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GENES & DEVELOPMENT
2024 May 22

MiladRazavi-Mohseni,...
Machine learning identifies activation of RUNX/AP-1 as drivers of mesenchymal and fibrotic regulatory programs in gastric cancer.
GENES & DEVELOPMENT
胃癌(GC)是全球第五大常见癌症,是一种异质性疾病。在 GC 亚型中,间质表型(Mes 样)比上皮表型(Epi 样)更具侵袭性。虽然上皮-间质转化 (EMT) 的基因表达已被研究,但塑造这一过程的调控景观尚未完全了解。在这里,我们使用来自胃癌细胞系和原发性肿瘤纲要的 ATAC-seq 和 RNA-seq 来检测调节状态变化的驱动因素及其转录反应。使用 ATAC-seq,我们开发了一种机器学习方法来确定调节 GC 亚型的转录因子 (TF)。我们确定了胃癌中驱动间充质(RUNX2、ZEB1、SNAI2、AP-1 二聚体)以及上皮状态(GATA4、GATA6、KLF5、HNF4A、FOXA2、GRHL2)的 TF。我们确定了与这些 TF 失调相关的 DNA 拷贝数改变,特别是 GATA4 的删除和 MAPK9 的扩增。与批量和单细胞 RNA-seq 数据集的比较确定了 Mes 样 GC 中成纤维细胞样表观基因组和表达特征的激活。这种间充质纤维化程序的激活与上调间充质基因侧翼的可差异性 DNA 顺式调节元件有关。这些发现建立了 GC 中 TF 活性的图谱,并强调了拷贝数驱动的改变在塑造表观基因组调控程序中的作用,作为胃癌异质性和进展的潜在驱动因素。由冷泉港实验室出版社出版。
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GASTROINTESTINAL ENDOSCOPY
2024 May 20

MarieMuller,EtienneB...
Deciphering the clinical spectrum of gastric disease in patients with Juvenile Polyposis Syndrome.
GASTROINTESTINAL ENDOSCOPY
幼年性息肉病综合征 (JPS) 是一种罕见的遗传性常染色体显性癌症易感综合征,由位于 SMAD4 或 BMPR1A 基因的种系致病变异 (PV) 引起。由于胃病变的演变,准确的临床和内镜表现仍不清楚。前瞻性地对 2007 年至 2020 年法国罕见消化性息肉病网络 (RENAPOL) 数据库中包含的 SMAD4 或 BMPR1A PV 患者的临床、内镜、遗传、病理数据进行了前瞻性研究收集这些数据是为了解决有关胃受累的不确定性。纳入了 36 名患者:25 名 (69.5%) 具有 SMAD4 PV,11 名具有 BMPR1A PV。对于 SMAD4 PV 携带者,纳入时的中位年龄为 43.0 岁 [范围 10-78]。在基线食管胃十二指肠镜检查 (EGD) 中,22/25 (88%) 表现出至少一处幼年性胃息肉,5/25 (20%) 有炎症性胃炎的宏观体征。早期胃病多位于贲门下方,随后进展至胃窦和胃体。在平均 55.0 个月的随访期间,12/25 的患者出现胃部疾病进展(即新发幼年息肉 (91.6%)、胃弥漫性受累 (41.6%)、炎症平坦进展 (25%))。在 62 份活检中,2 名患者的 5 份(7.5%)样本中观察到低度不典型增生。 9 名携带者 (36%) 由于弥漫性胃受累或临床症状恶化而接受了胃切除术(平均年龄 47.2 岁)。在一份胃切除标本中发现胃腺癌(T1)。在 11 名 BMPR1A PV 患者中,2 名在基线 EGD 时患有胃错构瘤,没有不典型增生或症状。JPS 中的胃受累似乎在一生中呈进展性,起始于贲门区,主要涉及 SMAD4 PV 携带者。版权所有 © 2024 American胃肠内窥镜学会。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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EUROPEAN RADIOLOGY
2024 May 22

