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Experimental Hematology & Oncology
2023 Jul

KazemGhaffari,AliBay...
Combination Effect of Deferoxamine and Arsenic Trioxide on Viability and Vitality of APL Like Cell Line.
Experimental Hematology & Oncology
三氧化二砷是治疗急性早幼粒细胞白血病(APL)的活性剂,单独作用,但对患者有不良影响。此外,去铁胺具有抗增殖活性并诱导白细胞减少症。为了增强三氧化二砷的抗白血病效果并减少三氧化二砷的用量,本实验研究了三氧化二砷与去铁胺(DFO)联合使用对APL细胞系(NB4)的细胞毒作用。在急性早幼粒细胞白血病中,用不同剂量处理NB4细胞系(伊朗巴斯德研究所提供),然后分别以24小时、48小时和72小时为间隔,研究存活百分比、细胞计数、代谢活性和凋亡诱导。 。此外,通过RT-PCR方法分析了hTERT基因表达。我们发现DFO单独以及与ATO组合具有细胞毒性和抗增殖作用,并以剂量和时间依赖性方式降低NB4细胞系的活力和细胞代谢活性。此外,这种组合会导致细胞中细胞凋亡增加、Caspase-3 上调和 hTERT 基因下调。ATO/DFO 联合治疗协同降低了 hTERT 的 mRNA 水平,并增加了 Caspase-3 的 mRNA 水平。 3 与单独使用 DFO 相比,以时间依赖性方式实现。© 2023 Kazem G., et al.
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 May 23

PaoloBattuello,Giorg...
Mutational signatures of colorectal cancers according to distinct computational workflows.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
肿瘤突变特征在癌症研究中受到重视,但缺乏标准化方法阻碍了可重复性和稳健性。利用结直肠癌 (CRC) 作为模型,我们探讨了计算参数对 230 个 CRC 细胞系和 152 名 CRC 患者突变特征分析的影响。结果在三个独立数据集中得到验证:483 名子宫内膜癌患者按错配修复 (MMR) 状态分层,35 名肺癌患者按吸烟状况分层,以及 12 名患者来源的类器官 (PDO) 注释大肠杆菌素暴露。通过评估各种生物信息学工具、参考数据集和输入数据大小(包括全基因组测序、全外显子组测序和泛癌基因组),我们证明了结果的显着差异。我们报告说,使用不同的算法和参考文献会导致统计上不同的结果,强调任意选择如何可能导致突变特征贡献的变异性。此外,我们发现编码区和基因间区域之间突变特征的差异贡献,并定义了可靠突变特征分配所需的体细胞变异的最小数量。为了便于确定最合适的工作流程,我们开发了编码和外基因区域的比较突变特征分析 (CoMSCER),这是一种生物信息学工具,使研究人员可以通过将多个工具和公共参考数据集的结果结合起来,轻松地进行比较突变特征分析。评估编码和非编码基因组区域的突变特征贡献。总之,我们的研究提供了一个比较框架来阐明不同计算工作流程对突变特征的影响。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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BRITISH JOURNAL OF CANCER
2024 May 23

CristianoRamos,Vasil...
Metastasis-associated fibroblasts in peritoneal surface malignancies.
BRITISH JOURNAL OF CANCER
几十年来,腹膜表面恶性肿瘤(PSM)一直与有限的治疗选择和不良的预后相关。然而,围手术期全身化疗、细胞减灭术(CRS)和腹腔热灌注化疗(HIPEC)的进步显着改善了临床结果。 PSM 主要由腹内肿瘤扩散引起,然后形成继发性腹膜转移。结直肠癌、卵巢癌和胃癌是最常见的原因。尽管主要起源不同,但腹膜微环境的独特性塑造了 PSM 的共同特征。腹膜转移涉及肿瘤细胞与腹膜微环境之间复杂的相互作用。成纤维细胞发挥着至关重要的作用,有助于肿瘤的发生、进展和治疗耐药。 PSM 中的腹膜转移相关成纤维细胞 (MAF) 表现出高度异质性。单细胞 RNA 测序技术表明,免疫调节癌症相关成纤维细胞 (iCAF) 似乎是 PSM 中最常见的亚型。此外,在 PSM 研究中也经常观察到其他主要亚型,如肌成纤维细胞 CAF (myCAF) 和基质 CAF (mCAF)。腹膜 MAF 被认为起源于间皮细胞、间皮下成纤维细胞、周细胞、内皮细胞和网膜驻留细胞。 CAF 的这种可塑性和异质性导致 PSM 中复杂的微环境,影响治疗反应。了解这些相互作用对于开发有针对性的局部疗法以改善 PSM 患者的治疗效果至关重要。© 2024。作者。
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BREAST
2024 May 18

