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肿瘤
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug 27
WeiZhu,ShiqinMao,Jua...
TRPM2-AS promotes ovarian cancer cell proliferation and inhibits cell apoptosis by upregulating the nearby gene TRPM2 via miR-6764-5p.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
卵巢癌（OC）已成为全世界女性致命的妇科恶性肿瘤。靶向治疗对于 OC 患者来说是一种有前途的治疗选择，识别生物标志物并探索分子机制是必要的。本研究探讨了长链非编码RNA瞬时受体电位通道亚家族M成员2反义RNA（TRPM2-AS）在OC中的功能和机制。利用逆转录定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) 分析 OC 细胞中的 TRPM2-AS 表达。采用细胞计数试剂盒-8 (CCK-8) 和集落形成实验来探讨 TRPM2-AS 对 OC 细胞活力和增殖的影响。使用 TdT 介导的 dUTP Nick-End 标记 (TUNEL) 和流式细胞术分析检测细胞凋亡。对细胞凋亡标记物的蛋白质表达进行蛋白质印迹分析。应用 RNA Pulldown 或荧光素酶报告基因测定来探索 TRPM2-AS 和 miR-6764-5p 之间的相互作用或 miR-6764-5p 和 TRPM2 的结合。结果显示TRPM2-AS在OC细胞中高表达且主要定位于细胞质。 TRPM2-AS 耗竭抑制 OC 细胞活力和增殖，同时增加细胞凋亡率。 TRPM2 在 OC 细胞中表现出高水平，并受到 TRPM2-AS 的正向调节。 TRPM2-AS 与 miR-6764-5p 相互作用，从而上调 TRPM2 表达。此外，TRPM2 过表达逆转了 TRPM2-AS 耗竭对恶性 OC 细胞过程的抑制作用。总之，TRPM2-AS 通过与 miR-6764-5p 相互作用调节 TRPM2 水平，促进 OC 细胞活力和增殖，同时增强细胞凋亡。© 2024。作者。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug 27
KangweiZhou,KailiZhe...
Discrimination of healthy oral tissue from oral cancer based on the mean grey value determined by optical coherence tomography.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
本研究旨在确定光学相干断层扫描 (OCT) 图像的定量指标，以区分肿瘤与周围组织。基于 OCT 测量，确定了 54 个人体组织样本（18 个癌组织、癌旁组织）的 432 个位置的平均灰度值。 ，以及正常组织）。通过苏木精和伊红染色（H
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug 27
Carole-AnneMartineau...
From viruses to cancer: exploring the role of the hepatitis C virus NS3 protein in carcinogenesis.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
丙型肝炎病毒 (HCV) 长期感染全世界约 1.7 亿人，是肝细胞癌 (HCC) 的已知病原体。 HCV 介导的致癌作用的分子机制尚不完全清楚。这篇综述文章重点关注 NS3 的致癌潜力，NS3 是一种对细胞具有转化作用的病毒蛋白，尽管其确切机制仍难以捉摸。与更广泛研究的 Core 和 NS5A 蛋白不同，NS3 在癌症发展中的作用不太明确，但很关键。研究表明，NS3 与多种致癌过程有关，例如增殖信号传导、细胞死亡抵抗、基因组不稳定和突变、侵袭和转移、肿瘤相关炎症、免疫逃避和复制永生。了解 NS3 等病毒蛋白对细胞转化的直接影响对于阐明 HCV 在 HCC 发展中的作用至关重要。总体而言，这篇综述阐明了 NS3 促进肝癌发生的分子机制，并强调了其在 HCV 相关 HCC 背景下的重要性，强调需要进一步研究其特定的分子和细胞作用。© 2024。作者（s）。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug 27
MiekeRVanBockstal,Je...
