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肿瘤
Frontiers in Pharmacology
2024
MeihuaLiu,YangDu,Dej...
Licochalcone A: a review of its pharmacology activities and molecular mechanisms.
Frontiers in Pharmacology
甘草源自甘草的根，是一种重要的中药，具有解毒、健脾、补气的功效。甘草查尔酮 A (Lico A) 是甘草的重要成分，因其分子多功能性和受体结合亲和力而引起人们的兴趣。本文探讨了甘草A在多种疾病中的具体作用，为其特性提供新的见解，指导甘草的合理使用。通过CNKI、PubMed、Google Scholar等数据库，以“甘草应用”、“Lico A药理活性”等术语进行综合文献检索，收集Lico A药理活性和作用机制的相关研究。 Lico A 是甘草中代表性的查尔酮，针对抗癌和抗炎活性的特定机制。它还在转录后调控中发挥作用。本综述描述了 Lico A 抗癌和抗炎机制的异同，并得出其通过转录后机制对非编码 RNA 的影响值得进一步探索的结论。版权所有 © 2024 Liu、Du 和 Gau。
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BMC Medical Research Methodology
2024 Aug 26
HaoningShen,Chengfen...
Assessing treatment effects with adjusted restricted mean time lost in observational competing risks data.
BMC Medical Research Methodology
根据恶性肿瘤患者的长期随访数据，评估治疗效果需要仔细考虑竞争风险。常用的特定原因风险比（CHR）和次分布风险比（SHR）是相对指标，可能在比例风险假设和临床解释方面提出挑战。最近，限制平均损失时间（RMTL）被推荐作为更好的临床解释的补充措施。此外，对于流行病学和临床环境中的观察性研究数据，由于混杂因素的影响，协变量调整对于确定治疗的因果效应至关重要。我们基于逆概率加权方法调整协变量后构建RMTL估计量，并导出方差以根据大样本属性构建区间估计。我们使用模拟研究来研究该估计器在各种情况下的统计性能。此外，我们进一步考虑了治疗效果随时间的变化，构建了动态 RMTL 差异曲线以及曲线相应的置信带。模拟结果表明，调整后的 RMTL 估计量与未调整的 RMTL 相比表现出更小的偏差，并在所有场景。该方法应用于真实的宫颈癌患者数据，揭示了宫颈小细胞癌患者预后的改善。结果显示，手术的保护作用仅在前20个月内显着，但长期效果并不明显。放疗在 17 至 57 个月的随访期间显着改善了患者的预后，而放疗联合化疗在整个期间显着改善了患者的预后。我们提出了一种易于解释和实施的方法，用于评估观察性竞争风险中的治疗效果数据。© 2024。作者。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Jul 26
MichaelFMendoza,Nina...
Exploring the Molecular Adaptations, Benefits, and Future Direction of Exercise Training: Updated Insights into Cardiovascular Health.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
这篇综述强调了全球公认的身体活动指南，并探讨了持续锻炼时发生的各种分子适应。必须强调心肺健康、肌肉力量和肌肉质量在降低死亡率和提高生活质量方面的关键作用。各种研究表明，心肺健康水平较高的个体的心血管死亡率和全因死亡率肯定会大幅降低。还对阻力训练进行了检查，同样，即使每周参与量最少，阻力训练也能显着降低死亡率。当深入研究分子机制时，很明显运动训练对某些心血管疾病有有利的影响，主要是由于它对增强脂质代谢、改善葡萄糖调节、调节炎症和氧化过程的能力以及诱导其他心脏保护作用（如改善心脏功能）有影响。交感神经张力和左心室重构。心血管疾病和恶性肿瘤也具有相同的危险因素，这解释了为什么运动还可以降低患多种癌症的风险。但尽管研究取得了这些进展，心血管疾病仍然普遍存在，这可能表明需要设计其他方法来促进身体活动的参与。这些方法可能包括更加强调增加锻炼依从性所带来的社会效益，而社区参与和健身追踪设备的技术进步则促进了这一点。我们的结论是，运动研究的未来方向应强调个性化或量身定制的运动计划的必要性，以使其对不同人群更具吸引力、更容易获得和更具包容性。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2024 Aug 21
PawelNowialis,Julian...
