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Cellular & Molecular Immunology
2024 Oct 21

AgataBinienda,Katarz...
Synthetic free fatty acid receptor (FFAR) 2 agonist 4-CMTB and FFAR4 agonist GSK13764 inhibit colon cancer cell growth and migration and regulate FFARs expression in in vitro and in vivo models of colorectal cancer.
Cellular & Molecular Immunology
游离脂肪酸受体 (FFAR) 是 G 蛋白偶联受体,分为 4 种亚型; FFAR2 和 FFAR3 由短链脂肪酸激活,而 FFAR1 和 FFAR4 由长链脂肪酸激活。最近的研究表明 FFAR 可能参与结直肠癌 (CRC) 的病理生理学。在 CRC 患者中观察到 FFAR2 和 FFAR4 基因表达下降。我们研究的目的是在 CRC 体外和体内模型中评估选择性合成激动剂刺激 FFAR2 和 FFAR4 的抗癌作用。使用了 FFAR2 激动剂 4-CMTB 和 FFAR4 激动剂 GSK137647。与测试化合物孵育 48 小时后,使用 MTT 测定确定细胞活力(CCD 841 CoN 和 SW-480)。使用实时 qPCR 和蛋白质印迹来识别 FFAR 表达的变化。通过商业测试来表征迁移和入侵。通过氧化偶氮甲烷和葡聚糖硫酸钠诱导结肠炎相关结直肠癌 (CACRC) 小鼠模型。4-CMTB 和 GSK137647 显着降低癌细胞生长以及迁移和侵袭能力。两种合成化合物均可增加 SW-480 细胞中 FFAR2 和 FFAR4 的表达。 4-CMTB 和 GSK137647 都不影响 AOM/DSS 诱导的小鼠 CACRC 的进程,然而,4-CMTB 升高了小鼠组织中 FFAR2 蛋白的表达。我们提出,刺激 FFAR2 和 FFAR4 可能会抑制 CRC 细胞活力和迁移,并且CRC 中降低的 FFAR2 和 FFAR4 表达可以通过各自激动剂的治疗来恢复,这表明 CRC 治疗中新的有希望的药理学靶点。© 2024。作者。
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Cellular & Molecular Immunology
2024 Oct 21

GuodongChen,ZixinChe...
LINC01518 predicts poor prognosis of prostate cancer and promotes its progression by regulating hsa-miR-320a/CNKSR2 axis.
Cellular & Molecular Immunology
前列腺癌(PCa)是男性泌尿生殖系统最常见的恶性肿瘤。了解PCa的分子机制及其预后标志物将有助于选择更好的治疗方案。探讨LINC01518在PCa发生发展中的作用及其预后价值,了解其具体的调控机制。LINC01518、hsa-的水平通过 RT-qPCR 检测 miR-320a 和 CNKSR2 mRNA。构建 ROC 曲线来评估 LINC01518 对 PCa 的预后价值。 LINC01518敲除后,通过CCK-8、Transwell试验和凋亡标志物检测证明了LINC01518对PCa细胞功能的影响。通过构建荧光素酶载体检测hsa-miR-320a与LINC01518或CNKSR2 mRNA之间的相互作用。LINC01518在PCa细胞和肿瘤组织中异常表达,敲低它会抑制PCa细胞的生长。 LINC01518 预测 PCa 患者的去势抵抗性前列腺癌 (CRPC) 结局,AUC 为 0.803,敏感性和特异性分别为 75.4% 和 74.6%。 Hsa-miR-320a 模拟转染 WT-LINC01518/CNKSR2 质粒的 PCa 细胞中荧光素酶活性的降低。敲低LINC01518会降低CNKSR2水平,这种调节作用随着hsa-miR-320a的抑制而消失。高水平的LINC01518预示PCa患者预后不良,并通过竞争性结合hsa-miR-320a促进CNKSR2表达,促进PCa进展。 PCa.© 2024。作者。
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CANCER LETTERS
2024 Oct 18

