我们从表观遗传学的角度描述了融合驱动的肉瘤病因学的令人兴奋的最新进展。通过探索该领域的现状，我们确定并描述了决定肉瘤发生的核心机制。此外，我们讨论了翻译基因组学的开创性研究，这些研究使得融合驱动的肉瘤的表观遗传特征成为可能。表观遗传机制的重要背景包括但不限于细胞周期和代谢、核心调节电路、3维染色质结构失调、与ATP依赖性染色质重塑的整合以及转化动物模型。矛盾的是，虽然致癌转化的遗传要求对于融合伴侣来说是高度特异性的，但我们作为一个群体发现的表观遗传机制却非常广泛。这种二分法提出了一个问题：罕见疾病表观基因组学的研究是否应该优先研究个体细胞群，从而检查染色质失调的机制是否特定于特定肿瘤。我们回顾了横纹肌肉瘤、滑膜肉瘤、肺泡软组织肉瘤、透明细胞肉瘤、未分化圆形细胞肉瘤、尤文肉瘤、粘液样/圆形脂肪肉瘤、上皮样血管内皮瘤和促结缔组织增生性圆形细胞肿瘤的最新进展。该领域越来越多的突破性发现促使我们期待未来几年机械表观基因组学和直接靶向融合转录因子领域会取得进一步令人兴奋的进展。版权所有 © 2024 Stanton 和 Pomella。

母乳为婴儿提供许多生物活性因子，包括免疫调节成分、抗菌剂和益生元，它们可调节婴儿微生物组和免疫系统的成熟。因此，母乳喂养会影响婴儿从婴儿期到青春期直至成年的健康。从保护婴儿免受感染，到降低肥胖、1 型糖尿病和儿童白血病的风险，在接受母乳喂养的婴儿中观察到许多积极的健康结果。对于母亲来说，母乳喂养可以预防产后出血和抑郁症，促进体重减轻，并长期降低患 2 型糖尿病、乳腺癌和卵巢癌以及心血管疾病的风险。除了婴儿和母亲之外，更广泛的社会也受到影响，因为由于缺乏母乳接触而产生与发病和死亡相关的本可避免的成本。在这篇综述中，Medline 用于搜索相关文章来讨论母乳喂养的健康益处及其社会影响，然后探索未来的建议，以增强我们对母乳喂养积极影响背后的机制的理解，并在全球范围内促进母乳喂养。© 2024 作者（s）。约翰·威利 (John Wiley) 出版的《微生物生物技术》

癌症的早期诊断对于有效治疗和改善预后至关重要。肿瘤生物标志物可用于癌症的早期诊断、治疗和预后评估，近年来已成为研究热点。核酸作为一类肿瘤生物标志物，含有重要的遗传信息，对于癌症的发生、发展具有重要意义。目前，能够对核酸进行原位成像和动态监测的活细胞核酸探针已成为一个快速发展的领域。本综述重点关注可用于肿瘤早期诊断的活细胞核酸探针。我们用三个单元描述了探针的基本设计，并重点关注不同纳米材料在探针输送中的作用。© 2024 沉阳药科大学。由 Elsevier B.V. 出版

