研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2024 May 23
KarlaTWashington,Deb...
Accessibility, Relevance, and Impact of a Symptom Monitoring Tool for Home Hospice Care: Theory Elaboration and Qualitative Assessment.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
早期用户发现,用于改善肿瘤护理症状的参与和可视化 (ENVISION) 是一款基于网络的应用程序,旨在改善临终关怀患者症状的家庭管理并支持患者和家庭护理人员的福祉,通常有用且易于使用使用。然而,他们也对技术熟练程度有限的用户可能遇到的潜在挑战表示担忧。我们试图同时实现两个相互关联的研究目标:(1) 开发健康信息系统的数字包容性概念框架;(2) 应用该框架评估 ENVISION 应用程序的数字包容性。我们让 ENVISION 用户 (N=34) 参与一项定性研究,通过直接观察、出声思考技术和对开放式查询的回答来收集数据。通过理论阐述和基本定性描述对数据进行分析。可及性、相关性和影响被确定为评估卫生系统数字包容性的 3 个基本考虑因素。研究结果普遍支持 ENVISION 的数字包容性,特别是它与家庭护理人员和临终关怀临床医生的工作的相关性及其对症状管理和生活质量的潜在积极影响。 ENVISION 数字包容性的局限性主要集中在可访问性问题,特别是技术知识和技能有限的个人之间的可操作性。健康信息系统数字包容性的可访问性、相关性和影响概念框架可以帮助确定加强工具的数字包容性的机会,例如 ENVISION,旨在供广泛和多样化的用户使用。©Karla T Washington、Debra Parker Oliver、Allison K Donehower、Patrick White、Jacquelyn J Benson、Patrick G Lyons、George Demiris。最初发表于 JMIR Human Factors (https:// humanfactors.jmir.org),2024 年 5 月 23 日。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2024 May 23
BonnieBSong,ZacharyS...
Fertility-Sparing Surgery for Stage I Epithelial Ovarian Cancer.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
旨在描述在美国接受保留生育手术的早期上皮性卵巢癌育龄患者的人群水平使用情况和结果。这项回顾性研究询问了国家癌症研究所的监测、流行病学和最终结果计划。该研究纳入了 3,027 名 50 岁以下的 I 期上皮性卵巢癌患者,这些患者在 2007 年至 2020 年期间接受了初次手术治疗。保留生育能力手术的定义是针对单侧病变保留一个卵巢和子宫,针对双侧病变保留子宫。 。通过对数变换的线性分段回归评估保留生育力手术的时间趋势。采用Cox比例风险回归模型评估与保留生育力手术相关的总生存率。共有534名患者(17.6%)接受了保留生育力手术。在队列水平上,2007 年保留生育手术的使用率为 13.4%,2020 年为 21.8%(趋势 P=0.009)。研究期间,非西班牙裔白人(2.8 倍)、具有高级浆液性组织学的个体(2.2 倍)和 IC 期疾病个体(2.3 倍)的保留生育手术利用率增加了两倍以上周期(趋势的所有 P<.05)。在控制了测量的临床病理特征后,接受保留生育手术的患者的总体生存率与接受非保留生育手术的患者相当(5年生存率93.6% vs 92.1%,调整后风险比0.87,95% CI,0.57-1.35 )。这种生存相关性在高级别浆液性(5 年率 92.9% vs 92.4%)、低级别浆液性(100% vs 92.2%)、透明细胞(97.5% vs 86.1%)、粘液性(92.1% vs 86.6)中是一致的。 %)、低级别子宫内膜样组织(95.7% vs 97.7%)和混合组织学(93.3% vs 83.7%)(所有 P>.05)。在高级别子宫内膜样肿瘤中,保留生育能力的手术与总生存率降低相关(5 年生存率 71.9% vs 93.8%,调整后风险比 2.90,95% CI,1.09-7.67)。在双侧卵巢病变中,保留生育能力的手术与总生存率无关(5 年生存率分别为 95.8% 和 92.5%,P=.364)。研究期间,在 41,914 名患有任何年龄和分期的上皮性卵巢癌患者中,年龄小于 50 岁的 I 期疾病患者从 8.6% 增加至 10.9%(趋势 P=0.002)。近五分之一的生殖-近年来,美国的 I 期上皮性卵巢癌老年患者接受了保留生育能力的手术。除患有高级别子宫内膜样肿瘤的患者外,接受保留生育能力手术的 I 期上皮性卵巢癌育龄患者在 5 年时间点仍存活。版权所有 © 2024 美国妇产科学院妇科医生。由 Wolters Kluwer Health, Inc. 出版。保留所有权利。
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IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
2024 May 23
BinyuZhang,ZhuMeng,H...
