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Neurobiology of Stress
2024 Sep

ShaojieYang,JiaminHu...
DCC, a potential target for controlling fear memory extinction and hippocampal LTP in male mice receiving single prolonged stress.
Neurobiology of Stress
创伤后应激障碍(PTSD)是一种严重的压力依赖性精神障碍,其特征是恐惧记忆消退受损;然而,确定 PTSD 患者恐惧记忆消退受损的生物标志物仍不清楚。在由单一长期应激 (SPS) 引起的 PTSD 样行为的雄性小鼠中,与对照组相比,在海马体中发现了 19 种差异表达的蛋白质。其中,一种名为deleted的生物大分子蛋白在结直肠癌(DCC)中高度上调。海马区 DCC 的特异性过度表达会引起与 SPS 小鼠中观察到的类似的长时程增强 (LTP) 损伤和恐惧记忆消退。通过使用中和抗体抑制海马 DCC 功能,可以改善 SPS 小鼠的恐惧记忆消退损伤。机制研究表明,敲低或抑制海马神经元中的 μ-calpain 会增加 DCC 表达并诱导恐惧记忆消退受损。此外,SPS 引发的海马 LTP 损伤和恐惧记忆消退可以通过激活 Rac1-Pak1 信号通路来挽救。我们的研究提供了证据,表明钙蛋白酶介导的 DCC 调节可控制 SPS 小鼠的海马 LTP 和恐惧记忆消退,这可能是通过激活 Rac1-Pak1 信号通路实现的。© 2024 作者。
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Environmental Technology & Innovation
2024 Sep 03

ZhaoqianLiu,YuhanSun...
An Explainable Graph Neural Framework to Identify Cancer-Associated Intratumoral Microbial Communities.
Environmental Technology & Innovation
微生物广泛存在于各种癌症组织中,在癌发生和治疗反应中发挥着关键作用。然而,瘤内微生物与肿瘤之间的潜在关系仍然知之甚少。在此,提出了使用异质图转换器 (MICAH) 来识别肿瘤内癌症相关微生物群落的微生物癌症关联分析。 MICAH 将微生物之间的代谢和系统发育关系整合为异质图表示。它使用图形转换器来全面捕获肿瘤内微生物与癌症组织之间的关系,从而提高了已识别的微生物群落与癌症之间关联的可解释性。 MICAH 应用于 5 种癌症类型和 5 种真菌数据集的瘤内细菌数据,并证明了其普遍性和再现性。使用肿瘤-微生物-免疫相互作用的小鼠模型对代表性观察结果进行实验测试后,观察到与 MICAH 确定的关系一致的结果。来源追踪分析表明,已知的与癌症相关的微生物群落的主要贡献者是受癌症类型影响的器官。总体而言,该图神经网络框架将可用于后续实验验证的微生物数量从数千种细化至数十种,从而有助于加速对肿瘤与瘤内微生物组之间关系的理解。© 2024 作者。 《Advanced Science》由 Wiley‐VCH GmbH 出版。
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Frontiers in Immunology
2024