背景 。肿瘤、免疫和血管生态位之间的相互作用在驱动胶质母细胞瘤 (GBM) 恶性肿瘤和治疗反应中发挥着重要作用。然而，介导这种相互作用的细胞外核心基质蛋白（CMP）的组成、异质性和定位尚不清楚。方法 。在这里，通过计算基因组学和蛋白质组学方法，我们以批量、单细胞和空间解剖分辨率分析了 GBM 中 CMP 表达的功能和临床相关性。结果 。我们鉴定了编码 CMP 的基因，其表达水平将 GBM 肿瘤分为 CMP 高表达 (M-H) 和 CMP 低表达 (M-L) 组。 CMP 富集与患者生存率较差、特定驱动致癌改变、间充质状态、促肿瘤免疫细胞浸润和免疫检查点基因表达相关。解剖学和单细胞转录组分析表明，基质体基因表达在血管和前缘/浸润生态位中丰富，这些生态位已知含有驱动 GBM 进展的神经胶质瘤干细胞。最后，我们鉴定了一个 17 基因 CMP 表达特征，称为 Matrisome 17 (M17) 特征，进一步完善了 CMP 基因的预后价值。与 MGMT 启动子甲基化状态以及典型亚型相比，M17 特征是一个明显更强的预后因素，而且重要的是，它可能预测对 PD1 阻断的反应。结论 。基质体基因表达特征通过生存和功能相关 GBM 生态位的潜在生物标志物提供了对 GBM 患者的稳健分层，这些生物标志物可以介导间充质免疫串扰。基于基质体概况的患者分层有助于治疗策略的选择和优化。

177Lu-oxodotreotide 肽受体疗法 (LuPRRT) 是一种有效治疗放射学反应可变的中肠神经内分泌肿瘤 (NET) 的方法。一些临床、生物学和成像参数可用于建立相对的疾病预后，但没有一个能够预测早期疗效或毒性。我们研究了与放射敏感性和肿瘤进展有关的 mRNA 和 miRNA 的表达水平，寻找与 LuPRRT 治疗期间患者结果相关的相关性。2019 年 5 月至 2021 年 9 月期间，35 名患者接受了针对 G1/G2 中肠 NET 的 LuPRRT。在治疗前收集了外周血样本在第二次和第四次 LuPRRT 之前和之后 48 小时以及 6 个月的随访时进行照射。进行多元回归分析和 Pearson 相关性来确定最能预测 LuPRRT 反应的 miRNA/mRNA 特征。重点关注四种 mRNA 和三种 miRNA，我们确定了一种 miRNA/mRNA 特征，能够早期识别 miRNA 显着减少的 LuPRRT 反应者1 年时疾病进展的患者首次 LuPRRT 给药后 /mRNA 表达 (p < 0.001)。通过研究 LuPRRT 后 6 个月内该特征的演变，增强了该特征的相关性。此外，对于患有进展性疾病的患者，首次 LuPRRT 给药后前 2 个月内的最低绝对淋巴细胞计数与低 miRNA/mRNA 表达水平显着相关 (p < 0.05)。我们提出了一项初步研究，探索与相关性相关的 miRNA/mRNA 特征。 LuPRRT 后 12 个月出现早期血液学毒性和治疗反应。该签名将在更大规模的患者中进行前瞻性测试。版权所有 © 2024 Jacques, Dierickx, Texier, Brillouet, Courbon, Guimbaud, Vija 和 Savagner。

细胞衰老是一种常见的生物过程，与癌症有着明确的联系。然而，细胞衰老对肿瘤进展的影响仍不清楚。为了研究这种关系，我们利用衰老基因组的转录组数据来探索衰老与癌症预后之间的联系。我们通过最小绝对收缩和选择算子 (LASSO) Cox 模型开发了衰老评分。我们从癌症基因组图谱（TCGA）计划中获得了衰老基因集的转录组信息。此外，我们创建了一个将这些衰老评分与临床特征相结合的列线图，为预后评估提供了更全面的工具。我们根据42个衰老相关基因的表达水平计算了衰老评分。我们根据衰老评分和临床特征建立了列线图。衰老评分与上皮间质转化、细胞周期和糖酵解呈正相关，与自噬呈负相关。此外，我们进行了基因本体（GO）分析，以探索不同衰老评分组中的信号通路和生物过程。衰老评分是本研究中构建的一种新工具，在预测各种癌症类型的生存结果方面显示出希望。这些发现不仅强调了衰老与癌症之间复杂的相互作用，还表明细胞衰老可能作为肿瘤预后的生物标志物。版权所有 © 2024 Xu 和 Feng。

