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Cellular & Molecular Immunology
2024 Oct 29
EriOguro-Igashira,Ma...
The pyruvate-GPR31 axis promotes transepithelial dendrite formation in human intestinal dendritic cells.
Cellular & Molecular Immunology
肠腔富含肠道微生物代谢物,可作为肠道免疫细胞的信号分子。 G 蛋白偶联受体 (GPCR) 感知代谢物,可以作为将肠道腔信号转化为宿主免疫反应的关键介质。然而,肠道微生物-GPCR 相互作用对人体生理学的影响尚未完全阐明。在这里,我们发现由肠道细菌代谢物丙酮酸激活的 GPR31 在人肠固有层的 1 型常规树突状细胞 (cDC1) 上特异性表达。使用人类诱导多能干细胞衍生的cDC1和单层人肠道类器官共培养系统,我们发现cDC1将其树突向腔侧的丙酮酸延伸,形成跨上皮树突(TED)。因此,通过丙酮酸激活 GPR31 可以通过 TED 形成有效摄取肠腔抗原(例如饮食化合物和细菌颗粒),从而增强 cDC1 的基本功能。我们的结果强调了 GPCR 在根据局部代谢线索调节人类肠道免疫系统中的作用。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Oct 18
LuyuQi,JunZhu,Zhongy...
Integrated global proteomic and phosphoproteomic analysis of cisplatin-induced apoptosis in A549 cells.
Cellular & Molecular Immunology
蛋白质磷酸化是一种广泛发生且重要的翻译后修饰,是各种生物过程不可或缺的一部分。我们之前使用蛋白质亲和探针来识别顺铂损伤的基因,发现顺铂对蛋白激酶和蛋白磷酸酶基因造成严重损伤。在这项研究中,我们研究了顺铂诱导的 A549 细胞整体蛋白质组和磷酸蛋白质组的变化。使用 Fe-IMAC 珠子和酪氨酸磷酸化富集抗体,我们在顺铂处理的 A549 细胞和对照细胞的三个生物复制中鉴定了 6944 个蛋白质组和 4915 个蛋白质上的 18,274 个磷酸化位点。其中,鉴定出 730 个酪氨酸磷酸化位点,这是顺铂治疗后 A549 细胞中此类位点的最实质性发现。生物信息学分析表明,表现出显着磷酸化水平变化的蛋白质主要涉及RNA加工、修饰、转录、翻译和剪接体。这表明顺铂诱导的蛋白激酶和磷酸酶损伤可能会破坏这些蛋白的正常功能,从而损害 DNA 复制、RNA 翻译和剪切,最终导致肿瘤细胞死亡。此外,我们将蛋白质组数据与之前获得的顺铂损伤基因进行交叉引用,观察到大多数下调的蛋白质源自顺铂诱导的基因损伤。这些数据可在 ProteomeXchange 上获取,标识符为 PXD053902。版权所有 © 2024 Elsevier Inc。保留所有权利。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Oct 18
JizhongShi,ManshanLi...
Two-pronged strategy: A mitochondria targeting AIE photosensitizer for hydrogen sulfide detection and type I and type II photodynamic therapy.
Cellular & Molecular Immunology
用于硫化氢(H2S)检测和缺氧肿瘤光动力治疗(PDT)的多功能I型光敏剂(PSs)表现出诱人的疗效,但仍然是一项具有挑战性的任务。在此,设计并合成了一种线粒体靶向聚集诱导发射(AIE)光敏剂TSPy-SS-P,可用于H2S检测和同时I型和II型PDT。 TSPy-SS-P对肿瘤细胞内源性和外源性H2S检测具有优异的选择性和抗干扰能力。 TSPy-SS-P 能够通过对 H2S 的荧光“关闭”反应来区分具有高水平 H2S 的肿瘤细胞和正常细胞。此外,TSPy-SS-P表现出Ⅰ型和Ⅱ型活性氧(ROS)生成能力,可有效消融缺氧的肿瘤细胞。 TSPy-SS-P表现出线粒体靶向能力,可以原位产生ROS破坏线粒体并促进细胞凋亡。体内PDT实验表明TSPy-SS-P具有优异的肿瘤保留能力、有效的肿瘤消融能力和良好的生物相容性。这项工作提供了一种双管齐下的策略来设计用于 H2S 检测和有效肿瘤 PDT 的细胞器靶向光敏剂。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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Brain Structure & Function
2024 Oct 21
CanChang,LiYao,Xiaoj...
