研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2024 May 24
QiChang,YongqiangChe...
Comprehensive Urinary Proteome Profiling Analysis Identifies Diagnosis and Relapse Surveillance Biomarkers for Bladder Cancer.
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
膀胱癌(BCa)是泌尿系统的主要恶性肿瘤。在此,初步建立了全面的尿液蛋白质组学特征,用于膀胱癌的无创诊断和复发监测。收集279例(63例原发BCa、87例非肿瘤对照(NT)、73例复发BCa(BCR)和56例非复发BCa(BCNR))来筛查尿蛋白生物标志物。分别通过 DDA 和两个发现组中所有理论质谱 (SWATH-MS) 分析的连续窗口采集对 4761 和 3668 种蛋白质进行定性和定量。通过多反应监测(MRM)在两个独立的组合组中验证上调的蛋白质。使用多支持向量机递归特征消除 (mSVM-RFE) 算法,包含 13 种蛋白质的模型在 BCa 和 NT 之间表现出良好的性能,AUC 为 0.821 (95% CI: 0.675-0.967),灵敏度为 90.9% (95诊断测试集中的 % CI:72.7-100%)和 73.3% 特异性(95% CI:53.3-93.3%)。同时,11 标记物分类器显着区分 BCR 和 BCNR,敏感性为 75.0%(95% CI:50.0-100%),特异性为 81.8%(95% CI:54.5-100%),AUC 为 0.784(95% CI) :0.609-0.959)在复发监测测试队列中。值得注意的是,新报道了 24 个标记的 6 个蛋白(SPR、AK1、CD2AP、ADGRF1、GMPS 和 C8A)。本文揭示了 BCa 的新型尿蛋白生物标志物,并为膀胱癌的发病机制提供了新的理论见解(数据标识符 PXD044896)。
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JOURNAL OF NEUROSURGERY
2024 May 24
HassanAFadel,JacobAP...
Laser interstitial thermal therapy for first-line treatment of insular glioma.
JOURNAL OF NEUROSURGERY
由于复杂的周围功能和血管解剖结构,岛状胶质瘤带来了重大的手术挑战。作者报告了他们使用激光间质热疗法 (LITT) 治疗岛状神经胶质瘤的新框架的经验,并提供了代表性案例,强调了适应症、基本原理和技术要点。前瞻性收集的机构数据库用于识别新诊断的患者2015 年至 2023 年间接受 LITT 的岛状胶质瘤。拟议的岛状胶质瘤治疗框架以肿瘤大小和岛外肿瘤受累程度为指导。肿瘤局限于岛叶(仅岛叶)的患者接受单次或分期 LITT 治疗。患有额颞叶受累的岛叶肿瘤(岛叶)患者接受岛叶 LITT 和标准额颞叶岛外肿瘤切除术治疗。分析了临床和体积病变特征,特别强调细胞减灭治疗的程度和安全性。在 2015 年至 2023 年间在作者所在机构接受 LITT 治疗的 261 名患者中,确定了 33 例 LITT 手术,涉及 22 名未经治疗的岛叶状肿瘤患者。神经胶质瘤。在 22 名患者中,12 名仅患有岛叶肿瘤,仅接受 LITT 治疗,而 10 名患者患有岛叶病变,接受 LITT 和切除术治疗。仅岛叶肿瘤的中位肿瘤体积为 13.4 cm3(IQR 10.6、26.3 cm3),中位治疗范围为 100%(IQR 92.1%、100%)。岛叶病变明显更大,中位体积为 81.2 cm3(IQR 51.9,97 cm3),中位治疗范围为 96.6%(IQR 93.7%,100%)。所有仅有岛叶肿瘤的患者在消融后第二天就出院了,而岛叶患者的住院时间明显更长,50% 的住院时间超过 3 天。总体而言,8% 的仅岛状患者患有永久性神经功能缺损,而岛状患者的这一比例为 33%。两名患者的肿瘤在随访期间出现进展:一名患者患有 WHO 4 级星形细胞瘤,另一名患者患有未另行说明的弥漫性神经胶质瘤。 4 级肿瘤患者的永久性神经功能缺损率最高 (43%),术后卡诺夫斯基表现状态评分下降幅度较大 (p = 0.046)。作者介绍了他们使用新型岛状胶质瘤治疗范例的经验,该范例将 LITT 纳入岛状胶质瘤手术的更广泛框架。他们的研究结果表明,岛叶 LITT 是可行的,并且可以实现高细胞减灭率,同时可能降低传统岛叶神经胶质瘤手术的风险。
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JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS
2024 May 24
KamonwanPonsuwan,Sup...
