肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

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子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

Disease Models & Mechanisms

CameronCYoung,Kather...

Development and validation of a reliable DNA copy-number-based machine learning algorithm (CopyClust) for breast cancer integrative cluster classification.

Disease Models & Mechanisms

整合簇亚型 (IntClusts) 提供了一个框架，用于根据拷贝数和基因表达将乳腺癌肿瘤分为 10 个不同的组，每个组都有独特的疾病和临床预后的生物学驱动因素。通常缺乏基因表达数据，仅用拷贝数数据将样本准确分类到 IntClusts 中至关重要。当缺乏基因表达数据时，当前的分类方法精度较低，因此需要开发新的 IntClust 分类方法。来自 METABRIC 的 1980 个乳腺癌样本的拷贝数数据用于训练多类 XGBoost 机器学习算法 (CopyClust)。对每个 IntClust 的平均拷贝数谱应用分段恒定拟合，并识别 10 个谱中的独特断点并将其转换为用作 CopyClust 特征的 ~ 500 个基因组区域。这些模型由两种方法组成：一个 10 类模型，其最终 IntClust 标签由单个多类模型预测；以及一个具有二元重分类的 6 类模型，其中组合四对 IntClust 进行初始多类分类。使用从 SNP 阵列和 WES 平台生成的拷贝数数据，在 TCGA 数据集上验证了性能。 CopyClust 在 TCGA SNP 和 WES 数据集上分别实现了 81% 和 79% 的总体准确度，整体 IntClust 亚型分类准确度提高了 9 个百分点或更大。对于没有可用基因表达数据的样本，CopyClust 在 IntClust 亚型分类准确性方面比现有方法有了显着改进，并且是一种易于实现的算法，用于使用拷贝数数据对乳腺癌样本进行 IntClust 分类。© 2024。作者。

Disease Models & Mechanisms

YongqiangZhou,Weihai...

MKI67 with arterial hypertension predict a poor survival for prostate cancer patients, a real-life investigation.

Disease Models & Mechanisms

前列腺癌是男性常见的泌尿外科恶性肿瘤，居全球第二位。当与高血压同时诊断时，这种疾病尤其严重。 MKI67 是人类肿瘤细胞增殖的既定标志物，但其对前列腺癌和高血压患者的预后价值的意义需要进一步研究。在这项回顾性分析中，我们评估了 2012 年 3 月 2 日至 11 月期间的 296 名高血压前列腺癌患者2015 年 1 月 1 日。我们使用 Cox 回归模型和预测分析来评估总体生存率。此外，我们创建了列线图，并使用校准曲线验证了其准确性。在所有参与者中，有 101 人 (34.12%) 死亡。我们的多因素分析显示，MKI67 表达与死亡风险比增加（> 五倍）（风险比 5.829，95% CI 3.349-10.138，p 值 < 0.01）和进展风险比增加（两倍）（HR 2.059，95%）相关。 CI 1.368-3.102，p 值 < 0.01）。我们的Lasso分析模型显示，心力衰竭、吸烟、ACS、血清白蛋白、Gealson评分、预后营养指数、MKI67表达、手术和分期等几个因素是前列腺癌的高风险因素。为了确保每个协变量对癌症预后的贡献，我们创建了 Cox 模型列线图，它准确预测了死亡风险（C 统计量为 0.8289），并为风险评估提供了适当的校准图。MKI67 表达预测前列腺总体死亡率的不良结果癌症和高血压患者。此外，我们经过交叉验证的多变量评分（包括 MKI67）证明了预测预后的准确性。© 2024。作者获得 Federación de Sociedades Españolas de Oncología (FESEO) 的独家许可。

Disease Models & Mechanisms

AninditaSaha,ShahidM...

VER-Net: a hybrid transfer learning model for lung cancer detection using CT scan images.

