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NUCLEIC ACIDS RESEARCH
2024 May 23

MunevverCinar,Lourde...
Transposon DNA sequences facilitate the tissue-specific gene transfer of circulating tumor DNA between human cells.
NUCLEIC ACIDS RESEARCH
已知细胞之间的基因交换在许多生物体中发挥重要的生理和病理作用。我们证明循环肿瘤 DNA (ctDNA) 促进人类癌细胞之间的细胞特异性基因转移,并解释了这种现象背后的部分机制。当 ctDNA 迁移到细胞核中时,遗传信息就会被转移。细胞靶向和 ctDNA 整合需要 ERVL、SINE 或 LINE DNA 序列。化学制造的 AluSp 和 MER11C 序列复制了多发性骨髓瘤 (MM) ctDNA 细胞靶向和整合。此外,我们发现 ctDNA 可能会改变 MM 和胰腺癌模型的治疗反应。这项研究表明逆转录转座子 DNA 序列促进癌症基因转移。然而,由于在生理和其他病理条件下都检测到了游离 DNA,因此我们的研究结果不仅具有癌症的影响,而且具有更广泛的影响。此外,转座子 DNA 序列介导组织特异性靶向的发现将为基因和疗法的传递开辟新途径。© 作者 2024。由牛津大学出版社代表 Nucleic Acids Research 出版。
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NMR IN BIOMEDICINE
2024 May 24

KeZhang,SimonMFTriph...
Navigator-based motion compensation for liver BOLD measurement with five-echo SAGE EPI and breath-hold task.
NMR IN BIOMEDICINE
这项工作的目的是将多回波自旋梯度回波 (SAGE) 回波平面成像 (EPI) 与基于导航器 (NAV) 的前瞻性运动补偿方法相结合,用于定量肝血氧水平依赖 (BOLD) )使用屏气 (BH) 任务进行测量。开发了五回波 SAGE 序列来定量测量 T2 和 T2*,以足够的信噪比、空间分辨率和对 BH 引起的 BOLD 变化的敏感性来描述功能任务。为了解释呼吸运动,采用了单一梯度回波投影读数形式的导航器,沿着上下方向位于膈肌处。在基于自旋回波 EPI 的读数的每个横向成像切片之前,合并了导航器采集和脂肪抑制。从导航器获取运动数据并将其传输回序列,从而可以实时调整切片定位。这项研究包括六名健康志愿者和三名肝癌患者。在 BH 任务的每个时间点计算定量 T2 和 T2*。使用一般线性模型计算一级分析的 t 值参数以及 Echo1、T2 和 T2* 的肝血管反应性 (HVR)。使用导航信号成功补偿了呼吸活动引起的运动。屏气期间 T2 和 T2* 的平均变化分别约为 1% 和 0.7%。借助 NAV 前瞻性运动补偿,可以获得没有运动伪影的全肝 t 值。量化的肝脏 T2 (34.7±0.7ms) 和 T2* (29±1.2ms) 值与文献值一致。在健康志愿者中,统计 t 值和 HVR 在整个肝脏中的分布是均匀的。在肝癌患者中,由于转移或治疗,t值和HVR的分布不均匀。本研究证明了使用NAV前瞻性运动补偿技术结合五回波SAGE EPI定量测量肝脏BOLD的可行性BH 任务。© 2024 作者。约翰·威利 (John Wiley) 出版的《生物医学中的核磁共振》
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NATURE BIOTECHNOLOGY
2024 May 23

ZacharyHWalsh,ParinS...
Mapping variant effects on anti-tumor hallmarks of primary human T cells with base-editing screens.
NATURE BIOTECHNOLOGY
关键 T 细胞基因中的单核苷酸变异 (SNV) 可以驱动临床病理,并可重新用于改善细胞癌症免疫疗法。在这里,我们进行大规模并行碱基编辑筛选,在具有已知或潜在临床相关性的基因位点上生成数千个变异。我们发现了广泛的假定功能获得 (GOF) 和功能丧失 (LOF) 突变,包括 PIK3CD 及其编码调节亚基 PIK3R1、LCK、SOS1、AKT1 和 RHOA 的基因。在具有黑色素瘤表位特异性工程 T 细胞受体的 T 细胞中或在不同代的 CD19 嵌合抗原受体 (CAR) T 细胞中对 PIK3CD 和 PIK3R1 变体进行碱基编辑表明,发现的 GOF 变体(而非 LOF 或沉默突变对照)增强了分别是同源黑色素瘤和白血病细胞模型的信号传导、细胞因子产生和裂解。此外,我们还表明,用 PIK3CD GOF 突变设计的几代 CD19 CAR T 细胞表现出增强的抗原特异性信号传导、细胞因子产生和白血病细胞杀伤,包括与其他近期策略进行基准比较时。© 2024。作者,获得独家许可施普林格自然美国公司
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MOLECULAR CELL
2024 May 16

