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Epigenetics & Chromatin
2024 Jun

Ya-XiWu,Bing-QianLi,...
Histone deacetylase 6 as a novel promising target to treat cardiovascular disease.
Epigenetics & Chromatin
组蛋白脱乙酰酶 6 (HDAC6) 属于一类表观遗传靶标,已被发现是肿瘤与心血管疾病之间关联的关键蛋白。最近的研究集中在HDAC6在调节动脉粥样硬化、心肌梗死、心肌肥大、心肌纤维化、高血压、肺动脉高压和心律失常等心血管疾病中的关键作用。在此,我们综述HDAC6与心血管疾病的关联、HDAC6抑制剂在心血管疾病治疗中的研究进展,并讨论HDAC6抑制剂与其他治疗药物联合治疗心血管疾病的可行性。© 2024 The Authors.约翰·威利 (John Wiley) 出版的《癌症创新》
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Epigenetics & Chromatin
2024

MariaRitaBraghini,Cr...
Focal adhesion kinase and its epigenetic interactors as diagnostic and therapeutic hints for pediatric hepatoblastoma.
Epigenetics & Chromatin
肝母细胞瘤(HB)是最常见的儿童肝脏恶性肿瘤。尽管 HB 治疗取得了进展,但研究 HB 病理机制以优化分层和治疗仍然是改善高危患者预后的焦点。在这里,我们旨在探讨这些机制对 HB 的影响。对 17 名诊断为 HB 的患者的肝脏样本和两个正常肝脏样本进行了一项观察性研究。体外实验是在用 FAK 抑制剂 TAE226 处理的 Huh6 人 HB 细胞系上进行的。我们的结果强调,与正常肝脏相比,HB 肝脏中 FAK 的 mRNA 和蛋白表达显着上调。总 FAK 和 Tyr397 磷酸化 FAK (pTyr397FAK) 蛋白表达的增加与组蛋白 H3 甲基化和乙酰化的一些表观遗传调节因子的表达显着相关。值得注意的是,pTyr397FAK、N-甲基转移酶 (EZH2) 的表达和 H3K27 残基的三甲基化与肿瘤大小和甲胎蛋白 (AFP) 水平相关。最后,TAE226 导致 pTyr397FAK、表观遗传调节因子、AFP、EPCAM、OCT4 和 SOX2 显着减少,与 HB 细胞的抗增殖和促凋亡作用相关。我们的结果表明 FAK 在 HB 中的作用需要进一步研究主要致力于探索其有效的诊断和治疗可翻译性。版权所有 © 2024 Braghini, De Stefanis, Tiano, Castellano, Cicolani, Pezzullo, Tocco, Spada, Alaggio, Alisi 和 Francalanci。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug

Yuan-YuanSun,Hai-Che...
Identification of NR3C2 as a functional diagnostic and prognostic biomarker and potential therapeutic target in non-small cell lung cancer.
Epigenetics & Chromatin
非小细胞肺癌(NSCLC)包括肺鳞状细胞癌(LUSC)和肺腺癌(LUAD)亚型,是一种五年生存率较差的恶性肿瘤。迫切需要鉴定新的强大的NSCLC诊断生物标志物、预后生物标志物和潜在的治疗靶点。利用UCSC Xena、UALCAN和GEO数据库筛选和分析NSCLC的差异表达基因、调控模式和遗传/表观遗传改变。使用UCSC Xena数据库、GEO数据库、组织微阵列和免疫组织化学染色分析来评估诊断和预后价值。进行功能获得测定来检查这些作用。使用ESTIMATE、TIMER、Linked Omics、STRING和DAVID算法分析潜在的分子机制。NR3C2被确定为NSCLC中潜在的重要分子。 NR3C2在NSCLC、LUAD、LUSC组织中低表达,与这些患者的临床指标显着相关。受试者工作特征曲线分析表明,NR3C2 表达模式的改变对 NSCLC、LUAD,尤其是 LUSC 患者具有诊断价值。 NR3C2 表达水平降低可以帮助预测 NSCLC 和 LUAD 患者的不良预后,但不能帮助预测 LUSC 患者的不良预后。这些结果已通过数据库分析和组织微阵列上的真实临床样本得到证实。拷贝数变异导致 NSCLC 和 LUAD 中 NR3C2 表达水平较低,而启动子 DNA 甲基化参与 LUSC 中 NR3C2 的下调。 NR3C2启动子的两个甲基化位点对LUSC诊断具有较高的敏感性和特异性,具有临床应用潜力。 NR3C2可能是NSCLC发生发展的关键参与者,与肿瘤微环境和免疫细胞浸润密切相关。 NR3C2 共表达基因参与许多癌症相关信号通路,进一步支持 NR3C2 在 NSCLC 中的潜在重要作用。NR3C2 是 NSCLC 中一种新型的潜在诊断和预后生物标志物和治疗靶点。© 2024 作者。约翰·威利 (John Wiley) 出版的《癌症创新》
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Epigenetics & Chromatin
2024

