研究动态
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Apr
AudreyGraceliaRiwu,J...
Anti-inflammatory effect of Faloak (Sterculia quadrifida R. Br) stem bark on TNF-α, IL-1β, and IL-6 in DENV-3-infected Wistar rats.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
登革热感染可以引发免疫反应,导致炎症反应,作为保护宿主的防御机制。登革热感染导致促炎细胞因子的释放增加,包括肿瘤坏死因子-α (TNF-α)、白介素-1β (IL-1β) 和白细胞介素-6 (IL-6)。这三种细胞因子已被证明与血小板减少症和血浆渗漏的发生有关,而血浆渗漏又与疾病的严重程度有关。本研究旨在研究 faloak (Sterculia fourrifida R. Br) 茎皮对 TNF-α、感染登革热(特别是 DENV-3)的 Wistar 大鼠中的 IL-1β 和 IL-6 水平。将 27 只年龄为 2-3 个月、体重为 200-300 g 的雄性 Wistar 大鼠(Rattusnorvegicus)分为三个不同组:健康组、登革热组和治疗组(登革热感染和提取物)。登革热组和治疗组的大鼠均通过腹膜内途径注射DENV-3,滴度为105 pfu,剂量为0.8 cc。 DENV-3的增殖是使用C6/36细胞开始的,并且经历了四次传代。通过鼻胃管口服提取物,剂量为 1,500 mg/kg 体重,每天一次,持续 7 天。健康组在第一天采血,登革热组和治疗组分别在第五天和第八天采血。与健康组相比,登革热组和治疗组在第5天的TNF-α水平存在显着差异。感染后。事后分析显示,登革热治疗组和登革热健康组之间存在统计学显着差异。与健康组相比,感染后第 5 天和第 8 天,登革热组和健康组的 IL-1β 水平存在显着差异。治疗组在第 5 天和第 8 天的 IL-6 水平下降幅度小于登革热组。然而,没有观察到统计学上的显着差异。 S. fourrifida 的茎皮显示出作为登革热感染抗炎剂的潜力,特别是其降低 TNF-α 和 IL-1β 水平的能力。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2024 Mar 25
XiangyuZhang,Yingcha...
Ferroptosis: Iron-mediated cell death linked to disease pathogenesis.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
铁死亡是一种铁介导的调节性细胞死亡模式,其特征是氧化损伤。其分子调节机制与铁代谢、脂质过氧化、谷胱甘肽代谢有关。此外,一些免疫信号通路,如干扰素基因轴的环化GMP-AMP合酶刺激剂、Janus激酶信号转导器和转录1轴激活剂、转化生长因子β1-Smad3轴等也可能参与铁死亡的调节。 。研究表明,铁死亡与癌症、神经退行性疾病、炎症性疾病、自身免疫性疾病等多种疾病密切相关。考虑到铁死亡调节信号在多种疾病发病机制中的关键作用,铁死亡诱导剂或抑制剂的开发可能对治疗上述病症具有重要的临床潜力。
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npj Systems Biology and Applications
2024 May 28
ChenChen,MeghaPadi
Flexible modeling of regulatory networks improves transcription factor activity estimation.
npj Systems Biology and Applications
转录调控在决定细胞命运和疾病方面发挥着至关重要的作用,但从基因表达数据推断关键调控因子仍然是一个重大挑战。现有的估计转录因子 (TF) 活性的方法通常依赖于静态 TF-基因相互作用数据库,无法适应不同细胞类型和疾病条件下调节机制的变化。在这里,我们提出了一种新算法 - 使用基因表达和调控数据的转录推理 (TIGER) - 通过灵活地建模激活和抑制事件、增加基本边缘的权重、通过稀疏贝叶斯先验将不相关的边缘缩小到零来克服这些限制,以及同时估计 TF 活动水平和基础监管网络的变化。当应用于酵母和癌症 TF 敲除数据集时,TIGER 在预测准确性方面优于同类方法。此外,我们将 TIGER 应用于组织和细胞类型特异性 RNA-seq 数据,证明了其揭示调控机制差异的能力。总的来说,我们的研究结果强调了在推断转录因子活动时对特定环境调节进行建模的实用性。© 2024。作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 May 29
JDavidChamorroCañon,...
Electrochemical Characterization of the Encapsulation and Release of 5-Fluorouracil in Nanocarriers Formed from Soy Lecithin Vesicles.
