肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

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肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS

ZhenWang,YanhuaFang,...

Reconstructing tumor clonal heterogeneity and evolutionary relationships based on tumor DNA sequencing data.

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS

肿瘤克隆的异质性驱动了不同肿瘤细胞群的选择和进化，导致复杂且动态的肿瘤进化过程。虽然肿瘤批量 DNA 测序有助于阐明肿瘤内异质性，但由于拷贝数变化和重建过程中的不确定性而导致的突变多重性错误识别等挑战阻碍了肿瘤进化的准确推断。在本研究中，我们引入了一种新方法，即重建肿瘤克隆异质性和进化关系（RETCHER），该方法通过准确识别突变多重性，同时考虑重建过程中的不确定性以及亚克隆聚类的可信度和合理性，来表征更真实的癌细胞组分。该方法全面、准确地推断了多种形式的肿瘤克隆异质性和系统发育关系。 RETCHER 在模拟数据上优于现有方法，并在五种肿瘤类型的真实多样本测序数据中推断出更清晰的亚克隆结构和进化关系。通过精确分析肿瘤内复杂的克隆异质性，RETCHER为肿瘤进化研究提供了新方法，并为制定精准、个性化的治疗策略提供了科学证据。该方法有望在肿瘤进化研究、临床诊断和治疗中发挥重要作用。 RETCHER 可在 https://github.com/zlsys3/RETCHER 上免费获取。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS

Mut-Map: Comprehensive Computational Pipeline for Structural Mapping and Analysis of Cancer-Associated Mutations.

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS

了解基因突变对蛋白质结构的功能影响对于推进癌症研究和开发靶向疗法至关重要。主要挑战在于准确地将这些突变映射到蛋白质结构并分析它们对蛋白质功能的影响。为了解决这个问题，Mut-Map (https://genemutation.org/) 是一个综合计算管道，旨在将癌症体细胞突变目录数据库中的突变数据与蛋白质数据库和 AlphaFold 模型中的蛋白质结构数据整合起来。该流程首先获取 UniProt ID，然后绘制相应的蛋白质数据库结构、对残基重新编号以及评估无序百分比。然后它会叠加突变数据，根据结构背景对突变进行分类，并使用 MolStar 等高级工具将它们可视化。这种方法可以详细分析突变如何通过影响 DNA 界面、配体结合位点和二聚体相互作用等关键区域来破坏蛋白质功能。为了验证该产品线，对 TP53 基因（一种在癌症中经常发生突变的关键肿瘤抑制基因）进行了案例研究。该分析强调了 DNA 结合界面上最常见的突变，从而深入了解它们在癌症进展中的潜在作用。 Mut-Map 为阐明癌症相关突变的结构影响提供了强大的资源，为更有针对性的治疗策略铺平了道路，并增进了我们对蛋白质结构与功能关系的理解。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS

YouruiHan,BolinChen,...

Cancerous time estimation for interpreting the evolution of lung adenocarcinoma.

BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS

肺腺癌的进化伴随着大量的基因突变和功能障碍，使其表型状态和进化方向高度复杂。为了解释肺腺癌的进化，已经开发了多种方法来阐明分子发病机制和功能进化过程。然而，这些方法大多数都受到癌症时间信息的缺乏以及异质特征的挑战的限制。为了解决这些问题，本研究提出了一种患者准电位景观方法来估计进化过程中表型状态出现的癌变时间。随后，根据癌变时间和突变情况，共鉴定出39条不同的致癌路径，反映了肺腺癌进化过程的分子发病机制。为了解释肺腺癌的进化模式，通过合并癌基因路径，获得了三种癌基因图作为共同的进化模式。此外，根据癌变时间将患者均匀地重新划分为早期、中期和晚期进化阶段，并建立了可行的框架来构建肺腺癌的功能进化网络。基于通路富集分析，从功能进化网络中总共识别出了六个重要的功能进化过程，这在理解肺腺癌的发展中发挥着关键作用。©作者2024。由牛津大学出版社出版。

BRITISH JOURNAL OF SPORTS MEDICINE

BehnazMahdaviani,Mar...