Systematic assessment of HER2 status in ductal carcinoma in situ of the breast: a perspective on the potential clinical relevance.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
在许多国家，常规对导管原位癌（DCIS）进行激素受体状态评估，因为激素受体阳性的DCIS患者有资格接受辅助抗激素治疗，旨在降低同侧和对侧乳腺癌风险。尽管 HER2 基因扩增及其相关的 HER2 蛋白过度表达构成了浸润性乳腺癌的主要预后和预测标志物，但其在 DCIS 的诊断和治疗中的应用并不那么简单。 HER2 免疫组织化学尚未常规进行，因为 HER2 阳性在 DCIS 生物学中的作用尚不清楚。尽管如此，最近的数据对这种做法提出了挑战。在这里，我们讨论常规 HER2 评估对 DCIS 的价值。 HER2 阳性与 DCIS 分级密切相关：大约五分之四的 HER2 阳性 DCIS 表现出高度异型性。由于形态学 DCIS 分级容易出现观察者间的变异，HER2 免疫组织化学可以使分级更加稳健。多项研究表明 HER2 阳性 DCIS 与同侧复发风险之间存在关联，尽管目前尚不清楚这是整体复发、原位复发还是侵入性复发。 HER2 阳性 DCIS 往往较大，手术切缘受累的风险较高。 HER2 阳性 DCIS 患者从辅助放疗中获益更多：它大大降低了肿瘤切除术后的局部复发风险，且不影响总生存期。单纯活检诊断的 DCIS 中 HER2 阳性与手术后升级为浸润性癌的增加有关。因此，术前活检的 HER2 免疫组织化学可能为外科医生提供有用的信息，有利于更广泛的切除。现在似乎是考虑 DCIS 亚型依赖性治疗的正确时机，包括对 HER2 阳性 DCIS 患者进行适当的局部治疗，以及对激素受体阳性、HER2 阴性 DCIS 患者进行降级治疗。© 2024。作者。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug
YueMa,Jia-JiaLi
[Expression and Clinical Significance of LncRNA HEIH in Patients with Acute Myeloid Leukemia].
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
探讨长链非编码RNA（lncRNA）HEIH在急性髓系白血病（AML）患者中的表达及临床意义。选取2019年1月至2020年12月蚌埠医学院第一附属医院收治的50例初诊AML患者（M3除外）。该研究纳入了 30 名非血液恶性肿瘤患者作为对照。检测所有患者中lncRNA HEIH的相对表达水平，分析AML患者临床特征、基因突变、FAB分型、疗效、预后及总生存期（OS）与lncRNA HEIH表达水平的相关性。 AML患者中lncRNA HEIH的表达量显着高于非血液恶性肿瘤患者（P <0.01）。而且，白细胞计数（WBC）高、CEBPA和FLT3突变、疗效差、预后差的AML患者往往表现出较高的lncRNA HEIH表达，而lncRNA HEIH高表达的患者表现出较短的总生存期（OS）。 HEIH在AML患者中表现出独特的分子生物学意义，可能为AML的诊断、监测和靶向治疗提供新的方法。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug
LanYang,Li-XiaCao,Hu...
[Primary Extranodal Diffuse Large B-Cell Lymphoma in the Rituximab Era: a Single-Center Retrospective Analysis].
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
探讨利妥昔单抗时代原发性结外弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者的临床特征和预后因素。病例资料完整且一线接受利妥昔单抗、环磷酰胺、表柔比星治疗的初诊DLBCL患者的连续数据回顾性分析2013年1月至2023年11月内蒙古医科大学附属医院收治的长春新碱、强的松（R-CHOP）或R-CHOP治疗情况。分析结外DLBCL的临床、分子免疫学特征及预后，采用Logistic回归模型分析患者预后的影响因素。共纳入237例患者，其中54.4%（129例）为原发结外来源的DLBCL ，最常见的结外部位如下：胃（19.4%）、结肠（14.7%）、扁桃体（12.4%）、皮肤/肌肉（9.3%）、中央（7.7%）、鼻/鼻咽（6.2%） 、骨髓（5.4%）、睾丸（4.7%）。骨髓、中枢、肝脏、胃肠道或肺部起源的结外DLBCL患者的3年PFS和OS显着低于其他非特殊部位起源的结外DLBCL患者，差异有统计学意义。 PFS：65.2% vs 76.7%，P = 0.008；OS：82.6% vs 88.3%，P = 0.04）。多因素分析显示影响OS的预后因素包括NCCN-IPI评分>3（OR : 0.142, 95%CI : 0.041-0.495, P =0.002）、非生发中心来源（OR : 2.675，95%CI :1.069- 6.694，P =0.036) 和 DEL 患者 (OR : 0.327, 95%CI : 0.129-0.830, P =0.019)。 NCCN-IPI 评分 >3 是 PFS 的唯一独立不良预后因素（OR：0.235，95%CI：0.116-0.474，P < 0.001）。 原发性结外来源的 DLBCL 患者更常见于胃肠道受累，总体而言预后比淋巴结起源的患者差。 NCCN-IPI评分是预测原发性结外弥漫性大B细胞淋巴瘤患者总生存期和无进展生存期的重要独立不良预后因素。
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Epigenetics & Chromatin
2024
ParamitaKundu,RuchiJ...
