肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

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膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

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急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

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子宫内膜样癌

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眼部黑色素瘤

CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS

AgungAryWibowo,Natha...

The efficacy of omega-3 fatty acids (O3FAs) as a complementary in colorectal cancer patients: A systematic review and meta-analysis.

CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS

结直肠癌（CRC）是发达国家第三大常见恶性肿瘤。因此，omega-3 脂肪酸 (O3FA) 因其调节炎症反应和改善营养水平的能力而被建议作为有益的补充治疗。本研究旨在评估 O3FA 作为炎症、营养水平、营养水平的补充治疗的效果。术后感染并发症，以及促进结直肠癌患者的康复。通过三个数据库进行文献检索。通过测量促炎细胞因子（IL-1β、IL-6 和 TNF-α）和 CRP 水平、用于营养评估的血清白蛋白水平、术后感染并发症以及用于恢复评估的住院时间来评估感兴趣的结果。分别使用RoB 2.0和RevMan 5.4进行质量评价和荟萃分析。结果显示O3FAs显着降低IL-6、CRP和TNF-α，但不影响IL-1β。此外，血清白蛋白水平略有增加，补充导致术后感染并发症减少并缩短住院时间。O3FA作为补充治疗为结直肠癌患者提供了优势，还应进行进一步的临床试验和实验来强调其影响以及 O3FA 在 CRC 患者营养状况中的临床实施。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。

Stem Cell Research & Therapy

ZhengShi,CuilanHu,Xi...

Feedback loop between hypoxia and energy metabolic reprogramming aggravates the radioresistance of cancer cells.

Stem Cell Research & Therapy

放射治疗是癌症治疗的主流方法之一，但由于肿瘤细胞的放射抗性，临床效果有限。缺氧和代谢重编程是肿瘤发生和进展的标志，并且与放射抗性密切相关。在肿瘤内部，血管生成的速度落后于细胞增殖的速度，某些位点的血管发育不全、功能异常，导致癌细胞缺氧，即缺氧。这可以防止辐射有效消除缺氧的癌细胞。癌细胞转而使用糖酵解作为主要能量来源，这种现象被称为瓦尔堡效应，以维持其快速增殖率。因此，参与代谢重编程和缺氧诱导的放射抗性的途径是癌症治疗的有希望的干预目标。在这篇综述中，我们详细讨论了缺氧和代谢重编程导致的放射抗性的机制和途径，包括DNA修复、癌症干细胞的作用、氧化应激缓解、自噬调节、血管生成和免疫逃逸。此外，我们提出能量代谢重编程和缺氧之间存在反馈回路，这与肿瘤放射抗性的发展和加剧有关。同时阻断该反馈环路和其他肿瘤特异性靶点可能是克服癌细胞放射抗性的有效方法。这一全面的概述为肿瘤放射敏感性和进展的机制提供了新的见解。© 2024。作者。

Stem Cell Research & Therapy

TumasBeinortas,Brian...

Integrated functional genomic screening to bypass TKI resistance in chronic myeloid leukemia.

Stem Cell Research & Therapy

CML 很容易用酪氨酸激酶抑制剂 (TKI) 治疗；然而，出现了耐药性，只有约 15%-20% 的患者可以治愈该疾病。 Adnan Awad 等人利用整合的功能基因组学，鉴定出有效对抗 CML 干细胞的药物，并描述了 TKI 耐药性的潜在机制。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。

Stem Cell Research & Therapy

TeresaKrammer,Hannah...

Mouse neural tube organoids self-organize floorplate through BMP-mediated cluster competition.

Stem Cell Research & Therapy

在神经管 (NT) 发育过程中，脊索诱导组织者底板分泌 Sonic Hedgehog (SHH) 来形成神经祖细胞。相反，来自胚胎干细胞（ESC）的NT类器官（NTO）在没有脊索的情况下自发形成底板，这表明干细胞可以在没有胚胎诱导剂的情况下进行自组织。在这里，我们研究了克隆小鼠 NTO 的底板自组织。底板标记物 FOXA2 的表达最初在空间上分散，然后分解成多个簇，这些簇经过竞争和排序，产生稳定的“获胜”底板。我们发现 BMP 信号控制着远程簇竞争。 FOXA2簇表达BMP4，抑制接收细胞中的FOXA2，同时表达BMP抑制剂NOGGIN，促进簇的持久性。 Noggin 突变扰乱了 NTO 和 NT 体内中脑/后脑区域底板的形成，这表明底板如何在没有脊索的情况下自主形成。确定组织者自组织的调控途径对于在组织工程中利用干细胞的发育可塑性至关重要。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。

Stem Cell Research & Therapy

FelixBarajasOrdonez,...

