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Stem Cell Research & Therapy
2024 May 31

YoelGoldstein,OraTCo...
Particle uptake in cancer cells can predict malignancy and drug resistance using machine learning.
Stem Cell Research & Therapy
肿瘤异质性是导致治疗失败的主要因素。能够根据癌细胞的功能对癌细胞进行分类的预测工具可以大大增强治疗效果并延长患者的寿命。此处利用细胞生物力学和癌细胞功能之间的联系,通过颗粒摄取的机械测量对细胞进行分类。机器学习 (ML) 用于根据单细胞摄取不同尺寸颗粒的模式对细胞进行分类。研究了三对人类癌细胞亚群,它们的耐药性或恶性程度各不相同。让细胞与尺寸范围为 0.04 至 3.36 μm 的荧光标记聚苯乙烯颗粒相互作用,并使用流式细胞术分析其摄取模式。机器学习算法准确分类癌细胞亚型,准确率超过 95%。摄取数据对于形态相似的细胞亚群特别有利。此外,发现摄取数据可以作为一种“标准化”形式,可以减少重复实验中的变化。
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Stem Cell Research & Therapy
2024 May 29

GangWang,HangdiWu,Xi...
Kidney Organoid Modeling of WT1 Mutations Reveals Key Regulatory Paths Underlying Podocyte Development.
Stem Cell Research & Therapy
Wilmstumor-1(WT1)是调节足细胞发育的重要转录因子。然而,WT1在足细胞发育过程中发挥功能的表观基因组机制尚未完全阐明。在这里,生成胎儿肾脏和肾脏类器官的单细胞染色质可及性和基因表达图谱。确定了 WT1 靶向基因的功能意义,这些基因对于足细胞的发育及其结构的维持至关重要,包括调节 WNT 信号通路的 BMPER/PAX2/MAGI2、维持肌动蛋白丝组织的 MYH9 和调节细胞连接组装的 NPHS1 。为了进一步说明 WT1 介导的转录调控在足细胞发育过程中的功能重要性,培养并植入了源自 WT1 杂合错义突变患者的诱导多能干细胞 (iPSC) 的患者来源的肾脏类器官。单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 和功能测定的结果证实,WT1 突变无法激活靶向基因 MAGI2、MYH9 和 NPHS1,从而导致足细胞发育延迟并对细胞结构造成损害。值得注意的是,使用 CRISPR-Cas9 基因编辑纠正患者 iPSC 中的突变可以挽救足细胞表型。总的来说,这项工作阐明了与人类足细胞发育相关的 WT1 相关表观基因组景观,并确定了 WT1 突变的致病作用。© 2024 作者。 《Advanced Science》由 Wiley‐VCH GmbH 出版。
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Stem Cell Research & Therapy
2024 May 29

JuanMontoro,MaudNgoy...
PTCy versus CNI-based GVHD prophylaxis in HLA-matched transplants for Hodgkin Lymphoma: a study of the LWP of the EBMT.
Stem Cell Research & Therapy
在霍奇金淋巴瘤 (HL) 患者中,比较移植后环磷酰胺 (PTCy) 与传统的基于钙调磷酸酶抑制剂 (CNI) 的 GVHD 预防方案的疗效的研究很少。本研究旨在使用 2015 年 1 月至 2022 年 12 月期间向 EBMT 数据库报告的数据,比较接受来自 HLA 匹配供体的造血干细胞移植的 HL 患者的结果,这些患者接受了基于 PTCy 或传统 CNI 方案的 GVHD 预防。在该队列中,270 名接受者接受了基于 CNI 的传统预防,176 名接受者接受了 PTCy 预防。值得注意的是,与基于 CNI 的预防相比,PTCy 预防与造血恢复延迟相关,但也具有较低的慢性 GVHD 风险(25% 与 43%,p<0.001)和广泛慢性 GVHD(13% 与 28%,p=0.003)。队列。基于 PTCy 和 CNI 的 2 年累积非复发死亡率和复发发生率分别为 11% 和 17% (p=0.12) 以及 17% 和 30% (p=0.007)。此外,与基于 CNI 的组相比,PTCy 组的 2 年总生存率、无进展生存率和无 GVHD、无复发生存率均显着更好:85% 对比 72% (p=0.005),72分别为 % 与 53% (p<0.001) 和 59% 与 31% (p<0.001)。在多变量分析中,与基于 CNI 的平台相比,PTCy 与较低的慢性和广泛慢性 GVHD 风险、减少的复发以及更好的 OS、PFS 和 GRFS 相关。我们的研究结果表明,对于接受 HLA 匹配供体的 HSCT 的成年 HL 患者,与传统的基于 CNI 的预防相比,PTCy 作为 GVHD 预防可提供更有利的结果。版权所有 © 2024 美国血液学会。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 May 29

