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Cellular & Molecular Immunology
2024 May

RenatoGualtieri,Sabi...
Rituximab-to-vaccine interval on SARS-CoV-2 immunogenicity in children: The potential role of prior natural infection.
Cellular & Molecular Immunology
抗 CD20 抗体(利妥昔单抗)用于成人和儿童治疗各种自身免疫性疾病和肿瘤疾病。利妥昔单抗会消耗 B CD20 细胞,从而消除对疫苗的抗体反应。本研究旨在检查接受利妥昔单抗治疗的 5-18 岁儿童与健康匹配儿童相比,对基于 mRNA 的 COVID-19 疫苗的抗体反应。 2022 年 1 月 31 日至 7 月 18 日期间,我们在日内瓦大学进行了一项前瞻性观察研究医院招募接受利妥昔单抗治疗的 5-18 岁儿童,这些儿童已接受两剂基于 mRNA 的 SARS-CoV-2 疫苗。对照组是没有明显健康状况的健康志愿者。排除标准包括最近感染过 SARS-CoV-2。第二次疫苗接种后第 60 天 (±30) 和第 270 天 (±90) 采集血样。利妥昔单抗治疗组表现出 SARS-CoV 抗受体结合域 (RBD) 特异性抗体水平显着降低在第二次疫苗接种后 60 (±30) 天,比健康对照组的峰值 (S) 蛋白 -2(几何平均浓度:患者中为 868.3 IU/mL,对照中为 11,393 IU/mL;p = .008)。然而,利妥昔单抗与疫苗间隔短于 6 个月且有既往感染证据(基于阳性抗 N 抗体水平)的患者,其抗 RBD 抗体水平较高。既往感染 SARS-CoV- 2 可能会诱导抗 RBD 特异性记忆 B 细胞,即使在利妥昔单抗诱导的 B 细胞耗竭后,这些 B 细胞也可以通过 SARS-CoV-2 疫苗接种重新激活。这表明,有可能在利妥昔单抗注射后 6 个月内接种疫苗,以产生良好的抗体反应,特别是在过去感染过 SARS-CoV-2 的情况下。© 2024 作者。儿科过敏和免疫学由欧洲过敏和临床免疫学学会和约翰·威利出版
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Cellular & Molecular Immunology
2024 May 26

UmadeviEtikyala,Rajk...
An in silico approach to identify novel and potential Akt1 (protein kinase B-alpha) inhibitors as anticancer drugs.
Cellular & Molecular Immunology
Akt1(蛋白激酶 B)因其在多种细胞过程中的重要功能而成为人们关注的焦点,并且抑制 Akt1 可以有效减少癌细胞中的肿瘤生长。在目前的工作中,我们通过使用多种计算技术,即基于药效团的虚拟筛选、分子对接、结合自由能计算和 ADME 特性,发现了一组新型 Akt1 抑制剂。使用 AADRR38 实施并验证了五点药效团假设。获得的 R2 和 Q2 值分别处于可接受的范围内,值分别为 0.90 和 0.64。生成的药效团模型用于虚拟筛选,以找出潜在的 Akt1 抑制剂。此外,对选定的命中进行分子对接、结合自由能分析,并使用 ADME 特性进行精炼。此外,我们通过包含从数据库获得的命中的结构特征,设计了一系列 6-甲氧基苯并[b]恶唑类似物。发现分子 D1-D10 具有较强的结合相互作用和较高的结合自由能值。此外,还进行了分子动力学模拟,以了解蛋白质-配体复合物的构象变化。© 2024。作者,获得 Springer Nature Switzerland AG 的独家许可。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 May 26