Low subcutaneous adipose tissue and myosteatosis are prognostic factors after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation.

Stem Cell Research & Therapy

异基因造血干细胞移植（allo-HSCT）是多种血液肿瘤的唯一治疗选择。本研究旨在评估身体成分参数作为白血病、骨髓增生异常综合征 (MDS) 和骨髓增生性肿瘤 (MPN) 患者移植后总生存 (OS) 和不良事件的预测因素。这是一项对 122 名成人进行的回顾性研究接受第一次同种异体造血干细胞移植的患者。基于 CT 的半自动测量皮下脂肪组织 (SAT)、内脏脂肪组织 (VAT)、内脏与皮下脂肪比率 (VSR)、骨骼肌指数 (SMI) 方面的肌肉减少症和基于进行了骨骼肌辐射衰减（SM-RA）。使用 Cox 回归分析评估身体成分参数与 OS 的关联。在单变量分析中，低 SAT 和肌脂肪变性与较低的 OS 相关（风险比 [HR] 2.02，95% 置信区间 [CI] 1.16-3.51，p = 0.01) 和 (HR 2.50, 95% CI 1.48-4.25, p =< 0.001)。调整相关协变量后，这种相关性仍然显着，HR 2.32，95% CI 1.23-4.38，p = 0.01；HR 2.86，95% CI 1.51-5.43，p =< 0.001。相反，VAT、VSR、少肌症和少肌症肥胖在 OS 中没有统计学意义。严重的移植后不良事件在低 SAT 组中更为常见（优势比 [OR] 3.12，95% CI 1.32-7.40，p = 0.01），OR 3.17，95% CI 1.31-7.70，p =< 0.01年龄和性别调整分析。低 SAT 和肌脂肪变性可能会增加移植后死亡率的风险，而低 SAT 似乎会增加严重移植后不良事件的风险。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

MariyaLysenkovaWikla...

A multiomic characterization of the leukemia cell line REH using short- and long-read sequencing.

MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS

已知 B 细胞急性淋巴细胞白血病 (ALL) 细胞系 REH 具有 t(12;21) ETV6::RUNX1 易位，具有由一系列大规模染色体重排定义的复杂核型。该细胞系取自一名复发的 15 岁儿童，为儿科 B-ALL 的研究提供了实用模型。近年来，短读长和长读长 DNA 和 RNA 测序已成为解决肿瘤学结构变异中核型分析技术的补充。在这里，我们探索长读长 PacBio 和 Oxford Nanopore 全基因组测序、IsoSeq RNA 测序和短读长 Illumina 测序的整合，以创建 REH 细胞系的详细基因组和转录组表征。全基因组测序阐明了被破坏的 ALL 相关基因的分子特征，包括 CDKN2A、PAX5、BTG1、VPREB1 和 TBL1XR1，以及糖皮质激素受体 NR3C1。同时，转录组测序鉴定了基因组断点内的 7 个融合基因。我们广泛的全基因组研究共同为白血病基因组学界提供了高质量的开源数据。© 2024 Lysenkova Wiklander 等人。

Epigenetics & Chromatin

JueWang,YunfangYu,Yu...

Artificial intelligence enables precision diagnosis of cervical cytology grades and cervical cancer.

Epigenetics & Chromatin

宫颈癌是一个重大的全球健康问题，其患病率和预后凸显了早期筛查对于有效预防的重要性。本研究旨在创建并验证用于对宫颈细胞学进行分级的人工智能宫颈癌筛查（AICCS）系统。 AICCS 系统使用各种数据集进行训练和验证，包括回顾性、前瞻性和随机观察试验数据，总共涉及 16,056 名参与者。它利用两种人工智能 (AI) 模型：一种用于检测斑块级别的细胞，另一种用于对全玻片图像 (WSI) 进行分类。 AICCS 在预测不同数据集的细胞学等级方面始终表现出较高的准确性。在前瞻性评估中，其曲线下面积（AUC）为0.947，敏感性为0.946，特异性为0.890，准确性为0.892。值得注意的是，随机观察试验显示，AICCS 辅助的细胞病理学家的 AUC、特异性和准确性显着高于单独的细胞病理学家，敏感性显着提高了 13.3%。因此，AICCS 有望成为准确、高效的宫颈癌筛查的附加工具。© 2024。作者。

Epigenetics & Chromatin

WillemVanDerByl,Simo...

