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肿瘤
Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 27
Chia-ChinWu,LicaiHua...
Whole genome and reverse protein phase array landscapes of patient derived osteosarcoma xenograft models.
Disease Models & Mechanisms
骨肉瘤是儿童和年轻人最常见的原发性骨恶性肿瘤，治疗选择很少。因此，过去几十年来，生存结果几乎没有改善。在这种疾病中，对测试新疗法的模型的需求尤其巨大，因为它既罕见又对大多数疗法没有反应。为了解决这个问题，NCI 资助的一个联盟已经表征并利用了一组源自患者的骨肉瘤异种移植模型进行药物测试。这些模型的外显子组、转录组和拷贝数景观先前已介绍过。这项研究现在添加了全基因组测序和反相蛋白质阵列分析数据，这些数据可以与药物测试结果相关联。此外，还描述了四种额外的骨肉瘤模型供研究界使用。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 27
GianniDurando,Federi...
Combination of US hyperthermia and radiotherapy on a preclinical glioblastoma model.
Disease Models & Mechanisms
在这项工作中，研究了超声（US）热疗（HT）与放射治疗（RT）相结合的效果。将治疗应用于通过注射2×10 6 U87 luc细胞获得的GBM异种移植裸鼠模型。联合治疗组接受6 Gy和43°HT 8 min。超声场由闭环计算控制系统产生，该系统由中心频率为 3.57 MHz 的高强度聚焦超声 (HIFU) 换能器、功率放大器、函数发生器和 MATLAB 控制器组成。机械锥适配器设计用于在预定义的后焦距处使用 HIFU 光束。将两个热电偶放置在机械锥体和小鼠皮肤之间，以测量和控制 HT 治疗期间的温度。放射治疗采用专用的小动物图像引导放射治疗系统进行。使用卡尺进行的肿瘤体积测量显示，在治疗后长达 21 天，RT-HT 组相对于 RT 组或对照组具有良好的肿瘤控制。治疗后两周内，标准化（治疗前）肿瘤体积的平均值几乎等于 0.5，在处死时增加至 1.5。对照组和 HT 组在前两周显示出较高的值，约为 1.5，在随访期结束时显示为 3.5。我们的结论是，使用 HT 作为放射增敏剂可以改善胶质母细胞瘤的治疗效果。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 27
AlicanÖzkan,NinaTere...
Intestinal organ chips for disease modelling and personalized medicine.
Disease Models & Mechanisms
肠道结构、力学和生理学的改变是急性和慢性肠道疾病的基础，其中许多疾病受到微生物组、蠕动、基质或免疫反应失调的影响。在临床前动物模型中研究人类肠道生理学或病理生理学很困难，因为它们的微生物组和免疫系统与人类不同。尽管类器官培养的进步部分克服了这一挑战，但肠道类器官仍然缺乏研究肠道健康和疾病的核心功能所必需的关键特征，例如消化或液体流动，以及活微生物组、蠕动的长期影响的贡献和免疫细胞。在这里，我们回顾了人类肠道芯片上器官（器官芯片）微流体培养模型的进展，该模型由上皮细胞排列并与其他组织（例如基质或内皮）连接，可以经历流体流动和类似蠕动的运动。器官芯片提供了强大的方法来模拟不同人群和个体患者的肠道生理学和疾病状态，并可用于获得对疾病的潜在分子和生物物理机制的新见解。它们还可以用作临床前工具来发现新药，然后在相同的人类相关模型中验证其治疗功效和安全性。© 2024。Springer Nature Limited。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 27
SapnaLunj,TimAndrewD...
Immune effects of α and β radionuclides in metastatic prostate cancer.
