液体活检通过分析脱落的肿瘤细胞 (ETC) 或肿瘤来源的无细胞 DNA (cfDNA)，为无法进行活检的肿瘤进行诊断和基因组分析提供了一种方便、更安全的方法。然而，其主要挑战在于与基于组织的方法相比其准确性有限。我们报告了一种并行单 ETC 基因组测序 (Past-Seq) 方法，用于对胆管癌 (CCA) 和上尿路尿路上皮癌 (UTUC) 等难以活检的肿瘤进行准确诊断和基因组分析。对于 CCA，研究了可疑胆道狭窄患者 (n = 36) 的前瞻性队列。对胆汁 ETC 进行并行单细胞全基因组测序和全外显子组测序，分别用于 CCA 诊断和解析突变谱，并对胆汁 cfDNA 进行测序以进行比较。多个 ETC 中一致的单细胞拷贝数改变 (CNA) 谱为恶性诊断提供了令人信服的证据。 Past-Seq 产生了基于胆汁的准确 CCA 诊断（96% 敏感性、100% 特异性和阳性预测值），超越了病理评估（56% 敏感性）和胆汁 cfDNA CNA 分析（13% 敏感性），并在恢复组织突变。为了进一步探索 Past-Seq 的适用性，我们对 10 名可疑 UTUC 患者进行了尿液标本调查，Past-Seq 在诊断 UTUC 方面表现出 90% 的敏感性，证明了其在各种液体活检和癌症类型中的广泛适用性。

通过调节细胞外 Ca2+ 浓度来增强肿瘤细胞粘附具有高度挑战性，并且有望实现抗转移。在此，开发了一种pH响应性共轭聚合物-钙复合纳米颗粒（PFV/CaCO3/PDA@PEG），用于基于钙介导的细胞粘附增强的抗转移和活性氧（ROS）触发的钙超载和光动力疗法（PDT）肿瘤的协同治疗。 PFV/CaCO3/PDA@PEG主要配备共轭聚芴-亚乙烯基(PFV-COOH)复合CaCO3纳米粒子，在肿瘤酸性微环境下可快速分解，有效释放Ca2+和光敏剂PFV-COOH 。高细胞外Ca2+浓度有利于两个相邻钙粘蛋白胞外域之间生成二聚体，从而大大增强细胞与细胞的粘附并抑制肿瘤转移。对高转移性肿瘤细胞4T1和MCF-7的抑制率分别为97%和87%。这种精心设计的纳米颗粒还有助于实现PDT、线粒体功能障碍和ROS触发的Ca2超载协同治疗。此外，PFV/CaCO3/PDA@PEG 对 4T1 肿瘤生长表现出优异的体内抑制作用，并通过静脉注射和瘤内注射模式显示出显着的抗转移作用。因此，这项研究为钙介导的肿瘤转移抑制提供了一种强有力的策略。

响应细胞内信号（例如 pH）的纳米材料具有许多生物医学应用的潜力，例如药物输送，因为可以定制组装/拆卸过程以响应特定亚细胞位置的刺激特征。在这项工作中，开发了两种罗丹明肽，它们在生理pH下形成稳定的纳米管，但在内体/溶酶体细胞区室的酸化内部解离成高荧光单体。显示了罗丹明二肽缀合物 NH2-KK(RhB)-NH2 (RhB-KK) 和 NH2-EK(RhB)-NH2 (RhB-KE)，其中赖氨酸残基的 ε-氨基位置附加了罗丹明 B 发色团在 pH 值高于 ~4-5 时组装成明确的纳米管，并在较低 pH 值下解离成荧光单体状态。使用圆二色性 (CD) 和荧光光谱以及透射电子显微镜 (TEM)、原子力显微镜 (AFM) 和共焦成像研究了组装过程的 pH 依赖性。虽然两种肽的罗丹明发色团的开环/闭环转变发生在 pH 4.1 时，但 RhB-KE 的组装开始于 pH 4.6，RhB-KK 的组装开始于相对更碱性的 pH (5.8)。因此，罗丹明肽在三种 pH 依赖性状态之间相互转化：pH 值等于或低于 4.6 时，开环单体状态（λmax 580 nm，λex 550 nm）；闭环纳米管形式，在较高 pH 值下表现出 AIEE（λmax 460 nm，λex = 330 nm）；低于临界胶束浓度 (CMC) 时出现的闭环、非发射单体状态。使用共焦激光扫描显微镜 (CLSM) 对三种癌细胞系进行活细胞成像，评估了肽的 pH 响应特征。与 RhB-KE 或 RhB-KK 孵育后对细胞进行可视化，产生 CLSM 图像，在与溶酶体共定位的德克萨斯红通道中具有点状外观。这些实验表明，纳米管被快速运输到细胞内的酸性溶酶体区室中，从而诱导解离成单体的开放状态。摄取抑制研究表明，细胞摄取是由小凹或网格蛋白介导的内吞作用介导的，具体取决于所研究的细胞系。

