研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS
2024 May 11
KavyaChavali,HolleyC...
Proteogenomics in Nephrology: A New Frontier in Nephrological Research.
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS
蛋白质基因组学代表了肾脏病学的变革性交叉点,它将基因组学、转录组学和蛋白质组学结合起来,揭示肾脏疾病的分子复杂性。这篇综述概括了蛋白质基因组学的方法论本质及其对慢性肾脏病(CKD)研究的深远影响。我们探索蛋白质组学流程,强调基因组、转录组和蛋白质组数据的综合分析及其在增强我们对肾脏病理学理解方面的关键作用。通过案例研究,我们展示了蛋白质基因组学在透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 和常染色体隐性多囊肾病 (ARPKD) 中的应用,强调其在个性化治疗策略和生物标志物发现方面的潜力。该综述还解决了蛋白质基因组分析中的挑战,包括数据集成的复杂性和生物信息学的局限性,并提出了推进该领域的解决方案。最终,这篇综述强调了蛋白质基因组学在肾脏病学中的前景,特别是在推进个性化医疗和提供新颖的治疗见解方面。
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GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS
2024 May 09
RaimundDietze,Witold...
Phosphoproteomics Reveals Selective Regulation of Signaling Pathways by Lysophosphatidic Acid Species in Macrophages.
GENOMICS PROTEOMICS & BIOINFORMATICS
肿瘤微环境(TME)中普遍存在的溶血磷脂酸(LPA)会对多种癌症产生不利影响。在卵巢癌中,18:0 和 20:4 LPA 种类选择性地与较短的无复发生存期相关,表明对细胞信号网络有明显的影响。巨噬细胞代表了 TME 中高度相关的细胞类型,但 LPA 对这些细胞的影响仍然不清楚。在这里,我们通过无偏磷酸蛋白质组学发现了人类单核细胞来源的巨噬细胞中不同的 LPA 物种特异性反应,其中 87 个和 161 个磷酸位点分别被 20:4 和 18:0 LPA 上调,并且只有 24 个共享位点。下调磷酸位点的特异性更为明显(163 个位点对 5 个位点)。考虑到 TME 中高水平的 20:4 LPA 及其与不良生存率的选择性关联,这一发现可能具有重要意义。通路分析确定 RHO/RAC1 GTPase 信号传导是主要受影响的靶点,包括 AHRGEF 和 DOCK 鸟嘌呤交换因子、ARHGAP GTPase 激活蛋白和调节蛋白激酶。与这些发现一致的是,暴露于 20:4 导致肌动蛋白丝网络发生强烈改变,从而增强巨噬细胞迁移。此外,20:4 LPA 诱导 p38 磷酸化,这是 18:0 LPA 未反映的反应,而 AKT 的模式则相反。此外,RNA 分析确定了参与胆固醇/脂质代谢的基因作为 20:4 LPA 的选择性靶标。这些发现表明,两种 LPA 物种协同调节不同的途径,以支持 TME 内促肿瘤巨噬细胞所必需的功能。其中包括通过 AKT 激活实现细胞存活以及通过 RHO/RAC1 和 p38 信号传导实现细胞迁移。
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Immunity & Ageing
2024 May 24
XingChen,LifuWan,Yao...
The efficacy and safety of apatinib combined with S-1 for advanced gastric cancer: A systematic review and meta-analysis.