Disease Models & Mechanisms
外照射放疗用于根治器官局限性前列腺癌并治疗转移性疾病的病变，而使用标记的前列腺特异性膜抗原配体和镭 223 (223Ra) 的分子放疗适用于转移性前列腺癌，并已显示出显着的改善与标准护理治疗相比，症状控制和总体生存率有所提高。前列腺癌被认为是一种免疫冷肿瘤，因此调查治疗引起的免疫反应影响的研究已经完成。然而，新出现的数据支持放射治疗在前列腺癌中诱导免疫反应的观点，但该反应是抗肿瘤反应还是促肿瘤反应取决于放射治疗方案，并且还取决于细胞系。体外数据表明，单剂量放疗方案比分次放疗方案产生更大的免疫抑制作用；关于分子放射治疗药物诱导的免疫反应知之甚少，但有证据表明，这些药物可能会诱导免疫抑制性全身免疫反应，表现为抑制性检查点分子（例如程序性细胞死亡 1 配体 1 和 2）表达增加，并且这些变化可能与临床反应有关。不同的放疗方式可以诱导不同的免疫特征，从而激活或抑制免疫介导的肿瘤杀伤作用，并且当前用于前列腺癌研究的临床前模型对于研究放疗诱导的免疫反应的复杂性还不是最佳的。© 2024. Springer自然有限公司。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 27
XuekaiHu,JiayunWei,P...
Organoid as a promising tool for primary liver cancer research: a comprehensive review.
Disease Models & Mechanisms
原发性肝癌（PLC）是世界范围内最常见的恶性胃肠道肿瘤之一。受限于肝移植供体短缺和肿瘤的异质性，肝癌患者缺乏有效的治疗方案，导致病情快速进展和转移。目前，PLC的临床前模型与临床现实存在差距，并且对疾病进展的反应和药物治疗的有效性受到限制。类器官是体外三维培养的临床前模型，具有高度异质性，保留原发肿瘤的组织形态学和基因组特征。肝癌类器官已广泛应用于药物筛选、新靶点发现、精准医疗等领域；因此是研究 PLC 的一个有前途的工具。在这里，我们总结了肝癌类器官的研究进展及其作为疾病模型的潜在应用。这篇综述全面介绍了这一新兴技术，并为研究人员在精准医学领域探索提供了新思路。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug
Hui-JuanChen,YangCao...
[Prognostic Value of DTA Mutations in Patients with Newly Diagnosed Acute Myeloid Leukemia].
Disease Models & Mechanisms
探讨DTA（DNMT3A、TET2、ASXL1）基因突变对非M3急性髓系白血病（AML）患者预后的意义。 收集2018年1月至2018年1月至常州市第一人民医院住院的180例初诊AML患者的临床资料。对2022年4月进行了回顾性分析。采用二代测序技术检测患者150个基因突变，并采用log-rank检验和Cox回归模型分析预后因素。180例AML患者中83例（46.1%）检测到DTA基因突变。与无 DTA 突变的患者相比，有 DTA 突变的患者年龄明显较大 (P < 0.001)。 DTA突变组的中位总生存（OS）时间和无病生存（DFS）时间显着短于无DTA突变组（均P < 0.05）。多变量分析显示，年龄≥60岁（P < 0.001）、DTA突变（P = 0.018）和中危（相对于有利风险）（P = 0.005）是AML患者OS的独立危险因素。 DTA突变患者年龄相对较大，中位OS时间和DFS时间较短，预后较差。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Aug 27
PeiwenMiao,JingdiYu,...
Establishment and verification of a TME prognosis scoring model based on the acute myeloid leukemia single-cell transcriptome.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
肿瘤微环境（TME）在急性髓系白血病（AML）的发生、发展中发挥着重要作用。单细胞测序使研究人员能够探索TME亚群与肿瘤预后之间的相关性，区分肿瘤细胞耐药亚群的存在，并揭示AML细胞异质性的复杂性。我们使用公共数据库中的骨髓免疫细胞富集分析来筛选预后基因，构建预后模型，并在独立的外部数据集和患者样本上验证其预后意义。共获得18,251个单细胞，建立CCL5、ETLS2、IL2RA等10个关键基因的预后评分模型。将AML病例分为高危组和低危组。低风险组的生存率高于高风险组。 TCGA和GEO训练集中1年、3年和5年生存曲线的曲线下面积（AUC）分别大于0.8和0.6，表明预测有效。该模型的预后功效在多个验证集上得到了证实。结果表明，与对照相比，AML 样本中 ETS2、CCL5 和 IL2RA 的表达增加，这与总生存期 (OS) 降低相关。这种基于肿瘤免疫浸润的预后评分模型为开发复发/难治性 AML 的新治疗策略提供了参考。© 2024。作者。
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Stem Cell Research & Therapy
2024 Nov
ZuzanaNascakova,Jiaz...
Helicobacter pylori induces the expression of Lgr5 and stem cell properties in gastric target cells.