Disease Models & Mechanisms

肺癌是全球第二大常见癌症，每年新增病例超过 200 万。早期识别将使医疗保健从业者能够更有效地处理它。计算机辅助检测系统的进步极大地影响了人类疾病的临床分析和决策。为此，机器学习和深度学习技术正在成功应用。由于多种优点，迁移学习已在基于图像数据的疾病检测中变得流行。在这项工作中，我们通过堆叠三种不同的迁移学习模型构建了一种新颖的迁移学习模型（VER-Net），以使用肺部 CT 扫描图像检测肺癌。该模型经过训练，可以绘制四种肺癌类别的 CT 扫描图像。采取了图像预处理、数据增强和超参数调整等各种措施来提高 VER-Net 的效率。所有模型均使用胸部 CT 图像多类分类进行训练和评估。实验结果证实 VER-Net 优于其他八种迁移学习模型。在准确率、精确率、召回率和 F1 分数测试中，VER-Net 的得分分别为 91%、92%、91% 和 91.3%。与最先进的技术相比，VER-Net 具有更好的准确性。VER-Net 不仅可以有效地用于肺癌检测，而且还可能对其他可获得 CT 扫描图像的疾病有用。© 2024。作者。

DIABETES & METABOLISM

UnurjargalGalindev,U...

Anti-obesity effects of potential probiotic Lactobacillus strains isolated from Mongolian fermented dairy products in high-fat diet-induced obese rodent model.

DIABETES & METABOLISM

本研究旨在研究从蒙古“Airag”和“Khoormog”等发酵乳制品中分离出的乳酸菌（LAB）的抗肥胖特性。这些传统乳制品在蒙古被广泛使用，并被认为具有潜在的益生菌、抗糖尿病、抗癌和抗结核特性，分别由未加热的双峰骆驼奶和马奶制成。我们根据益生菌特性（包括对胃酸和胆汁酸的耐受性）选择了三种 LAB 菌株。然后我们检查了益生菌菌株的体内抗肥胖活性。采用高脂饮食（HFD）诱导肥胖的雄性 C57BL/6J 小鼠 20 只，分为 5 组：常规饮食组（阴性对照）、HFD 组（阳性对照）、HFD 乳酸菌组副干酪 X-1 (X-1)、副干酪乳杆菌 X-17 (X-17) 和发酵硅酸乳杆菌 BM-325 (BM-325)。在六周内，给 LAB 喂养组口服 5 × 109 菌落形成单位 (CFU) 的细菌。空腹血糖（FBG）、血脂、器官指数和器官形态均被测量。益生菌菌株可抑制脂肪细胞体积的增长，稳定 FBG，减少肝细胞变性，并减缓 HFD 引起的体重增加。结果表明，某些菌株在降低体重的同时会增加一般代谢。© 2024。作者获得 Sociedade Brasileira de Microbiologia 的独家许可。

CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS

LéaBoidin,MorganeMoi...

Targeted photodynamic therapy using a Vectorized photosensitizer coupled to folic acid analog induces ovarian tumor cell death and inhibits IL-6-mediated inflammation.

CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS

卵巢癌（OC）是女性中最致命的癌症之一。由于微小肿瘤残留物的存在而导致腹膜频繁复发，这证明了开发新疗法的合理性。事实上，我们的主要目标是开发一种针对 OC 腹膜癌病的靶向光动力疗法 (PDT) 治疗方法，以提高癌症患者的预期寿命。在此，我们提出了一种靶向PDT，使用矢量光敏剂（PS）与新的叶酸类似物（FAA）（称为PSFAA）结合，以靶向腹膜转移上过度表达的叶酸受体α（FRα）。该 PSFAA 是焦脱镁叶绿酸-a (Pyro-a) 作为 PS 通过聚乙二醇 (PEG) 间隔基与新合成的 FAA 偶联的结果。与低表达 FRα 的纤维肉瘤细胞相比，在两种过表达 FRα 的人类 OC 细胞系上评估了 PSFAA 的选择性和 PDT 功效。最终的PSFAA，包括新FAA的合成及其与Pyro-a的缀合，经过10个合成步骤得到，总产率为19%。对 PSFAA 在 EtOH 中的光物理性质进行了测试，结果显示与游离 Pyro-a 相似，例如荧光和单线态氧量子产率（游离 Pyro-a 的 Φf=0.39 和 ΦΔ=0.53，Φf=0.26 和 ΦΔ=0.41对于 PSFAA）。注意到 PSFAA 的任何毒性。光照后，PS 浓度和光剂量呈现剂量依赖性效应。此外，检测到 PSFAA 对 OC 细胞分泌组的 PDT 功效可诱导促炎细胞因子分泌 (IL-6) 减少。这种新的 PSFAA 显示出有前景的生物学特性，突出了该疗法的选择性，为治疗陷入治疗困境的癌症开辟了新的视角。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。

CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS

LuWang,FangSun,Qiany...