FuZhao,JunjieHong,Gu...
Elucidating the role of tumor-associated ALOX5+ mast cells with transformative function in cervical cancer progression via single-cell RNA sequencing.
Frontiers in Immunology
宫颈癌(CC)是全球女性第四大常见恶性肿瘤,也是发展中国家女性癌症相关死亡的主要原因。 CC 的早期症状通常不明显,通常在晚期才做出诊断,这导致临床预后不佳。近年来,大量研究表明肥大细胞(MCs)与肿瘤发生发展有着密切的关系。然而,当时对于MC在CC中所发挥的作用的研究还非常有限。因此,该研究对人CC细胞进行了单细胞多组学分析,旨在探讨MCs与CC肿瘤微环境相互作用的机制。目的是为CC的预防、诊断和治疗提供科学依据,以期改善患者的预后和生活质量。本研究通过ArrayExpress获取了10个CC肿瘤样本的单细胞RNA测序数据数据库。利用 Slingshot 和 AUCcell 来推断和评估 MC 亚群的分化轨迹和细胞可塑性。采用基因本体论、基因集富集分析和基因集变异分析对 CC 中的 MC 亚群进行差异表达分析。 CellChat 软件包用于预测 MC 亚群和 CC 细胞之间的细胞通讯。细胞功能实验验证了 TNFRSF12A 在 HeLa 和 Caski 细胞系中的功能。此外,还构建了风险评分模型来评估各种风险评分在临床特征、预后、免疫浸润、免疫检查点和功能丰富方面的差异。利用拷贝数变异推断计算拷贝数变异水平。获得的93,524个高质量细胞被分为十种细胞类型,包括T_NK细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞、上皮细胞、B细胞、浆细胞、MC 、中性粒细胞和骨髓细胞。此外,总共 1,392 个 MC 被细分为 7 个亚群:C0 CTSG MC、C1 CALR MC、C2 ALOX5 MC、C3 ANXA2 MC、C4 MGP MC、C5 IL32 MC 和 C6 ADGRL4 MC。值得注意的是,C2亚群与肿瘤相关MCs表现出密切的关联,Slingshot结果表明C2亚群处于分化的中晚期,可能代表CC良性向恶性转化的关键转变点。 CNVscore和批量分析结果进一步证实了C2亚群的转化状态。 CellChat 分析表明 TNFRSF12A 是参与 C2 ALOX5 MC 活动的关键受体。此外,体外实验表明下调TNFRSF12A基因可能部分抑制CC的发展。此外,基于C2亚群标志基因的预后模型和免疫浸润分析为患者预后和临床干预策略提供了有价值的指导。我们首先鉴定了CC内转化性肿瘤相关MCs亚群C2 ALOX5 MCs,该亚群处于CC的关键期。肿瘤分化阶段并影响 CC 的进展。体外实验证实敲除TNFRSF12A基因对CC的发展具有抑制作用。基于C2 ALOX5 MCs子集构建的预后模型表现出优异的预测价值。这些发现为 CC 的临床决策提供了新的视角。版权所有 © 2024 赵、洪、周、黄、林、张、梁和唐。
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Frontiers in Immunology
2024

BartBoersma,ViolaPud...
GSDMD is associated with survival in human breast cancer but does not impact anti-tumor immunity in a mouse breast cancer model.
Frontiers in Immunology
炎症在癌症发展中起着关键作用,慢性炎症促进肿瘤进展和治疗抵抗,而急性炎症反应有助于保护性抗肿瘤免疫。 Gasdermin D (GSDMD) 介导促炎细胞因子的释放,例如 IL-1β。虽然 IL-1β 的释放与多种癌症的进展直接相关,但 GSDMD 在癌症中的作用尚不清楚。在这项研究中,我们发现 GSDMD 表达在人类乳腺癌、肾癌、肝癌和前列腺癌中上调。较高的 GSDMD 表达与原发性乳腺浸润性癌 (BRCA) 的生存率增加相关,但与肝细胞癌 (LIHC) 的生存率无关。在 BRCA 中(但在 LIHC 中则不然),高 GSDMD 表达与骨髓细胞特征相关,从而改善预后。为了进一步研究 GSDMD 在抗癌免疫中的作用,我们在 GSDMD 缺陷小鼠中诱导乳腺癌和肝癌肿瘤。与我们的预期相反,除了肝癌肿瘤中 Cxcl10 上调外,GSDMD 缺陷对肿瘤生长、免疫细胞浸润或肿瘤微环境中的细胞因子表达没有影响。 TLR 配体在体外和体内的先天免疫激活会引发炎症反应,结果显示 GSDMD 缺陷型小鼠和野生型小鼠之间没有显着差异。这些结果表明 GSDMD 对抗癌免疫的影响取决于肿瘤类型。他们强调了炎症通路在癌症中的复杂作用,强调需要进一步探索 GSDMD 在各种肿瘤微环境中的多方面影响。由于 GSDMD 的多种药理学调节剂可用,这可能会带来癌症联合治疗的新策略。版权所有 © 2024 Boersma、Puddinu、Huard、Fauteux-Daniel、Wirapati、Guedri、Tille、McKee、Pittet、Palmer 和 Bourquin。
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Frontiers in Immunology
2024