Passifetilactones A-E, Fatty Acid Lactones from the Fruit and Flowers of Passiflora foetida with Cytotoxic Activity.
JOURNAL OF NATURAL PRODUCTS
对西番莲果实和花的植物化学研究分离出 14 种化合物,其中 5 种是以前未描述过的脂肪酸内酯。通过光谱和光谱数据分析,鉴定出四种 2-吡喃酮,passifetilactones A-D (1-4) 和一种呋喃酮,passifetilactone E (5)。测试了先前未描述的内酯对癌细胞系 HeLa、A549、PC-3、KKU-055 和 KKU-213A 以及两种正常细胞系 Vero 和 MMNK-1 的细胞毒性活性。 Passifetilactones B (2) 和 C (3) 对 6 种细胞系表现出良好至轻度的细胞毒活性,IC50 分别为 3.7-25.9 μM 和 12.2-19.8 μM,但对 MMNK-1 细胞系的活性较弱。在流式细胞术实验中,Passifetilactones B 和 C(2 和 3)显示出对 KKU-055 细胞系的细胞凋亡诱导作用。 Passifetilactone D (4) 是通过硅胶纯化产生的分离产物,但我们证明它也可以在粗 EtOAc 提取物中缓慢形成。这是对该植物的花和果实的首次调查。
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IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
2024 May 24
YuchengLu,ZhixinXu,M...
Cross-domain Denoising for Low-dose Multi-frame Spiral Computed Tomography.
IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
计算机断层扫描 (CT) 已在全世界范围内用作辅助诊断的非侵入性检查。然而,X 射线暴露的电离性质引起了人们对癌症等潜在健康风险的担忧。对较低辐射剂量的渴望促使研究人员提高重建质量。尽管之前关于低剂量计算机断层扫描(LDCT)去噪的研究已经证明了基于学习的方法的有效性,但大多数都是在模拟数据上开发的。然而,现实世界的场景与模拟域有很大不同,特别是在使用多层螺旋扫描仪几何结构时。本文提出了一种适用于商用多层螺旋 CT 扫描仪的两阶段方法,该方法可以更好地利用完整的重建流程来跨不同领域进行 LDCT 去噪。我们的方法充分利用了多切片投影和体积重建的高冗余,同时利用了传统级联框架中因过度去噪而导致的过度平滑问题。专用设计还提供了对数据流的更明确的解释。对各种数据集的大量实验表明,所提出的方法可以在不影响空间分辨率的情况下消除高达 70% 的噪声,而两位经验丰富的放射科医生的主观评估进一步支持了其在临床实践中相对于最先进方法的优越性能。代码可在 https://github.com/YCL92/TMD-LDCT 获取。
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Toxins
2024 Apr 30
YuechiSong,Xiaochang...
Exposure to Microcystin-LR Promotes Colorectal Cancer Progression by Altering Gut Microbiota and Associated Metabolites in APCmin/+ Mice.
Toxins
微囊藻毒素 (MC) 是蓝藻产生的毒素,微囊藻毒素-LR (MC-LR) 是水生环境中最普遍、最具毒性的变体之一。 MC-LR不仅造成环境问题,而且对人类健康构成重大风险。本研究旨在探讨 MC-LR 对 APCmin/ 小鼠的影响,APCmin/小鼠被认为是肠道肿瘤的理想动物模型。我们给小鼠灌胃 40 µg/kg MC-LR 8 周,然后进行组织病理学检查、微生物多样性和代谢组学分析。与对照组相比,暴露于 MC-LR 的小鼠在 APCmin/ 小鼠中表现出结直肠癌进展的显着促进和肠道屏障功能受损。在暴露于 MC-LR 的小鼠中观察到肠道微生物失调,表明肠道微生物群结构发生显着改变。这包括 Marvinbryantia、Gordonibacter 和 Family_XIII_AD3011_group 的富集以及 Faecalibaculum 和 Lachnoclostridium 的减少。代谢组学分析显示,暴露于 MC-LR 的小鼠肠道内容物中胆汁酸 (BA) 代谢物增加,特别是牛磺胆酸 (TCA)、α-鼠胆酸 (α-MCA)、3-脱氢胆酸 (3-DHCA)、 7-酮脱氧胆酸(7-KDCA)和12-酮脱氧胆酸(12-KDCA)。此外,我们发现在暴露于 MC-LR 的小鼠中,Marvinbryantia 和 Family_XIII_AD3011_group 与牛磺胆酸 (TCA) 表现出最强的正相关性。这些发现为MC-LR在易感人群中的作用和机制提供了新的见解,为MC-LR在饮用水中的指导价值提供了基础。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 May 24
XianqiangLiu,Dingcha...