白细胞介素 17 (IL-17) 家族细胞因子促进保护性炎症以抵抗病原体，同时也促进自身免疫和肿瘤发展。 IL-17 向调节性 T 细胞 (Treg) 发出的直接信号尚未报道，可能有助于解释这些二分反应。我们通过将 Foxp3-YFP-Cre 小鼠与 Il17ra-flox 小鼠 (Il17ra) 杂交，在 Tregs 中条件性敲除 Il17ra ΔTreg 小鼠）。随后，我们将 Il17ra ΔTreg 小鼠的骨髓细胞过继转移至散发性结直肠癌小鼠模型 (Cdx2-Cre /Apc F/ )，以选择性消除结直肠癌中 Tregs 上的 IL-17 直接信号传导。对小鼠结直肠肿瘤的纯化 Treg 进行单细胞 RNA 测序和批量 RNA 测序，并与人类肿瘤浸润 Treg 细胞进行比较。IL-17 受体 A (IL-17RA) 在小鼠肠系膜淋巴结中的 Tregs 中表达和结肠肿瘤。 IL-17RA 的消除，特别是 Tregs 中的 IL-17RA 的消除，导致 Th17 细胞增加，并加剧肿瘤的发展。从机制上讲，肿瘤浸润性 Tregs 表现出独特的基因特征，与其激活、成熟和抑制功能相关，并且这种特征在一定程度上得到 IL-17 向 Tregs 的直接信号传导的支持。为了研究 Treg 编程途径，我们发现肿瘤 Tregs 中 IL-17RA 的缺失导致 RNA 剪接减少，以及已知调节选择性剪接和促进 Treg 功能的几种 RNA 结合蛋白的下调。IL-17 直接向 Tregs 发出信号并促进其成熟和功能。该信号通路构成了一个负反馈环，控制 CRC 中促癌炎症。版权所有 © 2024 Theune、Chen、Theune、Ye、Ménoret、Vella 和 Wang。

尽管手术和治疗方法取得了进步，但高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）的预后仍然很差。手术是治疗方案中不可或缺的组成部分，因为切除所有可见的肿瘤病变（细胞减灭术）可以显着提高总体生存率。用于评估细胞减灭术的增强预测工具对于优化治疗精度至关重要。患者的免疫状态广泛反映了肿瘤细胞的生物学行为以及患者对疾病和治疗的反应。血清细胞因子分析是免疫适应和偏差的敏感测量方法，但其与治疗范式的整合尚未得到充分探索。这项研究是 IMPACT 试验 (NCT03378297) 的一部分，旨在表征 HGSOC 初级治疗之前和期间的免疫反应，以确定用于治疗选择和预后的生物标志物。从诊断到反应评估期间收集了 22 名患者的纵向血清样本。根据腹腔镜评分，患者接受了初次细胞减灭术或新辅助化疗（NACT）。 Bio-Plex 200 分析了 27 种血清细胞因子，在诊断时揭示了两种免疫表型：免疫高，血清细胞因子水平明显高于免疫低。免疫表型反映了腹腔镜评分和手术治疗的分配。与接受相同治疗的免疫低患者相比，接受初次细胞减灭术的五名免疫高患者表现出免疫动员和延长的无进展生存期。腹腔镜检查和细胞减灭术均引起血清细胞因子的显着和短暂变化，炎症细胞因子 IL-6 上调，多功能细胞因子 IP-10、Eotaxin、IL-4 和 IL-7 下调。在研究期间，所有患者的细胞因子水平一致下降，导致最初的免疫表型消失，无论治疗选择如何。这项研究揭示了 HGSOC 患者独特的治疗前免疫表型，这可能为治疗分层和预后提供信息。这种潜在的新型生物标志物有望成为改善 HGSOC 患者治疗反应评估的基础。 ClinicalTrials.gov 标识符：NCT03378297。版权所有 © 2024 Torkildsen、Austdal、Jarmund、Kleinmanns、Lamark、Nilsen、Stefansson、Sande、Iversen、Thomsen 和 Bjørge。