FabioPostiglioneMans...
Impact of the genomic signature of 70-genes for breast cancer in the public system and in supplementary health care in a country of medium socioeconomic development.
BREAST
由于乳腺癌的高发病率和全身治疗成本的增加,乳腺癌的财务影响已被讨论,并且在社会经济发展水平较低和中等的国家中更为重要。 评估使用 MammaPrint™ (MP) 基因特征的财务可行性在社会经济发展指数中等的国家的公共和私营系统中进行。一项药物经济学试验,进行成本效益分析,评估高危激素受体阳性患者化疗、支持药物和化疗输注期间使用的材料的成本降低情况(HR) 乳腺癌患者使用 MammaPrint™ 基因签名进行分析。在统一医疗系统 (SUS) 中使用 MammaPrint™ 的价值将为 50 岁以上年龄组中的每位患者带来 1,334.56 美元的额外费用。在私人医疗领域,在同一人群中使用 MammaPrint™ 将为每位患者节省 2,422.53 美元至 9,989.95 美元的成本。在巴西,MP 在具有高临床风险和低基因组风险的 RH 乳腺癌患者中的使用处于领先地位当应用于补充医疗保健时可以显着节省资源。在 SUS 中,降低大规模使用 MP 的成本可以使其应用可行。这些值需要在每个机构中使用试验中应用的方法重新评估,根据成本进行调整,以获得反映其现实的结果。版权所有 © 2024。由 Elsevier Ltd 出版。
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Brain Structure & Function
2024 Jun 20

AlessandroCanella,Ma...
BRAF V600E in a preclinical model of pleomorphic Xanthoastrocytoma: Analysis of the tumor microenvironment and immune cell infiltration dynamics in vivo.
Brain Structure & Function
低级别胶质瘤 (LGG) 是影响儿科患者 (pLGG) 的最常见脑肿瘤,BRAF 突变构成最常见的基因改变。在 pLGG 谱系中,大约 70%-80% 被诊断患有转化性多形性黄色星形细胞瘤 (PXA) 的儿科患者携带 BRAF V600E 突变。然而,神经胶质瘤 BRAF V600E 细胞对肿瘤浸润免疫细胞的调节作用及其对肿瘤进展的贡献仍不清楚。此外,与 BRAF 突变黑色素瘤的影响相比,BRAF 抑制剂治疗 pLGG 的功效有限。在这里,我们报告了一种新型的免疫活性 RCAS-BRAF V600E 小鼠神经胶质瘤模型。病理学评估表明该模型似乎与弥漫性胶质瘤和PXA的形态特征一致。我们的研究揭示了与肿瘤微环境 (TME) 内运输和激活增加相关的独特免疫细胞特征。有趣的是,TME 内的免疫系统激活还会产生与 CD8 T 细胞功能失调、免疫抑制性骨髓细胞和调节性 T 细胞增多相关的明显炎症反应。此外,我们的数据表明肿瘤诱发的炎症过程,例如细胞因子风暴。这些发现表明,临床前 BRAF V600E LGG 中肿瘤进展与 TME 内强烈的炎症反应之间存在复杂的相互作用,这可能会显着影响动物的生存。© 2024 作者。
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Brain Structure & Function
2024 Jul

JasmineTaylor,Fatémé...
Targeting the Hippo pathway to prevent radioresistance brain metastases from the lung (Review).
Brain Structure & Function
非小细胞肺癌 (NSCLC) 占所有肺癌的 85%,其预后较差,5 年生存率为 19%,主要是因为 NSCLC 诊断时已是晚期且已转移。阶段。尽管最近的治疗取得了进展,但约 50% 的 NSCLC 患者会出现脑转移 (BM)。对于有症状的患者和单发脑转移瘤的患者,可以单独进行手术BM治疗;对于不适合手术或脑病灶直径在5-30 mm范围内的脑病灶少于4个的患者,可以联合立体定向放射治疗(RT),或可以对大量或大型脑转移进行全脑放疗。然而,放射抗性 (RR) 总是会阻止 RT 的作用。 RR 的几种机制已被描述,包括缺氧、细胞应激、癌症干细胞的存在、细胞凋亡和/或自噬失调、细胞周期失调、细胞代谢变化、上皮间质转化、程序性细胞死亡过度表达‑配体 1 和激活多个信号通路;然而,Hippo 信号通路在 RR 中的作用尚不清楚。 NSCLC 中 Hippo 通路的失调会导致转移特性,目前正在开发针对该通路的抑制剂。因此,有必要评估抑制 Hippo 通路,特别是效应子 yes 相关蛋白 1 对肺癌脑转移的影响。
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CANCER IMAGING
2024 May 23