LianruZhang,JieXiao,...
Efficacy and Safety of Chidamide in Combination with PD-1 Inhibitor and Radiotherapy for HER2-Negative Advanced Breast Cancer: Study Protocol of a Single Arm Prospective Study.
Epigenetics & Chromatin
作为癌症治疗最重要的突破之一,免疫检查点抑制剂极大地延长了乳腺癌患者的生存期。然而,它们的应用和疗效有限,特别是对于晚期 HER2 阴性乳腺癌。据报道,组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂西达本胺的表观遗传调节以及放射治疗的免疫微环境调节可能与免疫治疗产生协同作用。因此,西达本胺、放疗和免疫治疗的联合治疗有望改善晚期 HER2 阴性乳腺癌患者的预后。这是一项单臂、开放、前瞻性临床试验,研究 HDAC 抑制剂西达本胺、抗 PD-1 抗体信迪利单抗,以及新型免疫放射疗法,旨在提高 HER2 阴性乳腺癌后续疗法中免疫疗法的疗效。我们的研究将包括 35 名内分泌治疗和一线化疗均失败的晚期乳腺癌患者。参与者将接受每周两次 30 毫克西达本胺,每 3 周一次 200 毫克信迪利单抗,并结合免疫放射治疗。至少一个病灶的放射治疗集中为 8 Gy,其他病灶的放射治疗至少为 1 Gy。我们将在一个周期内完成三个部分的放射治疗。主要终点是无进展生存期,次要终点是客观缓解率、疾病控制率和安全性。此外,还将探索包括细胞因子和淋巴细胞亚群在内的生物标志物。作为单臂临床试验,对每种单一治疗的影响的分析是有限的。此外,我们的研究是一项开放研究,既不涉及随机化,也不涉及盲法。尽管存在上述限制,这项前瞻性临床试验将深入了解 HER2 阴性晚期乳腺癌的后续治疗方案,延长这些参与者的生存期或实现长期缓解,并确定潜在的反应者。© 2024 张等人。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jun 17

SnehalNirgude,Elisia...
Single-nucleus multiomic analysis of Beckwith-Wiedemann syndrome liver reveals PPARA signaling enrichment and metabolic dysfunction.
Epigenetics & Chromatin
Beckwith-Wiedemann 综合征 (BWS) 是一种由人类 11p15 染色体位点甲基化变化引起的表观遗传过度生长综合征。 BWS 患者表现出组织过度生长,并且儿童肝脏和肾脏肿瘤的风险增加。为了了解这些 11p15 变化的影响,特别是在肝脏中,我们进行了单核 RNA 测序 (snRNA-seq) 和单核转座酶可及染色质测序分析 (snATAC-seq),以生成配对的细胞类型-BWS肝脏和非BWS肝脏非肿瘤组织的特异性转录和染色质可及性特征。我们的整合 RNA ATACseq 多组学方法发现了肝细胞特异性富集和过氧化物酶体增殖物激活受体 α (PPARA)(一种肝脏代谢调节剂)的激活。为了证实我们的发现,我们利用了 BWS 诱导的多能干细胞 (iPSC) 模型,其中细胞分化为肝细胞。我们的数据表明 BWS 肝脏中脂质代谢失调,这与肝细胞分化过程中观察到的 PPARA 上调一致。与对照组相比,BWS 肝细胞表现出中性脂质减少和脂肪酸 β-氧化增加。我们还观察到 BWS 肝细胞中过氧化脂质形式的活性氧 (ROS) 副产物增加,这与氧化 DNA 损伤增加相一致。这项研究提出了由于代谢紊乱导致 BWS 肝脏过度生长和癌症易感性的假定机制。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jun 17

