研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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CANCER CELL
2024 May 16
ZhanyuWang,Chengming...
Molecular subtypes of neuroendocrine carcinomas: A cross-tissue classification framework based on five transcriptional regulators.
CANCER CELL
神经内分泌癌(NEC)是一种极其致命的恶性肿瘤,几乎可以发生在任何解剖部位。 NEC 的稀有性和显着的组织间和组织内异质性阻碍了 NEC 的表征。在此,通过对来自 31 个不同组织的 1,000 多个 NEC 进行综合分析,我们揭示了它们与组织无关的趋同,并进一步揭示了由不同转录调节因子驱动的分子分歧。因此,泛组织 NEC 被分为 ASCL1、NEUROD1、HNF4A、POU2F3 和 YAP1 定义的五种内在亚型。描绘了这些亚型的全面概况,突出显示了亚型特异性转录程序、基因组改变、进化轨迹、治疗漏洞和临床病理学表现。值得注意的是,新发现的 HNF4A 主导的 H 亚型表现出类似胃肠道的特征、野生型 RB1、独特的神经内分泌分化、较差的化疗反应和普遍的大细胞形态。统一分类范式的提出阐明了 NEC 异质性的转录基础,并弥合了不同谱系和细胞形态变异之间的差距,其中亚型的背景依赖性流行率是其表型差异的基础。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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CANCER CELL
2024 May 17
JianZhong,XudongXing...
Distinct roles of TREM2 in central nervous system cancers and peripheral cancers.
CANCER CELL
胶质母细胞瘤(GBM)是一种无法治愈的中枢神经系统(CNS)癌症,其特征是大量骨髓细胞浸润。在外周非 CNS 癌症中确定的骨髓细胞定向治疗靶点是否适用于 GBM 需要进一步研究。在这里,我们确定了周围癌症中关键的免疫抑制靶点,即触发髓样细胞 2 (TREM2) 上表达的受体,在 GBM 中具有免疫保护作用。遗传或药理学 TREM2 缺陷会促进体内 GBM 进展。单细胞和空间测序揭示 GBM 浸润的骨髓细胞中 TREM2 下调。 TREM2 与 GBM 中的免疫抑制性骨髓和 T 细胞耗竭特征呈负相关。我们进一步证明,在 GBM 进展过程中,富含 CNS 的鞘脂结合骨髓细胞上的 TREM2 并引发抗肿瘤反应。临床上,骨髓细胞中 TREM2 的高表达与 GBM 更好的生存相关。腺相关病毒介导的 TREM2 过度表达可阻碍 GBM 进展并与抗 PD-1 疗法产生协同作用。我们的结果揭示了 TREM2 在 CNS 癌症中的独特功能,并支持癌症免疫治疗中的器官特异性骨髓细胞重塑。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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CANCER CELL
2024 May 20
JohnBFinlay,AbbieSIr...
Olfactory neuroblastoma mimics molecular heterogeneity and lineage trajectories of small-cell lung cancer.
CANCER CELL
嗅上皮经历基底干细胞的神经元再生,并且容易罹患嗅神经母细胞瘤(ONB),这是一种来源不明的罕见肿瘤。利用 Rb1/Trp53/Myc (RPM) 的改变,我们建立了一种具有 NEUROD1 不成熟神经元表型的高级别转移性 ONB 基因工程小鼠模型。我们证明球形基底细胞(GBC)是 ONB 的允许起源细胞,并且 ONB 表现出模仿正常 GBC 发育轨迹的细胞命运异质性。 RPM ONB 中 ASCL1 缺失会导致非神经元组织病理学的出现,包括 POU2F3 微绒毛样状态。与小细胞肺癌 (SCLC) 类似,小鼠和人类 ONB 表现出相互排斥的 NEUROD1 和 POU2F3 样状态、免疫冷肿瘤微环境、包含神经元和非神经元谱系的瘤内细胞命运异质性以及细胞命运可塑性证据通过基于条形码的谱系追踪和单细胞转录组学。总的来说,我们的研究结果强调了 ONB 和神经内分泌肿瘤之间保守的相似性,对 ONB 分类和治疗具有重要意义。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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CANCER CELL
2024 May 18
MatheusHenriqueDias,...