PengZhai,HengZhang,Q...
SETBP1 activation upon MDM4-enhanced ubiquitination of NR3C1 triggers dissemination of colorectal cancer cells.
Cellular & Molecular Immunology
结直肠癌(CRC)在全球范围内日益受到关注,其发病率和死亡率不断上升,从而造成了巨大的健康负担。本研究深入探讨核受体亚家族 3 C 组成员 1 (NR3C1) 在 CRC 转移中的作用并探讨相关机制。通过全面的生物信息学分析,NR3C1 作为结直肠癌中表达水平降低的基因出现。 CRC 组织和细胞中 NR3C1 低表达模式的观察结果证实了这一发现。此外,涉及 NR3C1 敲低的实验显示,体外结直肠癌细胞的增殖、迁移和侵袭加剧。通过尾静脉或盲肠末端注射人 HCT116 细胞建立的小鼠异种移植肿瘤模型的后续评估表明,NR3C1 敲低后,肿瘤转移至肺和肝的能力分别减少。从功能上讲,NR3C1(糖皮质激素受体)通过与其启动子区域结合来抑制 SET 结合蛋白 1 (SETBP1) 的转录。值得注意的是,小鼠双分钟 4 (MDM4) 被确定为 NR3C1 的上游调节因子,通过泛素化依赖性蛋白酶体降解协调其下调。进一步的研究表明,SETBP1 敲除抑制了 CRC 细胞的迁移和侵袭以及上皮细胞向间质细胞的转变,从而阻碍了小鼠模型中的体内转移。相反,MDM4 的上调加剧了 CRC 细胞的转移表型,而 NR3C1 的额外上调则减轻了这种倾向。总之,本研究阐明了一个级联反应,其中 MDM4 介导的 NR3C1 泛素化使 SETBP1 转录激活,从而推动 CRC 细胞的传播。© 2024。作者获得 Springer Nature B.V. 的独家许可。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 May 26

XiaohuZhou,YanhuiLi,...
Upregulated lncRNA LINC01128 in colorectal cancer accelerates cell growth and predicts malignant prognosis through sponging miR-363-3p.
Cellular & Molecular Immunology
结直肠癌(CRC)是指发生在结肠或直肠的高死亡率、高复发率的肿瘤。长链非编码RNA(lncRNA)的参与有助于CRC的治疗和预后评估,为患者的根治带来新的方向。目的 探讨lncRNA LINC01128(LINC01128)对结直肠癌细胞的病理机制和调控,并分析其潜在的预后价值。采用RT-qPCR评估122例结直肠癌患者组织和细胞标本中LINC01128的水平。通过 Kaplan-Meier 和 Cox 分析分析 LINC01128 在 CRC 中的临床意义和预后价值。使用 CCK8 和 Transwell 测定法研究 LINC01128 的体外功能。通过荧光素酶报告基因检测证实LINC01128与miR-363-3p之间的关系。LINC01128的过表达与CRC患者的TNM分期和淋巴结转移相关。沉默LINC01128可抑制CRC细胞的增殖和转移。此外,LINC01128直接靶向并负向调节miR-363-3p的表达,而miR-363-3p抑制剂恢复了LINC01128的抑制功能。作为CRC的独立预后因素,LINC01128的上调可预测不良预后并通过以下方式加速肿瘤恶化: miR-363-3p.© 2024。作者。
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CANCER LETTERS
2024 May 23

ZimeiLin,LibinChen,Y...
Improving Ultrasound Diagnostic Precision for Breast Cancer and Adenosis with Modality-Specific Enhancement (MSE) - Breast Net.
CANCER LETTERS
腺病是一种良性乳腺疾病,其病变类似于乳腺癌,可通过乳腺影像报告和数据系统 (BI-RADS) 评估是否存在恶性肿瘤。我们构建并验证了基于多模态超声图像的模态特异性增强 (MSE)-Breast Net 的性能,并将其与 BI-RADS 在区分腺病和乳腺癌方面进行比较。这项回顾性、两机构研究共纳入了 179 名乳腺癌患者和 229 名腺病患者,然后分为训练队列(机构 I,n = 292)和验证队列(机构 II,n = 116) 。在训练队列中,最终模型的 AUC (0.82;P<0.05) 显着高于基于 B 模式的模型 (0.69,95% CI [0.49-0.90])。在验证队列中,最终模型的AUC为0.81,大于BI-RADS的AUC(0.75,P<0.05)。多模态模型优于单独模型和双模态模型,AUC 显着提高至 0.87 (95% CI = 0.69-1.0) (P<0.05)。基于多模态超声图像的 MSE-Breast Net 在区分腺病和乳腺癌方面表现出比 BI-RADS 更好的诊断性能,可能有助于临床诊断和治疗。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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CANCER LETTERS
2024 May 23