Molecular characterization, clinical value, and cancer-immune interactions of genes related to disulfidptosis and ferroptosis in colorectal cancer.
GENES & DEVELOPMENT
本研究致力于利用二硫死亡相关铁死亡(SRF)基因构建一个新的特征,以预测结直肠癌(CRC)个体对免疫治疗的反应、预后和药物敏感性。RNA测序数据以及个体相应的临床信息与 CRC 一起从癌症基因组图谱 (TCGA) 数据集中提取。 SRF 是在随机森林 (RF)、最小绝对收缩和选择算子 (LASSO) 以及逐步回归算法的帮助下构建的。为了验证 SRF 模型,我们将其应用于外部队列 GSE38832。比较高风险组和低风险组(类别)的预后、免疫治疗反应、药物敏感性、基因的分子功能和基因的体细胞突变。此后,所有统计分析均借助 R(版本 4.23)软件和 Cytoscape(版本 3.8.0)工具的各种软件包进行。SRF 是基于五个基因(ATG7、USP7、MMD、PLIN4 和总谐波失真 (THDC)2)。单变量和多变量 Cox 回归分析均证实 SRF 是一个独立的、与预后相关的危险因素。高风险类别的个体预后更差,肿瘤突变负荷(TMB)升高,并且免疫抑制状态明显。因此,他们在免疫治疗后可能有更好的结果,并且可能受益于帕唑帕尼、拉帕替尼和舒尼替尼的给药。总之,SRF可以作为预后评估的新生物标志物。此外,它也是 CRC 药物敏感性和免疫治疗反应的良好预测因子,但在临床环境中实施之前应进行优化。© 2024。作者。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 May 24
CharlesBobin,Yasmine...
Sequential analysis of cfDNA reveals clonal evolution in neuroblastoma patients receiving ALK targeted therapy.
GENES & DEVELOPMENT
无细胞 DNA (cfDNA) 研究能够对神经母细胞瘤患者的肿瘤细胞特异性遗传改变进行连续分析。已确定 18 名接受第三代 ALK 抑制剂 Lorlatinib 治疗的复发性神经母细胞瘤患者(SACHA 国家登记处和/或机构) )。通过执行 WGS 文库构建,然后对热点突变(F1174L、R1275Q、I1170N)(变异等位基因分数 (VAF))进行 ALK 靶向 ddPCR,对 9 名患者复发时的 cfDNA 进行分析,并依次对 5 名患者(血液/骨髓血浆)进行分析检测限 0.1%)和 WES 来评估疾病负担和克隆进化,与肿瘤/种系 WES 进行比较。Lorlatinib 的总体缓解率为 33%(CI 13-59%),其中 6/10 例未使用 Lorlatinib 的患者观察到缓解,而 0 例则为 0 /8 例具有 MYCN 扩增(MNA)。 ALK VAF 与总体临床疾病状态相关,临床缓解时 VAF <0.1%,而进展时 VAF 较高 (>30%)。重要的是,序贯 ALK ddPCR 比临床成像更早检测到复发。 cfDNA WES 揭示了 Lorlatinib 治疗后所有疾病进展情况中未见于原发肿瘤的新 SNV,表明克隆进化,包括与肿瘤侵袭性 (TP53) 或新靶标 (EGFR) 相关的基因的改变。基因通路分析揭示了新兴克隆中针对细胞分化的基因和持久性克隆中针对细胞粘附的基因的富集。在后续样本中可以观察到克隆造血的证据。我们证明了结合 ALK cfDNA ddPCR 用于疾病监测和 cfDNA WES 用于研究接受 ALK 靶向治疗的神经母细胞瘤患者的克隆进化和耐药机制的临床实用性。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 May 24
RenéeCDuardo,Jessica...
Human DNA topoisomerase I poisoning causes R loop-mediated genome instability attenuated by transcription factor IIS.