EmiliaCirillo,Antoni...
MicroRNA dysregulation in ataxia telangiectasia.
Frontiers in Immunology
共济失调毛细血管扩张症 (AT) 是一种罕见疾病,其特征是神经变性、联合免疫缺陷、恶性肿瘤倾向和高度临床变异。 microRNA (miRNA) 的分析可能有助于深入了解复杂的罕见人类疾病的潜在机制,因为 miRNA 在增殖、分化和 DNA 修复等多种生物学功能中发挥着重要作用。在这项研究中,我们研究了 AT 患者样本中 miRNA 的差异表达,以识别 miRNA 模式并分析这些模式与疾病的关系。我们招募了 20 名 AT 患者(平均年龄 17.7 ± 9.6 岁)并收集了临床和遗传信息。数据。我们对外周血单核细胞 (PBMC) 和成纤维细胞进行了简短的非编码 RNA 测序分析,以比较 AT 患者和对照之间的 miRNA 表达谱。我们在血液样本中观察到 42 个差异表达 (DE)-miRNA,在成纤维细胞样本中观察到 26 个差异表达 (DE)-miRNA 。其中,三种 DE-miRNA,miR-342-3p、miR-30a-5p 和 miR-195-5p,在其他 AT 样本中得到了进一步验证,证实了它们的失调。我们在血细胞中鉴定了与 AT 相关的 miRNA 特征和从一组 AT 患者收集的成纤维细胞样本。我们还预测了一些失调的途径,主要与癌症、免疫系统控制或炎症过程有关。研究结果表明,miRNA 可以深入了解 AT 的病理生理学和肿瘤发生,并有可能在癌症研究中作为有用的生物标志物。版权所有 © 2024 Cirillo, Tarallo, Toriello, Carissimo, Giardino, De Rosa, Damiano, Soresina, Badolato, Dellepiane、巴塞利、卡拉巴、法比奥、贝尔托里尼、蒙坦、孔蒂、罗马诺、波齐、费雷罗、龙卡拉蒂、费拉辛、布鲁斯科、帕伦蒂和皮尼亚塔。
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Immunity & Ageing
2024 Sep 03

LiamQi,AmanDeep,Jord...
A scoping review on adult patients with de novo glomerular diseases following COVID-19 infection or vaccine.
Immunity & Ageing
感染 COVID-19 并接种疫苗后出现肾小球疾病 (GD) 的报告越来越多。目前关于 COVID-19 感染或疫苗接种与 GD 之间可能存在联系的证据是相互矛盾的。本研究对研究进行了范围界定审查,以描述 COVID-19 感染和疫苗接种与 GD 之间的关系以及常见的管理策略和总体结果疾病,以确定知识差距并指导进一步的研究。2022 年 9 月 5 日之前以英文发表的所有原始研究都被考虑纳入该综述。排除标准包括动物研究、尸检研究以及涉及儿科患者(< 16 岁)、移植受者、肾小球疾病复发、伴有癌症或可能导致肾小球疾病的非 COVID-19 感染的数据,或未接受肾活检。搜索的五个电子数据库是 MEDLINE、PubMed、Scopus、EMBASE 和 Cochrane。使用布尔运算符“AND”组合了与 COVID-19 和肾小球疾病相关的两个单独的搜索字符串。使用过滤器将出版物限制为以英文发表的原始研究报告。每个数据库的搜索结果被导入 Covidence 软件 ( www.covidence.org ) 并用于重复数据删除、文章筛选和数据提取。使用描述性分析来总结人口统计、诊断和治疗结果。去除重复后,筛选出 6853 个标题和摘要。在纳入的 188 项研究中,106 项研究描述了 341 名感染 COVID-19 后出现 GD 的患者,82 项研究描述了 146 名接种 COVID-19 疫苗后出现 GD 的患者。 IgA 肾病是接种 COVID-19 疫苗后报告的最常见的 GD 病理,其中 GD 在 mRNA 疫苗接种后最常见。塌陷性局灶节段性肾小球硬化症是 COVID-19 感染后最常见的 GD。 GD 的免疫抑制治疗在疫苗队列中比在感染队列中更常见。尽管世界各地有大量的 COVID-19 感染和疫苗接种,但我们对 GD 与 COVID-19 感染和疫苗接种相关的了解仍然很薄弱,还有更多的研究需要更好地了解可能的关系。© 2024。Crown。
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Immunity & Ageing
2024 Sep 03