The case for therapeutic overactivation of oncogenic signaling as a potential cancer treatment strategy.
CANCER CELL
大多数靶向抗癌药物都会抑制癌细胞所依赖的致癌信号。我们在这里讨论一种违反直觉的癌症治疗方法,该方法包括故意过度激活致癌信号以使癌细胞的应激反应超载。我们讨论了为什么这种致癌信号的过度激活与应激反应途径的扰动相结合,可能有效地杀死癌细胞,旨在激发进一步的讨论和思考。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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Experimental Hematology & Oncology
2024 May 24
Meng-HanWu,FelipeVal...
Deleting the mitochondrial respiration negative regulator MCJ enhances the efficacy of CD8+ T cell adoptive therapies in pre-clinical studies.
Experimental Hematology & Oncology
线粒体呼吸对于过继性细胞疗法中使用的 T 细胞的生存和功能至关重要。然而,专门增强线粒体呼吸以促进 T 细胞功能的策略仍然有限。在这里,我们研究了甲基化控制的 J 蛋白 (MCJ),它是 CD8 细胞中表达的线粒体复合物 I 的内源性负调节因子,可作为提高过继性 T 细胞疗法疗效的靶标。我们证明 MCJ 抑制鼠 CD8 CAR-T 细胞中的线粒体呼吸,并且 MCJ 的缺失增加了它们对抗鼠 B 细胞白血病的体外和体内功效。同样,卵清蛋白 (OVA) 特异性 CD8 T 细胞中的 MCJ 缺失也增强了它们对体内表达 OVA 的黑色素瘤的功效。此外,我们首次证明MCJ在人CD8细胞中表达,并且MCJ表达水平与CD8 CAR-T细胞的功能活性相关。沉默人 CD8 CAR-T 细胞中 MCJ 的表达会增加其线粒体代谢并增强其抗肿瘤活性。因此,靶向 MCJ 可能代表一种潜在的治疗策略,可增加线粒体代谢并提高过继性 T 细胞疗法的疗效。© 2024。作者。
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Brain Structure & Function
2024 May 25
SiyuLiu,HaoranWang,S...
Mixture-of-experts and semantic-guided network for brain tumor segmentation with missing MRI modalities.
Brain Structure & Function
利用多模态 MRI 图像进行准确的脑肿瘤分割至关重要,但临床实践中缺少模态往往会降低准确性。本研究的目的是提出一个专家和语义引导网络的混合体,以解决脑肿瘤分割中缺失模式的问题。我们引入了一种基于变压器的编码器,具有新颖的专家混合块。在每个模块中,四名模态专家致力于特定模态的特征学习。采用可学习的模态嵌入来减轻缺失模态的负面影响。我们还引入了一种由语义信息引导的解码器,旨在更加关注各种肿瘤区域。最后,我们与其他模型进行了广泛的比较实验以及消融实验,以验证所提出的模型在 BraTS2018 数据集上的性能。即使缺少模式,所提出的模型也可以准确地分割脑肿瘤子区域。在 15 种模态组合中,整个肿瘤的平均 Dice 得分为 0.81,肿瘤核心的平均 Dice 得分为 0.66,增强型肿瘤的平均 Dice 得分为 0.52,在大多数情况下实现了顶级或接近顶级的结果,同时还表现出较低的计算成本。我们的专家混合和语义引导网络在缺少模式的情况下实现了准确可靠的脑肿瘤分割结果,表明其临床应用的巨大潜力。我们的源代码已在 https://github.com/MaggieLSY/MESG-Net 上提供。© 2024。国际医学和生物工程联合会。
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Brain Structure & Function
2024 May 24
PatrickHLuckett,Mich...
Predicting post-surgical functional status in high-grade glioma with resting state fMRI and machine learning.