XiaoliXu,MinZhu,Zixi...
Prognostic and predictive value of interstitial lung abnormalities and EGFR mutation status in patients with non-small cell lung cancer.
CANCER IMAGING
确定间质性肺异常 (ILA) 对表皮生长因子受体 (EGFR) 突变状态的预测价值,并评估 EGFR 和 ILA 在非小细胞肺癌 (NSCLC) 患者中的预后意义。我们回顾了 797 名连续患有以下疾病的患者: 2013 年 1 月至 2018 年 10 月期间经组织学证实的原发性 NSCLC 诊断。其中,109 名 NSCLC 患者被发现伴有 ILA。使用多变量逻辑回归分析来确定预测 EGFR 突变的显着临床和计算机断层扫描 (CT) 结果。 Cox 比例风险模型用于确定重要的预后因素。109 个肿瘤中有 22 个肿瘤 (20.2%) 发现了 EGFR 突变。多变量分析显示,结合临床、肿瘤 CT 和 ILA CT 特征的模型产生的受试者工作特征曲线 (AUC) 值分别为 0.749、0.838 和 0.849。结合三种模型时,EGFR突变的独立预测因素是非纤维化ILA、女性和肿瘤体积小,AUC值为0.920(95%置信区间[CI]:0.861-0.978,p < 0.001) 。在多变量 Cox 模型中,与野生型相比,EGFR 突变(风险比 = 0.169,95% CI = 0.042-0.675,p = 0.012;692 天与 301 天)与延长的总生存期独立相关。 ILA 独立预测 EGFR 突变的存在,并且 EGFR 突变而非非纤维化 ILA 的存在可作为 NSCLC 患者的独立良好预后因素。© 2024。作者。
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BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
2023 Nov 15

Wen-JingLiu,RuiSong,...
Enzymatic DNA repairing amplification-powered construction of an Au nanoparticle-based nanosensor for single-molecule monitoring of cytosine deaminase activity in cancer cells.
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
APOBEC3A (A3A) 是一种胞苷脱氨酶,在分子诊断中发挥着重要作用。在此,我们展示了基于 Au 纳米粒子的纳米传感器的酶 DNA 修复放大驱动结构,用于单分子监测癌细胞中的 A3A 活性。靶标A3A可将底物探针中的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),然后模板与底物探针结合形成含有U/A碱基对的双链DNA。尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG)切除U碱基产生无嘌呤/无嘧啶(AP)位点,该位点可以被无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶1(APE1)切割以获得具有3'-OH末端的底物片段。随后,底物片段启动循环酶修复扩增 (ERA),释放触发器 1 和触发器 2。所得的trigger-1可以作为引物诱导多个循环ERA,产生大量的trigger-1和trigger-2。触发器2与信号探针的杂交形成具有AP位点的dsDNA双链体,诱导APE1对信号探针的循环切割,从而从AuNPs中释放出丰富的Cy5分子。释放的 Cy5 分子可以通过单分子成像轻松定量。该纳米传感器可以特异性、灵敏地检测A3A活性,检测限为0.855 aM,并且可以在单细胞水平上进一步测量动力学参数、筛选抑制剂以及量化内源A3A活性,在疾病诊断和治疗方面具有广阔的应用前景.版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
2024

LanpengGuo,YunongZha...
Electrochemical protein biosensors for disease marker detection: progress and opportunities.
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
人工智能医疗保健的发展为下一代生物传感器技术带来了机遇和挑战。蛋白质作为生物大分子标记物广泛应用于疾病诊断和治疗效果分析。电化学蛋白质生物传感器利用免疫学中的特异性抗体-抗原结合原理实现了理想的特异性。然而,蛋白质生物标志物的活性中心被肽基质包围,这阻碍了电荷转移并导致传感器灵敏度不足。因此,人们设计了电极修饰材料和换能器装置来提高电化学蛋白质传感器的灵敏度并改善其实际应用前景。在这篇综述中,我们总结了用于蛋白质生物标志物检测的电化学生物传感器的最新报告。我们重点介绍用于检测癌症、病毒传染病、炎症和其他疾病的电化学蛋白质生物传感器的最新研究。还一般性地讨论了与此类生物传感器相关的相应敏感材料、换能器结构和检测原理。最后,我们对未来几年使用电化学蛋白质生物传感器进行疾病标志物检测进行了展望。© 作者 2024。
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BIOORGANIC CHEMISTRY
2024 May 15

RanSun,YangfanHu,Xia...
Discovery, optimization and biological activity evaluation of genipin derivatives as potential KRAS G12D inhibitors.
BIOORGANIC CHEMISTRY
设计并合成了一系列京尼平衍生物作为针对 KRAS G12D 突变的潜在抑制剂。这些化合物中的大多数都表现出针对 KRAS G12D 突变肿瘤细胞(CT26 和 A427)的潜在抗增殖作用。值得注意的是,七种化合物在 CT26 (KRASG12D) 和 A427 (KRASG12D) 细胞中表现出抗癌作用,IC50 值范围为 7.06 至 9.21 µM,并有效抑制 CT26 细胞的集落形成。选择一种代表性化合物SK12来进一步研究其生物活性和作用机制。 SK12 以浓度依赖性方式显着诱导 CT26 细胞凋亡。此外,SK12还能提高肿瘤细胞中活性氧(ROS)的水平,并对KRAS信号通路发挥调节作用,从而抑制下游磷酸化蛋白的激活。通过表面等离子共振 (SPR) 测定进一步证实了 SK12 与 KRAS G12D 蛋白的结合亲和力,结合 KD 为 157 µM。 SK12还在裸鼠肿瘤模型中表现出显着的抗癌功效。实验组(50 mg/kg)的相对肿瘤增殖率(T/C)为 31.04%(P < 0.05),同时保持了值得称赞的安全性。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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