Immunity & Ageing
对一线治疗无反应的晚期胃癌(AGC)对临床管理提出了挑战。本研究的目的是比较阿帕替尼联合S-1二线及以上治疗AGC的疗效和安全性。Cochrane Library、Science Direct、EMBASE、PubMed、CNKI检索截至2023年8月的随机对照试验仅符合《胃癌规范化诊疗指南》的患者纳入研究。提取准确的数据并区分随访时间和药物剂量以减少异质性,并根据Cochrane手册评估纳入试验的偏倚风险。最后,根据试验中的临床反应率、生存期、生化指标和不良事件发生情况来评估治疗的生存获益。荟萃分析包括29项随机对照试验,涉及2149名受试者。临床有效率(优势比 = 2.61,95%置信区间[2.13-3.20],P < .00001)和疾病控制率(优势比 = 3.16,95%置信区间[2.54-3.94],P <阿帕替尼与S-1联用时发现了.00001),并且在降低肿瘤标志物和调节免疫因子方面也具有明显的优势。此外,阿帕替尼联合S-1显着增加了高血压风险,但减轻了肝功能损害,而其他不良事件的改善并不明显。阿帕替尼联合S-1对于二线及以上治疗更有效、更安全AGC的治疗。本研究最大限度地减少了基础数据来源造成的结论偏差,但仍需要更多高质量的研究来验证这些结论。版权所有 © 2024 作者。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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Immunity & Ageing
2024 Apr 10
HawraaAllawiLuaibi,B...
Relationship of TNFα-238 G/A (rs 361525) genotypes with TNFα gene expression in liver and pancreas disorders in sample of beta thalassemia major adult Iraqi patients.
Immunity & Ageing
肿瘤坏死因子-α (TNFα) 是免疫反应的重要生理调节因子,多种疾病与其失调有关。本研究旨在了解成年肝脏和胰腺疾病患者中 TNFα 基因的表达,并检查 TNFα 的影响该人群有 238 种基因型。 在巴格达的 Ibn Al-Baladi 医院,从 40 名被诊断为 β 地中海贫血合并胰腺疾病的患者、40 名被诊断为地中海贫血合并肝脏疾病的患者和 40 名被诊断为地中海贫血合并肝脏疾病的患者中采集了血液样本。被诊断患有地中海贫血,但没有胰腺或肝脏疾病。为了建立对照组,从相同年龄、相同性别且健康状况良好的人中采集了 40 个样本。所有这些人均被视为年龄超过 18 岁。通过利用实时聚合酶链反应(PCR),研究和评估TNF-α基因表达水平。采用T-ARMS-PCR方法对地中海贫血患者和健康对照样本中TNFα-238进行检测和基因分型。结果显示,TNFα基因表达评估显示,B组(地中海贫血合并肝病患者)的折叠程度高于其他组。组中基因表达量最低的是 D 组(作为对照组)。此外,在重型β地中海贫血患者中TNFα基因表达折叠与TNFα-238基因型之间的关系发现,与GG基因型相比,GA基因型患者的TNFα基因表达水平显着增加,其次是AA基因型。此外,当前研究的结果表明,突变(A)等位基因(无论是杂合子(GA)还是纯合子(AA))的存在与患有肝脏和胰腺疾病的地中海贫血患者的TNF-α基因表达之间存在关联。结果,可以得出结论,TNF-α 238 突变 (A) 等位基因(无论是杂合子 (GA) 还是纯合子 (AA))的存在与肝脏和胰腺疾病中的 TNF-α 基因表达之间存在关系,如下所示:以及地中海贫血患者。
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Bone & Joint Journal
2024 May 24
Elena-CodrutaCozma,L...
Molecular mechanisms of human papilloma virus related skin cancers: A review.