Genome-Wide Methylation Profiling of Peripheral T-Cell Lymphomas Identifies TRIP13 as a Critical Driver of Tumor Proliferation and Survival.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
胞嘧啶甲基化有助于哺乳动物基因表达和正常造血的调节。它由 DNA 甲基转移酶家族（包括 DNMT1、DNMT3A 和 DNMT3B）催化。外周 T 细胞淋巴瘤 (PTCL) 代表侵袭性成熟 T 细胞恶性肿瘤，表现出广泛的临床特征，预后不良，分子病理学了解不足。为了更好地了解分子格局并识别参与疾病维持的候选基因，我们对 PTCL 的 DNA 甲基化和基因表达进行了分析。我们发现 PTCL 中的甲基化模式失调且异质，但在所有样本中共有 767 个低甲基化和 567 个高甲基化差异甲基化区域 (DMR)，以及 231 个基因上调和 91 个基因下调，这表明与肿瘤发展存在潜在关联。我们进一步鉴定了 39 个与大多数 PTCL 基因表达增加相关的低甲基化启动子。这种假定的致癌特征包括 TRIP13（甲状腺激素受体相互作用蛋白 13）基因，该基因的遗传和药理学失活可通过诱导 G2-M 停滞和细胞凋亡来抑制 T 细胞系的增殖。因此，我们的数据表明，人类 PTCL 具有大量反复出现的甲基化改变，这些改变可能会影响对增殖至关重要的基因的表达，而这些基因的靶向可能有利于抗淋巴瘤治疗。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Sep 10
IndiraKundu,ShivaniV...
The multifaceted roles of circular RNAs in cancer hallmarks: From mechanisms to clinical implications.
Epigenetics & Chromatin
环状 RNA (circRNA) 代表一类独特的共价闭合 RNA 物种，缺乏传统的 5' 至 3' 极性。 circRNA 主要源自蛋白质编码基因的前 mRNA 转录物，通过外显子-外显子或外显子-内含子连接的反向剪接事件产生。它们表现出组织和细胞特异性的表达模式，并在调节细胞周期动力学、增殖、凋亡和分化等基本细胞过程中发挥关键作用。 CircRNA 通过表观遗传、转录和转录后水平的多种机制调节基因表达，有些甚至可以翻译成功能蛋白。最近，circRNA 的异常表达已成为控制癌症特征的复杂调控网络中的一种重要分子畸变。 circRNA 的肿瘤特异性表达模式和显着的稳定性对癌症诊断、预后和治疗具有深远的影响。这篇综述全面探讨了 circRNA 在各种肿瘤类型中跨癌症标志的多方面作用，强调了它们在癌症诊断和治疗干预中日益增长的重要性。它还详细介绍了利用基于 circRNA 的疗法的策略，并讨论了使用 circRNA 进行癌症管理的挑战，强调需要进一步研究来克服这些障碍。© 2024 作者。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug
DannaLiang,GaizhenKu...
Near-infrared light-responsive Nitric oxide microcarrier for multimodal tumor therapy.
Epigenetics & Chromatin
一氧化氮（NO）在肿瘤治疗中显示出巨大潜力，精确可控NO释放平台的开发仍需探索。在此，提出了一种微流体电喷雾策略，用于制造封装NO供体（S-亚硝基谷胱甘肽，GSNO）以及黑磷（BP）和化疗药物阿霉素（DOX）的水凝胶微球，作为肿瘤治疗的微载体。基于BP优异的光热性能和GSNO的热敏感性，微载体表现出近红外光（NIR）响应的NO释放行为。此外，微载体的光热性能加速了DOX的释放。这些都使得微载体通过结合NO疗法、光热疗法和化疗等多种治疗策略具有优异的肿瘤杀伤效果。此外，研究表明，NIR响应型NO递送微载体可以显着抑制肿瘤生长，并且在体内没有明显的副作用。因此，人们相信新型近红外响应型 NO 微载体是临床肿瘤治疗应用中很有前途的候选者。© 2023 作者。 Wiley‐VCH GmbH 代表中国科学院大学温州研究院出版的《智慧医疗》。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Aug
YuyanChen,ZhengyiZhu...
Roles of N6-methyladenosine epitranscriptome in non-alcoholic fatty liver disease and hepatocellular carcinoma.