MTCSNet: One-stage learning and two-point labeling are sufficient for cell segmentation.
IEEE TRANSACTIONS ON MEDICAL IMAGING
深度卷积神经网络已广泛应用于医学图像分析,例如全切片图像中的病灶识别、癌症检测和细胞分割等。然而,研究人员往往不可避免地会尽力细化注释以增强模型性能,特别是细胞分割任务。弱监督学习可以大大减少标注的工作量,但弱监督学习方法和全监督学习方法之间仍然存在巨大的性能差距。在这项工作中,我们提出了一种弱监督细胞分割方法,即多任务细胞分割网络(MTCSNet),适用于多模态医学图像,包括病理、明场、荧光、相位衬度和微分干涉衬度图像。 MTCSNet以单阶段训练方式学习,每个单元只有两个注释点提供监督信息,第一个是质心,第二个是其边界。此外,还精心设计了五个辅助任务来训练网络,包括两个像素级分类、一个像素级回归、一个局部温度缩放和一个实例级距离回归任务,该任务旨在回归细胞质心之间的距离及其八个方向的边界。实验结果表明,我们的方法在公共多模态医学图像数据集上优于所有最先进的弱监督细胞分割方法。令人鼓舞的性能还表明,采用两点标记方法的单阶段学习足以进行细胞分割,而不是精细轮廓描绘。代码位于:https://github.com/binging512/MTCSNet。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 May
VinayMathewThomas,Be...
Differential Tumor Gene Expression Profiling of Patients With Prostate Adenocarcinoma on the Basis of BMI.
GENES & DEVELOPMENT
BMI 增加与前列腺癌发病率和死亡率增加有关。基线肿瘤基因表达谱(GEP)可以提供与治疗反应和疾病进展相关的生物过程的全面图景。我们根据前列腺腺癌患者的 BMI 询问并验证肿瘤 GEP 的潜在差异。纳入标准包括组织学证实的前列腺腺癌以及从未经治疗的原发性前列腺组织获得的 RNA 测序数据的可用性。 RNA 测序由临床实验室改进修正案认证的实验室(Tempus 或 Caris Life Sciences)进行。 Tempus 队列用于询问,Caris 队列用于验证。根据前列腺癌诊断时的 BMI 对患者进行分层:BMI 高(BMIH;BMI ≥30)和 BMI 低(BMIL;BMI <30)。使用 DEseq2 管道进行两个队列之间的差异基因表达分析。使用 Gene Set Enrichment 软件进一步分析所得的 GEP,以确定每个队列中表现出富集的途径。总体而言,102 名患者符合资格,其中 Tempus 队列中有 60 名患者(BMIL = 38,BMIH = 22),Caris 中有 42 名患者队列(BMIL = 24,BMIH = 18)。从BMIL组患者获得的肿瘤组织表现出与炎症途径相关的基因的较高表达。 BMIH 显示参与血红素代谢和雄激素反应等途径的基因表达增加。我们的研究表明,与患有前列腺癌的 BMIH 患者相比,BMIL 中不同基因组途径的上调。这些假设生成数据可以解释两组不同的生存结果,并指导前列腺癌男性的个性化治疗。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 May
YoheiAndo,MohamadDbo...
Germline Pathogenic Variants in Patients With Pancreatic and Periampullary Cancers.
GENES & DEVELOPMENT
如果没有显着的癌症家族史,通常不会怀疑遗传性癌症易感性。胰腺癌的致病种系变异已得到充分研究,指南中建议进行常规基因检测。然而,关于胰腺癌以外的罕见壶腹周围癌症的数据不足。我们比较了胰腺癌和非胰腺壶腹周围癌患者种系易感性变异的发生率。 研究对象为三级转诊医院接受胰十二指肠切除术的 608 例患者,其中胰腺导管腺癌 213 例,壶腹癌 172 例,胰十二指肠癌 154 例。远端胆总管癌 69 例,十二指肠腺癌 69 例。对 20 个癌症易感性和候选易感性基因进行了测序,并通过询问 ClinVar 和 PubMed 评估了变异解释。在 46 名患者 (7.7%) 中发现了致病性或可能致病性、中度至高渗透性种系变异,其中包括相似比例的患者胰腺癌(8.5%)和非胰腺壶腹周围癌(7.1%)。另外 11 名患者 (1.8%) 中发现了低渗透变异。 89% 的中度至高渗透性变异涉及主要癌症易感基因 BRCA2、ATM、BRCA1、CDKN2A、MSH2/MLH1 和 PALB2;其余11%涉及其他癌症易感基因,如BRIP1、BAP1和MSH6。几乎所有致病性变异携带者都有癌症家族史。胰腺和非胰腺壶腹周围癌患者的致病性癌症易感性变异的患病率相似。对于任何壶腹周围癌患者都应考虑进行种系敏感性检测。
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GENES & DEVELOPMENT
2024 May 22
YifeiLi,CongcongFan,...