NivedithaNerlakanti,...
Histone deacetylase upregulation of neuropilin-1 in osteosarcoma is essential for pulmonary metastasis.
CANCER LETTERS
肺部是骨肉瘤 (OS) 最常见的转移部位。尽管我们在开发治疗实体恶性肿瘤的靶向疗法方面取得了进展,但广泛作用的化疗仍然是 OS 的一线治疗方法。在分析已批准的治疗非 OS 恶性肿瘤的疗效时,我们之前发现组蛋白脱乙酰酶 1 和 2(HDAC1 和 2)抑制剂罗米地辛可有效治疗已确定的肺转移性 OS。然而,罗米地辛已注意到对人类的毒性,因此我们的目的是确定 HDAC1/2 介导 OS 进展的主要机制,以识别更具选择性的药物靶点/途径。罗米地辛处理的 OS 细胞的微阵列和蛋白质组学分析显示,神经毡蛋白-1 (NRP1) 受到显着抑制,神经毡蛋白-1 是已知的癌细胞迁移和侵袭的调节因子。 NRP1 沉默可显着降低体外 OS 增殖、迁移、侵袭和粘附。更引人注目的是,在体内,减少 NRP1 表达可显着减轻两个独立模型(K7M2 和 SAOS-LM7)中 OS 的肺转移潜力。从机制上讲,我们的数据表明 NRP1 通过下调迁移机制(即 SRC、FAK 和 ROCK1 表达/活性)介导这种效应,这部分与 NRP1 与整合素 β 1 (ITGB1) 的相互作用有关。总之,我们的数据表明,罗米地辛对 NRP1 的下调显着降低了 OS 细胞在肺部播种和建立转移的能力,并且用选择性抑制剂靶向 NRP1 或其效应子可能是预防这一致命方面的可行方法。疾病。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版
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CANCER
2024 Oct 21

JenniferBrunet,Sitar...
Aerobic exercise and CogniTIVe functioning in women with breAsT cancEr (ACTIVATE): A randomized controlled trial.
CANCER
随着化疗相关认知障碍患病率的上升,对治疗方案的研究至关重要。本研究的目的是测试化疗期间开始的有氧运动干预与常规护理(候补名单控制条件)相比对(1)客观测量的认知功能和自我报告的认知功能以及(2)的影响。认知障碍对干预后生活质量 (QOL) 的影响(与化疗完成相当)。乳腺癌女性的有氧运动和认知功能 (ACTIVATE) 试验是一项在渥太华进行的双组、双中心随机对照试验和温哥华(加拿大)。 57 名被诊断患有 I-III 期乳腺癌并正在等待化疗的女性(Mage,48.8 ± 10 岁)被随机分配到化疗开始时进行有氧运动 (nEX = 28) 或化疗期间进行常规护理,化疗完成后进行有氧运动 (nUC = 29)。干预持续 12-24 周,包括监督有氧训练和家庭锻炼。主要结果是通过 13 项神经心理学测试测量的客观认知功能(标准化为 M ± SD,0 ± 1);通过问卷评估自我报告的认知功能的次要结果及其对生活质量的影响。对干预前和干预后(主要终点)收集的数据进行了分析。尽管在考虑多重测试后,干预后的客观认知功能结果在各组之间没有发现显着差异,但六项自我报告的认知功能结果中有四项显示出有利于有氧运动的显着差异。运动组。在开始乳腺癌化疗的女性中,有氧运动并没有导致化疗完成后干预后客观认知功能的显着差异;然而,结果确实支持使用这种干预措施来改善自我报告的认知功能及其对生活质量的影响。© 2024 作者。 《癌症》由 Wiley periodicals LLC 代表美国癌症协会出版。
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Experimental Hematology & Oncology
2024 Oct 21

NWang,BQQi,MRuan,XYZ...
[Clinical features and long-term prognostic analysis of relapsed pediatric acute lymphoblastic leukemia].
Experimental Hematology & Oncology
目的:探讨复发性小儿急性淋巴细胞白血病(ALL)的临床特征及长期预后因素。方法:收集中国儿童白血病研究组(CCLG)-ALL 2008方案初治的217例复发ALL儿童的临床资料,包括年龄、初诊至复发时间、复发部位和分子生物学特征。
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Experimental Hematology & Oncology
2024