DNA Methylation in Recurrent Glioblastomas: Increased TEM8 Expression Activates the Src/PI3K/AKT/GSK-3β/B-Catenin Pathway.
Epigenetics & Chromatin
胶质母细胞瘤（GBM）是浸润性恶性脑肿瘤，大多数在手术切除和放化疗后一年内复发。对放化疗后胶质母细胞瘤细胞的研究已被证明可诱导转分化、细胞可塑性、DNA 损伤反应的激活和干性。由于胶质母细胞瘤是一种异质性肿瘤，会产生治疗耐药性和可塑性，因此我们研究了复发肿瘤中是否存在全基因组 DNA 甲基化变化。利用全基因组 DNA 甲基化芯片，我们比较了 11 种原发性（首次出现）肿瘤与13 复发性（复发性）GBM，以描绘与治疗暴露、治疗抵抗和疾病复发相关的表观遗传变化的贡献。我们的数据显示，与原发性疾病相比，复发性胶质母细胞瘤中有 1,224 个高甲基化探针和 526 个低甲基化探针。我们发现溶质载体和离子通道基因、白细胞介素受体/配体基因、肿瘤抑制基因和与转移相关的基因的差异甲基化。我们对这样一个低甲基化上调基因进行了功能性表征，即炭疽毒素受体 1/肿瘤内皮标志物 8 (ANTXR1/TEM8)，与原发性肿瘤相比，其表达被证实在复发性胶质母细胞瘤中显着上调，并通过免疫组织化学证实。通过过表达和敲低方法，我们发现 TEM8 诱导胶质母细胞瘤细胞的增殖、侵袭、迁移和化疗放射抗性。此外，我们还证明了由于 TEM8 通过 Src/PI3K/AKT/GSK3β/β-catenin 通路过度表达而导致 β-catenin 稳定和激活 β-catenin 转录程序的新机制。我们报告了复发性乳腺癌中全基因组 DNA 甲基化的变化GBM 并提示 TEM8 基因参与 GBM 复发和进展。版权所有 © 2024，国际抗癌研究所（George J. Delinasios 博士），保留所有权利。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 27
IsabellaPallavicini,...
LSD1 inhibition improves efficacy of adoptive T cell therapy by enhancing CD8+ T cell responsiveness.
Epigenetics & Chromatin
赖氨酸特异性组蛋白去甲基酶 1 A (LSD1) 参与抗肿瘤免疫；然而，它在塑造 CD8 T 细胞 (CTL) 分化和功能方面的作用在很大程度上仍未被探索。在这里，我们表明，在过继性 T 细胞疗法 (ACT) 的背景下，CTL 中 LSD1 (LSD1i) 的药理抑制会引起表型和功能改变，从而在雌性小鼠的临床前模型中产生强大的抗肿瘤免疫力。此外，抗 PDL1 治疗与基于 LSD1i 的 ACT 相结合可以根除肿瘤，并在黑色素瘤模型中实现长期无瘤生存，补充了单独免疫或表观遗传治疗的有限疗效。总的来说，这些结果表明 LSD1 调节可改善 ACT 和抗 PDL1 疗法产生的抗肿瘤反应，为其临床评估提供基础。© 2024。作者。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 27
BaoyanBai,JillianFWi...