Bone & Joint Journal
人乳头瘤病毒 (HPV) 属于乳头瘤病毒科病毒,其中包括小型双链 DNA 病毒因子。大约 90% 的 HPV 感染是无症状的,并且会自行消退。然而,高风险病毒株的感染可能导致癌前病变的发展,并增加癌变的可能性。这些恶性肿瘤的位置包括口腔、子宫颈、阴道、肛门和外阴等。 HPV 在致癌作用中的作用已经在上述瘤形成中得到证实。然而,对于皮肤恶性肿瘤,我们仍然无法确定 HPV 在其发生和进展中所起的作用的机制。迄今为止,唯一完全了解的病毒性皮肤肿瘤发生机制是人类疱疹病毒 8 感染卡波西肉瘤。然而,就 HPV 感染而言,大多数数据都集中在 β 病毒株以及紫外线辐射 (UVR) 和其他环境或遗传因素在皮肤鳞状细胞癌 (cSCC) 的肿瘤发生中所发挥的作用。然而,最近的流行病学调查强调,HPV 还可能引发其他非黑素细胞癌,例如基底细胞癌 (BCC) 和/或黑素细胞皮肤癌,例如黑色素瘤。在此,我们概述了 HPV 在良性和恶性皮肤病变中发挥的作用,特别关注描述 HPV 与皮肤癌的关系的主要流行病学、病理生理学和分子方面。版权所有 © 2024。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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Bone & Joint Journal
2024 May 24
SoominAn,WankyuEo
Preoperative abnormal bone mineral density as a prognostic indicator in patients undergoing gastrectomy for gastric cancer: A cohort study.
Bone & Joint Journal
由于肿瘤-淋巴结-转移(TNM)系统等传统分期系统的局限性,预测胃癌(GC)患者的胃切除术后复发和死亡率仍然具有挑战性。本研究旨在调查术前亨斯菲尔德单位 (HU) 值(作为骨矿物质密度 (BMD) 替代指标)对预测 GC 患者生存结果的影响。对接受根治性胃切除术的胃癌患者的数据进行回顾性分析。使用机会性腹盆腔计算机断层扫描图像来评估第三腰椎 (L3) 的 HU 值。然后使用 110 HU 的截止值对这些值进行分类,该截止值在之前的研究中已确定为异常与正常 BMD 的决定因素。 Cox 回归分析建立了总生存期 (OS) 的预测模型。在 501 名初始患者中,478 名符合纳入标准。多变量分析显示 HU 值(风险比,1.51)以及其他因素(5 因素修正衰弱指数、胃切除术类型、TNM 分期、贫血和血清白蛋白水平)是 OS 的重要预测因子。与仅基于 TNM 分期的基线模型 (BM) 相比,包含这些变量的完整模型 (FM) 表现出卓越的辨别能力(一致性指数:0.807 vs 0.709;P < .001)。此外,FM 在预测术后 36 个月和 60 个月的 OS 风险方面优于 BM。总之,在接受胃切除治疗GC的患者中,机会性CT扫描确定的L3水平HU值 ≤ 110(表明BMD异常)的患者预后较差于HU值 > 110(表明BMD正常)的患者。将 HU 与其他临床病理学参数相结合可提高预测准确性,促进个体化风险分层和治疗决策,这可能会改善生存结果。作者版权所有 © 2024。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版
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Bone & Joint Journal
2024 Mar 29
SSegun-Busari,HKOmok...
Prognosticators of Excision of Giant Intra-Oral Tumors in a Resource-Challenged Setting: A Case Report.