CD8 T 细胞激活导致效应 T 细胞 (Teffs) 快速增殖和分化，从而介导抗肿瘤免疫。尽管有氧糖酵解在 CD8 Teffs 中优先被激活，但在低葡萄糖和酸性肿瘤微环境 (TME) 中调节 CD8 T 细胞葡萄糖摄取的机制仍知之甚少。在这里，我们报告在 CD8 T 细胞激活和抗肿瘤免疫过程中葡萄糖转运蛋白 GLUT10 的丰度增加。具体来说，GLUT10 缺乏会抑制肿瘤浸润 CD8 T 细胞的葡萄糖摄取、糖酵解和抗肿瘤效率。单独补充葡萄糖不足以挽救 TME 中 CD8 T 细胞的抗肿瘤功能和葡萄糖摄取。通过分析肿瘤环境代谢物，我们发现高浓度的乳酸通过直接与 GLUT10 的胞内基序结合，降低了 CD8 T 细胞的葡萄糖摄取、激活和抗肿瘤作用。通过模拟肽 PG10.3 破坏乳酸和 GLUT10 的相互作用，促进 CD8 T 细胞葡萄糖利用、增殖和抗肿瘤功能。 PG10.3和GLUT1抑制或抗程序性细胞死亡1抗体治疗的组合显示出协同抗肿瘤作用。总之，我们的数据表明，CD8 T 细胞的葡萄糖摄取选择性地需要 GLUT10，并确定 TME 积累的乳酸通过直接与 GLUT10 结合并降低其葡萄糖转运能力来抑制 CD8 T 细胞效应功能。最后，我们的研究表明破坏乳酸-GLUT10 结合是增强 CD8 T 细胞介导的抗肿瘤作用的一种有前景的治疗策略。

建立一种高度敏感和特异的方法来检测乳腺癌（BC）患者中循环PIK3CA H1047R突变，并研究PIK3CA H1047R突变的患病率与临床表现之间的关联。以等位基因特异性方式设计合适的阻断剂并针对基于 PCR 的 PIK3CA H1047R 突变鉴定进行了优化。所建立的技术在 196 名招募的 BC 患者的无细胞 DNA 样本中得到了验证。使用正确设计的阻断剂进行的等位基因特异性 PCR 测定能够检测到 0.01% 的 H1047R 突变体。通过应用新建立的检测方法，发现 62 例病例（占招募病例总数的 31.6%）携带血液循环 H1047R 突变体。其中，检测到的突变率随着疾病分期的增加而增加，从I期的2/18（11.1％）到II期的17/71（23.9％），III期的20/53（37.7％）和23/31（42.6％）。 %）的第四阶段（p = 0.025），分别。 H1047R 突变频率较高与晚期 (p = 0.033) 或复发 (p = 0.045) 或转移性患者 (p = 0.049) 以及接受放射治疗的人表皮生长因子受体 2 (HER2) 阳性 BC (p = 0.004）。 PIK3CA突变携带者常见于50岁以下肝转移、脑转移或淋巴结侵犯的患者中（p < 0.05）。成功建立了一种高灵敏度的新型等位基因特异性PCR检测方法，用于检测PIK3CA突变携带者。临床实践中的 PIK3CA H1047R 突变。版权所有：© 2024 Thao 等人。这是一篇根据知识共享署名许可条款分发的开放获取文章，允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制，前提是注明原始作者和来源。

静脉血栓栓塞（VTE）是脑肿瘤患者的常见并发症。由于颅内出血 (ICH) 风险升高，急性 VTE 的治疗尤其具有挑战性。抗凝治疗发生脑出血的风险受到多种因素的影响，包括肿瘤类型、近期手术、合并用药、血小板计数和放射学特征。对于脑出血风险较高的患者，需要平衡抗凝治疗的益处与发生严重出血并发症的可能性。管理决策包括是否给予抗凝治疗、剂量、放置下腔静脉滤器、监测出血或进行性血栓的发生以及增加抗凝剂量。本文讨论了治疗脑肿瘤患者急性 VTE 的复杂性，并根据 VTE 诊断时是否存在 ICH 概述了治疗算法。通过基于案例的场景，我们说明了我们的抗凝方法，强调个体化风险评估和循证实践，以优化治疗结果，同时最大限度地降低脑肿瘤患者出血事件的风险。版权所有 © 2024 美国血液学会。

肿瘤代谢的异质性是肿瘤生物学的一个重要但仍知之甚少的方面。目前的工作重点是使用氧化还原辅因子 NAD(P)H 的荧光寿命成像 (FLIM) 对结直肠癌细胞代谢异质性进行可视化和量化。在体外四种癌细胞系（HT29、HCT116、CaCo2 和 CT26）、体内四种类型的小鼠结直肠肿瘤以及离体患者肿瘤样本中对 NAD(P)H 进行了 FLIM 显微镜检查。评估衰减参数的分散性和双峰性以量化细胞间代谢异质性。我们的结果表明，与培养细胞和肿瘤异种移植物相比，患者的结直肠肿瘤具有显着更高的能量代谢异质性，这表现为内部 NAD(P)H 游离（糖酵解）部分的贡献更广泛且频繁的双峰分布。一个样本。在患者的肿瘤中，高级别和早期肿瘤的离散度较大，但与双峰性没有任何关联。这些结果表明，通过 NAD(P)H FLIM 评估的细胞水平代谢异质性有可能成为临床预后因素。© 2024，Komarova、Sinyushkina、Shchechkin 等人。