YassineAlamiIdrissi,...
Exploring the Impact of the β-Catenin Mutations in Hepatocellular Carcinoma: An In-Depth Review.
Experimental Hematology & Oncology
肝癌,主要是肝细胞癌,是一个重大的全球健康问题,具有重大的临床、经济和心理影响。由于乙型和丙型肝炎感染、非酒精性脂肪性肝炎以及各种环境影响等危险因素,其发病率持续上升。 Wnt/β-Catenin 信号通路在 HCC 中经常失调,成为一个有前途的治疗靶点。关键的遗传改变,特别是 CTNNB1 基因中的突变,涉及 β-连环蛋白 N 末端结构域(S33、S37、T41 和 S45)和犰狳重复结构域(K335I 和 N387 K)的关键磷酸化位点的突变。这些突变阻碍 β-连环蛋白降解,增强其致癌潜力。除了遗传改变外,分子和表观遗传机制(包括 DNA 甲基化、组蛋白修饰和非编码 RNA)进一步影响 β-连环蛋白信号传导和肿瘤进展。然而,仅β-连环蛋白激活不足以促进肝癌发生。肿瘤的发生需要额外的基因“打击”。 Ras、c-Met、NRF2 和 LKB1 等基因的突变或改变与 β-连环蛋白激活相结合,可显着促进 HCC 的发生和进展。了解这些协同突变可以提供对该疾病的重要见解并揭示潜在的治疗策略。遗传变异和肿瘤微环境之间复杂的相互作用,加上针对 Wnt/β-Catenin 通路的新型治疗方法,为改善 HCC 治疗提供了希望。尽管取得了进展,但将临床前研究结果转化为临床实践仍然是一个挑战。未来的研究应侧重于阐明特定的 β-连环蛋白突变和其他基因改变如何导致 HCC 发病机制,利用基因改造的小鼠模型探索不同的信号传导影响,并确定下游靶标。相关临床试验对于推进个性化治疗和改善患者治疗效果至关重要。本综述对 HCC 中的 β-连环蛋白信号传导进行了全面分析,强调了其在发病机制、诊断和治疗靶向中的作用,并确定了关键研究方向以提高理解和临床结果。
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Experimental Hematology & Oncology
2024 Sep

YangHe,AbaiXu,LiXiao...
Phosphorus Metabolism-Related Genes Serve as Novel Biomarkers for Predicting Prognosis in Bladder Cancer: A Bioinformatics Analysis.
Experimental Hematology & Oncology
磷代谢可能与肿瘤的发生和进展有关。我们的目的是筛选与膀胱癌相关的磷代谢基因并构建临床预后模型。用于分析的数据集来自TCGA数据库。随后将 GO 和 KEGG 富集分析应用于差异表达基因。利用共识聚类,比较不同聚类的肿瘤免疫微环境和其他特征。通过单变量Cox回归、LASSO回归和多变量Cox回归分析筛选出与预后相关的磷代谢相关基因,并构建列线图。分别使用TCGA数据集和GEO数据集验证列线图的性能。总体而言,TCGA数据库中鉴定出405个与磷代谢相关的差异表达基因,这些基因与磷酸化、细胞增殖、白细胞激活和信号通路相关。通过一致性聚类得到两个聚类。经过肿瘤免疫微环境分析,发现簇1和簇2之间的免疫细胞浸润存在显着差异。四种磷代谢相关基因(LIME1、LRP8、SPDYA 和 MST1R)与膀胱癌(BLCA)患者的预后相关。我们建立了一个预后模型,并将该模型可视化为列线图。校准曲线证明了该列线图的性能,与 ROC 曲线所示的一致。我们成功鉴定了四个与预后相关的磷代谢相关基因,为生物标志物和治疗提供了潜在靶标。开发了基于这些基因的列线图。尽管如此,这项研究是基于生物信息学,实验验证仍然至关重要。版权所有© 2024 He et al.由德黑兰医科大学出版。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 Sep 23