Bone & Joint Journal
小唾液腺广泛分布于唇、腭、鼻腔、咽、喉的粘膜表面,因此可以起源于这些原发部位。口腔内小唾液腺肿瘤(IMSGT)虽然在普通人群中被认为罕见,但与所有其他口腔外部位相比却相对更为常见。正如索引患者中所见,多形性腺瘤是最常诊断的良性 IMSGT。口腔内小唾液腺肿瘤并不罕见,根据其大小、性质和位置,可能会导致患者呼吸、清晰说话和/或吞咽能力的严重限制,从而导致严重的发病率甚至死亡。除了这些有害影响之外,它们还给外科医生和麻醉师带来了重大的手术挑战,外科医生必须确定最安全、最可行的途径以确保完全或接近完全切除,麻醉师需要确保获得明确的结果。通过鼻子或嘴巴的气道,这两者都可能因肿瘤的存在而受到严重限制。目的是展示我们对文献中记录的最大的口腔内小唾液腺肿瘤之一的成功治疗,强调我们为解决我们面临的特殊手术和麻醉挑战而采取的具体措施。手术已经过去两年了,患者身体健康,生活质量显着改善,并且没有复发。患者为一名 50 岁男性,口腔顶部有一个缓慢生长的无痛性左腭肿块,病程已长达 10 年,并伴有反复自发性血性分泌物和打鼾。有吞咽困难和窒息的相关病史,左侧面部不对称,但没有脸颊肿胀、吞咽疼痛、喉咙痛或呼吸困难。就诊前大约两年,同侧上切牙缺失且牙齿无序。没有其他鼻科、耳科或眼科症状。无颈部肿胀、僵硬、咳嗽或胸部症状。由于口腔内肿块的大小,口咽体格检查受到很大限制。图 1. 面部不对称,左侧上颌骨隆起,左侧 1b 级和 2 个无压痛淋巴结肿大,可自由活动,不粘附于皮肤。颅面 CT 扫描显示广泛的等密度不均匀增强口腔内软组织肿块,占据整个腭/口腔,并横向侵犯咀嚼器和咽旁间隙,左上颌底和舌骨受到侵蚀。 图 2. 患者接受了切除术对有游离缘的腭部肿块进行活检。手术时无冰冻切片。组织学检查显示为多形性腺瘤,随访 2 年未发现复发迹象。预测者预计,延迟就诊会导致肿块增大,严重限制患者呼吸、清晰说话和/或吞咽能力,从而导致严重的发病率甚至死亡,但外科医生不会不知所措,熟练的麻醉师可能会在我们不进行气管切开术的情况下操纵鼻腔并获得手术的成功结果。版权所有 © 2024 西非医学杂志。
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Protein & Cell
2024 May 17
EloáPereiraBrabo,Ser...
Expression of somatostatin receptors in hemangioblastomas associated with von Hippel-Lindau disease as a novel diagnostic, therapeutic, and follow-up opportunity: A case report and literature review.
Protein & Cell
与 von Hippel-Lindau (VHL) 病相关的血管母细胞瘤经常是多发的,并且在长期随访期间会复发。目前,尚无针对这些肿瘤的全身治疗方法。最近的研究表明生长抑素受体在这些类型的血管母细胞瘤中表达。值得注意的是,通过肽受体放射性核素成像测定,肿瘤中生长抑素受体表达的增加是对生长抑素类似物和肽受体放射性核素治疗反应的预测因素。本研究的目的是描述一名与 VHL 疾病相关的鞍上血管母细胞瘤中生长抑素受体表达增加的患者的病例,并对 VHL 相关血管母细胞瘤患者中生长抑素受体表达进行文献综述。我们在此描述了一名患有 VHL 疾病的 51 岁男性病例,他在磁共振成像中检测到鞍上血管母细胞瘤。使用镓-68-DOTATOC (68Ga-DOTATOC) 进行的肽受体放射性核素成像发现,鞍上血管母细胞瘤以及多发性胰腺神经内分泌肿瘤和双侧嗜铬细胞瘤中生长抑素受体的表达增加。该患者接受兰瑞肽(一种生长抑素类似物)治疗一年。开始兰瑞肽一年后重复 68Ga-DOTATOC 显示血管母细胞瘤对放射性示踪剂的吸收减少,这与代谢反应一致。与 VHL 疾病相关的血管母细胞瘤中存在生长抑素受体是一项新发现。如本例所述,用生长抑素类似物治疗后这些受体的表达降低,使生长抑素受体成为 VHL 疾病患者新的诊断、治疗和随访机会的新靶点。
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Protein & Cell
2024 Mar 29
CJOkeke,EAJeje,RWOje...
Waiting Times in Prostate Cancer Diagnosis and Treatment: A Ten-Year Experience in A Nigerian Teaching Hospital.
