研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE
2024 May 28
YunshangChen,XueFeng...
USP9X-mediated REV1 deubiquitination promotes lung cancer radioresistance via the action of REV1 as a Rad18 molecular scaffold for cystathionine γ-lyase.
JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE
放射抗性是肺癌患者放疗疗效的一个关键临床限制。 REV1 DNA定向聚合酶(REV1)在修复DNA损伤和维持基因组稳定性方面发挥着重要作用。但其在肺癌放疗抵抗中的作用尚不清楚。本研究旨在阐明REV1在肺癌放疗抵抗中的作用,明确其内在机制,为肺癌治疗新靶点的临床转化提供理论依据。体内和体外实验。采用RNA测序(RNA-seq)结合非靶向代谢组学分析来探索REV1的下游靶点。使用液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)来定量特定氨基酸的含量。使用免疫共沉淀 (co-IP) 和 GST Pull-down 测定来验证蛋白质之间的相互作用。构建泛素化文库筛选系统来研究REV1上游的调控蛋白。靶向REV1可以增强体内放射敏感性,但体外效果不明显。 RNA测序结合非靶向代谢组学显示,差异结果与代谢有关,REV1敲低后甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸(Gly/Ser/Thr)代谢信号通路的表达下调。 LC-MS/MS 证明 REV1 敲低会导致这三种氨基酸的水平降低,而胱硫醚 γ-裂解酶 (CTH) 是其功能的关键。 REV1增强CTH与E3泛素连接酶Rad18的相互作用,并促进Rad18对CTH的泛素化降解。泛素化化合物库筛选发现泛素特异性肽酶9 X-linked (USP9X)是泛素-蛋白酶体系统对REV1的上游调节蛋白,可重塑细胞内Gly/Ser/Thr代谢。USP9X介导REV1的去泛素化REV1和异常表达的REV1作为支架蛋白协助Rad18与CTH相互作用,促进CTH泛素化和降解,诱导Gly/Ser/Thr代谢重塑,从而产生放射抗性。一种新型 REV1 抑制剂 JH-RE-06 被证明可以增强肺癌细胞的放射敏感性,具有良好的临床转化前景。© 2024。作者。
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INTERNATIONAL JOURNAL OF PHARMACEUTICS
2024 May 25
LanJiang,JiaLi,Runku...
Effect of hydrogel drug delivery system for treating ulcerative colitis: A preclinical meta-analysis.
INTERNATIONAL JOURNAL OF PHARMACEUTICS
用于治疗溃疡性结肠炎(UC)的水凝胶药物递送系统(DDS)引起了人们的关注。然而,缺乏总结其有效性的荟萃分析。因此,本研究旨在对水凝胶 DDS 与免费给药的临床前证据进行荟萃分析。根据水凝胶材料(多糖与非多糖)和水凝胶 DDS 的给药途径(直肠与口服)进行亚组分析。结果指标包括结肠长度、组织学评分、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、闭锁带蛋白1(ZO-1)和曲线下面积(AUC)。结果证实,与游离药物组相比,水凝胶 DDS 对 UC 的治疗效果增强。值得注意的是,多糖和非多糖材料之间没有发现显着差异,但口服给药在 TNF-α 和 AUC 方面表现更佳。总之,口服水凝胶DDS可以作为口服结肠靶向DDS中潜在的优良剂型,并且在结肠水凝胶递送系统的设计中,多糖与其他材料相比并没有显示出优势。版权所有©2024。由Elsevier B.V.出版。
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Int J Biol Macromol
2024 May 25
YapingYan,TengkunDai...
A review of non-classical MAPK family member, MAPK4: A pivotal player in cancer development and therapeutic intervention.