Ting-WeiWang,Jia-She...
Standalone deep learning versus experts for diagnosis lung cancer on chest computed tomography: a systematic review.
EUROPEAN RADIOLOGY
旨在比较独立深度学习 (DL) 算法和人类专家在胸部计算机断层扫描 (CT) 扫描肺癌检测中的诊断性能。本研究检索了 PubMed、Embase 和 Web of Science 从成立到 2023 年 11 月期间的研究。我们关注成年肺癌患者,比较了 DL 算法和放射专家在 CT 扫描疾病诊断中的功效。使用 QUADAS-2、QUADAS-C 和 CLAIM 进行质量评估。对任务(恶性肿瘤分类与侵袭性分类)、成像方式(CT 与低剂量 CT [LDCT] 与高分辨率 CT)、研究区域、使用的软件和出版年份进行双变量随机效应和亚组分析。我们包括20 项关于 CT 扫描肺癌诊断各个方面的研究。从数量上来说,与人类专家相比(敏感性 81%,特异性 69%),深度学习算法表现出卓越的敏感性 (82%) 和特异性 (75%)。然而,特异性差异具有统计学显着性,而敏感性差异则不具有统计学显着性。深度学习算法的性能因不同的成像模式和任务而异,这表明需要对深度学习算法进行定制优化。值得注意的是,DL 算法在标准 CT 的敏感性方面与专家相匹配,在特异性方面超过专家,但在 LDCT 扫描上显示出较高的敏感性和较低的特异性。DL 算法在 CT 扫描的恶性肿瘤和侵袭性分类方面表现出比人类读者更高的准确性。然而,它们的性能因成像方式而异,这突显了继续研究以全面评估 DL 算法对肺癌的诊断有效性的重要性。DL 算法有潜力改进 CT 上的肺癌诊断,匹配人类的敏感性并超越人类的特异性。这些发现要求进一步优化跨成像模式的深度学习,旨在推进临床诊断和患者治疗结果。通过 CT 进行肺癌诊断具有挑战性,可以通过人工智能集成来改进。 DL 在 CT 上检测肺癌的准确性比人类专家更高。提高 DL 准确性可能会改善肺癌诊断和结果。© 2024。作者。
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ENDOCRINE-RELATED CANCER
2024 May 01

GiuliaVocinoTrucco,M...
Changes in categorization or nomenclature within Neuroendocrine Tumours.
ENDOCRINE-RELATED CANCER
WHO 神经内分泌肿瘤分类的第五版旨在实现统一的术语并定义不同解剖位置的类似诊断方案。与第四版不同的是,引入了一章讨论非神经内分泌器官中的神经内分泌肿瘤,提出了一种二元分类系统,用于区分高分化肿瘤(称为神经内分泌肿瘤(NET))和低分化肿瘤(称为神经内分泌癌(NEC)) )。 NET 的分级系统基于有丝分裂指数和/或 Ki-67 指数和/或坏死,具体取决于不同的位置。如果已经在消化系统中得到很好的应用,这种方法将修改和统一泌尿道、女性生殖器官和男性生殖系统神经内分泌肿瘤的分类。在肺和胸腺中,类癌/NET 双重术语已在世界卫生组织胸部肿瘤分类第五版中引入,并得到认可。这种方法无疑有助于多学科方法对受这些肿瘤影响的患者进行诊断和临床管理,而不会失去影响不同解剖部位肿瘤的临床和生物学行为的部位特异性特征。世卫组织新计划的其他主要进展是流行病学数据的同质化以及未来前瞻性研究数据的正确整合,这些研究旨在定义分子谱并确定肿瘤类型特异性和患者特异性治疗方法。
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Disease Models & Mechanisms
2024 May 20

NicholasGravbrot,Cal...
Gross tumor and intracranial control benefits with fractionated radiotherapy compared to stereotactic radiosurgery for patients with WHO grade 2 meningioma.
Disease Models & Mechanisms
手术切除是 WHO 2 级脑膜瘤的主要治疗方法。尽管许多中心利用立体定向放射外科 (SRS) 治疗复发或进展,但术后经常采用分段放射治疗 (RT)。在此,我们报告了辅助分次放疗与挽救性 SRS 的机构队列的疾病控制结果。我们从机构数据库中确定了 32 名接受 SRS 或分次放疗治疗的 WHO 2 级脑膜瘤和残留/复发肿瘤患者。患者于 2007 年至 2021 年间接受治疗,并进行了至少 1 年的随访。 Kaplan-Meier 估计器用于确定大体肿瘤控制 (GTC) 和颅内控制 (IC)。使用生物有效剂量 (BED) 作为连续参数的单变量 Cox 比例风险模型来评估剂量反应。中位随访时间为 5.5 年,13 名患者 (41%) 接受了针对复发或进展结节的 SRS 治疗,2 (6%) 对复发或进行性结节进行分割放射,17 例 (53%) 在次全切除后进行辅助分割放射。与 SRS 相比,分次放疗的 5 年 GTC 更高(82% vs. 38%,p=0.03)。与 SRS 相比,分段放疗的 5 年 IC 也更好(82% vs. 11%,p<0.001)。在单变量分析中,增加 BED10 与更好的 GTC 显着相关 (p=0.039);增加 BED3 则不然 (p=0.82)。在该患者队列中,与挽救性 SRS 相比,接受辅助分次放疗的患者的 GTC 和 IC 显着更高。增加 BED10 与更好的 GTC 相关。对于 2 级脑膜瘤,分段放疗可能比立体放射外科提供更好的治疗率。由爱思唯尔公司出版。
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Disease Models & Mechanisms
2024