BohengLi,PieterJohan...
Targeting the ubiquitin pathway in lymphoid malignancies.
CANCER LETTERS
泛素化和相关的细胞过程控制着人类细胞生物学的各个方面,这些过程的缺陷会导致多种疾病。近几十年来,我们对泛素化在淋巴癌中的病理作用以及针对修饰的泛素化系统的治疗策略的认识有了巨大的发展。在这里,我们回顾了由癌症相关 E2/E3 和去泛素化酶 (DUB) 的异常表达介导的信号机制改变,这些机制导致癌蛋白过度激活或肿瘤抑制因子经常联合下调。我们讨论了与几种不同的治疗干预措施有关的最新亮点,这些干预措施目前正在评估以有效阻断异常泛素-蛋白酶体途径,以及使用异双功能分子招募泛素化系统来降解或稳定非同源底物。本综述有助于理解淋巴癌中的泛素化异常和当前的靶向策略,并引发进一步的研究,以深入了解细胞泛素化与淋巴发病机制之间的联系,并改善相应的治疗干预措施。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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CANCER LETTERS
2024 May 23

ShichenZhang,NaTa,Sh...
Unraveling Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Immune Prognostic Signature through a Naive B Cell Gene Set.
CANCER LETTERS
胰腺导管腺癌 (PDAC) 是癌症死亡的主要原因,其发病机制复杂,涉及多种免疫细胞,包括 B 细胞及其亚群。尽管关于这些细胞在肿瘤微环境 (TME) 中的作用的研究不断涌现,但与肿瘤浸润免疫细胞 (TIIC) 的详细分子相互作用尚未完全了解。我们应用 CIBERSORT 来量化 TIIC 和初始 B 细胞,这些细胞可预测肿瘤的预后PDAC。整合来自 scRNA-seq 的标记基因和来自加权基因共表达网络分析 (WGCNA) 的模块基因,以识别初始 B 细胞相关基因。利用十种机器学习算法构建了预后特征,并在外部队列中进行了验证。我们进一步评估了按风险分层的患者组之间的免疫细胞多样性、估计评分和免疫检查点基因 (ICG),以阐明 PDAC 中的免疫状况。我们的分析在单细胞和批量转录组中鉴定了 994 个初始 B 细胞相关基因,其中 247 与总体生存率相关。我们使用 Lasso 和 plsRcox 算法开发了一个 12 基因预后特征,该特征通过 10 倍交叉验证得到证实,并在训练和现实队列中显示出强大的预测能力。值得注意的是,我们观察到高风险和低风险患者之间的免疫浸润存在显着差异。我们的研究提出了强有力的预后特征,有效地绘制了 PDAC 中复杂的免疫相互作用,强调了初始 B 细胞的关键功能,并提出了免疫治疗干预的新途径。该特征在个性化 PDAC 治疗、增强对免疫动力学的理解和指导免疫治疗策略方面具有潜在的临床应用。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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CANCER LETTERS
2024 May 23

