非编码RNA (ncRNA)，包括环状RNA (circRNA)和长非编码RNA (lncRNA)，是真核基因组中广泛鉴定的独特RNA分子。它们的失调已被发现，并在包括各种癌症在内的许多疾病的发病机制中发挥着关键作用。以前被认为缺乏蛋白质编码能力，最近的研究表明，这些 ncRNA 中的少量开放阅读框 (ORF) 赋予它们蛋白质编码的潜力。这些ncRNA衍生的肽或蛋白质已被证明可以通过不同的机制调节各种生理和病理过程。它们在疾病诊断和靶向治疗中的新兴作用强调了它们在临床环境中的潜在用途。这篇综合综述旨在系统概述 lncRNA 和 circRNA 编码的蛋白质或肽，阐明其产生和功能机制，并探索其在癌症诊断、疾病预测和靶向治疗中的前景应用。© 2024。作者。

癌症研究的最新进展强调了三级淋巴结构 (TLS) 在调节免疫反应中的关键作用，特别是在乳腺癌 (BRCA) 中。在这里，我们使用基于生物网络的计算策略和机器学习 (ML) 方法对来自 6000 多个 BRCA 样本的大量转录组数据进行了综合分析，并将 LGALS2 确定为 TLS 中的关键标记。单细胞测序和空间转录组学揭示了 LGALS2 在 TLS 相关树突状细胞 (DC) 刺激中的作用，并揭示了宏观和微观层面上肿瘤微环境 (TME) 的复杂性。 LGALS2 表达升高与生存期延长相关，这与强大的免疫反应有关，其特征是多样化的免疫细胞浸润和活跃的抗肿瘤途径，导致“热”肿瘤微环境。 LGALS2 与 TLS 相关 DC 的共定位及其在 BRCA 免疫激活中的作用通过苏木精-伊红 (HE)、免疫组织化学 (IHC) 和体内验证分析得到证实。 LGALS2 被鉴定为 BRCA 的关键因素，不仅凸显了其在新型 TLS 定向免疫疗法中的治疗潜力，而且还为患者分层和治疗选择开辟了新途径，最终改善了临床管理。© 2024。作者。

白蛋白结合型紫杉醇联合吉西他滨（AG）方案是胰腺癌的主要化疗方案，但常发生耐药。目前，促进耐药病例致敏的能力是一个重要的临床问题，而重新利用常规药物的策略是一个有前途的策略。本研究旨在寻找一种针对化疗耐药核心信号通路的经典药物，并将其与 AG 方案相结合以增强化疗敏感性。我们还旨在寻找药物组合敏感性的可靠预测生物标志物。通过 RNA 测序，我们发现异常 PI3K/Akt 通路激活在介导 AG 方案耐药性中发挥着核心作用。随后，通过随机选择的AG耐药患者来源的类器官（PDO）和PDO异种移植模型的内部和外部验证，我们首次发现经典抗炎药物舒林酸K-80003，一种PI3K/Akt抑制剂我们关注的途径促进了一半（14/28）AG 耐药胰腺导管腺癌病例的敏化。通过 RNA 测序、多重免疫荧光染色和免疫组织化学实验，我们确定 cFAM124A 是舒林酸 K-80003 促进 AG 致敏的新型生物标志物。它作为致敏标记物的作用通过以下机制来解释：cFAM124A 增强组织蛋白酶 L 的 mRNA 表达和组织蛋白酶 L 酶的活性。这种双重效应刺激 RXRα 的裂解，导致大量截短的 RXRα，成为 K-80003 的直接靶标。因此，该过程导致 PI3K/Akt 通路的病理激活。总之，我们的研究为耐药胰腺癌患者提供了新的治疗策略和新的生物学靶点。© 2024。作者。