A weakly supervised model for incomplete multimodal MRI synthesis with tumor-aware approach.
Brain Structure & Function
磁共振图像 (MRI) 是研究脑肿瘤的重要工具,多模态序列为脑肿瘤的不同方面提供了独特的见解。然而,在临床实践中,由于各种因素的影响,常常会出现缺失的情况。这使得获得与脑肿瘤相关的全面可靠的信息变得困难。这项工作的目的是开发一种高精度合成缺失MRI模态的算法,并集中于生成准确的肿瘤相关信息以提供更多数据提出了一种名为 TAM-DAM-GAN 的新型弱监督 MRI 合成模型,该模型集成了肿瘤感知和细节调整机制,以提高肿瘤生成的质量。肿瘤感知机制利用弱标签信息引导网络根据局部结构中的关键信息对图像进行分类,从而迫使生成网络识别并突出局部肿瘤区域的学习。细节调整机制利用鉴别器实时创建像素级的注意力图。然后使用这些映射来修改损失权重,从而调整生成的细节。四个任务(T1-to-T2、T2-to-T1、T1-to-FLAIR 和 FLAIR-to- T1) 进行了评估。 BRATS2015 数据集上的实验表明,所提出的方法在定性和定量测量方面均优于其他方法。以 FLAIR-to-T1 为例,与基线相比,TAM-DAM-GAN 将肿瘤区域的 PSNR 从 18.556 提高到 20.576。此外,与仅使用真实FLAIR数据相比,使用真实FLAIR数据和生成的T1数据可以将肿瘤分割精度提高10%。这一发现将有利于提高不完整多模态MRI中跨模态合成的精度,特别是对于肿瘤区域,从而为临床诊断和科学研究提供更可靠、更全面的数据。© 2024 美国医学物理学家协会。
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Brain Structure & Function
2024 Oct 15
XuejiaoChen,WenliMi,...
Astrocytes in the rostral ventromedial medulla mediate the analgesic effect of electroacupuncture in a rodent model of chemotherapy-induced peripheral neuropathic pain.
Brain Structure & Function
化疗引起的周围神经性疼痛加重了癌症幸存者的生活负担。在之前的研究中,电针(EA)对神经性疼痛表现出良好的镇痛作用。我们研究了 EA 在紫杉醇诱导的神经性疼痛小鼠模型中是否有效。我们进一步探讨了星形胶质细胞在延髓头端腹内侧(RVM)这一完善的疼痛调节中心在神经病理性疼痛过程中的功能作用以及电针的镇痛作用。我们发现紫杉醇诱导机械性异常性疼痛、星形细胞钙信号传导以及 RVM 和脊髓中的神经元激活,而这些可以通过电针治疗来抑制。电针有效缓解紫杉醇引起的机械异常性疼痛,并且RVM中星形胶质细胞的化学遗传学激活减弱了这种效果。此外,通过使用 IP3R2 敲除 (IP3R2 KO) 小鼠或将 AAV 介导的 hPMCA2 w/b 显微注射到 RVM 中来抑制星形胶质细胞钙活性,以减少星形胶质细胞中非 IP3R2 依赖性 Ca2 信号传导,对神经性疼痛具有镇痛作用,模仿了EA效应。目前的研究揭示了 RVM 星形胶质细胞在介导 EA 对化疗引起的周围神经性疼痛的镇痛作用中的关键作用。版权所有 © 2024 国际疼痛研究协会。
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Brain Structure & Function
2024 Oct 29
LiJiang,XuxinQi,Mins...
WDR20 prevents hepatocellular carcinoma senescence by orchestrating the simultaneous USP12/46-mediated deubiquitination of c-Myc.