SarahSamorodnitsky,M...
Statistical analysis of multiple regions-of-interest in multiplexed spatial proteomics data.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
多重空间蛋白质组学揭示了肿瘤细胞的空间组织,这与生存和治疗反应等重要的临床结果相关。这种空间组织通常使用空间汇总统计数据进行总结,包括 Ripley's K 和 Besag's L。然而,如果对同一肿瘤的多个区域进行成像,则不清楚如何综合与单个患者水平终点的关系。我们评估现有的在将汇总统计数据与结果相关联的情况下容纳多个图像的方法。首先,我们考虑基于平均的方法,其中单个样本的多个摘要被组合成加权平均值。然后,我们提出了一类新颖的集成测试方法,其中我们模拟用于汇总摘要的随机权重,测试与结果的关联,并组合 $P$ 值。我们通过模拟和应用非小细胞肺癌、结直肠癌和三阴性乳腺癌的数据来系统地评估这些方法的性能。我们发现最佳策略各不相同,但基于每个图像中的细胞数量的汇总统计的简单加权平均值通常提供最高功效并有效控制 I 型错误。当成像区域的大小变化时,在变化的大小提供信息的情况下,将这种变化合并到加权聚合中可以产生额外的功效。集成测试(但不是重采样)在模拟数据集中的条件下提供了高功率和 I 类错误控制。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
2024 Sep 23

MengqiuZheng,Shaofen...
MetaDegron: multimodal feature-integrated protein language model for predicting E3 ligase targeted degrons.
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS
通过泛素蛋白酶体系统进行的蛋白质降解在空间和时间上的调节对于许多细胞过程至关重要。 E3 连接酶和降解信号(降解决定子)是它们在靶蛋白中识别的序列,是泛素介导的蛋白水解的关键部分,它们的相互作用决定了降解特异性并维持细胞稳态。迄今为止,仅确定了有限数量的目标降解决定子实例,并且其特性尚未完全表征。为了应对这一挑战,我们在这里开发了一种新颖的深度学习框架,即 MetaDegron,用于通过集成蛋白质语言模型和全面的特征化策略来预测 E3 连接酶靶向降解子。通过使用基准数据集的广泛评估以及与 Degpred 等现有方法的比较,我们证明了 MetaDegron 的卓越性能。在功能特征中,MetaDegron 允许批量预测 21 种 E3 连接酶的目标降解决定子,并提供多个与降解决定子相关的结构和理化特征的功能注释和可视化。 MetaDegron 可在 http://modinfor.com/MetaDegron/ 上免费获取。我们预计 MetaDegron 将成为临床和转化界阐明蛋白质稳态调节机制、癌症研究和药物开发的有用工具。© 作者 2024。由牛津大学出版社出版。
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BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY
2024 Oct 20

XianPan,ShanJiang,Xi...
Recent strategies in target identification of natural products: Exploring applications in chronic inflammation and beyond.
BRITISH JOURNAL OF PHARMACOLOGY
天然产物因其多样化的生物活性和复杂多样的结构而成为药物发现的宝库,特别是在感染、炎症和癌症领域。慢性炎症与许多疾病密切相关,包括癌症和神经退行性疾病等复杂疾病。改进天然产物的靶标识别有助于阐明其作用机制和临床进展。它还有助于发现新的药物靶标并消除不需要的靶标,从而显着提高药物发现和开发的生产力。此外,被认为有望治疗复杂疾病的多药理学策略的兴起将进一步增加对靶标反卷积的需求。这篇综述强调了过去 5 年在慢性炎症背景下识别天然产物靶点 (NP) 的策略。这些策略包括用于早期靶标发现和化合物结合位点预测的计算方法、用于靶标描绘的蛋白质组学驱动方法以及用于靶标验证和综合机制探索的实验生物学技术。© 2024 英国药理学会。
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