Krishnan、Krishnadoss、Khandelwal、Gupta、Nihaal 和 Kumar。
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CANCER IMAGING
2024 Jul 02

OlivierHild,PierreBe...
Automation of Wilms' tumor segmentation by artificial intelligence.
CANCER IMAGING
维尔姆斯肿瘤的 3D 重建具有多种优势,但由于手动分割极其耗时,因此并未系统地进行。我们研究的目的是开发一种人工智能工具来自动分割儿童肿瘤和肾脏。由两名专家对 14 张 CT 扫描进行手动分割。然后,使用 CNN U-Net 和根据 OV2ASSION 方法训练的相同 CNN U-Net 自动执行维尔姆斯肿瘤和肿瘤性肾脏的分割。根据自动分割的切片数量来估计专家节省的时间。当由两名专家手动执行分割时,个体间差异导致肿瘤的 Dice 指数为 0.95,肾脏的 Dice 指数为 0.87。使用 CNN U-Net 进行全自动分割,维尔姆斯肿瘤的 Dice 指数很差,为 0.69,肾脏的 Dice 指数为 0.27。使用 OV2ASSION 方法时,Dice 索引会根据手动分段部分的数量而变化。对于维尔姆斯肿瘤和肿瘤肾的分割,间隙为 1(手动执行 3 个切片中的 2 个)时,其值分别为 0.97 至 0.94;间隙为 10(手动执行 6 个切片中的 1 个切片)时,其值分别为 0.94 和 0.86。 )。全自动分割仍然是医学图像处理领域的一个挑战。尽管可以使用已经开发的神经网络,例如 U-Net,但我们发现所获得的结果对于儿童肿瘤性肾脏或肾母细胞瘤的分割并不令人满意。我们开发了一种创新的 CNN U-Net 训练方法,可以像专家一样精确地分割肾脏及其肿瘤,同时将干预时间减少 80%。© 2024。作者。
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CANCER IMAGING
2024 Jul 01

MoritzGross,EdithEis...
MRI-guided in-bore biopsy of the prostate - defining the optimal number of cores needed.
CANCER IMAGING
大量研究表明,磁共振成像(MRI)靶向活检方法优于传统的系统性经直肠超声引导活检(TRUS-Bx)。然而,在多参数 MRI (mpMRI) 图像上识别的每个病变所需获得的最佳活检核心数量仍然存在争议。本研究的目的是评估 MRI 靶向“孔内”活检 (MRI-Bx) 设置中额外活检核心的增量价值。 2014 年 6 月期间接受 MRI-Bx 的 245 名患者和 2021 年 9 月,被纳入这项回顾性单中心分析。使用至少五个活检核心对所有病变进行活检,并计算每个顺序标记的活检核心的任何癌症 (PCa) 的累积检出率以及临床显着癌症 (csPCa) 的检出率。当考虑所有活检核心时,累积的每核心检测率以整数和达到的最大检测率的比例表示。 CsPCa定义为格里森评分(GS) ≥ 7(3 4)。245名患者中132名(53.9%)被诊断为前列腺癌,64名(26.1%)患者中发现csPCa。第一次活检核心显示 76.6% (49/64)/81.8% (108/132) 的病例为 csPCa/PCa。第二个、第三个和第四个核心在 10.9% (7/64)/ 8.3% (11/132)、7.8% (5/64)/ 5.3% (7/132) 和 3.1 中发现了以前的核心未检测到的 csPCa/ PCa分别为 % (2/64)/ 3% (4/132) 案例。在第四个活检核心之外获取一个或多个核心导致检出率增加 1.6% (1/64)/ 1.5% (2/132)。我们发现每个病变获取 5 个核心可以最大限度地提高检出率。然而,如果未来的研究应该在严重并发症的发生率与获得的活检核心数量之间建立明确的联系,那么三核心活检可能就足够了,因为我们的结果表明,约 95% 的 csPCa 是由前三个核心检测到的.© 2024。作者。
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EUROPEAN UROLOGY ONCOLOGY
2024 Jul 01

JoseAntonioKaram,Rob...
Adjuvant Atezolizumab in Patients with Sarcomatoid Renal Cell Carcinoma: A Prespecified Subgroup Analysis of IMmotion010.
EUROPEAN UROLOGY ONCOLOGY
肉瘤样肾细胞癌(sRCC)患者预后较差。在随机、双盲 3 期 IMmotion010 试验 (NCT03024996) 中,在手术后复发风险增加的局部区域肾细胞癌患者总体人群中,与安慰剂相比,辅助 atezolizumab 并未表现出无病生存 (DFS) 获益。这项预先指定的疗效和安全性亚组分析是在 104 名 sRCC 患者中完成的。治疗组之间的基线特征相似。在中位随访 45 个月时,阿替利珠单抗组 (n = 37) 和 23 个月 (95% CI, 11) 的中位 DFS 不可评估(NE;95% 置信区间 [CI],12 个月-NE) -NE)在安慰剂组中(n = 66;风险比 0.77 [95% CI,0.44-1.4])。在 sRCC 亚组中,atezolizumab 组的 1 名患者 (2.7%) 和安慰剂组的 2 名患者 (3.0%) 发生了 3/4 级治疗相关不良事件 (TRAE)。相比之下,353 名非肉瘤样组织学患者中的 54 名 (15%) 和 317 名患者中的 16 名 (5.0%) 报告各自手臂中发生了 3/4 级 TRAE。总之,对于 sRCC 患者,辅助 atezolizumab 和安慰剂之间的 DFS 差异不具有统计学意义。 sRCC 和非 sRCC 患者的安全性相似。患者摘要:患有特定类型局部肾癌(具有肉瘤样特征的肿瘤)的患者在手术后接受阿替利珠单抗或安慰剂治疗。与接受安慰剂治疗的患者相比,接受 atezolizumab 治疗的患者在病情没有恶化的情况下寿命更长,但这一发现并不具有统计学意义。副作用与同一研究 (IMmotion010) 中使用 atezolizumab 治疗的其他类型肾癌患者中观察到的副作用相似。在肉瘤样肾癌患者中,atezolizumab 是可耐受的,并且可能比安慰剂更有效,但这需要进一步研究。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V 出版。
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