Brain Structure & Function
泛素蛋白酶体系统(UPS)的功能障碍促进了肝细胞癌(HCC)的恶性进展。虽然已经提出以 UPS 为目标进行 HCC 治疗,但确定有效的靶点一直具有挑战性。在这项研究中,我们对针对UPS相关WD40重复(WDR)蛋白的siRNA文库进行了重点筛选,发现沉默WDR20(一种去泛素化酶激活因子)可以选择性抑制HCC细胞的增殖,而不影响正常肝细胞。此外,在异种移植、睡美人转座子/转座酶、水动力尾静脉注射诱导的 HCC 模型以及 Alb-Cre /MYC HCC 转基因小鼠模型中,WDR20 表达的下调诱导 HCC 细胞衰老并抑制肿瘤进展。从机制上讲,我们发现 WDR20 沉默扰乱了 c-Myc 的蛋白质稳定性,同时协调了 USP12/46 介导的 c-Myc 去泛素化,从而促进了 CDKN1A 的转录激活。进一步研究显示,88 个 HCC 临床样本的组织微阵列中 WDR20 和 c-Myc 呈阳性共表达。通过使用来自 HCC 个体的三种患者来源的类器官,我们验证了 WDR20 沉默后 c-Myc 表达的减少以及衰老和生长抑制的显着诱导。这项研究不仅揭示了WDR20的生物学功能并阐明了其对HCC细胞衰老负调控的分子机制,而且还强调了WDR20作为HCC治疗有前景的靶点的潜力。
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Brain Structure & Function
2024 Oct 21
GaladuSubah,SabrinaL...
Rare presentations of glioblastoma multiforme in the septum pellucidum: illustrative case.
Brain Structure & Function
多形性胶质母细胞瘤(GBM)是一种高级别原发性脑肿瘤,由于其侵袭性、浸润性生长和对治疗的有限反应,给神经肿瘤学带来了巨大的挑战。透明隔是 GBM 的一个罕见且意想不到的部位,增加了这种罕见颅内恶性肿瘤的诊断和治疗的复杂性。 一名 69 岁男性,既往有前列腺癌病史,到一家外部医院就诊,病史已有 2 周一种“恍惚状态”和认知能力下降。最初的头部计算机断层扫描显示脑室突出,没有明显的肿块病变。入院后,磁共振成像显示下透明隔内有一个肿块,延伸至第三侧脑室和两侧侧脑室。活检结果显示 GBM,世界卫生组织中枢神经系统肿瘤 4 级,胶质纤维酸性蛋白免疫阳性,Ki-67 标记指数为 60%-70%。在 60 多年的文献中仅鉴定了 5 例,系统评价阐明了透明隔 GBM 的不同临床表现、诊断进展和治疗方法。 https://thejns.org/doi/10.3171/CASE23770。
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BIOINFORMATICS
2024 Oct 21
MichaelKBFord,Ananth...
Biologically-informed Killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR) gene annotation tool.
BIOINFORMATICS
自然杀伤 (NK) 细胞是先天免疫系统的重要组成部分,其活性受到杀伤细胞免疫球蛋白样受体 (KIR) 的显着调节。 KIR 基因的多样性和结构复杂性对准确的基因分型提出了重大挑战,这对于了解 NK 细胞功能及其对健康和疾病的影响至关重要。传统的基因分型方法与 KIR 基因的可变性相矛盾,导致不准确,从而阻碍免疫遗传学研究。这些挑战延伸到了最近由人类泛基因组联盟推广的高质量分阶段组装。本文介绍了 BAKIR(KIR 位点的生物信息注释器),这是一种定制的计算工具,旨在克服高质量、定相基因组组装的 KIR 基因分型和注释的挑战。 BAKIR 旨在通过围绕识别关键功能突变构建注释管道来提高 KIR 基因注释的准确性,从而提高基因和等位基因调用的识别和后续相关性。它使用多阶段作图、比对和变体调用过程来确保高精度的基因和等位基因识别,同时还保持相对于已知等位基因数据库显着突变或截短的序列的高召回率。 BAKIR 已在 HPRC 组件的子集上进行了评估,其中 BAKIR 能够改进许多相关注释并调用新变体。 BAKIR 在 GitHub 上免费提供,通过 pip、conda 和奇异容器等多种安装方法提供轻松访问和使用,并配备了用户友好的命令行界面,从而促进了其在科学界的采用。 BAKIR可在 github.com/algo-cancer/bakir 获取。补充数据可在生物信息学在线获取。由牛津大学出版社 2024 年出版。
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ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
2024 Oct 16
ShidaWu,KuiyouWang,Q...