WanhuiZhou,DaoningLi...
Rapid and Precise Diagnosis of Retroperitoneal Liposarcoma with Deep-Learned Label-Free Molecular Microscopy.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
腹膜后脂肪肉瘤(RLPS)是一种罕见的恶性肿瘤,其唯一的治疗方法是手术切除。然而,高分化脂肪肉瘤(WDLPS)是其最常见的类型之一,如果没有有效的切缘评估方法,在手术过程中很难将其与正常脂肪区分开,严重危害预后且复发风险很高。在这里,我们结合了双无标记非线性光学模式、受激拉曼散射 (SRS) 显微镜和二次谐波发生 (SHG) 显微镜,对 35 个 RLPS 和 34 个正常脂肪样本中的两种主要组织生物分子、脂质和胶原纤维进行成像。 35名患者。生成的双模态组织图像用于基于深度学习的 RLPS 诊断。反映了肿瘤进展过程中脂质的显着降低和胶原纤维的增加。基于 ResNeXt101 的模型在区分正常脂肪、WDLPS 和去分化脂肪肉瘤 (DDLPS) 方面实现了 94.7% 的总体准确率和 0.987 ROC 曲线下平均面积 (AUC)。特别是,WDLPS 的检测精度和灵敏度分别为 94.1% 和 84.6%,优于现有方法。消融实验表明,这种性能归功于SRS和SHG显微镜,它们分别将识别WDLPS的灵敏度提高了16.0和3.6%。此外,我们在 RLPS 边缘上利用该模型来识别肿瘤浸润。我们的方法对于术中脂肪肉瘤的准确检测具有巨大的潜力。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 May

IsaacPHorn,AnnaLZaka...
Genetic Testing Utilization: Discrepancies Between Somatic and Germline Results in Patients With Cancer Reviewed at the UW Health Precision Medicine Molecular Tumor Board.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
体细胞和种系检测越来越多地用于评估癌症患者的风险。尽管种系测试和体细胞测试都可以识别可能改变患者护理和合格治疗的基因变异,但这些测试的目的及其技术有根本不同,不能互换使用。这项研究检查了华盛顿大学健康中心癌症患者的体细胞和种系基因检测的时间和结果。877 名参与者接受了体细胞基因检测,并由精准医学分子肿瘤委员会 (PMMTB) 进行了审查。患者被诊断患有癌症,包括乳腺癌、结直肠癌、子宫内膜癌、胰腺癌或卵巢癌,并符合国家综合癌症网络生殖系基因检测标准。通过病历审查收集生殖系检测详细信息。这项研究的结果发现,只有 310 名患者 (35%) 在 PMMTB 审查之前进行了生殖系评估。在可作用基因中鉴定出的种系致病/可能致病变异的百分比为 28%。大多数种系变异是在 BRCA1 (26%) 和 BRCA2 (28%) 基因中发现的。通过种系测试和体细胞测试,总共检测到 65% (54/83) 的种系变异;然而,35% (29/83) 的种系变异在体细胞结果中未被识别。这些结果证明了结合种系和体细胞检测的重要性。这项研究强调了基因检测类型的差异,并表明在诊断的早期阶段进行种系检测对于识别癌症患者潜在的可操作的和治疗特异性的变异是必要的。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 May 15