Multi-cohort validation: A comprehensive exploration of prognostic marker in clear cell renal cell carcinoma.
GENES & DEVELOPMENT
透明细胞肾细胞癌 (ccRCC) 是最常见的 RCC 形式。其特点是对传统放疗和化疗产生耐药性,临床预后不良。尽管 TYMP 与肿瘤进展有关,但 TYMP 在 ccRCC 中的作用仍不清楚。通过数据库挖掘在 ccRCC 中鉴定出 TYMP 表达升高,并在 RCC 细胞系中得到证实。事实上,TYMP 敲低会影响体外肾细胞癌细胞的增殖、迁移和侵袭。 TYMP与临床病理参数(组织学分级、病理分期)呈正相关。此外,在 TCGA-ccRCC 和外部队列中,TYMP 高表达的患者表明预后不良。单细胞分析结果表明,TYMP主要分布在单核细胞和巨噬细胞中。此外,TYMP 与免疫状态之间存在显着关联。甲基化分析进一步阐明了TYMP表达与多个甲基化位点之间的关系。药物敏感性分析揭示了潜在的药物选择。此外,突变分析还确定了 TYMP 与 BAP1 和 ROS1 等 ccRCC 驱动基因之间的关联。总之,TYMP 可作为 ccRCC 的可靠预后指标。版权所有 © 2024 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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Disease Models & Mechanisms
2024 May 23
YongChen,JunWu,JieYo...
Integrating IASLC grading and radiomics for predicting postoperative outcomes in stage IA invasive lung adenocarcinoma.
Disease Models & Mechanisms
国际肺癌研究协会 (IASLC) 病理学委员会于 2020 年推出了侵袭性肺腺癌 (LUAD) 的组织学分级系统。IASLC 分级系统以评估主要和高级组织学模式为基础,已被证明可以对侵入性 LUAD 具有实用性和预后意义。然而,评估IA期LUAD的预后仍存在局限性。放射组学可能是一个有价值的补充。建立一个整合IASLC分级和放射组学的模型,旨在预测IA期LUAD的预后。我们对2015年1月至2015年1月至2015年1月期间诊断为IA期LUAD的628例接受手术切除的患者进行了回顾性分析。 2018 年 12 月在我们机构。将患者按 7:3 的比例随机分为训练组(n = 439)和测试组(n = 189)。以总生存期(OS)和无病生存期(DFS)作为终点。放射组学特征由 PyRadiomics 获得。使用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)进行特征选择。 OS 和 DFS 的预测模型是使用多元 Cox 回归分析开发的,并且模型通过列线图可视化。使用曲线下面积 (AUC)、一致性指数 (C-index)、校准曲线和生存决策曲线分析 (DCA) 评估模型的性能。 OS 预测模型总共选择了 9 个放射组学特征,15 个放射组学特征被选择为 OS 预测模型。 DFS 预测模型选择放射组学特征。放射组学评分高的患者预后较差 (p < 0.001)。我们单独使用放射组学或 IASLC 构建了单独的预测模型,以及组合预测模型。在 OS 预测中,我们观察到组合模型(C 指数:0.812 ± 0.024,3 年 AUC:0.692,5 年 AUC:0.792)比放射组学(C 指数:0.743 ± 0.038,3年 AUC:0.633,5 年 AUC:0.768)和 IASLC 分级(C 指数:0.765 ± 0.042,3 年 AUC:0.658,5 年 AUC:0.743)单独模型。在 DFS 模型中也得到了类似的结果。放射组学和 IASLC 病理分级的结合被证明是预测 IA 期 LUAD 预后的有效方法。这对于指导早期 LUAD 的治疗决策具有重要的临床意义。© 2024 美国医学物理学家协会。
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DIABETES & METABOLISM
2024 May 23
LiminXiao,BowenWu,Ha...
Endoscopic Endonasal Internal Carotid Artery Transposition Technique in Tumor With Parasellar Extension: A Single-Center Experience.