Brain Structure & Function
高级别胶质瘤(HGG)是中枢神经系统最常见和致命的恶性胶质瘤。目前的护理标准包括手术切除肿瘤,这可能导致功能和认知缺陷。本研究的目的是开发能够在手术前预测 HGG 患者功能结果的模型,促进改善疾病管理和知情患者护理。对来自华盛顿大学医学中心神经外科脑肿瘤服务的成年 HGG 患者 (N = 102) 进行了回顾性研究被招募了。所有患者在手术前均完成了结构神经影像和静息态功能 MRI 检查。使用人口统计学、静息状态网络连接 (FC) 测量、肿瘤位置和肿瘤体积来训练随机森林分类器,以根据卡诺夫斯基表现状态(KPS < 70,KPS ≥ 70)预测功能结果。该模型实现了嵌套KPS 分类的交叉验证准确率为 94.1%,AUC 为 0.97。该模型确定的最强预测因子包括躯体运动网络、视觉网络、听觉网络和奖励网络之间的 FC。根据位置,肿瘤与背侧注意力、扣带盖和基底神经节网络的关系是 KPS 的强有力的预测因子。年龄也是一个强有力的预测因素。然而,肿瘤体积只是一个中等预测因子。目前的工作证明了机器学习能够在手术前对 HGG 患者的术后功能结果进行准确分类。我们的结果表明,FC 和肿瘤相对于特定网络的位置都可以作为功能结果的可靠预测因子,从而为个体患者量身定制个性化治疗方法。© 2024。作者。
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Brain Structure & Function
2024 May 25
EricCourchesne,VaniT...
Embryonic origin of two ASD subtypes of social symptom severity: the larger the brain cortical organoid size, the more severe the social symptoms.
Brain Structure & Function
社交情感和沟通症状是自闭症谱系障碍 (ASD) 的核心,但其严重程度因幼儿而异:一些患有 ASD 的幼儿在很小的时候就表现出不断提高的能力,并发展出良好的社交和语言技能,而其他患有“严重”自闭症的幼儿则一直表现出较低的水平。社交、语言和认知技能,需要终身护理。这些相反的 ASD 社会严重程度亚型和发育轨迹的生物学起源尚不清楚。由于 ASD 涉及早期大脑过度生长和神经元过多,我们测量了 10 名幼儿的 4910 个胚胎期大脑皮质类器官 (BCO) 的大小和生长情况ASD 和 6 个对照(平均测量/受试者 196 个单独的 BCO)。在 2021 年的一批中,我们测量了 10 个 ASD 和 5 个对照组的 BCO。在 2022 年的批次中,我们通过生成和测量来自 6 个 ASD 和 4 个对照受试者的独立批次的 BCO,测试了 BCO 大小和生长效应的可复制性。 BCO 大小是在我们的大型、独一无二的社会症状、社会注意力、社会大脑以及社会和语言心理测量规范数据集(从 N = 266 到 N = 1902 个幼儿)的背景下进行分析的。通过测量类器官发育 1 个月和 2 个月之间的大小变化来检查 BCO 增长率。在细胞水平上检查两个月后的神经发生标记。在分子水平上,我们测量了Ndel1的活性和表达; Ndel1 是细胞周期激活激酶的主要靶标;已知调节细胞周期、增殖、神经发生和生长;在 BCO 水平上,分析显示,2021 年和 2022 年批次的自闭症谱系障碍 (ASD) 中,BCO 大小显着增大了 39% 和 41%。胚胎 BCO 尺寸越大,自闭症谱系障碍 (ASD) 社交症状越严重。 BCO 大小与社会症状之间的相关性在 2021 年批次中为 r = 0.719,在 2022 年重复批次中为 r = 0.873。 ASD BCO 的生长速度比对照快近 3 倍。在细胞水平上,两个最大的 ASD BCO 加速了神经发生。在分子水平上,Ndel1活性与BCO的生长速率和大小高度相关。在自闭症谱系障碍 (ASD) 幼儿中发现了两种 BCO 亚型:一种亚型的 BCO 尺寸非常增大,生长速度和神经发生速度加快;另一种亚型的 BCO 尺寸非常大,生长速度和神经发生速度加快;严重的自闭症临床表型,表现出严重的社会症状、社会注意力减少、认知能力下降、语言和社交智商极低;并显着改变特定皮质社交、语言和感觉区域的生长。第二种亚型的 BCO 增大程度较轻,社交、注意力、认知、语言和皮质差异也较轻。 ASD 幼儿衍生的 BCO 和临床表型的较大样本可能会揭示其他 ASD 胚胎亚型。通过胚胎发生,两种亚型的生物学基础自闭症谱系障碍(ASD)的社交和大脑发育(深度自闭症和轻度自闭症)已经存在并可测量,涉及细胞增殖失调和神经发生和生长加速。自闭症谱系障碍 (ASD) 胚胎 BCO 大小越大,幼儿的社交症状越严重,社交注意力、语言能力和智商下降越严重,社交和语言脑区的生长也越不典型。© 2024。作者)。
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EUROPEAN UROLOGY ONCOLOGY
2024 May 23
XiaoyangDu,ShuangHao...