RanjanaPBird
Vitamin D and cancer.
Disease Models & Mechanisms
过去几十年来,维生素 D 在预防包括癌症在内的慢性疾病方面的作用受到了广泛关注。术语“癌症”代表具有不同生物复杂性的多种疾病状态。维生素 D 与癌症之间最密切的联系是通过临床前模型中的生态研究和观察研究得出的。显然,维生素 D 以组织特异性方式发挥多种生物反应。此外,多种人为因素可能影响维生素 D 的生物活性。维生素 D 引发的抗癌作用的机制多种多样,包括多系统水平的变化。致癌环境很容易破坏维生素 D 的传统作用,或者可以确保对维生素 D 介导的反应产生抵抗力。几位研究人员发现,我们对维生素 D 在癌症中的作用的了解存在空白。进一步确定了维生素 D 在癌症控制策略中的作用。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Mar

BhargavKansara,Ameer...
Suicide Risk Screening for Head and Neck Cancer Patients: An Implementation Study.
DIABETES & METABOLISM
针对头颈癌 (HNC) 患者(自杀风险较高的人群)的自杀风险筛查 (SRS) 的研究有限。为了弥补这一差距,这项单中心混合方法研究评估了肿瘤学专业人士对电子 SRS 计划的可行性、可接受性和适当性的看法,该计划作为 HNC 患者常规护理的一部分而实施。协助实施 SRS 的工作人员已完成(例如护士、医疗助理、高级实践提供者、医生、社会工作者)一次性调查 (N = 29) 和访谈 (N = 25)。使用先前验证的可行性、可接受性和适当性措施来评估定量结果。收集了额外的定性数据,为解释分数提供背景。 直接负责实施 SRS 的护士和医疗助理表示,与其他团队成员(例如医生、社会工作者、高级实践提供者)相比,其可行性、可接受性和适当性较低。团队成员确定了优化 SRS 所需的潜在改进措施,例如雇用更多员工、改进员工培训、为残疾人士完成筛查提供不同的方式,以及修改患者报告的结果以改善自杀风险预测。 对于将 SRS 作为 HNC 患者常规癌症护理的一部分实施,工作人员的看法存在很大差异。在对 HNC 和其他癌症患者进行更大规模的筛查之前,可能需要额外的实施策略来优化工作流程并减轻员工负担,例如员工培训、多种完成方式以及用于识别哪些患者最大程度的改进工具自杀的风险。蒂姆。版权所有。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Jun

KeiichiFujiya,Takash...
Postoperative sarcopenia increases both gastric cancer and other-cause mortality in older adults undergoing radical gastrectomy for cancer.
DIABETES & METABOLISM
胃癌术前肌少症与术后并发症增加和长期生存率降低相关。然而,术后肌肉减少症与长期结果之间的关系仍不清楚。因此,本研究旨在阐明胃癌胃切除术后肌肉减少症与生存结果之间的关系。这项回顾性研究纳入了2008-2018年期间因临床I-III期原发性胃癌接受根治性胃切除术的1512名年龄≥65岁的患者。术前通过测量手臂肌肉面积和握力来评估肌少症,并在术后 1 个月重复测量。我们比较了术后正常组和肌少症组的临床特征、手术治疗和长期结果。术前和术后分别观察到 173 名和 305 名患者出现肌少症。增加术后肌少症风险的因素包括年龄≥75岁、术前体重指数较低、糖尿病和临床II/III期胃癌。术后出现肌少症的患者总体生存率显着较低(风险比 [HR] 2.596,p < 0.001)。此外,术前肌少症患者(HR 2.813,p = 0.002)和术前未患肌少症患者(HR 1.925,p < 0.001)术后肌少症与总生存率降低相关。累积发病率显示,术后肌少症组因胃癌(HR 1.928,p < 0.001)和其他原因(HR 2.736,p < 0.001)导致的死亡率显着较高。胃癌术后肌少症与死亡风险增加有关由于癌症和其他原因,强调围手术期肌少症管理策略的重要性。版权所有 © 2024 欧洲临床营养和代谢学会。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 May 20