肠癌（IC）构成了重大的全球健康挑战，促使人们不断努力探索有效的治疗方式。 IC 的传统治疗方法是有效的，但存在一些局限性和缺点。中草药（CHM）在整体癌症预防和治疗策略中发挥着重要作用。近年来，越来越多的研究关注中药在 IC 治疗中的潜力，在管理 IC 和减轻放疗和化疗的不良反应方面显示出有希望的结果。本综述提供了中药在 IC 治疗中作用的临床前研究和临床观察的最新信息，提供了对其综合管理的见解并指导未来的预防策略和临床实践。© 2024。作者。

肝癌、胆道癌和胰腺癌因其高度恶性而对消化系统疾病领域提出了重大挑战。中医药（TCM）作为一种潜在的治疗方法而受到关注，在中国长期使用且临床疗效得到公认。在这篇综述中，我们系统地总结了中医药在治疗肝癌、胆道癌和胰腺癌的临床试验中显示出的良好效果的临床应用。我们重点介绍了几种经过严格临床试验验证疗效的常用中药疗法，包括槐耳颗粒、花蟾素和淫羊藿素。活性化合物及其潜在靶点已得到彻底阐明，为中药抗癌药物发现的潜力提供了宝贵的见解。我们强调进一步研究的重要性，以弥合中医与现代肿瘤学之间的差距，促进针对这些具有挑战性的恶性肿瘤的循证中医治疗的发展。© 2024。作者。

了解肿瘤的耐药机制对于推进癌症治疗至关重要。由 Gustave Roussy 领导的前瞻性 MATCH-R 试验 (NCT02517892) 旨在通过新鲜肿瘤活检的分子分析来表征癌症治疗的耐药机制。本报告介绍了 2015 年至 2022 年进行的 MATCH-R 研究的基因组数据分析，重点关注靶向治疗。该研究包括接受图像引导肿瘤活检的耐药转移患者 (pts)。在评估冷冻组织活检中的肿瘤含量（TC）后，在抗癌治疗之前和/或之后进行靶向NGS（10 < TC < 30%）或全外显子组测序和RNA测序（TC > 30%）。通过将肿瘤碎片植入 NOD scid gamma 小鼠体内并扩增至 5 代来建立患者来源的异种移植物 (PDX)。从 857 名患者中收集了总共 1,120 个活检组织，最常见的肿瘤类型是肺（38.8%）、消化道（ 16.3%）和前列腺癌（14.1%）。 30.9% (n = 265/857) 的患者中发现了分子靶向驱动因素，其中 EGFR (41.5%)、FGFR2/3 (15.5%)、ALK (11.7%)、BRAF (6.8%) 和 KRAS (5.7) %) 是最常见的改变基因。此外，66.0% (n=175/265) 在靶向治疗进展时进行了活检。在耐药病例中，41.1% (n = 72/175) 没有明确的分子机制，32.0% (n = 56/175) 表现出靶向耐药性，25.1% (n = 44/175) 表现出旁路耐药机制。对 44 名旁路耐药患者的分子谱分析发现了 51 种变异，其中包括 KRAS (13.7%)、PIK3CA (11.8%)、PTEN (11.8%)、NF2 (7.8%)、AKT1 (5.9%) 和 NF1 (5.9) %) 是改变最多的基因。治疗针对 45% 的患者进行了定制，并确定了耐药机制，使临床获益中位延长 11 个月。总共将341个活检组织植入小鼠体内，成功建立136个PDX模型，成功率达39.9%。 PDX 模型可用于 EGFR (n = 31)、FGFR2/3 (n = 26)、KRAS (n = 18)、ALK (n = 16)、BRAF (n = 6) 和 NTRK (n = 2) 驱动的癌症。这些模型在分子改变和药理学状态方面密切地概括了原始肿瘤的生物学，并作为验证克服治疗策略的有价值的模型。MATCH-R 研究强调了有意图像引导肿瘤活检和 PDX 建立来表征的可行性耐药机制并指导个性化治疗，以改善经治疗的转移性患者的结果。© 2024。作者。

