肿瘤类器官

研究动态

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肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

弥漫性大B细胞淋巴瘤

胶质母细胞瘤

胶质细胞瘤

肾嫌色细胞癌

肾透明细胞癌

肾乳头状细胞癌

急性髓系白血病

脑低级别胶质瘤

肺鳞状细胞癌

嗜铬细胞瘤和副神经节瘤

皮肤黑色素瘤

子宫内膜样癌

子宫癌肉瘤

眼部黑色素瘤

肿瘤类器官

肾上腺皮质癌

膀胱尿路上皮癌

乳腺浸润癌

宫颈鳞癌和腺癌

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胶质母细胞瘤

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眼部黑色素瘤

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

GyuntaeBae,GeorgyBer...

Quantitative Metabolomics and Lipoprotein Analysis of PDAC Patients Suggests Serum Marker Categories for Pancreatic Function, Pancreatectomy, Cancer Metabolism, and Systemic Disturbances.

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

胰腺导管腺癌（PDAC）早期诊断困难，且缺乏可靠的生物标志物。该项目的范围是建立定量核磁共振（NMR）波谱来全面研究 PDAC 患者的血清变化。使用体外诊断研究 (IVDr) 质子核磁共振波谱在 600 MHz 下对胰腺切除术前后获得的 34 名 PDAC 患者的血清样本以及来自健康捐献者的 83 份年龄和性别匹配的对照样本进行分析。应用单变量和多变量统计来识别显着的生物流体变化。当将健康对照者的血清与 PDAC 患者的血清进行比较时，我们发现了 29 种显着变化的代谢物和 98 种脂蛋白。最突出的特征是 (i) 胰腺功能标记物（例如葡萄糖和血液甘油三酯），(ii) 与手术相关的标记物（例如酮体和血液胆固醇），(iii) PDAC 相关标记物（例如， (iv) PDAC 系统性紊乱的标志物（例如肠道代谢物 DMG、TMAO、DMSO2 和肝脂蛋白）。定量血清 NMR 波谱适合作为研究 PDAC 的诊断工具。值得注意的是，2-羟基丁酸（2-HB）作为先前提出的胰岛素抵抗标志物，仅在胰腺切除术后才发现其水平异常高，这表明这种代谢物是胰腺功能丧失的最强标志物。

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

ArianaEShannon,Clair...

Gas-Phase Fractionation Data-Independent Acquisition Analysis of 3D Cocultured Spheroid Tumor Model Reveals Altered Translational Processes and Signaling Using Proteomics.

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

结直肠癌（CRC）具有相当大的异质性；因此，疾病模型也必须反映多种成分。与传统的 2D 模型相比，3D 细胞模型（例如肿瘤球体）可用于确定潜在疗法的药效。众所周知，单一培养球体可以概括无血管肿瘤的基因表达、细胞信号传导和病理生理梯度。然而，它们无法模拟结直肠癌中存在的基质细胞影响，众所周知，结直肠癌会干扰药物疗效，并与转移性晚期结直肠癌相关。本研究旨在开发一种使用癌和非癌成纤维细胞的共培养球体模型。我们使用气相分级分离的数据独立采集来表征共培养球体与单一培养球体的蛋白质组学特征。具体来说，我们确定与单一培养的球体相比，共培养的球体中与翻译和 mTOR 信号传导相关的蛋白质组差异显着增加。与成纤维细胞功能相关的蛋白质，例如包被囊泡的胞吐作用和生长因子的分泌，在共培养的球体中表达显着差异。最后，我们将单一培养和共培养球体的蛋白质组谱与来自实体结直肠癌的公开数据集进行了比较。我们发现共培养球体的蛋白质组与患者样本的蛋白质组更加相似，表明它们具有作为肿瘤模拟物的潜力。

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

SouvikSeal,BrianNeel...

SpaceANOVA: Spatial Co-occurrence Analysis of Cell Types in Multiplex Imaging Data Using Point Process and Functional ANOVA.

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

多重成像平台能够识别复杂组织或肿瘤微环境中不同类型细胞的空间组织。探索不同组织或疾病类别中不同细胞类型的空间共现或共定位的潜在变化可以提供重要的病理学见解，为干预策略铺平道路。然而，这方面的现有方法要么依赖于严格的统计假设，要么缺乏普遍性。基于泊松点过程和方差函数分析的理论，我们提出了一种非常强大的方法来研究跨多个组织或疾病组的细胞类型的差异空间共现。值得注意的是，该方法可以容纳每个受试者的多个图像，并解决了由于数据收集复杂性而经常遇到的组织区域缺失的问题。通过现实模拟研究，我们证明了该方法与现有方法相比具有优越的统计能力和稳健性。此外，我们将该方法应用于使用不同成像平台收集的不同疾病的三个真实数据集。特别是，其中一个数据集揭示了对各种类型结直肠腺瘤的空间特征的新见解。

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

ErJin,ZhidongYin,Xiu...

Potential of Targeting TDO2 as the Lung Adenocarcinoma Treatment.

JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH

色氨酸分解代谢在癌细胞的代谢重新连接中发挥重要作用，以支持肿瘤发生和进展的特殊需求。色氨酸途径的分解代谢产物犬尿氨酸具有抑制肿瘤细胞免疫反应的能力。在本研究中，我们进行了内部和外部队列研究，以揭示色氨酸 2,3-双加氧酶 (TDO) 对肺腺癌 (LUAD) 的重要性。我们的研究进一步证明TDO2表达与LUAD细胞的增殖、存活和侵袭相关，靶向TDO2治疗LUAD肿瘤可能是一种潜在的治疗策略。

JOURNAL OF PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY

BingxinWu,ZuhuiLiang...

The role of PKM2 in cancer progression and its structural and biological basis.

JOURNAL OF PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY

丙酮酸激酶 M2 (PKM2) 是丙酮酸激酶 (PK) 的一种亚型，已被证明在癌症的发展中发挥重要作用。它调节糖酵解途径的最后一步。 PKM2同时具有丙酮酸激酶和蛋白激酶活性，PKM2这两种功能的转换依赖于二聚体和四聚体的相互变化。 PKM2的二聚化可以促进肿瘤细胞的增殖和生长，因此抑制PKM2的二聚化对于治疗癌症至关重要。 PKM2 的聚集受到内源和外源辅因子以及翻译后修饰 (PTM) 的调节。尽管关于PKM2在肿瘤发生过程中不同聚集的研究较多，但近年来的总结较少。在这篇综述中，我们首先介绍PKM2在肿瘤生长的各种生物学过程中的作用。然后，我们总结了各种内源性辅因子如果糖-1,6-二磷酸（FBP）、各种氨基酸和翻译后修饰（PTM）对PKM2的聚集调节机制。最后总结了PKM2的相关抑制剂和激动剂，为今后在癌症治疗中调控PKM2聚集提供参考。© 2024。作者获得纳瓦拉大学独家许可。

JOURNAL OF PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY

YoungSeokEom,FahadHa...

Novel insight on IRE1 in the regulation of chondrocyte dedifferentiation through ER stress independent pathway.

JOURNAL OF PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY

肌醇需求酶 1 (IRE1) 是未折叠蛋白反应途径的主要调节因子，与内质网 (ER) 感知和调节细胞应激相关。 IRE1 的活性在癌症和其他细胞中得到了深入研究和充分表征。然而，人们对软骨细胞中 IRE1 的分子机制知之甚少。本研究探讨了 IRE1 对软骨细胞的软骨形成基因表达的影响及其与不同细胞途径和细胞行为的相关性。蛋白质印迹和免疫荧光证实，转染 IRE1 cDNA 的软骨细胞减少了 II 型胶原蛋白的表达，破坏了软骨细胞的分化。 siRNA 治疗后，IRE1 对软骨细胞分化的影响通过恢复 II 型胶原蛋白的正常表达而得以恢复。探索了不同的分子途径来研究 IRE1 在引起软骨细胞去分化中的作用。然而，我们发现没有显着相关性，因为 IRE1 通过独立途径诱导去分化。响应各种内质网 (ER) 激动剂（2-脱氧-D-葡萄糖）和 ER 应激拮抗剂（牛磺熊去氧胆酸和 salubrinal），IRE1 过表达不会影响 GRP78/94，这与 ER 应激的发病机制有关。此外，当IRE1过表达与炎症通路核因子κB（NFκB）相关时，IRE1显着增加p50的表达，同时降低核因子κ轻链多肽α（IκBα）的表达。这些结果表明，IRE1 通过调节炎症途径来诱导软骨细胞去分化，而炎症途径则通过破坏 II 型胶原表达来引起去分化。© 2024。作者获得纳瓦拉大学的独家许可。

JOURNAL OF PINEAL RESEARCH

XinyueLuo,JingjingWa...

Melatonin inhibits the stemness of head and neck squamous cell carcinoma by modulating HA synthesis via the FOSL1/HAS3 axis.

JOURNAL OF PINEAL RESEARCH

透明质酸（HA）是一种糖胺聚糖，是细胞外基质（ECM）的主要成分，据报道其与其受体CD44相互作用，在多种癌症干细胞（CSC）的自我更新和维持中发挥关键作用。恶性肿瘤。褪黑激素是一种具有多效抗肿瘤特性的神经内分泌激素。然而，褪黑激素是否可以调节 ECM 中 HA 的积累，从而调节头颈鳞状细胞癌 (HNSCC) 的干性仍不清楚。在这项研究中，我们发现褪黑激素抑制了 HNSCC 细胞的 CSC 相关标志物，例如 CD44，并降低了体内 CSC 的肿瘤起始频率。此外，褪黑激素通过下调透明质酸合酶3 (HAS3) 的表达来调节HNSCC 细胞的HA 合成。进一步的研究表明，Fos-like 1 (FOSL1)/HAS3 轴以不依赖于受体的方式介导褪黑素对 HNSCC 的 HA 积累和干细胞性的抑制作用。综上所述，褪黑素通过 FOSL1/HAS3 轴调节 HA 合成，抑制 HNSCC 细胞的干性，这阐明了褪黑素对 ECM 的影响，并为褪黑素在 HNSCC 治疗中的应用提供了新的视角。© 2024 John Wiley

J Photoch Photobio B

MingmeiJi,YulanWang,...