CytoSIP: an annotated structural atlas for interactions involving cytokines or cytokine receptors.

CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS

针对细胞因子-细胞因子受体（CK-CKR）相互作用的治疗药物会破坏细胞信号传导，并可有效治疗包括肿瘤在内的许多疾病。然而，缺乏对 CK/CKR 上带注释的结构表面区域的普遍且快速的访问，限制了结构驱动方法在开发靶向大分子药物和精准医学疗法方面的进展。在此，我们开发了 CytoSIP（单核苷酸多态性 (SNP)、界面和表型），这是一个丰富的互联网应用程序，基于实验确定的 CK/CKR 结构复合物中热点周围原子相互作用的数据库。 CytoSIP 包含： (1) CK/CKR 上的 SNP； (2)涉及CK/CKR结构域的相互作用，包括CK/CKR界面、寡聚界面、表位或其他药物靶向表面； (3) 与 CK/CKR 或 SNP 相关的疾病和表型。该数据库框架引入了独特的三级 SIP 数据模型，使用蛋白质结构（复合物）作为基础框架（分子水平），将遗传变异（原子水平）与疾病表型（有机体水平）联系起来。采用定制的筛选工具来检索相关的 CK/CKR 子集，这减少了询问涉及 CK/CKR 表面热点和相关病理的大型数据集所需的时间和资源。 CytoSIP 门户可通过 https://CytoSIP.biocloud.top 公开访问，促进对 CK/CKR 之间的上下文相关串扰和靶向治疗药物的开发进行全景研究。© 2024。作者。

CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS

AdamBraun,SalmanOtou...

Blinatumomab-induced macrophage activating syndrome (MAS) in adult with B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL).

CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS

对于复发难治性 B 细胞急性淋巴细胞白血病 (B-ALL) 患者，博纳吐单抗作为单药已表现出优于挽救性化疗的优势，且安全性和有效性可控。尽管已知博纳吐单抗会出现预期的药物毒性，包括细胞因子释放综合征 (CRS) 和神经毒性，但之前只有一份关于 blinatumomab 引起的巨噬细胞激活综合征 (MAS) 的报道。病例介绍：我们报告了首例成人博纳吐单抗诱导的 MAS 病例。患者在第二个周期的博纳吐莫单抗治疗中出现发烧、咳嗽和虚弱症状。全血细胞计数显示严重白细胞减少症，综合代谢组显示碱性磷酸酶、AST、ALT、LDH 升高和与 MAS 一致的高铁蛋白血症。患者出现 MAS 时已处于 MRD 阴性缓解状态。她对停止用药并服用托珠单抗和地塞米松做出了迅速反应。她能够以 9 mcg/天的剂量重新开始 blinatumomab 治疗，并且没有症状复发。尽管 MAS 与 blinatumomab 没有预期的关联，但 CRS 的风险却是存在的。在这种情况下，继发性 MAS 可能与其他高炎症性疾病具有相同的机制。治疗包括扣押博纳吐单抗等违规药物，以及给予托珠单抗和地塞米松。未来的研究需要预测哪些患者在接受类似 T 细胞疗法后发生 MAS 的风险最高。© 2024。作者。

Stem Cell Research & Therapy

YangfanLiu,TongxuSun...

Fractionated irradiation induces radioresistant oral carcinoma cells with enhanced malignant phenotypes.