尤文肉瘤 (ES) 由于难以靶向其主要肿瘤驱动因子 EWS::FLI1，因此带来了重大的治疗挑战。我们表明，通过抑制 P300/CBP 来对 EWS::FLI1 转录复合物进行药理学靶向可驱动与直接敲低 EWS::FLI1 类似的整体转录结果，并进一步产生 ES 患者结果的预后风险因素。我们发现 EWS::FLI1 在 ES 细胞和 EWS::FLI1 允许的间充质干细胞中通过重复的 GGAA 基序识别和乙酰化编码上调 LMNB1，当 P300 抑制逆转时，会导致 ES 细胞衰老。然后可以通过针对 PI3K 信号通路的 senolytics 消除 P300 抑制的衰老 ES 细胞。 ES 细胞对这种联合疗法的脆弱性为未来的治疗探索提供了一种有吸引力的协同策略。© 2024。作者。

最近的研究表明，CHK1、ATR 和 WEE1 抑制剂等复制检查点调节剂 (RCM) 在实体瘤（包括铂类耐药的高级别浆液性卵巢癌 (HGSOC)）中具有良好的单药治疗活性。然而，临床反应率普遍低于30%。虽然 RCM 诱导的 DNA 损伤已在临床前和临床研究中得到广泛研究，但复制检查点中断与肿瘤缩小之间的联系仍不完全清楚。在这里，我们利用 HGSOC 细胞系和患者来源的异种移植物 (PDX) 来研究从 RCM 治疗到卵巢癌细胞死亡的事件。这些研究表明，RCM 在体外增加 CDC25A 水平和 CDK2 信号传导，导致 HGSOC 细胞系的细胞周期进程失调和复制应激增加，与同源重组状态无关。这些事件导致 JNK 和多个 BH3-only 蛋白的连续激活，包括 BCL2L11/BIM、BBC3/PUMA 和 BMF，所有这些都是完全启动 RCM 诱导的细胞凋亡所必需的。相同信号通路的激活发生在 HGSOC PDX 中，这些 PDX 对聚（ADP-核糖）聚合酶抑制剂具有抗性，但在体外对 RCM 做出反应，导致 3 维培养中的细胞数量减少，在体内则出现异种移植物收缩或生长显着减弱速度。这些发现确定了将复制检查点抑制与卵巢癌抗肿瘤反应联系起来的关键细胞死亡启动事件。© 2024。作者。

与其他类型的肿瘤疫苗相比，RNA疫苗因其高效、快速开发能力以及低成本制造和安全给药的潜力而成为传统疫苗疗法的有前途的替代品。 RNA疫苗主要包括mRNA、环状RNA（circRNA）和自扩增mRNA（SAM）。针对不同肿瘤的不同RNA疫苗平台在动物和人类模型中显示出令人鼓舞的结果。该综述全面介绍了RNA疫苗在抗肿瘤治疗中的进展和应用。还讨论了将这一有前景的疫苗平台扩展到广泛治疗用途的未来方向。© 2024。作者。

乳腺癌仍然是一个重大的健康问题，三阴性乳腺癌 (TNBC) 是一种预后不良的侵袭性亚型。上皮间质转化（EMT）对于早期肿瘤向侵袭性恶性肿瘤的进展非常重要。 Snail 是 EMT 的核心成分，受到严格调控，可能会受到蛋白酶体降解。我们报告了 Snail 降解中涉及伴侣介导的自噬 (CMA) 的一种新的蛋白酶体独立途径，通过其与 HSC70 的胞质相互作用和溶酶体靶向介导，从而阻止其在管腔型乳腺癌细胞中积累。相反，Snail 主要定位于细胞核，从而避免 TNBC 细胞中 CMA 介导的降解。饥饿诱导的 CMA 激活通过促进细胞质易位下调 TNBC 细胞中的 Snail。逃避 CMA 介导的 Snail 降解可诱导 EMT，并增强管腔型乳腺癌细胞的转移潜力。我们的研究结果阐明了 CMA 在 Snail 调节中先前未被认识的作用，强调了其在乳腺癌中的重要性，并为临床干预提供了潜在的治疗靶标。© 2024。作者。