Barriers and enablers of adherence to high-intensity interval training among patients with cancer: a systematic review and meta-analysis.

BRITISH JOURNAL OF SPORTS MEDICINE

体力活动可以为癌症患者带来身体和心理上的益处，并降低发病率和死亡率，但坚持程度各不相同。高强度间歇训练 (HIIT) 既省时又可以提高依从性。我们的目标是确定癌症患者坚持 HIIT 的障碍和促进因素。系统回顾和荟萃分析。PubMed-MEDLINE、Scopus 和 Web of Science。干预研究包括诊断患有任何类型癌症且参加 HIIT 的患者在治疗的任何阶段有或没有联合干预，并报告了依从性的结果。筛选了 800 篇文章，纳入了 22 篇 (n=807)； 19 人被纳入荟萃分析 (n=755)。 HIIT 的加权坚持率为 88%（95% CI，81% 至 94%）。没有一项研究报告严重的不良事件。尽管女性身份和患有乳腺癌与较低的依从性相关（p<0.05），但年龄却并非如此（p=0.15）。与治疗前和治疗后阶段相比，治疗阶段的依从性显着降低，分别为 83%、94% 和 96%（p<0.001）。当无人监督并与其他干预措施相结合时，超过 60 分钟的疗程时间与依从性下降相关 (p<0.05)。癌症患者对 HIIT 计划的依从性各不相同，当干预措施受到监督、持续时间较短、包括以下内容时，依从性会得到改善：仅进行 HIIT，不与其他运动相结合，并在治疗前和治疗后阶段进行。可能需要提高特定亚群对 HIIT 依从性的策略，以确保为所有癌症患者提供获得与身体活动相关的益处的最佳机会。CRD42023430180.© 作者（或其雇主）2024 年。无商业用途重复使用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。

BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY

MeihuiziDing,RuiHan,...

Plumbagin, a novel TRPV2 inhibitor, ameliorates microglia activation and brain injury in a middle cerebral artery occlusion/reperfusion mouse model.

BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY

瞬时受体电位香草酸 2 (TRPV2) 是一种 Ca2 渗透性非选择性阳离子通道。尽管TRPV2在免疫反应、癌症进展和心脏发育中发挥重要作用，但TRPV2的药理学探针仍有待鉴定。我们的目的是发现 TRPV2 抑制剂并阐明其作用的分子机制。在表达鼠 TRPV2 的 HEK-293 细胞中进行基于荧光的 Ca2 测定，用于鉴定白花丹素作为一种新型 TRPV2 抑制剂。应用膜片钳、计算机对接和定点诱变来研究白花丹素相互作用的关键分子机制。 ELISA 和 qPCR 分别用于评估一氧化氮释放和炎症介质的 mRNA 水平。 si-RNA 干扰用于敲低 TRPV2 表达，并通过蛋白质印迹法进行验证。神经学和组织学分析用于检查小鼠大脑中动脉闭塞/再灌注 (MCAO/R) 后的脑损伤。Plumbagin 是一种有效的 TRPV2 负变构调节剂，IC50 值为 0.85μM，选择性是 TRPV1 的 14 倍以上。 TRPV3 和 TRPV4。白花丹素通过降低通道开放概率来抑制 TRPV2 活性，而不影响单一电导。此外，白花丹素与TRPV2跨膜螺旋S5和S6之间的孔螺旋和柔性环形成的细胞外袋结合。白花丹素可有效抑制 LPS 诱导的 BV-2 小胶质细胞炎症，并改善 MCAO/R 小鼠的脑损伤。白花丹素是研究 TRPV2 病理生理学的新型药理学探针。 TRPV2 是治疗神经炎症和缺血性中风的新型分子靶标。© 2024 英国药理学会。

BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY

NazaninPazhouheshFar...

Breaking the barriers: Overcoming cancer resistance by targeting the NLRP3 inflammasome.

BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY

炎症在各种癌症的发生和进展中起着关键作用，有助于转移、血管生成、细胞增殖和侵袭等关键过程。此外，肿瘤微环境（TME）内炎症介导的细胞因子的释放在协调这些事件中起着至关重要的作用。免疫细胞膜上模式识别受体的激活引发了 caspase-1 募集促进的炎性 caspase 的激活。这种激活导致促炎细胞因子（包括 IL-1β 和 IL-18）的产生，并参与具有重大意义的多种生物过程。 NOD 样受体蛋白 3 (NLRP3) 炎症小体在先天免疫中发挥着核心作用，并通过释放 IL-1β 和 IL-18 来调节炎症。此外，它与各种细胞区室相互作用。最近，NLRP3炎症小体激活的机制引起了人们的广泛关注。 NLRP3 炎性体激活的破坏与一系列炎症性疾病有关，包括糖尿病、肠炎、神经退行性疾病、肥胖和肿瘤。 NLRP3 对肿瘤发生的影响因不同癌症类型而异，观察到的作用也不同。例如，NLRP3 可以抑制与结肠炎相关的结直肠癌，而其活性可能会促进胃癌和皮肤癌。本综述对 NLRP3 炎症小体的结构、生物学特性和机制进行了全面的了解，特别关注 NLRP3 与肿瘤相关免疫反应和 TME 之间的关系。此外，该综述还探讨了通过 NLRP3 炎性体调节靶向癌症的潜在策略。这包括创新方法，包括基于 NLRP3 的纳米颗粒、基因靶向治疗和免疫检查点抑制剂。© 2024 英国药理学会。

BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY

JacobAKinsella,Marjo...

Pharmacology of PIEZO1 channels.

BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY

PIEZO1 是一种真核膜蛋白，可组装为三聚体，形成钙渗透性、非选择性阳离子通道，具有精湛的机械力感应能力，并将力传导到多种细胞类型中，包括血细胞、内皮细胞、上皮细胞、成纤维细胞干细胞和不同的系统，包括骨骼、淋巴管和肌肉。该通道具有广泛的作用，被认为是癌症和心血管、牙科、胃肠道、肝胆、感染、肌肉骨骼、神经系统、眼部、妊娠、肾脏、呼吸和泌尿系统疾病等疾病的新疗法的靶点。 PIEZO1 调节剂的识别还处于起步阶段，但已经出现了一些有用的实验工具来激活通道，并在较小程度上抑制通道。 Yoda 系列小分子激动剂的基本结构-活性关系众所周知，显示出多种物理化学和药理学特性的潜力。 Yoda1 的有趣作用包括刺激去除多余的脑脊液。尽管 PIEZO1 表达广泛，但仍建议进行选择性正向或负向调节，而不会产生无法忍受的副作用。在这里，我们对该药理学的进展进行了有针对性的、非系统的、叙述性的回顾，并讨论了该领域未来潜在的研究方向。© 2024 作者。约翰·威利出版的《英国药理学杂志》

BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY

AllisonBarraclough,S...

The value of semiquantitative PET features and end-of-therapy PET in grade 3B follicular lymphoma.

BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY

3B 级滤泡性淋巴瘤 (G3BFL) 是一种罕见的淋巴瘤，被认为位于低度 FL 和弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 之间的连续体。定量正电子发射断层扫描 (PET) 指标（例如总代谢肿瘤体积 (TMTV)、总病变糖酵解 (TLG) 和最大标准摄取值 (SUVmax)）在 FL 和 DLBCL 中的预后影响已在 FL 和 DLBCL 中进行了广泛分析，但 G3BFL 数据缺乏。在这里，我们描述了 46 例统一接受 R-CHOP（类似）化疗的 G3BFL 病例的 PET 结果和放射组学特征。使用 MIM 软件进行的中央半自动 PET TMTV、TLG 和 SUVmax 分析与临床结果相关，并与低级别 FL 和 DLBCL 的已发表结果进行比较。在 G3BFL 中，治疗结束时的完全代谢反应与改善的无进展生存期（PFS；p = 0.002）和总生存期（OS；p = 0.04）相关。 G3BFL 中位 TLG (1455) 和 SUVmax (16.50) 位于已公布的低级 FL 值（TLG：1112，SUVmax：11.3）和 DLBCL（TLG：3004，SUVmax：24.35）之间。 TMTV (>350cm3) 与生存率之间没有关联（PFS：p= 0.24；OS：p= 0.40）。高 SUVmax (>19.2) 和 TLG (>2760) 均导致较差的 PFS，但不影响 OS（PFS：SUVmax p = 0.004；TLG p = 0.05）。这些数据支持在基线和 G3BFL 治疗反应中常规纳入 PET 放射组学。© 2024 英国血液学会和 John Wiley

BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY

LeoraBoussi,JeetayuB...

Therapeutic strategies targeting aberrant RNA splicing in myeloid malignancies.

BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY

近年来，大规模测序工作已经确定了造血干细胞中的可靶向驱动突变。这些努力导致九种治疗复发或难治性急性髓性白血病（R/R AML）的新药得到开发和批准。然而，尽管靶向治疗不断扩大，但实现 AML 和高危骨髓增生异常综合征 (HR-MDS) 的持久缓解仍然是一项重大挑战，迫切需要新的有效治疗方法。异常 RNA 剪接的调节已成为骨髓疾病的一种新型治疗方法。异常剪接会导致基因表达失调，从而通过增加增殖和转移潜力、免疫逃避、减少细胞凋亡和化疗耐药来促进肿瘤发生。剪接体成分的突变已在多种癌症亚型中被发现，其中 RNA 结合蛋白 SF3B1、SRSF2、U2AF1 和 ZRSR2 的突变经常发生在 AML 和高达 60% 的 MDS 患者以及慢性粒单核细胞白血病和10%的患者患有慢性淋巴细胞白血病。在这篇综述中，我们探讨了针对异常剪接的治疗策略以及这些方法推动临床反应的潜力。© 2024 英国血液学会和 John Wiley

BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY

ValeriaBuccheri,Fred...

External validation and calibration of the HoLISTIC Consortium's advanced-stage Hodgkin lymphoma international prognostic index (A-HIPI) in the Brazilian Hodgkin lymphoma registry.

BRITISH JOURNAL OF HAEMATOLOGY

霍奇金淋巴瘤国际个人护理研究 (HoLISTIC) 联盟的 A-HIPI 模型于 2022 年针对晚期经典霍奇金淋巴瘤 (cHL) 开发，可预测新诊断患者的 5 年内生存率。这项研究验证了其在巴西霍奇金淋巴瘤登记中的表现。到 2022 年，巴西 HL 登记处纳入了 1357 名 cHL 患者，中位随访时间为 5 年。使用 A-HIPI 模型方程计算 5 年无进展生存期 (PFS) 和总生存期 (OS) 的概率。歧视（Harrell C 统计/Uno C 统计）和校准措施评估了外部验证和校准。超出允许范围的实验室值被排除，反映了最初的 A-HIPI 分析。共有 694 名晚期 cHL 患者符合最初的纳入标准（年龄 18-65 岁，IIB-IV 期）。中位年龄为 31 岁； 46.3%为女性。分期分布为IIB（33.1%）、III（27.4%）、IV（39.5%）。巨块病占32.6%。五年 PFS 和 OS 分别为 68.4% 和 86.0%。 Harrell C 统计量的 PFS 为 0.60，OS 为 0.69，Uno C 统计量的 PFS 为 0.63，OS 为 0.72。校准图显示了经过良好校准的预测，5 年 OS 和 PFS 的校准斜率分别为 0.91 和 1.03。尽管患者、临床特征和社会经济因素不同，但基线预测工具在巴西队列中表现良好，表现出充分的区分和校准。这支持了其在不同环境下的可靠性。© 2024 英国血液学会和 John Wiley