Cellular & Molecular Immunology
5-氟尿嘧啶 (5-FU) 是一种抗肿瘤药物,因其生物利用度低和细胞渗透有限而闻名,通常会对健康细胞产生不利影响。因此,寻找能够增强生物利用度、实现控制释放并减轻不利影响的载体至关重要。该研究的重点是将 5-FU 封装在大豆卵磷脂囊泡 (SLV) 中,并评估其对载体特性和功能的影响。结果表明,加入 5-FU 不会影响 SLV 的大小或多分散性,甚至在冻干后也是如此。从 SLV 中释放 5-FU 需要破坏系统而不是自发释放,使用方波伏安法测定的封装效率约为 43%。对结直肠癌细胞的细胞毒性测定显示,基于 SLV 的递送具有显着功效,超过了游离药物溶液的效果,72 小时后细胞活力为 45%,而细胞活力为 73%。该研究通过创建一种生物相容性纳米载体来实现高效药物输送,解决了 5-FU 有限的生物利用度问题,并强调 SLV 由于持续的抗增殖作用和改善的细胞摄取而有望用于靶向癌症治疗。该研究强调了定制药物输送系统在增强治疗效果方面的重要性,并建议 SLV/5-FU 制剂作为癌症治疗策略的潜在进步。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Jun
BrendanBender,Chi-Ch...
Population pharmacokinetics and CD20 binding dynamics for mosunetuzumab in relapsed/refractory B-cell non-Hodgkin lymphoma.
Cellular & Molecular Immunology
Mosunetuzumab (Mosun) 是一种 CD20xCD3 T 细胞接合双特异性抗体,可重定向 T 细胞以消除恶性 B 细胞。批准的 1/2/60/30mg IV 逐步剂量方案旨在减轻细胞因子释放综合征 (CRS) 并最大限度地提高早期周期的疗效。群体药代动力学 (popPK) 模型是根据 439 名接受 Mosun IV 单药治疗的复发/难治性 B 细胞非霍奇金淋巴瘤患者开发的,包括固定剂量(每 3 周 (q3w) 0.05-2.8mg IV)和第 1 周期递增给药组(0.4/1/2.8-1/2/60/30 mg IV q3w)。在 Mosun 治疗之前,约 50% 的患者残留有先前治疗中的抗 CD20 药物(例如利妥昔单抗或 obinutuzumab)。 CD20 受体结合动力学和利妥昔单抗/obinutuzumab PK 被纳入模型中,以计算随时间变化的 Mosun CD20 受体占据百分比 (RO%)。具有时间依赖性清除率 (CL) 的两室模型最好地描述了数据。典型患者的初始 CL 为 1.08L/天,过渡到稳态 CL 为 0.584L/天。 PK参数的统计相关协变量包括体重、白蛋白、性别、肿瘤负荷和基线抗CD20药物浓度;没有发现协变量对批准剂量的暴露具有临床相关影响。 Mosun CD20 RO% 变化很大,归因于残留基线抗 CD20 药物浓度的巨大变化(中位值=10μg/mL)。 60mg 负荷剂量增加了第 1 周期中 Mosun CD20 RO%,在存在竞争性抗 CD20 药物的情况下提供有效的暴露。 PopPK 模型模拟,调查 Mosun 剂量延迟,告知治疗恢复方案,以确保 CRS 缓解。© 2024 作者。 《临床和转化科学》由 Wiley periodicals LLC 代表美国临床药理学和治疗学会出版。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Jan 04
YanGu,KeWei,JunWang
Phase separation and transcriptional regulation in cancer development.
Cellular & Molecular Immunology
液-液相分离是一种新颖的生化现象,其医学应用受到越来越多的研究。它是无膜细胞器形成的基础,并参与许多细胞和生物过程。在转录调控过程中,动态缩合物是通过转录因子、共激活子和介体等转录元件之间的相互作用形成的。癌症是一种以不受控制的细胞增殖为特征的疾病,但肿瘤发生的确切机制通常仍有待阐明。新的证据已将异常转录缩合物与多种疾病(尤其是癌症)联系起来,这意味着相分离在肿瘤发生中发挥着重要作用。相分离形成的冷凝物可能对肿瘤中的基因转录产生影响。在本综述中,我们重点关注相分离和转录调控之间的相关性,以及这种现象如何促进癌症的发展。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Mar 07
ShuhanChen,XuchunWan...
p53 exerts anticancer effects by regulating enhancer formation and activity.