Enhanced therapeutic intervention of curcumin loaded in exosomes derived from milk in alleviating retinal pigment epithelial cells damage.
ANTIOXIDANTS & REDOX SIGNALING
黄斑是视网膜中一个虽小但非常重要的区域,对于健康的视力至关重要。全球大约 8.7% 的失明是由年龄相关性黄斑变性引起的,而且受影响的人数正在迅速增加。与年龄相关的黄斑变性通常是由氧化应激和过度炎症引起的,这些炎症会损害黄斑中的视网膜色素上皮细胞。姜黄素是一种有效的抗氧化剂和抗炎类胡萝卜素,但由于食品科学中的低相容性和稳定性问题而受到阻碍。创新地,这项研究利用牛奶来源的外泌体作为一种新颖的递送方法,产生姜黄素注入系统(姜黄素@外泌体),以提高其生物相容性和稳定性。这种融合不仅抑制了过多的活性氧,还中和了细胞模型中 H2O2 诱导的线粒体破坏。它使视网膜色素上皮细胞恢复活力,在体外将其功能恢复到接近基线的水平。姜黄素@外泌体在抑制碘酸钠诱导的促炎细胞因子肿瘤坏死因子-α和白细胞介素-1β方面表现出色。这项研究表明姜黄素@外泌体有望成为治疗以氧化和炎症为特征的视网膜疾病的干预措施。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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JOURNAL OF THE AMERICAN COLLEGE OF SURGEONS
2024 Oct 21
MuhammadMusaabMunir,...
Trajectory Analysis of Healthcare Use Before and After Gastrointestinal Cancer Surgery.
JOURNAL OF THE AMERICAN COLLEGE OF SURGEONS
虚弱与较差的术后结果和较高的手术成本相关,但对医疗保健利用率的长期影响仍然不明确。我们试图评估胃肠癌患者手术前和术后的医疗保健利用模式,并描述其与虚弱的关系。接受肝癌、胆道癌、胰腺癌、结肠癌和直肠癌手术切除的患者的数据来自 2005 年至2020 SEER-医疗保险数据库。使用基于索赔的虚弱指数评估虚弱程度。基于群体的轨迹模型确定了具有离散医疗保健利用模式的患者群体。根据术前因素(包括虚弱程度)进行多变量回归来预测聚类成员资格。在 66,684 名受益人中,根据手术前后 12 个月的数据确定了四种不同的利用轨迹。手术当月利用率激增后,大多数患者恢复到手术前基线利用率(低:n=6588,9.9%;中:n=17,627,26.4%;高:n=29,850,44.8%)。然而,涉及 12,619 名 (18.9%) 患者的显着轨迹被确定,其中手术促使从术前“低”利用率状态转变为术后“高”利用率状态。体弱的患者更有可能属于那些转变为高利用者的人(低:4.2% vs. 转变:12.6% vs. 高:7.5%;p<0.001)。在纳入术前变量的多变量分析中,虚弱与高群体轨迹成员资格相关(参考:最低和中等;最高:OR 4.90,95%CI 4.49-5.35;p<0.001)。胃肠癌患者在术后表现出不同的医疗保健利用集群手术切除。术前预测模型可能有助于区分不同的医疗保健利用轨迹,从而帮助在术后期间为患者提供量身定制的护理。版权所有 © 2024 美国外科医生学会。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版。保留所有权利。
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