FangfangLu,HongtuZha...
Cryo-EM reveals that iRhom2 restrains ADAM17 protease activity to control the release of growth factor and inflammatory signals.
MOLECULAR CELL
解整合素和金属蛋白酶 17 (ADAM17) 是一种膜束缚蛋白酶,可触发多种信号通路。它释放主要炎症细胞因子肿瘤坏死因子 (TNF) 和癌症相关表皮生长因子 (EGF) 家族生长因子的活性形式。 iRhom2 是一种菱形、膜嵌入的假蛋白酶,是 ADAM17 的重要辅助因子。在这里,我们展示了人类 ADAM17/iRhom2 复合物在非活性和活性状态下的冷冻电子显微镜 (cryo-EM) 结构。这些揭示了三种调节机制。首先,利用 TMD 识别的菱形标志,iRhom2 与 ADAM17 TMD 相互作用,促进 ADAM17 运输和酶成熟。其次,独特的 iRhom2 胞外结构域出乎意料地保留了切割的 ADAM17 抑制性前结构域,防止过早激活和蛋白水解失调。最后,复合物中前结构域的丢失会动员 ADAM17 蛋白酶结构域,从而增强其与底物结合的能力。我们的结果揭示了菱形样假蛋白酶在进化过程中如何被重新利用来调节有效的膜束缚酶 ADAM17,从而确保炎症和生长因子信号传导的保真度。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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LIFE SCIENCES
2024 May 21

ZhangdiXu,LanZhang,X...
Construction of a TAN-associated risk score model with integrated multi-omics data analysis and clinical validation in gastric cancer.
LIFE SCIENCES
越来越多的研究强调了中性粒细胞激活和极化在肿瘤进展中的生物学意义。然而,肿瘤相关中性粒细胞 (TAN) 的特征研究还不够充分。患者的表达谱是从 TCGA、GEO 和 IMvigor210 数据库中获得的。使用六种算法来评估免疫细胞浸润。进行RNA测序以评估诱导的N1样中性粒细胞和N2样中性粒细胞之间的差异表达基因。结合加权基因共表达网络分析 (WGCNA) 和 RNA-seq 数据建立了 TAN 相关风险评分 (TRS) 模型,并在泛癌中进一步评估。招募了 117 名 GC 患者的临床队列,通过免疫组织化学 (IHC) 评估 TAN 在 GC 中的作用。 TRS 特征由 10 个 TAN 相关基因 (TRG) 构建,大多数 TRG 在 GC 微环境的 TAN 中高度丰富。 TRS模型可以准确预测患者的预后以及他们对化疗和免疫治疗的反应。 TRS与促肿瘤免疫细胞呈正相关,与抗肿瘤免疫细胞呈负相关。其他功能分析表明,该特征与泛癌中的促肿瘤和免疫抑制途径(例如缺氧途径)呈正相关。此外,我们的临床队列证明 TAN 是 GC 患者的独立预后因素。本研究构建并证实了一种新型 TRS 模型对于 GC 和泛癌预后预测的价值。对 TRS 和 TAN 的进一步评估将有助于加强对肿瘤微环境的了解并指导更有效的治疗策略。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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LEUKEMIA
2024 May 23