Stem Cell Research & Therapy

某些口腔癌患者经历放射治疗失败的事实意味着，在治疗过程中，存活癌细胞可能会出现更具放射抗性和侵袭性的表型。我们的研究旨在通过模拟临床相关放疗剂量策略的分次照射方案建立抗辐射口腔癌细胞，并研究恶性表型的全面改变。抗辐射口腔癌细胞是通过将 Cal27 和 Detroit 562 细胞暴露于 60 Gy 辐射而产生的分为 10 个剂量递增部分，并通过细胞免疫荧光进行验证。通过蛋白质印迹法评估与上皮间质转化（EMT）过程和癌症干细胞（CSC）表型相关的特异性标志物。分别使用基质胶包被的 Transwell 和伤口愈合测定来评估细胞侵袭和迁移。非靶向代谢组学用于机械地描述与 EMT 和 CSC 相关的潜在代谢模式；还通过球体形成试验和细胞免疫荧光检查了CSC表型。成功建立并验证了放射抗性口腔癌细胞系。这些细胞表现出增强的 EMT 以及细胞侵袭和迁移的增加。这些抗辐射细胞进一步表现出高代谢特征，特别是脂质代谢重编程和 ATP 结合盒 (ABC) 转运蛋白的功能富集。一致地，通过干性标志物的表达升高和球体形成能力的增加证实了放射抗性细胞中CSC表型的增强。接受分次辐射的放射抗性口腔癌细胞表现出增强的恶性表型。与增强的 EMT 和 CSC 表型相关的代谢特征为改善口腔癌放射治疗提供了潜在目标。版权所有 © 2024 Elsevier Ltd。保留所有权利。

Stem Cell Research & Therapy

BohuaWei,HaonanHuang...

Bibliometric and visualized analysis of the applications of exosomes based drug delivery.

Stem Cell Research & Therapy

外泌体是细胞分泌的内源性囊泡，具有生物相容性高、免疫原性低、靶向能力强、半衰期长、血脑屏障通透性等独特特性。它们在生理过程和疾病发生中充当重要的细胞间通讯载体。我们对 2013 年至 2023 年基于外泌体的药物递送研究的全面分析显示，有来自 33 个国家 717 个机构的 2,476 名作者。关键词聚类确定了五个研究领域：药物递送、间充质干细胞、癌症免疫治疗、靶向配体、表面修饰和巨噬细胞。外泌体药物递送技术与经过验证的临床模型相结合，能够利用化疗或放射增敏剂精确靶向肿瘤，并促进基因治疗。该文献计量分析旨在描述当前状态并推进基于外泌体的药物输送系统的临床应用。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier Masson SAS 出版。保留所有权利。

Stem Cell Research & Therapy

JohnRCashman,EmilyAC...

Effect of PAWI-2 on pancreatic cancer stem cell tumors.

Stem Cell Research & Therapy

在世界范围内，胰腺癌 (PC) 是一个主要的健康问题，2020 年将有近 50 万人被诊断出患有 PC。在美国，到 2023 年将有超过 64,000 名成年人被诊断出患有 PC。PC 对当前可用的治疗方法具有高度抵抗力，并且标准护理化疗会导致严重的副作用。大多数 PC 患者对临床治疗有抵抗力。联合治疗显示出优于单药治疗的疗效。然而，由于治疗相关的毒性，大多数治疗未能显示出总生存率的显着改善。开发有效的临床有用的 PC 疗法仍然是一个挑战。在此，我们展示了一种创新途径调节剂 p53-Activator Wnt Inhibitor-2 (PAWI-2) 对人类胰腺癌干细胞（即 hPCSC、FGβ3 细胞）产生的肿瘤的功效。 PAWI-2 是一种有效的肿瘤生长抑制剂。在本研究中，我们表明 PAWI-2 能有效抑制雄性和雌性小鼠的异种移植模型中 hPCSC 肿瘤的生长。 PAWI-2 以无毒方式抑制肿瘤。与媒介物处理的动物相比，PAWI-2 调节肿瘤的分子调节剂。抗癌结果表明 PAWI-2 的体内功效可能与体外抑制 FGβ3 细胞的效力相关。 PAWI-2 代表了一种对抗 PC 的安全新方法。© 2024。作者获得 Springer Science Business Media, LLC（Springer Nature 旗下公司）的独家许可。