Int J Biol Macromol
丝裂原激活蛋白激酶 (MAPK) 是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,在将细胞外信号传递到细胞内环境方面发挥着至关重要的作用,影响广泛的细胞过程,包括增殖、分化、凋亡、代谢活动、免疫功能和应激反应。 MAPK4 是一种非经典 MAPK,在多种恶性肿瘤中经常过度表达,包括前列腺癌、乳腺癌、宫颈癌、甲状腺癌和神经胶质瘤。它通过 AKT/mTOR 和/或 PDK1 信号通路协调细胞增殖、迁移和凋亡,从而促进肿瘤细胞生长。此外,MAPK4的表达与PI3K和PARP1等特异性抑制剂的有效性密切相关,也与癌症患者的生存率相关。越来越多的证据强调 MAPK4 参与肿瘤微环境、调节免疫反应和炎症相关疾病。本综述全面探讨了 MAPK4 的结构、功能和致癌作用,加深了对其在肿瘤发生中的激活和作用机制的了解,这可能有助于开发癌症管理的创新治疗策略。版权所有 © 2024。出版者爱思唯尔有限公司
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INTERNATIONAL IMMUNOPHARMACOLOGY
2024 May 26
YvxiaoRen,MingjieWan...
A novel insight into cancer therapy: Lipid metabolism in tumor-associated macrophages.
INTERNATIONAL IMMUNOPHARMACOLOGY
肿瘤免疫微环境(TIME)会限制传统癌症疗法的有效性并常常导致显着的副作用。因此,人们越来越有兴趣确定新的靶点以提高癌症靶向治疗的功效。更多研究表明,肿瘤相关巨噬细胞(TAM)源自骨髓祖细胞产生的外周血单核细胞,在肿瘤微环境(TME)中发挥着至关重要的作用,并与传统癌症治疗的耐药性密切相关。脂质代谢的改变已被广泛认为对肿瘤及其免疫微环境具有重大影响。脂质、脂质衍生物及其代谢途径中的关键物质可以通过调节TAM的表型、功能和活性来影响癌细胞的癌变和进展。因此,本综述重点关注癌细胞中脂质代谢的重编程及其免疫微环境,其中TAM尤其集中。这些变化会影响 TAM 的激活和极化,从而影响肿瘤细胞对治疗的反应。此外,本文还探讨了靶向 TAM 脂质代谢作为传统癌症治疗的补充方法的潜力。它回顾和评估了当前通过 TAM 脂质代谢增强疗效的策略,并提出了新的脂质代谢靶点作为放化疗和免疫治疗的潜在协​​同选择。这些努力旨在促进该领域的进一步研究。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。
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IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
2024 May 27
SaisaiDing,JunchengL...
Multimodal Co-attention Fusion Network with Online Data Augmentation for Cancer Subtype Classification.
IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
在计算病理学中准确诊断癌症亚型以实现个性化癌症治疗是一项重要任务。最近的研究表明,多模态数据(例如全幻灯片图像(WSI)和多组学数据)的结合可以实现更准确的诊断。然而,由于多模态数据之间的异质性,以及多模态患者数据不足导致的性能下降,稳健的癌症诊断仍然具有挑战性。在这项工作中,我们提出了一种新颖的多模式共同注意融合网络(MCFN)和在线数据增强(ODA),用于癌症亚型分类。具体来说,提出了一种多模态相互引导共同注意(MMC)模块来有效地执行密集的多模态交互。它使多模态数据能够在集成过程中相互指导和校准,以减轻模态间和模内的异质性。随后,开发了自归一化网络(SNN)-Mixer,以允许不同组学数据之间的信息通信,并缓解多组学数据中的高维小样本问题。最重要的是,为了弥补模型训练的多模态样本不足的问题,我们在 MCFN 中提出了 ODA 模块。 ODA模块利用多模态知识来指导WSI的数据增强,并在模型训练期间最大化数据多样性。在公共 TCGA 数据集上进行了大量实验。实验结果表明,所提出的 MCFN 优于所有比较算法,表明其有效性。
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IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
2024 May 27
FangChen,HaojieHan,P...
Do as Sonographers Think: Contrast-enhanced Ultrasound for Thyroid Nodules Diagnosis via Microvascular Infiltrative Awareness.
IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
动态超声造影(CEUS)成像可以反映微血管分布和血流灌注情况,对鉴别甲状腺结节的良恶性具有临床意义。值得注意的是,CEUS 可对结节周围的微血管分布进行细致的可视化,与灰度超声 (US) 相比,导致肿瘤大小明显增加。在获得的双图像中,病变尺寸从灰度US放大到CEUS,因为微血管似乎不断浸润周围组织。尽管微脉管系统的浸润性扩张仍然不明确,但超声检查医师认为它可能促进甲状腺结节的诊断。我们提出了一种深度学习模型,旨在模拟超声医师所采用的诊断推理过程。该模型整合了动态 CEUS 上微血管浸润的观察,利用灰度超声提供的额外见解来增强诊断支持。具体来说,在动态CEUS的时间维度上实施时间投影注意力来表示微血管灌注。此外,我们采用一组具有灵活的 Sigmoid Alpha 函数的置信图来感知和描述渗透扩张过程。此外,引入自适应整合机制,动态整合个体患者的辅助灰度超声和CEUS置信图,确保甲状腺结节的诊断可信。在这项回顾性研究中,我们收集了 282 个 CEUS 视频的甲状腺结节数据集。该方法的诊断准确率和灵敏度分别为 89.52% 和 93.75%。这些结果表明,模仿超声医师的诊断思维,包括动态微血管灌注和浸润扩张,被证明有利于基于 CEUS 的甲状腺结节诊断。
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npj Breast Cancer
2024 May 27
ReidTPowell,AmandaLR...
Targeting neddylation and sumoylation in chemoresistant triple negative breast cancer.
npj Breast Cancer
在美国,三阴性乳腺癌 (TNBC) 占乳腺癌病例的 15-20%。全身新辅助化疗 (NACT),无论是否联合免疫治疗,都是早期 TNBC 患者目前的标准治疗方法。然而,一旦 NACT 完成,高达 70% 的 TNBC 患者会出现明显的残留病灶,这与手术切除后两到三年内复发的高风险相关。为了确定耐药 TNBC 的可靶向脆弱性,我们在患者接受 NACT 之前和之后从 TNBC 肿瘤中生成了纵向患者衍生异种移植 (PDX) 模型。然后,我们编译了所有模型的转录组和药物反应概况。转录组分析发现,相对于 NACT 之前的肿瘤,NACT 后肿瘤模型中异常蛋白稳态途径的富集。这一观察结果与体外对针对蛋白酶体、热休克蛋白和neddylation途径的抑制剂的敏感性增加相关。 Pevonedistat 是一种被注释为 NEDD8 激活酶 (NAE) 抑制剂的药物,优先进行体内验证,并在 TNBC 的多个 PDX 模型中证明了作为单一药物的功效。药物转录组学分析确定了 pevonedistat 活性和翻译后修饰 (PTM) 机制之间的通路水平相关性,特别是涉及 neddylation 和 sumoylation 靶点。与体内反应较差的模型相比,在对 pevonedistat 表现出良好反应的模型中观察到 NEDD8 和 SUMO1 水平升高。此外,neddylation 调节途径的表达与肿瘤对 pevonedistat 的反应之间出现了相关性,表明针对这些 PTM 途径可能会有效对抗化疗耐药性 TNBC。© 2024。作者。
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HEART & LUNG
2024 May 27
CeceliaValrie,BSloan...
Investigating home-based opioid use among youth with sickle cell disease using ecological momentary assessment.
HEART & LUNG
阿片类药物是治疗急性镰状细胞病 (SCD) 疼痛的常见且必要的治疗方法。然而,阿片类药物具有众所周知的不良副作用,包括潜在的痛觉过敏和伤害性疼痛。我们使用生态瞬时评估 (EMA) 数据来描述患有 SCD 的青少年的阿片类药物使用情况,并调查了家庭阿片类药物使用、疼痛和一系列生物心理社会因素之间的关系。 88 名患有 SCD 的青少年(8-17 岁)完成了评估家庭阿片类药物使用、疼痛和相关因素的 EMA。分析包括描述性和多级逻辑回归,以预测日常家庭阿片类药物的使用。青少年平均 EMA 为 3.64 周。大约 35% 的样本 (n = 31) 在 EMA 期间服用阿片类药物,并且仅在 24% 报告的疼痛日使用它们。与不服用阿片类药物的青少年相比,服用阿片类药物的青少年的疼痛天数百分比(t = -2.67,p < .05)和平均疼痛严重程度评分(t = -2.30,p < .05)更高。多级逻辑回归分析表明,每日疼痛严重程度较高(比值比 [OR] = 1.02,p < .01)、年龄较大(OR = 1.324,p < .01)和低积极情绪(OR = 0.91,p <.01)。 01)均与阿片类药物使用的可能性增加有关。患有 SCD 的青少年根据每日自我报告,适当服用阿片类药物以应对疼痛。除了日常疼痛的严重程度之外,年龄和积极情绪的日常变化也与家庭阿片类药物的使用有关。这表明增强积极情感的行为干预可能会促进患有 SCD 的青少年减少阿片类药物的使用。© 2024 作者。儿科血液
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GENES & DEVELOPMENT
2024 May 27
EirikTveitSolheim,Yo...