Epigenetics & Chromatin
非酒精性脂肪肝病（NAFLD）是一种典型的慢性肝病，与发生肝细胞癌（HCC）的高风险有关。 NAFLD 和 HCC 的发展与表观遗传学的变化有关，例如组蛋白修饰和微小 RNA (miRNA) 介导的过程。最近，在表观转录组学领域，RNA 改变已成为重要的调节因子。 N6-甲基腺苷 (m6A) 是控制 mRNA 稳定性、剪接和翻译的最常见和最关键的改变。它对于控制肝病进展和肝功能尤其重要。本综述旨在总结 m6A 表观转录组在 NAFLD 和 HCC 发展背后的分子机制中的功能的最新研究，特别关注 m6A 改变对 HCC 发展的影响及其在 NAFLD 进展为 HCC 中的可能作用。此外，该综述还讨论了 m6A 改变对 NAFLD 和 HCC 治疗和诊断的可能影响。重要的是要记住，m6A 修饰是一种可逆行为，通过写入和删除蛋白质的协调功能控制，从而能够快速适应环境变化。该综述还讨论了 m6A 结合蛋白在 mRNA 选择性剪接、翻译和降解中的功能及其调节 mRNA 稳定性和加工的能力。了解 RNA 修饰调控及其在 HCC 和 NAFLD 出现中的作用可能为诊断和治疗这些疾病提供新途径。© 2023 作者。 Wiley‐VCH GmbH 代表中国科学院大学温州研究院出版的《智慧医疗》。
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Epigenetics & Chromatin
2024
JuliaNiebora,Sławomi...
The role of ncRNAs and exosomes in the development and progression of endometrial cancer.
Epigenetics & Chromatin
子宫内膜癌（EC）是最常见的妇科癌症之一。近年来，研究重点关注肿瘤的遗传特征，以详细说明其预后并制定治疗方案。就 EC 而言，基因突变已被证明是其形成的基础。了解与雌激素等诱导突变相关的 EC 形成机制非常重要。非编码 RNA (ncRNA) 由蛋白质编码能力极低的核苷酸转录物组成，已被证明非常重要。它们在许多恶性肿瘤中的表达模式可以抑制肿瘤的形成和进展。它们还在表观遗传、转录和转录后水平上调节蛋白质编码。 MicroRNA (miRNA) 的多种类型与正常子宫内膜及其肿瘤相关，在基因表达中也发挥着特别重要的作用。 miRNA 和长链非编码 RNA (lncRNA) 影响 EC 组织中的许多通路，并在癌症发生、侵袭和转移以及通过抑制癌症干细胞凋亡和进展等机制对抗癌药物产生耐药性中发挥重要作用。还值得注意的是，miRNA 具有高度精确性、敏感性和稳健性，使其成为诊断妇科癌症及其进展的潜在标记。不幸的是，随着 EC 发病率的增加，治疗变得具有挑战性并且仅限于侵入性工具。使用 microRNA 作为 EC 诊断和治疗用途的潜在候选者的前景似乎很有希望。外泌体是多种细胞（包括癌细胞）释放的细胞外囊泡。它们含有蛋白质、DNA 和各种类型的 RNA，例如 miRNA。外泌体的非编码 RNA 成分差异很大，具体取决于肿瘤组织及其来源细胞的生理学。外泌体含有DNA和RNA，具有细胞间通讯功能。外泌体 miRNA 介导 EC 细胞、肿瘤相关成纤维细胞 (CAF) 和肿瘤相关巨噬细胞 (TAM) 之间的通讯，并在肿瘤细胞增殖和肿瘤微环境形成中发挥关键作用。肿瘤外泌体携带的癌基因诱导靶细胞恶性转化。在外泌体的合成过程中，遗传和蛋白质组数据等各种因素都会上调。因此，通过分析外泌体中包含的生物标志物，它们被认为是子宫内膜癌诊断和预后的一个有趣的治疗靶点。来自 EC 患者血浆的外泌体中 miRNA，尤其是 miR-15a-5p 的表达升高。这可能表明该生物标志物在 EC 诊断中的重要用途。近年来，研究人员对子宫内膜癌的预后标志物这一主题产生了兴趣，因为已识别的标志物仍然太少，无法支持子宫内膜癌的有限治疗。进一步研究 ncRNA 和外泌体对 EC 的影响可能会实现癌症治疗的突破。版权所有 © 2024 Niebora、Woźniak、Domagała、Data、Farzaneh、Zehtabi、Dari、Pour、Bryja、Kulus、Mozdziak、Dzięgiel 和 Kempisty。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Jul
MuhammedYTaha,NohaOM...
CCND1 as a Prognostic and Diagnostic Biomarker and the Impact of Its Epigenetic Alterations on Cancer Survival.