Effectiveness and Cost-effectiveness of Artificial Intelligence-assisted Pathology for Prostate Cancer Diagnosis in Sweden: A Microsimulation Study.
EUROPEAN UROLOGY ONCOLOGY
基于图像的人工智能 (AI) 方法在前列腺癌 (PCa) 检测方面表现出很高的准确性。与人类病理学家相比,它们对患者治疗结果和成本效益的影响仍然未知。我们的目的是评估瑞典人工智能辅助病理学诊断 PCa 的有效性和成本效益。我们使用健康数据对 50 岁至 74 岁之间的男性在一生中进行四年一次的前列腺特异性抗原 (PSA) 筛查进行建模。护理视角。 PSA ≥3 ng/ml 的男性被转诊进行标准活检 (SBx),其中要么通过 AI 检查核心,然后由病理学家检查 AI 标记的阳性核心,要么单独由病理学家检查。 AI 性能特征是使用内部 STHLM3 验证数据集进行评估的。结果指标包括测试数量、PCa 发病率和死亡率、过度诊断、质量调整生命年 (QALY) 以及如果使用 AI,病理学家评估的活检核心可能会减少。使用增量成本效益比来评估成本效益。与单独的病理学家相比,人工智能辅助工作流程使 PSA 检测、SBx 手术和 PCa 死亡数量增加了 ≤0.03%,并略微降低了 PCa 发病率和过度诊断。人工智能将使病理学家评估的活检核心比例减少 80%。每个病例的成本为 10 欧元,与单独的病理学家相比,人工智能辅助工作流程的成本更低,并且 QALY 降低 <0.001%。结果对人工智能成本很敏感。根据我们的模型,人工智能辅助病理学将显着减少病理学家的工作量,不会影响患者的生活质量,并且与单独的人类病理学家相比,可以在瑞典节省成本。我们比较了瑞典前列腺癌患者的结果和两种评估前列腺活检方法的相关成本:(1)人工智能(AI)技术和人类病理学家对阳性活检的审查; (2) 一名人类病理学家单独进行所有活检。我们发现,与单独的人类病理学家相比,人工智能的加入可以减少病理工作量并节省资金,并且不会影响患者的治疗结果。结果表明,在瑞典将人工智能添加到前列腺病理学中可以节省成本。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
2024 May 24
MojtabaHosseine,Seye...
Label-free electrochemical biosensor based on green-synthesized reduced graphene oxide/Fe3O4/nafion/polyaniline for ultrasensitive detection of SKBR3 cell line of HER2 breast cancer biomarker.
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
癌症是现代世界中最具影响力的疾病之一,主要是因为它具有致命的后果。在这种情况下,最根本的担忧可能源于患者的延迟诊断。因此,检测各种形式的癌症势在必行。癌症研究中的一个巨大挑战是这种疾病的诊断和治疗。早期癌症诊断至关重要,因为它显着影响后续的治疗步骤。尽管做出了大量的科学努力,准确、快速地诊断癌症仍然是一项艰巨的挑战。众所周知,癌症诊断领域有效地包括了电化学方法。将适体、抗体或核酸等生物传感成分的卓越选择性与电化学传感器系统相结合已显示出积极的成果。在这项研究中,我们采用了一种新型电化学生物传感器来检测癌症。该生物传感器基于玻碳电极,采用还原氧化石墨烯/Fe3O4/Nafion/聚苯胺的纳米复合材料。我们使用 SEM、TEM、FTIR、RAMAN、VSM 和电化学方法阐明了改性过程。为了优化实验条件并监测固定过程,采用了 CV、EIS 和 SWV 等电化学技术。校准图的线性范围为 102-106 个细胞 mL-1,检测限为 5 个细胞 mL-1。© 2024。作者。
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