MatthewJRegner,Susan...
Defining the Regulatory Logic of Breast Cancer Using Single-Cell Epigenetic and Transcriptome Profiling.
Epigenetics & Chromatin
驱动癌细胞转录失调的顺式调节元件的注释对于提高我们对肿瘤生物学的理解至关重要。在此,我们以单细胞分辨率展示了人类乳腺肿瘤和手术切除后立即处理的健康乳腺组织的匹配染色质可及性 (scATAC-seq) 和转录组 (scRNA-seq) 概况的概要。我们确定了管腔乳腺肿瘤和基底乳腺肿瘤最有可能的起源细胞,然后引入了一种新的方法,该方法实施线性混合效应模型,以系统地量化恶性肿瘤中染色质可及性区域(即调控元件)与基因表达之间的关联。细胞与正常乳腺上皮细胞。这些数据揭示了从正常细胞基因表达沉默子到癌细胞基因表达增强子的调节元件,导致临床相关癌基因的上调。为了将该数据集的效用转化为易于处理的模型,我们为乳腺癌细胞系生成了匹配的 scATAC-seq 和 scRNA-seq 图谱,揭示了每种亚型的体外和体内细胞之间保守的致癌基因表达程序。总之,这项工作强调了致癌过程中非编码调控机制的重要性,以及单细胞多组学在单细胞分辨率下定义 BC 细胞调控逻辑的能力。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jun

HuiyiLiu,LuFu,ShuyuJ...
Cardiovascular toxicity with CTLA-4 inhibitors in cancer patients: A meta-analysis.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
随着细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA-4)抑制剂的出现,恶性肿瘤患者的预后显着改善。然而,心血管不良事件的发生率也有所增加,这会影响肿瘤的治疗。在这项研究中,我们通过分析涉及 CTLA-4 抑制剂治疗的已报道试验,评估了 CTLA-4 抑制剂引起的不良心血管事件的发生率和严重程度。2013 年 1 月 1 日至 2022 年 11 月 30 日以英文发表的随机临床试验,使用 Cochrane 图书馆和 PubMed 数据库进行检索。所有纳入的试验均检查了所有级别和 3-5 级心脏和血管不良事件。这些涉及 CTLA-4 抑制剂与安慰剂、CTLA-4 抑制剂加化疗与单独化疗的比较、CTLA-4 抑制剂联合 PD-1/PD-L1 抑制剂与单独 PD-1/PD-L1 抑制剂的比较以及 CTLA-4抑制剂加靶剂 PD-1/PD-L1 抑制剂加靶剂。使用 Mantel-Haenszel 方法计算比值比 (OR) 和相应的 95% 置信区间 (CI)。总共纳入了 20 项试验。 CTLA-4抑制剂显着增加所有级别心血管毒性的发生率(OR = 1.33,95% CI:1.00-1.75,p = 0.05)。接受单药CTLA-4抑制剂治疗的恶性肿瘤患者所有级别心血管毒性的发生率均升高(OR = 1.73,95% CI:1.13-2.65,p = 0.01),以及3-3级的发生率5 项心血管不良事件(OR = 2.00,95% CI:1.08-3.70,p = 0.03)。与非CTLA-4抑制剂组相比,CTLA-4抑制剂联合化疗、PD-1/PD-L1抑制剂或靶向药物对心脏和血管毒性的发生率没有显着影响。暴露于CTLA-4抑制剂的患者中,3-5级心力衰竭、高血压、心包积液、心肌炎和心房颤动的发生率明显较高,但数据无统计学意义。我们的研究结果表明,所有心血管疾病的发生率服用 CTLA-4 抑制剂的患者的毒性和严重心血管毒性增加。此外,严重心血管毒性事件的风险与不良事件的类型无关。根据这些结果,医生应评估 CTLA-4 抑制剂在治疗恶性肿瘤时的益处和风险。© 2024 作者。约翰·威利 (John Wiley) 出版的《癌症创新》
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024