YajunLi,KailinChen,B...
Increased coexpression of PD-L1 and IDO1 is associated with poor overall survival in patients with NK/T-cell lymphoma.
LEUKEMIA
程序性细胞死亡 1 配体 1 (PD-L1) 阻断的免疫疗法对 NK/T 细胞淋巴瘤患者有效。除PD-L1外,吲哚胺2,3-双加氧酶-1(IDO1)是最有前途的免疫治疗靶点之一。通过免疫组织化学 (IHC) 从来自三个癌症中心的 230 名新诊断的 NK/T 淋巴瘤患者的组织样本中观察到高比例的 PD-L1 和 IDO1 蛋白,并且与 NK/T 淋巴瘤患者的总生存期 (OS) 较差相关。重要的是,PD-L1 和 IDO1 的共表达与 NK/T 淋巴瘤患者的较差 OS 和较短的限制性平均生存时间有关,并且是训练队列中的一个独立预后因素,并且也在 58 例 NK/T 淋巴瘤患者中得到了验证患者(GSE90597)。此外,用 PD-L1 和 IDO1 表达以及年龄构建的列线图模型可以提供简明而精确的 OS 率和中位生存时间预测。列线图模型中的高危组与验证队列中的 CD4 T 细胞浸润呈正相关,免疫抑制因子水平也是如此。因此,PD-L1 和 IDO1 高表达与 NK/T 淋巴瘤患者的 OS 较差相关。 PD-L1 和 IDO1 可能是未来 NK/T 淋巴瘤免疫检查点阻断 (ICB) 疗法的潜在靶点。© 2024。作者,获得 Springer Nature Limited 的独家许可。
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JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY
2024 Jun

IreneLoCigno,Federic...
High-risk HPV oncoproteins E6 and E7 and their interplay with the innate immune response: Uncovering mechanisms of immune evasion and therapeutic prospects.
JOURNAL OF MEDICAL VIROLOGY
人乳头瘤病毒 (HPV) 是双链 DNA (dsDNA) 肿瘤病毒,与 5% 的人类癌症有因果关系,包括肛门生殖器癌和上呼吸消化道癌。尽管有预防性疫苗可供使用,但 HPV 仍然对全球健康构成重大挑战,这主要是由于疫苗获取和覆盖范围不足。这些病毒可以通过逃避受感染组织的内在防御和专业先天免疫细胞提供的外在防御来建立持续感染。它们逃避策略的关键是它们独特的上皮内生命周期,这有效地保护它们免受宿主检测。因此,旨在重新激活受感染或转化的上皮细胞内先天免疫反应的策略,特别是通过产生 I 型干扰素 (IFN) 和淋巴细胞募集趋化因子,被认为是抵消这些致癌病毒持续感染的不利影响的可行解决方案。 。本综述重点关注高危 HPV 癌蛋白 E6 和 E7 与上皮细胞和 HPV 相关癌症中的先天免疫反应之间的复杂相互作用。特别是,它详细介绍了 E6 和 E7 调节先天免疫反应的分子机制,强调了我们在理解这些过程方面取得的重大进展。它还研究了利用先天免疫系统改善现有抗癌疗法的前瞻性策略,从而为未来的治疗发展提供了重要的见解。© 2024 作者。 《医学病毒学杂志》由 Wiley periodicals LLC 出版。
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JOURNAL OF INORGANIC BIOCHEMISTRY
2024 May 16

SašaOpačak,Margareta...
Dissimilar effect of organometallic ruthenium complexes on the viability of MDR and non-MDR experimental models.
JOURNAL OF INORGANIC BIOCHEMISTRY
制备、表征并测试了含有三苯基膦二酰胺配体的钌配合物对各种癌细胞系和疟原虫恶性疟原虫的生物活性。使用 MTT 测定研究 M(单取代)和 B(双取代)复合物对人宫颈癌 (HeLa) 细胞系的影响。 24 种合成的钌配合物中的 5 种(B2、B3、B5、B6 和 B13)表现出显着的效果,IC50 值范围在 0.3 至 2.3 μM 之间。通过荧光光谱法对 B2 和 B13 的潜在生物分子靶标进行评估,揭示了与 BSA 的相关相互作用,并且与 ctDNA 的亲和力较弱。选择复合物 M2、B2、M13 和 B13 进行进一步的生物学表征。将它们对两种卵巢癌细胞系活力的影响与正常细胞系进行比较,表明它们的选择性。在治疗四种不同的耐药妇科癌细胞系(其多重耐药表型不同)时,双取代复合物的功效比单取代对应物更强。与不太敏感的 MDR 细胞相比,非 MDR 细胞对所有测试的复合物都敏感。在对复合物 M2、M13、B2 和 B13 对恶性疟原虫敏感和多重耐药寄生虫菌株的研究中,双取代复合物再次被证明是最有效的,对两种菌株均具有亚微摩尔活性。此外,复合物的耐药指数大约等于 1,比二磷酸氯喹低至少 5 倍,表明这些复合物能够在寄生虫的耐药形式中保留其活性。版权所有 © 2024。由 Elsevier 出版公司
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International Review of Cell and Molecular Biology
2024