Epigenetics & Chromatin
细胞周期蛋白 D1 (CCND1) 在细胞周期调节中发挥着至关重要的作用，并与多种癌症有关。众所周知，癌症是由基因组中有害变异的积累引起的。在这项研究中，我们阐明了 CCND1 在癌症诊断和进展中的作用，旨在对多种癌症类型中的 CCND1 进行全面分析，重点关注其表达、临床相关性、DNA 甲基化状态、预后影响、遗传改变使用 TIMER、GEPIA 和 UALCAN 数据库对 33 种癌症类型进行 CCND1 基因表达分析。研究临床参数以评估它们与 CCND1 表达的相关性。使用 UALCAN 和 GSCA 数据库进行甲基化分析，以研究 CCND1 启动子甲基化和基因表达之间的关系及其与生存的关联。进行免疫浸润和生存分析，以探讨 CCND1 表达在各种癌症中的预后意义。使用 Cox 比例风险模型和 Kaplan-Meier 分析等统计检验来评估生存结果。此外，使用 cBioPortal 数据库进行遗传改变分析，以检查不同癌症类型中 CCND1 改变的患病率和类型。与正常组织相比，CCND1 表达在 13 种癌症中显着升高，在不同癌症类型中观察到不同的模式。它在 BLCA、CHOL、COAD、ESCA、GBM、HNSC、KIRC、PAAD、RRAD、READ、STAD、THCA 和 UCEC 中高度表达。临床参数的调查揭示了 CCND1 表达与年龄、性别、种族和癌症分期等因素之间的关联。甲基化分析强调了 CCND1 在 13 种选定癌症类型中的低甲基化。生存分析确定了 CCND1 表达在不同癌症中的有利和不利的预后影响，并揭示了 CCND1 的高表达与 HNSC 和 PAAD 的不良预后相关，而 CCND1 的高表达与 KIRC 的良好预后相关。 STAD、THCA 和 UCEC。在各种癌症的免疫浸润分析中，观察到免疫细胞类型和肿瘤纯度之间存在许多统计学上显着的相关性。例如，在 BLCA 中，中性粒细胞和树突状细胞显示出统计学上显着的正相关性，而与巨噬细胞则显示出显着的负相关性。而在 CHOL 患者中，没有一种免疫细胞类型显示出显着的相关性。在具有不同免疫细胞类型的其他癌症类型中也观察到类似的统计显着性，例如 COAD、HNSC、GBM、KIRC、PAAD、PRAD、READ 和 STAD。基因改变分析显示，扩增是 CCND1 中主要的基因改变类型，在不同的癌症类型中观察到特定的模式。这项研究的结果为了解 CCND1 在癌症诊断和进展中的作用及其靶向治疗的潜力提供了宝贵的见解。 。 CCND1 可用作 COAD、ESCA、KIRC、READ、STAD 和 THCA 阶段的潜在诊断生物标志物。此外，CCND1 可用作 HNSC、KIRC 和 PAAD 的潜在预后生物标志物。此外，CCND1 甲基化和表达之间的相关性可用作 ESCA、HNSC 和 STAD 的潜在诊断和预后生物标志物。版权所有 © 2024，Taha 等人。
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Epigenetics & Chromatin
2024
WennaLiu,YujiaZhao,Q...
Systematic bioinformatics analysis reveals the role of shikonin in blocking colon cancer progression by identifying senescence-induced genes.
Epigenetics & Chromatin
紫草素是一种从紫草植物中提取的天然萘醌化合物，具有抗肿瘤、抗炎和抗菌特性。细胞衰老在预防肿瘤进展中起着关键作用。目前尚不清楚紫草素是否对结肠癌细胞衰老有影响。在本研究中，我们首先测定了紫草素对结肠癌细胞系HT29和HCT116的IC50值。然后，我们使用细胞计数试剂盒8、集落形成和伤口愈合实验验证了紫草素对结肠癌细胞系HT29和HCT116的增殖和迁移能力的抑制作用。接下来，我们使用高通量 mRNA 测序确定了一系列潜在靶标，并确定了 210 个上调基因和 296 个下调基因。 KEGG 分析揭示了八个与细胞衰老相关的下调基因：CCNB3、IL-1α、CXCL8、CDKN2A、MYC、IGFBP3、SQSTM1 和 GADD45G。其中，CXCL8和CDKN2A与结肠癌患者的不良预后相关，表明紫草素下调它们的表达可以提高患者的生存率。此外，SA-β-半乳糖苷酶染色显示，紫草素处理后结肠癌细胞的细胞衰老百分比显着增加。分子对接显示紫草素通过阻断 CXCL8 活性来抑制结肠癌进展。基于这些发现，我们认为紫草素可能通过下调CDKN2A和CXCL8来诱导结肠癌细胞衰老并发挥抗肿瘤活性。这为紫草素抑制结肠癌进展提供了新的分子机制和潜在的治疗靶点。版权所有©2024 Liu，Zhao，Liu，Wu，Li，Fu，Yang和Liang。
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