Multi-omics profiling reveals dysregulated ribosome biogenesis and impaired cell proliferation following knockout of CDR2L.
GENES & DEVELOPMENT
小脑变性相关 (CDR) 蛋白与副肿瘤性小脑变性 (PCD) 相关,这是一种罕见的神经退行性疾病,由肿瘤诱导的针对神经抗原的自身免疫引起,导致小脑中浦肯野神经元变性。 PCD 的发病机制尚不清楚,很大程度上是由于我们对 CDR 蛋白功能的了解有限。为此,我们对 CDR 敲除细胞进行了广泛的多组学分析,重点关注 CDR2L 蛋白,以更深入地了解 CDR 蛋白在卵巢癌中的特性。缺乏 CDR1、CDR2、使用RNA测序和基于质谱的蛋白质组学对CDR2L或CDR2L进行分析,以评估在没有这些蛋白质的情况下转录组、蛋白质组和分泌组的变化。对于每个敲除细胞系,我们鉴定了一组差异表达的基因和蛋白质。与 CDR1 和 CDR2 敲除细胞相比,CDR2L 敲除细胞显示出不同的表达谱。 CDR2L 的敲除导致参与核糖体生物发生、蛋白质翻译和细胞周期进展的基因失调,最终导致体外细胞增殖受损。其中一些基因在转录水平上同时上调,在蛋白质水平上下调。我们的研究首次对 CDR 基因敲除的影响进行了综合多组学分析,为 CDR 的生物学特性提供了新的见解。卵巢癌中的蛋白质,也是未来研究 CDR 蛋白质的宝贵资源。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 May 28
NicolaPBondonno,Prat...
Source-specific nitrate intake and all-cause mortality in the Danish Diet, Cancer, and Health Study.
Disease Models & Mechanisms
硝酸盐和亚硝酸盐天然存在于植物性和动物性食品中,在肉类加工中用作添加剂,并且存在于水中。越来越多的证据表明,它们对健康产生一系列影响,具体取决于饮食来源。该研究的目的是检查硝酸盐/亚硝酸盐的膳食摄入量与全因死亡率和特定原因死亡率之间的来源依赖性关联性。在丹麦饮食、癌症和健康研究的 52,247 名参与者中,来源依赖性硝酸盐和亚硝酸盐之间的关联性亚硝酸盐摄入量(使用综合食物成分和国家饮用水质量监测数据库计算)以及 27 年来的全因死亡率、心血管疾病 (CVD) 相关死亡率和癌症相关死亡率均使用 Cox 比例风险模型中的限制三次样条进行检查调整人口、生活方式和饮食混杂因素。根据假设影响致癌 N-亚硝基化合物形成的因素(即吸烟和维生素 C、维生素 E、叶酸和多酚的饮食摄入量)进行分层分析。植物来源的硝酸盐摄入量与全因死亡率呈负相关。 HRQ5vsQ1:0.83 (0.80, 0.87)],而天然动物源硝酸盐摄入量越高,全因死亡风险越高 [1.09 (1.04, 1.14)],添加剂允许的肉类来源硝酸盐 [1.19 (1.14, 1.25) )],以及自来水来源的硝酸盐[1.19 (1.14, 1.25)]。亚硝酸盐以及心血管疾病相关和癌症相关死亡率也存在类似的来源依赖性关联,但天然存在的动物源硝酸盐和自来水源硝酸盐与癌症相关死亡率无关,并且允许添加的肉类来源硝酸盐也没有相关性。与 CVD 相关死亡率有关。分层分析中没有出现明确的模式。来自植物来源的硝酸盐/亚硝酸盐与死亡率呈负相关,而来自天然动物来源、允许添加的肉类来源和自来水来源的硝酸盐/亚硝酸盐则与死亡率呈正相关。© 2024。 )。
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