GülinAlkanŞen,NihanŞ...
Hyperprogressive disease in patients with advanced cancer treated with immune checkpoint inhibitors.
Immunity & Ageing
超进展性疾病(HPD)是免疫检查点抑制剂(ICI)治疗时代发展的新现象。 HPD 的特点是肿瘤体积意外且快速进展且生存率低。 HPD 没有标准化定义,与 HPD 相关的临床病理学变量尚不清楚。在此,我们评估了接受 ICI 治疗的患者 HPD 的发生率、治疗结果和预测因素。我们回顾性分析了 2014 年至 2021 年间在一个学术中心接受 ICI 治疗的晚期癌症患者。我们使用 Lo Russo 采用的标准,结合临床和放射学HPD 定义的参数。所有根据 RECIST1.1 接受首次肿瘤评估的患者均被纳入。在 155 名患者中,147 名符合分析条件。中位年龄为 61 岁,83% 为男性。癌症类型是:肺癌67.3%,膀胱癌12.9%,胃癌9.5%,5%,结肠癌5.4%,肾细胞癌4.8%。 59.9% 的患者未接受过治疗,其他患者接受过一种或多种化疗。 19 名 (12.9%) 患者患有 HPD。在患有 HPD 的患者中,无进展生存期 (PFS) 显着缩短(1.5 个月与 9.8 个月,(HR 9.56;95% CI (5.51-16.57),p<0.001)。中位总生存期 (OS) 也较短HPD 患者比非 HPD 患者(分别为 3.0 个月和 23.1 个月,HR 12.03,95% CI (6.64-21.81),p< 0.001)。较高的中性粒细胞-淋巴细胞比率 (NLR) 与 HPD 显着相关。我们的研究结果表明,HPD 是一种快速现象,且存活率显着降低。一些临床病理因素和肿瘤特征可能表明 HPD。© 2024。作者,下。 Federación de Sociedades Españolas de Oncología (FESEO) 的独家许可。
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Bone & Joint Journal
2024 Sep 03

EmmaBone,ShiristiKum...
Current sessile serrated lesion incidence: implications for future clinical practice.
Bone & Joint Journal
无蒂锯齿状病变 (SSL) 占结直肠癌发病机制的 30%。随着多种分类的变化以及结肠镜检查设备和技术的改进,历史报告可能低估了 SSL 的真实发病率。本研究旨在确定一年内在新西兰坎特伯雷接受结肠镜检查的患者中 SSL 的发生率,并描述其临床和病理特征。搜索电子记录以识别自 2022 年 1 月 1 日起进行的所有下段内窥镜检查和息肉切除术至2022年12月1日(含)。患者的电子记录用于收集手术过程中切除的每个息肉的组织学分类、位置和大小。主要结果是发现一种或多种 SSL、腺瘤或增生性息肉的手术数量。次要结果包括组织学分类、每个息肉切除的位置和大小。研究期间完成了 4346 例手术。其中,64.1% (2786) 接受了息肉切除术,18.6% (808) 接受了至少一处 SSL 切除。对 9166 个息肉完成了个体息肉分析,发现切除的息肉中有 24.0% 是 SSL,并且主要位于右结肠(65.1% 右结肠、32.6% 左结肠、2.3% 直肠)。 SSL 通常<10mm (84.8%)。本研究发现与之前的研究相比,SSL 的发生率更高。这些结果提出了有关 SLL 率历史上是否被低估、SSL 检测率是否应作为关键绩效指标的问题,并引发了对使用计算机断层扫描结肠成像作为筛查工具的进一步担忧。© 2024 作者。约翰·威利 (John Wiley) 出版的 ANZ 外科杂志
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Bone & Joint Journal
2024 Sep 03