DIABETES & METABOLISM
在中线入路期间需要侧化或动员颈内动脉 (ICA),以暴露 ICA 后面或侧面的病变。然而,目前还没有关于内窥镜鼻内颈内动脉转位技术(EEITT)手术结果的公开数据。本研究旨在分析 ICA 周围的相关手术解剖结构,并提出 EEITT 分级方案。对在单一机构接受 EEITT 的患者进行回顾性评价。基于限制ICA的结构和术中发现,提出了EEITT的解剖学手术分级方案。纳入42例患者(平均年龄45.6岁,57.1%女性患者)。其中,Knosp 4级垂体腺瘤29例(69.0%),脊索瘤6例(14.3%),脑膜瘤6例(14.3%),脑膜IgG4相关疾病1例(2.4%)。 EEITT分为1级、2级和3级,分别有24例(57.1%)、12例(28.6%)和6例(14.3%)使用。最常见的症状是视力障碍(45.2%)。 1级(79.2%)和2级(83.3%)的毛全切除率远高于3级(66.6%)。视功能改善、术前颅神经(CN)麻痹改善和术后激素缓解的总体率分别为89.4%、85.7%和88.9%。以下疾病的发生率为脑脊液漏,2.4%;永久性尿崩症,4.8%;新发短暂性 CN 麻痹,9.5%;永久性 CN 麻痹,4.7%;全垂体功能减退症,7.1%; ICA损伤2.4%。EEITT在技术上是可行的,可以根据限制结构断开的程度进行分级。对于具有鞍旁扩展的复杂肿瘤,区分 1、2 和 3 级将有利于临床医生预测风险、避免并发症和制定量身定制的个体化手术策略。版权所有 © 神经外科医生大会 2024。保留所有权利。
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JCI Insight
2024 May 23
SophiaMRoush,JennyCo...
HIV infection and ART exposure impact tumor T-cell receptor repertoire of diffuse large B-cell lymphoma.
JCI Insight
弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 是全球最常见的淋巴瘤亚型,是 HIV 感染者 (HIV) 癌症死亡的主要原因。 HIV 感染和抗逆转录病毒治疗 (ART) 导致的 T 细胞区室重组可能对现代治疗选择产生影响,但目前对这些动态相互作用的理解有限。在这里,我们通过对一组 HIV 阴性 (HIV-)、经历过 HIV/ART 和从未接受过 HIV/ART 的 DLBCL 患者的 T 细胞受体 (TCR) 库进行测序,研究了 T 细胞对 DLBCL 的反应。与经历过 HIV 和 HIV/ART 的肿瘤 TCR 库相比,未经历过 HIV/ART 的肿瘤 TCR 库更具克隆性且彼此之间更加不同。此外,肿瘤和血液 TCR 库之间重叠的增加与生存率和 HIV/ART 状态的改善相关。我们的研究首次描述了非洲 DLBCL 队列中的 TCR 谱特征,并证明了 HIV 感染和 ART 暴露对 DLBCL TCR 谱的贡献。
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JCI Insight
2024 May 23
DykePMcEwen,Paramita...
ISG15-GRAIL1-CD3 axis influences survival of esophageal adenocarcinoma patients.
JCI Insight
免疫抑制是食管腺癌 (EAC) 的一个常见特征,并与较差的总生存期 (OS) 相关。我们假设上游因素可能会对 CD3 水平和 T 细胞活性产生负面影响,从而促进免疫抑制和更差的生存。我们使用了从 Barrett's (BE) 发展为不典型增生再到 EAC 患者的临床数据和患者样本,研究了基因 (RNAseq)、蛋白质(组织微阵列)表达并进行了细胞生物学研究,以描绘可能影响 EAC 的影响 CD3 蛋白质稳定性的途径结果。我们发现 CD3-ε 表达和 CD3 T 细胞数量的丧失与 EAC 中较差的 OS 相关。 GRAIL(与淋巴细胞无反应性相关的基因)异构体 1 (GRAIL1) 是 EAC 中的主要异构体,可降解 (ε、γ、δ) CD3 并使 T 细胞失活。相比之下,EAC 中减少的亚型 2 (GRAIL2) 可以稳定 CD3。此外,干扰素刺激基因 15 (ISG15)(一种泛素样蛋白)可促进 GRAIL1 介导的 CD3 降解。因此,连接酶死亡的 GRAIL1 的过表达、ISG15 敲低或缀合缺陷的 ISG15-LRAA 突变体的过表达都可以增加 CD3 水平。我们共同发现,ISG15→GRAIL1→突变的 p53 放大环路会对 CD3 水平和 T 细胞活性产生负面影响,从而促进 EAC 中的免疫抑制。
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