The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects.

Epigenetics & Chromatin

外周 CD8 T 细胞耐受性是自身免疫性疾病和抗癌免疫的一个检查点。尽管耐受诱导状态很重要，但其与其他 CD8 T 细胞分化状态之间的关系仍不清楚。使用流式细胞术表型分析、单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 和染色质可及性分析，我们证明体内外周对自身抗原的耐受性触发了一种与衰竭、记忆和功能性效应细胞不同的根本不同的分化状态，但类似于针对肿瘤缺陷的细胞。耐受细胞早期并逐渐从效应细胞中分化出来，在遇到抗原后 60 小时内采取转录和表观遗传上不同的状态。突破耐受性需要强 T 细胞受体 (TCR) 信号传导和炎症的协同作用，从而协同诱导增强蛋白质翻译的基因模块。由于效应基因表达与蛋白质翻译脱钩，旁观者感染过程中 TCR 信号微弱未能突破耐受性。因此，耐受性涉及由蛋白质翻译缺陷强制执行的独特分化轨迹。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。

Epigenetics & Chromatin

Peng-ChengYu,DanHou,...

SMARCA5 reprograms AKR1B1-mediated fructose metabolism to control leukemogenesis.

Epigenetics & Chromatin

染色质可及性的显着变化是白血病的表观遗传特征。然而，白血病这种变异的原因仍然难以捉摸。在这里，我们确定 SMARCA5（模仿开关（ISWI）染色质重塑复合物的核心 ATP 酶）是导致白血病细胞中染色质可及性异常的原因。我们发现 SMARCA5 是维持白血病发生的异常染色质可及性所必需的，然后通过招募转录共激活剂 DDX5 和转录因子 SP1 来促进 AKR1B1（一种醛/酮还原酶）的转录激活。较高水平的 AKR1B1 与白血病患者的不良预后相关，并通过重编程果糖代谢促进白血病的发生。此外，AKR1B1的药理抑制已被证明对白血病小鼠和白血病患者细胞具有显着的治疗效果。因此，我们的研究结果将 SMARCA5 介导的异常染色质状态与 AKR1B1 介导的内源果糖代谢重编程联系起来，并阐明了 AKR1B1 在白血病发生中的重要作用，这可能为白血病提供治疗策略。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。

Epigenetics & Chromatin

NadaAmer,DinaHesham,...

LC3A-mediated autophagy elicits PERK-eIF2α-ATF4 axis activation and mitochondrial dysfunction: Exposing vulnerability in aggresome positive cancer cells.

Epigenetics & Chromatin

未折叠蛋白反应途径 (UPR)、自噬以及将错误折叠蛋白分隔成包涵体是蛋白质质量控制网络的关键组成部分。在包涵体中，攻击体特别令人感兴趣，因为它们与细胞存活、耐药性和癌症侵袭行为有关。聚集体是塌陷的波形蛋白笼包围错误折叠的蛋白质，然后通过自噬最终去除时形成的分子凝聚物。然而，在癌细胞中控制攻击体形成和消除的机制中仍然存在显着的差距。了解这些机制至关重要，特别是考虑到 MAP1LC3 家族成员 LC3A 的参与，LC3A 在自噬调节中发挥着独特的作用，据报道在许多癌症中表观遗传沉默。在此，我们利用四环素诱导的 LC3A 表达来研究其在脉络丛癌细胞中的作用，脉络丛癌细胞本质上表现出聚集体的存在。采用活细胞成像来证明 LC3A 表达对聚集体阳性细胞的影响，同时基于 SILAC 的蛋白质组学鉴定了 LC3A 诱导的蛋白质和通路改变。我们的研究结果表明 LC3A 的延长表达与细胞衰老相关。然而，在这种情况下，溶酶体降解的阻碍对细胞活力具有有害影响。为了响应 LC3A 诱导的自噬，我们观察到线粒体形态发生显着改变，反映为线粒体功能障碍和 ROS 产生增加。此外，LC3A 表达引发了 UPR 的 PERK-eIF2α-ATF4 轴的激活，强调了蛋白质质量控制网络的显着变化。总之，我们的结果阐明了 LC3A 介导的自噬改变了蛋白质质量控制网络，暴露了攻击体阳性癌细胞的脆弱性。版权所有 © 2024 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。