WenhaoLuo,TaipingZha...
The New Era of Pancreatic Cancer Treatment: Application of Nanotechnology Breaking Through Bottlenecks.
CANCER LETTERS
自从纳米医学出现以来,医生们已经利用这些方法来预防、检测和治疗危及生命的疾病,特别是癌症。纳米粒子在癌症治疗中表现出显着的功效,展示了纳米技术在靶向药物输送方面的主要应用。胰腺癌是人类最致命的实体瘤。存活率低的原因在于其高度侵袭性、对化疗药物的内在耐药性以及缺乏成功的治疗方法,再加上非特异性症状导致的诊断延迟和缺乏快速诊断策略。尽管存在这些挑战,基于纳米技术的载体方法已成功应用于成像和治疗方法。克服胰腺癌的耐药性需要全面了解与疾病相关的微环境,从而为创新纳米载体铺平道路。由于血管化不足和肿瘤基质致密而阻碍化疗浸润,这是纳米技术解决的一个主要障碍。基于增强渗透性和保留效应的智能递送技术构成了最近开发的抗癌纳米载体的基础。这些进步旨在增强肿瘤部位的药物积累,为癌症的耐药性提供潜在的解决方案。应对胰腺癌治疗的挑战需要创新的疗法,而活性纳米载体的出现为提高治疗效果提供了一条有希望的途径。这篇综述专门探讨了纳米技术治疗胰腺癌的最新进展。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 May 23

SandeepSingh,XinruiS...
RTCpredictor: identification of read-through chimeric RNAs from RNA sequencing data.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
通读嵌合RNA被认为是扩展功能转录组的一种手段,并且在错误调控时有助于癌症肿瘤的发生。然而,当前的软件工具通常无法预测它们。我们开发了 RTCpredictor,利用快速 ripgrep 工具来搜索亲本基因对的所有可能的外显子-外显子组合。我们还添加了外显子变体,允许搜索包含常见的 SNP。据我们所知,这是第一个通读嵌合RNA特异性预测方法,也提供断点坐标。与其他 10 个流行工具相比,RTCpredictor 在模拟数据集和三个真实数据集上实现了高灵敏度。此外,RTCpredictor 的内存需求更少,执行时间更快,非常适合应用于大型数据集。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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BRITISH JOURNAL OF CANCER
2024 May 25

QipengWu,RuyanLiao,C...
Oncofetal SNRPE promotes HCC tumorigenesis by regulating the FGFR4 expression through alternative splicing.
BRITISH JOURNAL OF CANCER
由于对关键分子事件认识不足,肝细胞癌(HCC)缺乏有效的治疗靶点。剪接体相关基因在 HCC 中发生显着改变。癌胎蛋白是理想的肿瘤治疗靶点。筛选胚胎肝脏发育和肝癌中差异表达的剪接体相关癌胚蛋白,有助于发现肝癌的有效治疗靶点。通过生物信息学分析,对胎儿肝脏和肝癌中差异表达的剪接体基因进行分析。在胎儿肝脏、成人肝脏和 HCC 组织中检测到小核核糖核蛋白多肽 E (SNRPE) 表达。 SNRPE 在 HCC 中的作用在体外和体内进行了多次测定。 SNRPE 调节的选择性剪接已被 RNA-Seq 识别,并通过多种测定得到证实。我们在此确定 SNRPE 是一个重要的癌胚剪接因子,与 HCC 的不良预后显着相关。 SOX2 被确定为 SNRPE 重新激活的激活剂。 SNRPE 的有效敲低导致 HCC 肿瘤发生和进展的完全停止。从机制上讲,SNRPE 敲低通过触发无义介导的 RNA 衰减来减少 FGFR4 mRNA 表达。 FGFR4 敲低后观察到 SNRPE 诱导的 HCC 细胞恶性进展得到部分抑制。我们的研究结果强调了 SNRPE 作为一种新型癌胚剪接因子,并揭示了癌胚剪接因子、剪接事件和癌发生之间的复杂关系。因此,SNRPE 成为 HCC 治疗的潜在治疗靶点。癌胎儿 SNRPE 模型通过调节 FGFR4 前 mRNA 的 AS 促进 HCC 肿瘤发生。© 2024。作者,获得 Springer Nature Limited 的独家许可。
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