Cellular & Molecular Immunology
p53抑癌基因的异常在肺癌的发生发展中至关重要,p53可能通过调节靶基因启动子来对抗癌症。最近的研究表明 p53 与增强子元件有广泛的结合。然而,p53 是否通过塑造增强子景观发挥肿瘤抑制作用仍知之甚少。在当前的研究中,我们基于我们建立的 TP53 敲除人支气管上皮细胞 (BEAS-2B),采用了几种功能基因组学方法来评估整个基因组中 p53 结合位点的增强子活性。总共 943 个活性常规增强子和 370 个超级增强子 (SE) 在 p53 删除后消失,表明 p53 调节数百个增强子元件的活性。我们发现,位于 9 号染色体上的一种 p53 依赖性 SE 被命名为 KLF4-SE,它调节 Krüppel 样因子 4 (KLF4) 基因的表达。此外,在亚硝胺4-(甲基亚硝基氨基)-1-(3-吡啶基)-1-丁酮诱导的细胞转化模型中,p53的缺失显着降低了KLF4-SE增强子活性和KLF4表达,但增加了集落形成能力。随后,在TP53敲除细胞中,KLF4的过度表达部分逆转了p53缺陷引起的克隆形成能力的增加。一致的是,KLF4 表达在肺癌组织和细胞系中也下降。 KLF4的过度表达显着抑制肺癌细胞的增殖和迁移。总的来说,我们的结果表明 p53 对增强子形成和活性的调节是 p53 肿瘤抑制功能的一个组成部分。因此,我们的研究结果为 p53 在肺肿瘤发生中的调节机制提供了新的见解,并为筛选治疗靶点提供了新的策略。
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CANCER GENE THERAPY
2024 May 28
ChaoMa,YuchaoHao,BoS...
Unveiling mitochondrial and ribosomal gene deregulation and tumor microenvironment dynamics in acute myeloid leukemia.
CANCER GENE THERAPY
急性髓系白血病(AML)是一种恶性克隆性造血系统疾病,预后较差。了解白血病细胞与肿瘤微环境(TME)之间的相互作用有助于预测白血病的预后并指导其治疗。使用基于 Python 的管道(包括基于机器学习的 scVI 工具)重新分析来自 CSC 和 G20 队列的 scRNA-seq 数据,概括了 AML 患者样本中独特的层次结构。进行加权相关网络分析(WGCNA)来构建加权基因共表达网络并识别主要关注造血干细胞(HSC)、多能祖细胞(MPP)和自然杀伤(NK)细胞的基因模块。分析揭示了与有氧呼吸和核糖体/细胞质翻译相关的基因模块的显着失调。 CellChat 软件包阐明了细胞间通讯,揭示了激活和抑制性免疫信号通路的不平衡。拦截白血病 HSC 中上调的基因
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Experimental Hematology & Oncology
2024 May 27
KarrieMKiang,LeenaAh...
Biomolecular condensates: hubs of Hippo-YAP/TAZ signaling in cancer.
Experimental Hematology & Oncology
生物分子凝聚物是由液-液相分离(LLPS)形成的无膜细胞区室,代表了生理和致瘤过程的重要机制。最近的研究加深了我们对细胞质或细胞核中形成的这些凝聚物如何调节 Hippo 信号传导(器官发生和肿瘤发生的核心角色)的理解。在此,我们回顾了生理和病理过程中生物分子缩合物在调节 Hippo-yes 相关蛋白(YAP)/转录共激活子与 PDZ 结合基序(TAZ)信号通路中的动态形成和功能的最新研究结果。我们进一步讨论了 YAP 或 TAZ 融合癌蛋白的核凝聚物如何划分关键的转录共激活因子并改变染色质结构以促进致癌程序。最后,我们强调了有关这些发现如何为针对癌症的新疗法铺平道路的关键问题。版权所有 © 2024 Elsevier Ltd。保留所有权利。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 May 23
EuiseongKo,Youngsoon...
SPIN: sex-specific and pathway-based interpretable neural network for sexual dimorphism analysis.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
大多数常见疾病在患病率、严重程度和遗传易感性方面存在性别二态性。然而,大多数遗传和临床结果研究都是在性别组合框架中设计的,将性别视为协变量。很少有针对性别的研究分别分析男性和女性,未能确定基因与性别之间的相互作用。在这里,我们提出了一种新颖的统一的生物可解释的基于深度学习的框架(名为 SPIN),用于性别二态性分析。我们证明,SPIN 在 TCGA 癌症数据集中将 C 指数显着提高了 23.6%,并使用哮喘数据集进一步验证了这一点。此外,SPIN 还可以识别性别特异性和共享风险位点,而这些位点在之前的性别组合/单独分析中经常被遗漏。我们还表明,SPIN 可以解释生物途径如何导致性别二态性并改善个体水平的风险预测,这可以导致针对特定个体特征的精准医学的发展。© 作者 2024。已发表牛津大学出版社。
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