Stem Cell Research & Therapy
幽门螺杆菌感染使携带者患胃癌的风险很高。胃窦癌的细胞起源是Lgr5干细胞。在这里，我们发现，通过免疫荧光显微镜、qRT-PCR 和蛋白质印迹法确定，幽门螺杆菌感染胃窦来源的胃类器官细胞会增加干细胞标记物 Lgr5 的表达，无论是当细胞作为单层生长和感染时，还是当细胞暴露于 3D 结构中的幽门螺杆菌时。通过球体形成测定确定，幽门螺杆菌暴露增加了干性特性。 Lgr5 的表达和干性的获得依赖于功能性 IV 型分泌系统 (T4SS)，并且至少部分依赖于 T4SS 效应子 CagA。 NF-κB 的药理抑制或基因消除可逆转 Lgr5 和球体形成的增加。由于 Apc 失活而导致的持续活跃的 Wnt/β-catenin 信号传导加剧了幽门螺杆菌诱导的 Lgr5 表达和干性，这两种情况甚至在感染根除后仍然存在。综合数据表明，幽门螺杆菌具有诱导干性的特性，这取决于其激活 NF-κB 信号传导的能力。© 2024 Nascakova 等人。
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Stem Cell Research & Therapy
2024 Aug 24
BaofaYu,WenxueMa
Biomarker discovery in hepatocellular carcinoma (HCC) for personalized treatment and enhanced prognosis.
Stem Cell Research & Therapy
肝细胞癌（HCC）是全球癌症相关死亡的主要原因，由于其异质性，对诊断和治疗提出了重大挑战。生物标志物的发现对于应对这些挑战至关重要，有望实现早期检测、精确诊断和个性化治疗计划。甲胎蛋白 (AFP)、磷脂酰肌醇蛋白聚糖 3 (GPC3) 和 des γ 羧基凝血酶原 (DCP) 等关键生物标志物已显示出改善临床结果的潜力。蛋白质组学技术的进步，包括新一代测序 (NGS)、质谱分析以及检测循环肿瘤细胞 (CTC) 和循环肿瘤 DNA (ctDNA) 的液体活检，加深了我们对 HCC 分子格局的了解。 PD-L1 表达和肿瘤浸润淋巴细胞 (TIL) 等免疫标记物在指导免疫治疗决策中也发挥着至关重要的作用。尽管取得了这些进步，但在生物标志物验证、标准化、融入临床实践以及成本相关障碍方面仍然存在挑战。单细胞测序和机器学习等新兴技术为进一步探索提供了有希望的途径。研究人员、医疗保健提供者和政策制定者之间对研究和合作的持续投资对于充分利用生物标志物的潜力至关重要，最终彻底改变 HCC 管理并通过个性化治疗方法改善患者的治疗结果。版权所有 © 2024 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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Comput Meth Prog Bio
2024 Aug 05
NamaniDeepikaRani,Ma...
Improved rank-based recursive feature elimination method based ovarian cancer detection model via customized deep architecture.
Comput Meth Prog Bio
卵巢癌通常被认为是最致命的妇科癌症，因为它往往在晚期才被诊断出来，导致治疗选择有限且预后较差。卵巢癌的治疗面临诸多挑战，包括快速转移、遗传因素、生育史等。因此，需要对卵巢癌进行及时、准确的诊断，以便实施有效的治疗计划，为所有受 OC 影响的患者提供帮助。他们需要的关心和支持。该CCLSTM模型建议分为四个基本阶段，包括预处理、特征提取、特征选择和检测。最初，使用改进的两步数据标准化对输入数据进行预处理。随后，从归一化数据中提取统计特征、修正熵、原始特征和互信息等特征。接下来，获得的特征经过改进的基于排序的递归特征消除方法（IR-RFE）来选择最合适的特征。最后，所提出的 CCLSTM 模型将所选特征作为输入并提供最终的检测结果。此外，通过使用各种分析进行彻底评估来检查所提出的 CCLSTM 技术的性能。此外，CCLSTM 方案的灵敏度值为 0.948，而ALO-LSTM、ALOCNN、Bi-GRU、LSTM、RNN、KNN、CNN、DCNN 的灵敏度等级分别为 0.808、0.893、0.829、0.851、0.765、0.872、0.893。 LSTM 技术的加入产生了一种卵巢癌检测技术，与其他现有策略相比，该技术更加准确和一致。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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