JulienTaieb,DeboraBa...
Standardizing data collection in adjuvant colon cancer trials: A consensus project from the IDEA and ACCENT international consortia and national experts.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
尽管最近的临床试验做出了贡献,但辅助结肠癌(CC)的一些问题和挑战仍未解决。因此,应该计划进一步的研究,以更好地完善风险评估,并在辅助环境中建立最佳治疗策略。然而,有必要要求充分的、当代的和相关的变量,并均匀地报告它们,以便在分析其预后价值时带来最大的信息。该项目的设计是为了获得参与第二阶段的规划、应计和分析的专家的共识。 III CC 临床试验,以确定强制性和推荐的基线变量,以便 i) 协调全球范围内专门用于 CC 辅助治疗的临床试验的未来数据收集; ii) 为此类情况下临床试验中使用的病例报告表提出指南。总共72个与辅助临床试验中应报告的变量以及如何报告这些变量相关的问题获得批准,然后由小组成员投票达成最终共识。有关患者相关因素、组织病理学特征、分子概况、循环生物标志物的数据项整个专家组对血液分析进行了分析和讨论。对于每个项目,我们都会报告支持所达成的共识和讨论的相关问题的数据。对于已切除的 III 期患者,有 19 项被认为是强制性的,对于已切除的 II 期患者,有 24 项被认为是强制性的。此外,分别有9个和4个项目被判断为III期和II期推荐。我们认为,随着研究小组设计未来辅助结肠癌领域的临床试验,这28个变量应该在更全面的CRF中使用和统一报告.版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。
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Epigenetics & Chromatin
2024 May 29

TaherehBarati,Zohreh...
miR-449a: A Promising Biomarker and Therapeutic Target in Cancer and Other Diseases.
Epigenetics & Chromatin
在基因表达的调控中,非编码 RNA (ncRNA) 等表观遗传因子在遗传学中发挥着同等的作用。 microRNA (miRNA) 是 ncRNA 家族的成员,在转录后基因调控中的作用已得到充分证明,并且对正常和异常的生物过程(例如血管生成、增殖、存活和凋亡)具有重要影响。本研究的目的是通过分析各种数据库已发表的结果来综合先前关于 miR-449a 的研究,因为已经有许多关于 miR-449 可能参与人类疾病发展的研究。根据我们的研究结果,miR-449在多种疾病中严重失调,从各种癌症到心血管疾病、认知障碍和呼吸系统疾病,它可能在这些问题的发展中发挥关键作用。此外,miR-449a 作为几个众所周知的基因表达的关键调节因子,包括 E2F-3、BCL2、NOTCH1 和 SOX4。这反过来又调节与癌症相关的各种途径和过程,包括Notch、PI3K和TGF-β,并有助于提高癌症药物敏感性。奇怪的是,这种 miRNA 表达的异常可以作为区分健康人和患者或评估特定疾病的生存率的诊断或预后指标。本文概述了目前对 miR-449a 通过调节基因表达以及与这些基因及其相关过程相关的生物过程在人类疾病发展中的作用的理解。此外,我们还讨论了 miR-449a 作为一系列肿瘤和非肿瘤疾病的临床特征(诊断和预后)指标的潜力。总的来说,我们的目标是全面了解 miR-449a 在不同疾病中的众多功能。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC(Springer Nature 旗下公司)的独家许可。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 May 29