Protein & Cell
前列腺癌仍然是尼日利亚和撒哈拉以南非洲其他低收入和中等收入国家 (LMIC) 的主要男性癌症和癌症死亡的主要原因。早期诊断对于确保及时治疗并降低发病率和死亡率至关重要。因此,减少诊断和治疗的等待时间非常重要。研究前列腺癌管理等待时间,作为提高尼日利亚民众癌症护理质量的基线。这是一项针对所有患者等待时间的十年回顾性研究在尼日利亚埃博尼州阿巴卡利基的 Alex-Ekwueme 联邦教学医院就诊的经组织学确诊的前列腺癌患者。采用SPSS 26版进行统计分析。P值小于0.05被认为有统计学意义。然而,分析了73名数据完整的患者。患者的平均年龄为71.48±8.16岁。出现症状前的中位持续时间为 6 个月。平均总前列腺特异性抗原为82.08±54.9ng/mL。第一次就诊到确诊之间的平均时间为 6.53±11.68 个月,中位时间为 1 个月。从就诊到治疗的中位持续时间为 3 个月,平均为 9.71±13.4 个月。职业、最高教育程度、经济限制和研究的不同等待时间之间没有关联(P>0.05)。本研究中前列腺癌治疗的等待时间被过度延长;与患者相关的因素并没有影响这种等待。 前列腺癌是尼日利亚主要癌症的主要起因,也是非洲撒哈拉以南非洲的主要癌症来源。诊断是预防疾病和死亡的关键。这对诊断和性状的护理非常重要。研究前列腺癌奖的护理人员,将提供抗癌质量的参考服务尼日利亚人口. 联邦大学亚历克斯·埃克乌姆 (Abakaliki) 的所有患者前列腺癌确诊的组织学和特征回顾性回顾尼日利亚埃博尼国家。使用 SPSS 26 版逻辑分析统计数据。 Une valeur de P inférieure à 0,05 a été considérée comme statistiquement 显着性。总共 189 名患者患有前列腺癌;最后,我们对 73 名患者进行了完整的分析。 L'âge moyen des 患者 était de 71,48±8,16 ans。症状在 6 天内出现。前列腺特异抗原 (PSA) 总浓度为 82,08±54,9 ng/mL。首次访问的时间和诊断结果的时间为 6,53±11,68 分钟,平均时间为 1(1) 分钟。访问期间中间时间为 3 个月,大约 9,71±13,4 个月。奥库纳协会n'a été observée entre l'职业、le plus haut niveau d'education、les contraintes financières et les différents délais d'attente étudiés (P>0,05).Les délais d'attente pour la pleasure en charge du前列腺癌持续异常会延长治疗时间;事实是患者不影响 cette attente。前列腺癌、Délai d'attente、Délai、诊断、Traitement。版权所有 © 2024 西非医学杂志。
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Food & Function
2024 May 24
KeeneLAbbott,AhmedAl...
Metabolite profiling of human renal cell carcinoma reveals tissue-origin dominance in nutrient availability.
Food & Function
肿瘤微环境是癌症进展和治疗效果的决定因素,其中营养物质的可用性发挥着重要作用。尽管已经确定特定营养素的局部丰度决定了肿瘤生长的代谢参数,但与正常组织和血液相比,指导肿瘤中营养素可用性的因素仍然知之甚少。为了确定肾细胞癌(RCC)中的这些因素,我们对肿瘤间质液(TIF)、邻近正常肾间质液(KIF)和从患者收集的血浆样本进行了定量代谢组学和综合脂质组学分析。 TIF 的营养成分与 KIF 非常相似,这表明与癌症存在无关的组织特异性因素对营养水平的影响比肿瘤驱动的变化更强。值得注意的是,在 RCC TIF 中发现了与 RCC 代谢已知特征一致的选择代谢变化,而 TIF 中的葡萄糖水平并未消耗到低于 KIF 中的水平。这些发现为肾细胞癌的组织营养动态提供了信息,强调了非癌症驱动的组织因子在塑造这些肿瘤的营养可用性方面的主导作用。© 2024,Abbott,Ali,Reinfeld 等。
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