Multi-omics profiling of longitudinal samples reveals early genomic changes in follicular lymphoma.
Epigenetics & Chromatin
滤泡性淋巴瘤 (FL) 是最常见的惰性 B 细胞非霍奇金淋巴瘤类型。治疗的进步提高了总体生存率，但早期复发或转化为侵袭性疾病与较差的结果相关。为了识别早期遗传事件并追踪肿瘤克隆进化，我们对 44 名 FL 患者的 94 份纵向活检进行了多组学分析； 22 例发生转化 (tFL)，22 例复发但未发生转化 (nFL)。深度全外显子组测序证实编码表观遗传调节因子（CREBBP、KMT2D、EZH2、EP300）的基因反复发生突变，nFL 和 tFL 患者的突变情况相似。纵向样本之间基因组距离的计算揭示了两个亚群的复杂进化模式。 CREBBP 和 KMT2D 突变被确定为在病程早期发生的遗传事件，并且 CREBBP KAT 结构域突变的病例转化风险较低。 12 号和 18 号染色体 (TCF4) 的增加以及 6q 的丢失被确定为早期且稳定的拷贝数改变。识别此类早期且稳定的遗传事件可能为早期疾病检测和疾病监测提供机会。综合分析显示，具有 EZH2 突变的肿瘤表现出许多组蛋白基因（包括组蛋白接头基因）的基因表达降低。这可能会导致 FL 的表观遗传失调。© 2024。作者。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 27
XiuliGao,TingPan,YuG...
Acetylation of PGK1 at lysine 323 promotes glycolysis, cell proliferation, and metastasis in luminal A breast cancer cells.
Epigenetics & Chromatin
在之前使用 iTRAQ（相对和绝对定量同量异位标签）技术的研究中，我们在乳腺癌组织中鉴定出了一系列表现出高水平乙酰化的蛋白质。尽管取得了这一进展，但这些乙酰化蛋白在癌症生物学背景下的具体功能和含义尚未阐明。本研究旨在系统地研究这些乙酰化蛋白的功能作用，旨在确定乳腺癌病理生理学中潜在的治疗靶点。通过生物信息学鉴定乙酰化靶点，并随后确认其表达和乙酰化。蛋白质组分析和验证研究确定了潜在的乙酰转移酶和脱乙酰酶。我们通过催化活性、葡萄糖消耗、ATP 水平和乳酸生成测定来评估代谢功能。通过活力、循环分析、克隆形成测定、PCNA 摄取、伤口愈合、Transwell 测定和 MMP/EMT 标记物检测来评估细胞增殖和转移。乳腺癌中的乙酰化蛋白主要参与代谢，显着影响糖酵解和三羧酸循环。值得注意的是，PGK1 在赖氨酸 323 处表现出最高的乙酰化，并且在乳腺癌组织中表现出表达和乙酰化增加，特别是在 T47D 和 MCF-7 细胞中。值得注意的是，在 T47D 细胞中鉴定出 18 种乙酰转移酶或脱乙酰酶，其中 p300 和 Sirtuin3 已被验证与 PGK1 的相互作用。 323 K 的乙酰化通过提高其活性、葡萄糖摄取、ATP 产生和乳酸输出来增强 PGK1 的代谢作用。这种修饰还促进了细胞增殖，活力、S 期比例、克隆性和 PCNA 水平的增加证明了这一点。此外，PGK1-323 K 乙酰化促进转移，改善伤口愈合、细胞侵袭，上调 MMP2、MMP9、N-钙粘蛋白和波形蛋白，同时下调 E-钙粘蛋白。PGK1-323 K 乙酰化在 T47D 和 MCF-7 管腔中显着升高在乳腺癌细胞中，这种乙酰化可以通过 p300 和 Sirtuin3 进行调节。 PGK1-323 K 乙酰化促进细胞糖酵解、增殖和转移，突出了乳腺癌治疗的新表观遗传靶标。© 2024。作者。
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