RituShekhar,SujataKu...
The crosstalk between miRNAs and signaling pathways in human cancers: Potential therapeutic implications.
International Review of Cell and Molecular Biology
MicroRNA (miRNA) 越来越被认为是真核生物生理过程调节的核心参与者。这些小双链 RNA 分子已成为复杂的细胞信号通路网络中的关键调节因子,在人类癌症的发生和进展中发挥着重要作用。 miRNA 介导的信号通路调节的中心主题涉及它们靶向和调节通路成分表达的能力。 miRNA 的异常表达可以促进或抑制关键的信号转导事件,影响关键的细胞过程,例如增殖、凋亡、血管生成和转移。例如,致癌 miRNA 通常通过靶向信号通路的肿瘤抑制因子或负调节因子来促进癌症进展,从而增强通路活性。相反,肿瘤抑制 miRNA 经常通过靶向这些途径中的关键成分来抑制致癌信号传导。这种复杂的调控串扰强调了 miRNA 作为塑造癌细胞信号传导格局的核心参与者的重要性。此外,靶向 miRNA 对癌症的治疗意义重大。可以操纵 miRNA 来恢复正常的信号通路活性,为精准医疗提供了潜在的途径。基于 miRNA 的疗法(包括合成 miRNA 模拟物和 miRNA 抑制剂)的开发已在临床前和临床研究中显示出前景。这些策略旨在增强肿瘤抑制 miRNA 的活性或抑制致癌 miRNA 的功能,从而恢复信号平衡并阻止癌症进展。总之,人类癌症中 miRNA 和信号通路之间的串扰是癌症生物学的一个动态且有影响力的方面。了解这种相互作用可以为癌症的发生和进展提供宝贵的见解。利用 miRNA 作为信号通路调节剂的治疗潜力,为开发创新癌症治疗方法开辟了令人兴奋的机会,并有可能改善患者的治疗结果。在本章中,我们概述了癌症背景下 miRNA 和信号通路之间的串扰,并强调了针对这种调节相互作用的潜在治疗意义。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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International Review of Cell and Molecular Biology
2024

PriyankaSahu,AnkitaM...
Targeting KRAS and SHP2 signaling pathways for immunomodulation and improving treatment outcomes in solid tumors.
International Review of Cell and Molecular Biology
历史上,KRAS 一直被认为是“不可成药”的,尽管它是实体瘤中最常改变的致癌蛋白之一,这主要是由于突变亚型内缺乏药理学上“可成药”的口袋。然而,能够针对突变 KRAS 亚型(尤其是 KRASG12C 突变癌症)的药物设计的开创性发展,为出现由多种针对不同信号通路的抑制剂组成的联合疗法打开了大门。 SHP2 信号通路主要以激活 KRAS 等细胞内信号通路而闻名,已成为此类联合疗法的潜在靶标,因为它是连接 KRAS 和免疫信号通路的信号蛋白,并为理解重叠区域提供了链接RAS/ERK/MAPK 信号级联反应。因此,具有强大杀肿瘤活性以及免疫调节作用的SHP2抑制剂引起了研究人员的浓厚兴趣,以探索其作为KRAS突变实体瘤联合疗法的潜力。然而,这些联合疗法的兴奋需要克服耐药性和毒性增强带来的挑战。在这篇综述中,我们将讨论 KRAS 和 SHP2 信号通路及其在免疫调节和肿瘤微环境调节中的作用,并分析针对这些信号通路的不同联合疗法的积极作用和缺点,以及它们目前和未来治疗实体瘤的潜力。肿瘤。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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