TakumiKitaoka,KenjiH...
Quantification of Gremlin 1 throughout the tumor stroma using whole slide imaging and its clinicopathological significance in gastric cancer.
Bone & Joint Journal
Gremlin 1 (GREM1) 是骨形态发生蛋白 (BMP) 的拮抗剂。 GREM1 在多种癌症的基质细胞中表达,并通过抑制 BMP 信号传导促进肿瘤进展。我们设计本研究是为了建立 GREM1 表达的评估策略,重点关注肿瘤基质,并检查其在胃癌 (GC) 进展中的临床病理学意义。我们采用 RNA 原位杂交 (ISH) 来评估 104 例手术切除的 GC 病例中 GREM1 表达的预后价值,并根据以前的报告评估 ISH 评分。在肿瘤基质细胞(包括成纤维细胞)中观察到 GREM1 表达。我们将 GREM1 阳性细胞定义为表达 ISH 评分 ≥ 3 的细胞,并使用图像分析软件量化 GREM1 阳性细胞的数量。我们检查了肿瘤基质中 GREM1 阳性细胞的数量与临床病理特征之间的关系。每个肿瘤基质的 GREM1 阳性细胞数量范围为 0 至 714.7 个细胞/mm2(中位数为 1.65 个细胞/mm2)。我们根据上述中值将104例GC病例分为GREM1高表达组和GREM1低表达组。 GREM1高表达组与更晚期的pT分级、pN分级、淋巴侵犯和静脉侵犯显着相关。 Kaplan-Meier 分析显示,GREM1 高表达组的生存率明显低于 GREM1 低表达组。这些结果表明,GC 中的 GREM1 表达位于肿瘤基质细胞中,并且肿瘤基质中的高 GREM1 表达可能是一个不良预后因素。© 2024。作者获得 Springer-Verlag GmbH 德国的独家许可,施普林格自然的一部分。
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Protein & Cell
2024 Sep 03

SofiaMSousa,HelenaBr...
Darifenacin: a promising chitinase 3-like 1 inhibitor to tackle drug resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma.
Protein & Cell
胰腺导管腺癌(PDAC)是最具侵袭性的恶性肿瘤之一。我们之前的工作揭示了几丁质酶 3 样 1 (CHI3L1) 参与 PDAC 对吉西他滨的耐药性,将其确定为一个有前途的治疗靶点。在这里,我们的目的是鉴定假定的 CHI3L1 抑制剂并研究它们在 PDAC 中的化学增敏潜力。CHI3L1 的对接分析鉴定出有前途的 CHI3L1 抑制剂,包括达非那新(毒蕈碱受体拮抗剂)。 PDAC 细胞系 (BxPC-3、PANC-1) 和原代 PDAC 细胞用于评估达非那新 (Sulforhodamine B、SRB) 单独或与吉西他滨或吉西他滨加紫杉醇联合使用对细胞生长的影响。评估了针对正常永生化胰腺导管细胞(HPNE)的细胞毒性。使用重组蛋白来确认达非那新对 CHI3L1 诱导的 PDAC 细胞耐药性的影响(SRB 测定)。通过 ELISA 分析达非那新对 Akt 激活的影响。通过对 68 名患者手术切除的石蜡包埋组织进行免疫组织化学评估,胆碱能受体毒蕈碱 3 (CHRM3) 表达与治疗反应之间的关联。计算机筛选显示达非那新能够高效靶向 CHI3L1。 Darifenacin 抑制 PDAC 细胞生长,BxPC-3 和 PANC-1 细胞中的 GI50 分别为 26 和 13.6 µM。这些结果在原代 PDAC-3 细胞中得到证实,而达非那新对 HPNE 细胞没有显示出细胞毒性。重要的是,达非那新使 PDAC 细胞对标准化疗敏感,恢复了 CHI3L1 诱导的 PDAC 细胞对治疗的耐药性,并降低了 Akt 磷酸化。此外,高 CHMR3 表达与吉西他滨的低治疗反应相关。这项工作强调了达非那新作为 PDAC 治疗化疗增敏剂的潜力。© 2024。作者。
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