GENES & DEVELOPMENT
DNA 拓扑异构酶 I 可能导致癌症基因组不稳定。在催化活性过程中,拓扑异构酶 I 形成瞬时中间体拓扑异构酶 I-DNA 裂解复合物 (Top1cc),以允许链旋转和双链体松弛,从而导致 DNA-RNA 杂合体和微核水平升高。为了理解潜在的机制,我们在 Top1cc 诱导后不久整合了 Top1cc 触发的杂交和 DNA 双链断裂 (DSB) 的基因组数据,揭示了 Top1cc 通过不同的机制提高了杂交水平。 DSB 位于早期复制起始区的高度转录基因处,并与基因 5' 端积累的 RNA 聚合酶 II (RNAPII) 下游的杂交体重叠。损害转录延伸的转录因子 IIS 突变体可能由于回溯而进一步增加了 RNAPII 的积累。此外,Top1ccs 在 G1 晚期或 S 早/中期发生时可以触发微核,但在 S 晚期则不会。由于转录因子 IIS 减弱了微核和转录复制冲突,我们的结果支持 RNAPII 阻滞在 Top1cc 诱导的转录中的作用-导致 DSB 和微核的复制冲突。
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EUROPEAN RADIOLOGY
2024 May 24
MaartendeRooij,Clare...
PI-QUAL version 2: an update of a standardised scoring system for the assessment of image quality of prostate MRI.
EUROPEAN RADIOLOGY
当怀疑前列腺癌时,多参数 MRI 是最佳的初步检查,其排除和排除临床重大疾病的能力依赖于高质量的解剖和功能图像。实现一致的高质量采集的途径包括细致的患者准备、扫描仪设置、优化的脉冲序列、人员培训和人工智能系统。这些干预措施对最终图像的影响需要量化。前列腺成像质量 (PI-QUAL) 评分系统是第一个标准化量化方法,通过将图像质量与 MRI 癌症检测能力联系起来,证明了临床获益的潜力。我们推出 PI-QUAL (PI-QUAL v2) 的更新版本,适用于使用或不使用静脉造影剂进行的前列腺 MRI,使用简化的 3 点量表,重点关注关键技术和定性图像参数。临床相关性声明:高图像质量对于前列腺 MRI 至关重要,PI-QUAL 评分的更新版本 (PI-QUAL v2) 旨在解决版本 1 的局限性。它现在适用于多参数 MRI 和无静脉注射 MRI造影剂。要点:高质量图像对于使用 MRI 进行前列腺癌诊断和治疗至关重要。 PI-QUAL v2 简化了图像评估,并将其适用性扩展到无需造影剂的前列腺 MRI。 PI-QUAL v2 专注于关键技术和定性图像参数,并强调 T2-WI 和 DWI。© 2024。作者。
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EUROPEAN RADIOLOGY
2024 May 24
EunYoungChae,MiRanJu...
A predictive model using MRI and clinicopathologic features for breast cancer recurrence in young women treated with upfront surgery.
EUROPEAN RADIOLOGY
旨在确定术前乳腺 MR 成像和与复发相关的临床病理变量,并开发接受前期手术治疗的年轻乳腺癌女性复发的风险预测模型。这项回顾性研究分析了 2007 年 1 月至 2007 年 1 月至 2007 年 4 月期间连续 438 名年龄在 35 岁或以下的乳腺癌女性。 2016 年 12 月。手术前的乳房 MR 图像由对患者结果不知情的乳腺放射科医生独立审查。回顾了临床病理数据,包括患者人口统计、临床特征和肿瘤特征。使用单变量和多变量逻辑回归分析来确定与复发相关的独立因素。建立复发风险预测模型,并评估判别和校准能力。 438例患者中,中位随访65个月后,95例(21.7%)出现复发。 MR成像时的肿瘤大小(HR = 1.158,P = 0.006),多焦点或多中性疾病(HR = 1.676,P = 0.017),T2WI上的肿瘤疾病(HR = 2.166,p = 0.001)被确定为独立的复发预测指标,而辅助内分泌治疗(HR = 0.624,p = 0.035)与复发呈负相关。该预测模型在预测 5 年复发(C 指数,开发队列中为 0.707;验证队列中为 0.686)和总体复发(C 指数,开发队列中为 0.699;验证队列中为 0.678)方面表现出良好的辨别能力。校准图显示出良好的相关性(一致性相关系数,0.903)。基于乳腺 MR 成像和临床病理特征的预测模型显示出良好的辨别力,可以预测接受前期手术治疗的年轻乳腺癌女性的复发,这可能有助于个体化风险分层我们的预测模型结合了术前乳房 MR 成像和临床病理特征,可以预测接受前期手术的年轻乳腺癌女性的复发,促进个性化风险分层并为定制管理策略提供信息。患有乳腺癌的年轻女性的结果比在更典型的情况下诊断的女性要差年龄。所描述的预测模型在预测 5 年复发和总体复发方面表现出良好的区分性能。在该人群中采用更好的风险分层工具可能有助于改善结果。© 2024。作者,获得欧洲放射学会的独家许可。
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