AnneRix,HelenHeinric...
Ultrasound-induced immune responses in tumors: A systematic review and meta-analysis.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
超声波广泛应用于癌症的诊断和治疗。肿瘤可以通过热或机械组织消融来治疗。此外,可以通过热疗、声动力疗法和声孔作用来操纵肿瘤,例如通过增加肿瘤灌注或生物屏障的渗透性来增强药物递送。这些治疗在肿瘤中诱导各种免疫反应。然而,实验设置之间的相互矛盾的数据和高度异质性使得很难概括超声对肿瘤免疫的影响。因此,我们进行了系统评价来回答这个问题:“与没有超声的对照条件相比,超声是否会改变人类和动物外周实体瘤的免疫反应?”在 PubMed、EMBASE 和 Web of Science 中进行了系统的文献检索,并确定了 24,401 篇可能相关的出版物。其中,96 篇出版物有资格纳入系统评价。实验在人类、大鼠和小鼠中进行,重点针对不同的肿瘤类型,主要是乳腺癌和黑色素瘤。我们收集了有关热超声和非热超声设置、声波增敏剂或声波增强器的使用以及抗肿瘤治疗的数据。进行了六项荟萃分析,以量化超声对 T 细胞(细胞毒性 T 细胞、辅助 T 细胞和调节性 T 细胞)肿瘤浸润以及血液细胞因子(白细胞介素 6、干扰素 γ、肿瘤坏死因子 α)的影响。我们提供了强有力的科学证据,证明超声波可以改变 T 细胞浸润到肿瘤中并增加血液细胞因子浓度。此外,我们还根据肿瘤类型、超声设置和小鼠年龄确定了免疫细胞浸润的显着差异。使用热疗与声敏剂相结合并在年轻小鼠中观察到更强的效果。由于大多数癌症患者年龄较大,后者可能会损害研究结果的转化影响。因此,我们的结果可能有助于完善超声参数,以增强治疗用途的抗肿瘤免疫反应,并最大限度地减少诊断应用中的免疫效应。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Jun

AmáliaABastos,PaulaV...
Evaluating the influence of ultra-processed food intake on associations between dietary indices with systemic inflammation in adulthood and old ages.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
低度全身炎症(LGSI)对于许多慢性疾病的发生至关重要。反过来,研究表明饮食可以有利或不利地调节炎症状态。因此,通过适当的方法评估饮食至关重要;为此,对于饮食指数有不同的建议。我们的目的是:(i) 研究三个众所周知的饮食指数与 LGSI 生物标志物之间的关联; (ii) 单独或结合超加工食品 (UFP) 摄入量指标来测试这些关联。 (iii) 作为另一个目标,假设所有指数都应该能够识别饮食的炎症潜力,我们测试了这些指数一致且相互关联的假设。基于成年人和老年人的横截面人口数据(n = 583)。通过两次非连续24小时饮食回忆(24HDR)获得饮食数据,并计算饮食炎症指数(DII)、地中海式饮食模式评分(MSDPS);巴西健康饮食指数 - 修订版 (BHEI-R) 和从 UPF 摄入的能量(UPF 比率)。 LGSI 评分是根据一些血浆炎症生物标志物 [C 反应蛋白 (CRP)、肿瘤坏死因子-α (TNF-α) 和脂联素] 创建的。 Logistic 和线性回归模型测试了饮食指数与 LGSI 评分之间的关联。MSDPS 和 DII 与我们的炎症评分显着相关,但 BHEI-R 则不然。将 UPF 纳入回归模型并没有增加这些关联的强度。从这三个评分中,饮食炎症指数和地中海式饮食模式评分 (MSDPS) 与炎症生物标志物显示出显着相关性。这些指标与 UPF 摄入比例的组合并没有增加我们分析的意义。指标之间的最佳一致性为MSDPS和UPFs比率;唯一被认为一致且相关的一对指数是 BHEI-R 和 DII。版权所有 © 2024 欧洲临床营养和代谢学会。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。
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