使用抗 EGF 抗体从自动展示的 Fv 抗体库中筛选超热生长因子受体 (EGFR) 抑制剂。 Fv抗体文库表达于大肠杆菌外膜，对应免疫球蛋白G的重链VH区。通过定点随机化表达的VH区（11个氨基酸残基）的CDR3区构建文库。诱变。使用抗EGF抗体作为筛选探针，从Fv抗体库中筛选具有抗体结合亲和力的氨基酸序列（CDR3区）。这些氨基酸序列被认为与EGF具有相似的化学性质，可以与EGFR结合。从Fv抗体库中筛选出两个带有针对EGFR的Fv抗体的自展示克隆，并且筛选的Fv抗体表达为可溶性蛋白。使用SPR生物传感器估计结合亲和力(KD)，并使用EGFR介导的信号通路中的蛋白质的蛋白质印迹分析观察表达的Fv抗体对PANC-1胰腺肿瘤细胞和T98G胶质母细胞瘤细胞的抑制活性。观察到 PANC-1 和 T98G 细胞的活力因表达的 Fv 抗体的抑制活性而降低。最后，通过分子对接模拟分析了 Fv 抗体与 EGFR 之间的相互作用。

乳清蛋白（WP）是牛奶中含有的一种高生物价值的蛋白质，可能具有抗炎特性，并可以减少促炎细胞因子；然而，目前的证据尚无定论。本研究的目的是进一步研究补充乳清蛋白对成人炎症因子和氧化应激的影响。我们使用 PubMed 等数据库中的相关关键词进行了截至 2022 年 3 月的全面检索、Scopus、Embase 和 Cochrane 对照试验中央注册中心，重点关注随机对照试验 (RCT)。RCT 检查 WP 对 C 反应蛋白、肿瘤坏死因子 α、白细胞介素 6、谷胱甘肽、丙二醛和总抗氧化能力由 2 位作者独立选择。使用随机效应模型将结果汇总为加权平均差和 95% CI。本研究的结果表明，与对照相比，WP 补充剂对炎症和氧化应激的调节没有显着影响。预定义的亚组分析均未解释 WP 补充剂对炎症因子和氧化应激影响的差异。本研究表明，WP 补充剂对炎症因子和氧化应激没有显着影响。 CRD42022325855.© 作者 2024。由牛津大学出版社代表国际生命科学研究所出版。版权所有。如需权限，请发送电子邮件至：journals.permissions@oup.com。

5-羟甲基胞嘧啶 (5hmC) 是一种重要的表观遗传标记，在调节组织特异性基因表达方面发挥着重要作用，对于了解人类基因组的动态功能至关重要。尽管它很重要，但预测整个基因组中的 5hmC 修饰仍然是一项具有挑战性的任务，特别是考虑到 DNA 序列与各种表观遗传因素（例如组蛋白修饰和染色质可及性）之间的复杂相互作用时。使用组织特异性 5hmC 测序数据，我们引入了 Deep5hmC，一种多模式方法深度学习框架，集成了 DNA 序列和表观遗传特征，例如组蛋白修饰和染色质可及性，以预测全基因组 5hmC 修饰。与 Deep5hmC 的单峰版本和最先进的机器学习方法相比，Deep5hmC 的多峰设计在预测定性和定量 5hmC 修饰方面表现出显着改进。这一改进通过对在前脑类器官发育过程中的四个发育阶段收集的 17 个人体组织的一套全面的 5hmC 测序数据进行基准测试来证明。与 DeepSEA 和随机森林相比，在预测二元 5hmC 修饰位点时，Deep5hmC 在四个前脑发育阶段的 AUROC 分别实现了接近 4% 和 17% 的改进，在 17 个人体组织中分别实现了 6% 和 27% 的改进；在预测连续 5hmC 修饰时，四个前脑发育阶段的 Spearman 相关系数提高了 8% 和 22%，17 个人体组织的 Spearman 相关系数提高了 17% 和 30%。值得注意的是，Deep5hmC 通过在阿尔茨海默病病例对照研究中准确预测基因表达并识别差异羟甲基化区域，展示了其实用性。 Deep5hmC 显着提高了我们对组织特异性基因调控的理解，并促进了复杂疾病新生物标志物的开发。Deep5hmC 可通过 https://github.com/lichen-lab/Deep5hmC 获取。补充数据可在 Bioinformatics online 获取。©作者 2024 年。由牛津大学出版社出版。