ZhendongChen,MaxTaub...
A Semi-Mechanistic Population Pharmacokinetic Model of Noscapine in Healthy Subjects Considering Hepatic First-Pass Extraction and CYP2C9 Genotypes.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
诺斯卡品是一种常用的止咳药,对其抗炎和抗肿瘤特性的研究正在进行中。该药物具有显着的药代动力学变异性。本评价旨在使用半机械群体药代动力学模型描述那斯卡品的药代动力学,并确定可以解释个体间药代动力学变异性的协变量。48 名健康志愿者(30 名男性和 18 名女性,平均年龄 33 岁)被纳入一项随机、两期、两阶段、交叉生物等效性研究,研究诺斯卡品在两种不同液体制剂中的生物等效性。分别通过非房室分析和群体药代动力学模型评估口服50 mg那斯卡品后的那斯卡品血浆浓度。与参比制剂相比,受试制剂的比率(置信区间为94.12%)为0.784(0.662-0.929) ) 和血浆浓度-时间曲线下面积分别为 0.827 (0.762-0.925) 和 0.827 (0.762-0.925)。当比较 CYP2C9 基因型预测表型之间的血浆峰浓度和血浆浓度-时间曲线下面积时,观察到 p 值存在显着差异 (< 0.01)。具有零级吸收和一阶消除过程的三室模型最好地描述了等离子体数据。肝室的引入能够描述诺斯卡品深刻的首过效应。总体重和 CYP2C9 基因型预测表型均被确定为表观清除率的显着协变量,对于强代谢者(CYP2C9*1/*1 和 *1/*9),表观清除率估计为 958 ± 548 L/h,531 ±活性评分为 1.5 的中间代谢者为 304 L/h (CYP2C9*1/*2),活性评分为 1.0 的弱代谢者和中间代谢者为 343 ± 197 L/h (CYP2C9*1/*3,* 2/*3和*3/*3)。目前的工作预计将促进那可平未来药代动力学/药效学的发展。这项研究在开始之前已在“Deutsches Register Klinischer Studien”注册,注册号为: DRKS00017760.© 2024。作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 May 29

PaulinaChmiel,PiotrR...
What is the Optimal Treatment Strategy after Sarcoma R2 Surgery?
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
软组织肉瘤(STS)是罕见的间叶源性肿瘤,最常见于四肢,但也发生于腹膜后。 STS 的治疗方法是大范围根治性手术,在某些情况下结合围手术期放疗和化疗。 STS 的非根治性切除 (R2) 是近几十年来的一个新问题,因为最佳的后续治疗仍然存在争议。同样,对于最佳手术切缘仍没有达成共识。在辅助治疗中结合多种治疗方式可以实现切缘阳性手术后患者的局部和远处控制。因此,接受非根治性切除的患者需要额外的手术干预和辅助放疗,预后较好,但并发症数量较多。非根治性治疗后,四肢和躯干壁肉瘤以及腹膜后肉瘤患者还应加强肿瘤监测。鉴于此类临床情况中可能出现的潜在问题,更新当前指南以改善这些患者的长期预后至关重要。© 2024。作者。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 May 28

YanlingLi,QingyingYu...
Jingfang granules protects against intracerebral hemorrhage by inhibiting neuroinflammation and protecting blood-brain barrier damage.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
脑出血(ICH)可诱发强烈的氧化应激、神经炎症和脑细胞凋亡。然而,传统的脑出血治疗方法有很多缺点。迫切需要副作用最小的替代有效疗法。采用药效学实验、分子对接、网络药理学、代谢组学等方法探讨荆防颗粒(JFG)治疗脑出血的作用及其机制。在这项研究中,我们通过行为、脑含水量和磁共振成像实验研究了 JFG 对 ICH 的治疗效果。然而,JFG 的关键活性成分和目标仍然未知。这里我们验证了JFG对于改善ICH后的脑损伤是有益的。网络药理学分析表明,JFG 的抗炎作用主要是通过木犀草素、( )-Anomalin 和 Phaseol 激活磷脂酰肌醇 3-激酶 (PI3K)/AKT 通路以及靶向 AKT1、肿瘤坏死因子 α 介导的。 TNF-α) 和白介素-1β (IL-1β)。分子对接分析显示平均亲和力为-8.633 kcal/mol,表明结合强度小于-5 kcal/mol。代谢组学分析表明,JFG通过调节牛磺酸和亚牛磺酸的代谢、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成等代谢途径发挥对ICH的治疗作用。总之,我们证明 JFG 通过激活 PI3K/Akt 信号通路减轻 ICH 后的神经炎症和 BBB 损伤。
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