在本研究中，我们研究了来自整个 SARS-CoV-2 蛋白质组的肽是否与 TAA（肿瘤相关抗原）具有同源性，并且 BNT162b2 预防性疫苗或 SARS-CoV-2 是否可以引发交叉反应性 CD8 T 细胞自然感染。预测与 HLA-A*02:01 等位基因具有高亲和力 (<100nM) 的病毒表位。鉴定了共享的和变体特异性的表位。 SARS-CoV-2 肽和多种 TAA 之间发现氨基酸序列显着同源，主要与乳腺癌、肝癌、黑色素瘤和结肠癌相关。在所有病毒蛋白中都发现了病毒表位和 TAA 的分子模拟，主要是 Orf 1ab 和 Spike（BNT162b2 疫苗中包含的蛋白）。预测的结构相似性证实了序列同源性，并且观察到了与 HLA 和 TCR α 链和 β 链的可比接触模式。通过MHC l-右旋体染色发现了与配对肽发生交叉反应的CD8 T细胞克隆。我们的结果首次表明，几种SARS-COV-2抗原与TAA高度同源，并鉴定出交叉反应T细胞在感染者和 BNT162b2 预防性疫苗接种者中。这意味着 SARS-Cov-2 大流行可能代表乳腺癌、肝癌、黑色素瘤和结肠癌的自然预防性免疫。未来几年，现实世界的证据将为此类免疫学实验证据提供最终证明。此外，此类SARS-CoV-2表位可用于开发“多癌症”现成的预防/治疗性疫苗制剂，其比过度表达的肿瘤自身抗原具有更高的抗原性和免疫原性，具有潜在的宝贵益处全世界数以千计的癌症患者。版权所有 © 2024 Ragone、Mauriello、Cavaluzzo、Cavalcanti、Russo、Manolio、Mangano、Cembrola、Tagliamonte 和 Buonaguro。

单核细胞在肿瘤的发生和进展中发挥着关键作用，其对前列腺腺癌（PRAD）的影响尚未完全了解。本研究旨在鉴定关键的单核细胞相关基因并阐明其在 PRAD 中的机制。利用 TCGA-PRAD 数据集，使用 CIBERSORT 评估免疫细胞浸润水平，并分析其与患者预后的相关性。 WGCNA 方法精确定位了 14 个与单核细胞相关的关键基因。使用机器学习算法的组合开发了专注于单核细胞的诊断模型，同时使用 LASSO 算法创建了预后模型，两者均经过验证。随机森林和梯度增强机选出CCNA2作为单核细胞中与预后相关的最重要基因，并通过基因富集分析进一步研究其功能。 HLA-DR 高表达单核细胞与 PRAD 关联的孟德尔随机分析。采用分子对接评估CCNA2与PRAD靶向药物的结合亲和力，实验验证证实了CCNA2在PRAD中的表达和预后价值。基于WGCNA鉴定的14个单核细胞相关基因，我们建立了PRAD的诊断模型PRAD 使用多种机器学习算法的组合。此外，我们使用 LASSO 算法构建了预后模型，这两种算法都表现出了出色的预测能力。随机森林和梯度增强机算法的分析进一步支持了 CCNA2 在 PRAD 中的潜在预后价值。基因富集分析揭示了 CCNA2 与 PRAD 中细胞周期和细胞衰老调节的关联。孟德尔随机化分析证实，表达高水平 HLA-DR 的单核细胞可能促进 PRAD。分子对接结果表明 CCNA2 对 PRAD 药物具有很强的亲和力。此外，免疫组织化学实验验证了 PRAD 中 CCNA2 表达的上调及其与患者预后的相关性。我们的研究结果为单核细胞异质性及其在 PRAD 中的作用提供了新的见解。此外，CCNA2 具有作为 PRAD 新型靶向药物的潜力。版权所有 © 2024 Wang、Li、He、Zhao、Zhou、Sun、Zhu、Ding 和 Ren。