ZhiyongShi,MiaomiaoL...
A novel selenium analog of HDACi-based twin drug induces apoptosis and cell cycle arrest via CDC25A to improve prostate cancer therapy.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
癌症治疗已从单一药物转向更多基于机制的靶向方法。近年来,HDAC抑制剂与其他抗癌化学物质的结合在癌症治疗方面取得了令人兴奋的进展。在此,我们通过将二氯乙酸酯与含硒的有效 HDAC 抑制剂连接来开发一种新型前药。还研究了该化合物在治疗前列腺癌中的作用和机制。方法:设计并在温和条件下合成相关前药SeSA-DCA。对该化合物的临床前研究,包括药代动力学、细胞毒性和对前列腺癌细胞系的抗肿瘤作用进行了深入研究,并探讨和讨论了其可能的协同机制。结果:SeSA-DCA在生理条件下表现出良好的稳定性,在肿瘤微环境中可快速分解为DCA和SAHA的硒类似物(SeSAHA)。 CCK-8实验发现SeSA-DCA可以有效抑制多种肿瘤细胞系的增殖,尤其是前列腺癌。在进一步的研究中,我们发现SeSA-DCA还可以抑制前列腺癌细胞系的转移并促进细胞凋亡。在动物水平上,口服 SeSA-DCA 导致肿瘤显着消退,且没有明显毒性。此外,作为一种双分子偶联化合物,SeSA-DCA 在体外和体内均表现出比等摩尔 SeSAHA 和 DCA 的混合物优越得多的功效。我们的研究结果为前列腺癌的临床治疗提供了重要的理论基础。结论:我们的体内和体外结果表明,SeSA-DCA 是一种高效的 PCa 抗肿瘤化合物。与单一疗法相比,它可以有效诱导细胞周期停滞和生长抑制,并抑制PCa细胞系的迁移和转移。 SeSA-DCA 减少异种移植物生长的能力比多西紫杉醇稍好,且没有任何明显的毒性迹象。我们的研究结果为临床前列腺癌治疗提供了重要的理论基础。©作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Jun

HaoChen,JiangmeiXu,J...
Recent advances on thermosensitive hydrogels-mediated precision therapy.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
精准治疗因其靶点最佳药物浓度、提高治疗效果、减少不良反应而成为首选。在过去的几年中,可喷雾或可注射的热敏水凝胶表现出了很高的治疗潜力。通过在室温下简单地与自由流动的溶胶相混合,可以将它们用作细胞生长支架或药物释放储库。受其独特性质的启发,热敏水凝胶已广泛应用于精准医学的药物输送和治疗平台。在这篇综述中,研究了用于精准治疗的热敏水凝胶的最新进展,涵盖从热凝胶机制和主要成分到生物医学应用,包括伤口愈合、抗肿瘤活性、成骨和牙周病、鼻窦和眼科疾病。还根据其独特的特点讨论了温敏水凝胶在精准治疗中最有前景的应用和趋势。© 2024 沉阳药科大学。由 Elsevier B.V. 出版
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Frontiers in Genetics
2024

GarethPollin,AngelaJ...
Ehmt2 inactivation in pancreatic epithelial cells shapes the transcriptional landscape and inflammation response of the whole pancreas.
Frontiers in Genetics
简介:常染色质组蛋白甲基转移酶蛋白 2 (EHMT2),也称为 G9a,沉积转录抑制染色质标记,在多个器官的成熟和稳态中发挥关键作用。最近,我们发现小鼠胰腺中 Ehmt2 失活会改变生长和免疫基因表达网络,拮抗 Kras 介导的胰腺癌的发生和促进。在这里,我们阐明了 Ehmt2 在维持保护器官免受炎症的转录景观中的重要作用。方法:对来自 Ehmt2 条件性敲除动物 (Ehmt2 fl/fl ) 的正常产后和年轻成年胰腺组织进行比较 RNA-seq 研究,靶向外分泌胰腺上皮细胞 (Pdx1-Cre 和 P48 Cre/ ),揭示了基因表达网络的变化整个器官与损伤-炎症-修复相关,表明损伤的可能性增加。因此,我们在 Ehmt2 fl/fl 胰腺中诱导炎症修复反应,并使用基于数据科学的方法来整合 RNA-seq 衍生的途径和网络、反卷积数字细胞学和空间转录组学。我们还在形态学、生化和分子病理学水平上分析了组织对损伤的反应。结果和讨论:Ehmt2 fl/fl 胰腺表现出增强的损伤-炎症-修复反应,为了解该过程中涉及的基本分子和细胞机制提供了见解。更重要的是,这些数据表明,外分泌细胞中的条件性 Ehmt2 失活会重新编程局部环境,以招募增强炎症反应所需的间充质和免疫细胞。从机制上讲,这种反应是一种增强的损伤-炎症-修复反应,其中特定 Ehmt2 调节转录本的贡献很小。因此,这一新知识扩展了 Ehmt2 介导的通路在抑制胰腺癌发生和调节炎症性胰腺疾病中的作用机制。版权所有 © 2024 Pollin, Mathison, de Assuncao, Thomas, Zeighami, Salmonson, Liu, Urrutia, Vankayala, Pandol、洪、齐默尔曼、Iovanna、Jin、Urrutia 和 Lomberk。
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