Enhancing the photodynamic effect of curcumin through modification with TiO2 nanoparticles and cationic polymers.

J Photoch Photobio B

姜黄素 (CUR) 是一种从姜黄中提取的天然化合物，在光动力疗法 (PDT) 中显示出作为光敏剂的潜力。这项工作的目的是通过使用二氧化钛 (TiO2) 纳米颗粒和一种名为 Sofast 的阳离子聚合物对其进行改性，以创建纳米复合材料 TiO2-CUR-Sofast (TCS)，从而提高 CUR 的功效。与未修饰的 CUR 相比，TCS 在 400-550 nm 范围内的吸收波长中表现出向更长波长的展宽，从而改善了 CUR 吸收。 TCS 的细胞吸收效率也得到提高，其活性氧 (ROS) 生成量比 CUR 高出近 4.7 倍。此外，TCS 显示出附着在细胞膜上并在 30 分钟潜伏期内进入细胞的能力。辐射后，TCS 表现出显着的细胞毒性，导致各种癌细胞的活力显着降低。细胞内还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（磷酸）（NAD(P)H）和黄素腺嘌呤二核苷酸（FAD）酶的自体荧光寿命成像表明，经 TCS 和辐射处理的癌细胞经历了从氧化磷酸化到糖酵解的代谢途径转变。这些发现凸显了 TCS 作为癌症治疗有效 PDT 药物的潜力。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。

J Photoch Photobio B

FangrongZhang,Helmut...

Genetically encoded fluorescent sensor to monitor intracellular arginine methylation.

J Photoch Photobio B

精氨酸甲基化（ArgMet）作为一种翻译后修饰，在RNA加工、转录调控、信号转导、DNA修复、细胞凋亡和液-液相分离（LLPS）中发挥着至关重要的作用。由于精氨酸甲基化与癌症发病机制和进展相关，因此蛋白质精氨酸甲基转移酶作为抗癌治疗的靶标引起了人们的兴趣。尽管已经进行了大量的工作来阐明精氨酸甲基化调节的（病理）生理机制，但仍然缺乏在活细胞中以高时空分辨率可视化精氨酸甲基化的工具。为了解决这一未满足的需求，我们生成了一种对 ArgMet 敏感的基因编码、基于福斯特共振能量转移 (FRET) 的生物传感器，称为 GEMS，能够定量实时监测 ArgMet 动态。我们通过使用不同的 ArgMet 结合域、富含精氨酸-甘氨酸的区域并调整生物传感器内的接头来优化这些生物传感器以提高其性能。使用一组哺乳动物细胞系和调节剂，我们证明了 GEMS 在以单细胞和时间分辨率监测精氨酸甲基化变化方面的适用性。 GEMS 可以促进体外筛选，以发现潜在的蛋白质精氨酸甲基转移酶抑制剂，并将有助于更好地了解与分化、发育和疾病相关的 ArgMet 调节。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。

J Photoch Photobio B

PJosićDominović,MDob...

Validation and application of caged Z-DEVD-aminoluciferin bioluminescence for assessment of apoptosis of wild type and TLR2-deficient mice after ischemic stroke.

J Photoch Photobio B

程序性细胞死亡或细胞凋亡是组织重塑的极其重要的机制，并调节癌症、神经退行性或中风等疾病。本研究文章的目的是评估笼中 Z-DEVD-氨基荧光素底物对 TLR2 缺陷小鼠及其表达 TLR2 的小鼠缺血性中风后细胞凋亡的体内监测。缺血后炎症是缺血性损伤发展和细胞凋亡的重要因素，并且由 TLR2 受体修饰。笼式 Z-DEVD-氨基荧光素通过激活的 caspase-3 裂解可用于生物发光酶促反应，因此假定它能够报告和测量细胞凋亡。对普遍表达萤火虫荧光素酶转基因的小鼠中风后 28 天的细胞凋亡进行了研究。进行大脑中动脉闭塞以实现缺血性损伤，随后进行磁共振成像。通过笼Z-DEVD-氨基荧光素的生物发光、激活的caspase-3的免疫荧光、膜联蛋白-V的流式细胞术和TUNEL测定来确定细胞凋亡的范围。 Z-DEVD-氨基荧光素底物剂量效应的线性在小鼠大脑中显示。 Z-DEVD-氨基荧光素被证实是适当调整后监测细胞凋亡的良好工具。通过利用缺血性中风后 Z-DEVD-氨基荧光素的生物发光，发现 TLR2 缺陷小鼠的中风后细胞凋亡低于表达 TLR2 的野生型小鼠。总之，Z-DEVD-氨基荧光素可能是活体小鼠细胞凋亡测量的有价值的工具。版权所有 © 2024 作者。由 Elsevier B.V. 出版。保留所有权利。