缺血性心脏病严重威胁人类健康，甚至导致死亡。 Kirenol 主要源自豨莶草植物，具有广泛的生物效应（如抗菌、抗炎、抗癌和心脏保护）。然而，kirenol 在心肌缺血/再灌注损伤（MI/RI）中的调节作用和相关机制仍不清楚。本研究首先建立MI/RI大鼠模型。结果表明，kirenol 可防止 MI/RI 大鼠心功能恶化。此外，炎症是由缺血再灌注（IR）引起的，同样也受到基雷诺（kirenol）（5或10 mg/kg）的影响。此外，红外线还会增强氧化应激，而这一过程可被 kirenol 抵消。接下来，发现 IR 后细胞凋亡增加，但这种效应被 kirenol 中和。最后，人们发现 kirenol 具有阻断 NF-κB 通路激活的能力。总之，kirenol 通过调节 NF-κB 通路减轻炎症和氧化应激，从而改善大鼠的 MI/RI。这项工作可能为寻找治疗 MI/RI 的有用药物提供新颖的见解。版权所有 © 2024 Wolters Kluwer Health, Inc. 保留所有权利。

肺癌是全世界癌症死亡的主要原因。 KRAS 癌基因导致至少四分之一的肺腺癌（肺癌的主要亚型）。经过四十年的深入研究，KRAS 癌蛋白的选择性抑制剂终于进入临床。然而，由于耐药性的迅速出现，它们对总体生存的影响有限，这可能是这些肿瘤的高瘤内异质性特征的结果。在这项研究中，我们试图确定在肿瘤发展的最早阶段 KRAS 癌蛋白表达导致的功能改变。无论是否存在其他同时发生的突变，这种功能变化都可能在肿瘤进展的整个过程中持续存在。对表达 Kras 常驻癌基因的小鼠肺泡 2 型细胞的单细胞 RNA 测序分析显示，I 型干扰素途径受损，这是在整个肿瘤进展过程中持续存在的特征。这种改变也存在于含有 p53 或 LKB1 肿瘤抑制因子额外突变的晚期小鼠和人类肿瘤中。通过 IFN-β 或干扰素基因组成型活性刺激物 (STING) 表达恢复 I 型干扰素 (IFN) 信号对肿瘤微环境产生深远影响，将肿瘤从免疫学“冷”肿瘤转变为免疫学“热”肿瘤。因此，无论 p53 或 LKB1 是否同时发生突变，I 型 IFN 通路的增强都使 KRAS 突变肺肿瘤易于接受免疫治疗。

抗体药物偶联物 (ADC) 已成为一类有前景的靶向癌症治疗药物。进一步的改进对于释放其全部潜力至关重要，目前其潜力因缺乏经过验证的目标和有效载荷而受到限制。开发有效 ADC 的基本方面涉及表面抗原的识别，理想地将目标肿瘤细胞与健康类型区分开来，均匀表达，并伴有能够选择性靶向的高效有效负载。在这项研究中，我们利用 Lantern Pharma 专有的 AI 平台药物定位和救援响应算法 (RADR®) 集成了来自 Human Protein Atlas、Xenabrowser 和 Gene Expression Omnibus 的转录组学、蛋白质组学、免疫组织化学和细胞表面膜数据集。我们将其与基于证据的过滤相结合来识别具有改进的肿瘤选择性的 ADC 靶点。我们的分析确定了一组 82 个靶标和总共 290 个靶标适应症组合，用于有效的肿瘤靶向。我们通过针对 22 种肿瘤亚型查询 TCGA 突变数据库中的 416 个基因，评估了肿瘤突变对靶标表达水平的影响。此外，我们还使用 NCI 开发治疗计划编制了一份化合物目录，以识别潜在的有效负载。我们的有效负载挖掘策略根据从 pM 到 10 nM 范围的 GI50 值，结合 9 种不同癌症适应症的敏感性模式，将 729 种化合物分为三个子类。我们的结果确定了各种不同的目标和有效载荷，这可以为精确 ADC 定位提供多种选择。我们提出了一种初步方法来确定合适的目标-指示-有效负载组合，作为开发未来 ADC 候选者的宝贵起点。版权所有：© 2024 Kathad 等人。这是一篇根据知识共享署名许可条款分发的开放获取文章，允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制，前提是注明原始作者和来源。

合成致死率（SL）和合成活力（SV）是癌症靶向治疗方法中经常研究的遗传相互作用。在 SL 中，抑制任何一个基因都不会影响癌细胞的存活，但抑制这两个基因会导致致命的表型。在 SV 中，抑制脆弱基因会使癌细胞生病；抑制伴侣基因可挽救并促进细胞活力。许多低通量和高通量实验方法已被用来识别 SL 和 SV，但它们既耗时又昂贵。 SL 预测的计算工具涉及统计和机器学习方法。几乎所有机器学习工具都是二元分类器，并且仅涉及识别 SL 对。最重要的是，已知能够最好地描述和区分 SL 和 SV 的属性有限。我们开发了 MAGICAL（通过算法学习实现癌症遗传相互作用的多类方法），这是一种基于多类随机森林的机器学习模型，用于遗传相互作用预测。源自物理蛋白质-蛋白质相互作用的蛋白质的网络特性被用作对 SL 和 SV 进行分类的特征。该模型的训练数据集（CGIdb、BioGRID 和 SynLethDB）准确率约为 80%，并且在 DepMap 和其他实验得出的报告数据集上表现良好。在所有网络属性中，最短路径、平均neighbor2、平均介数、平均三角形和粘附力具有显着的判别力。 MAGICAL 是第一个识别合成致命和可行相互作用的歧视特征的多类模型。 MAGICAL 可以比任何现有的二元分类器更准确地预测 SL 和 SV 相互作用。版权所有：© 2024 Dey 等人。这是一篇根据知识共享署名许可条款分发的开放获取文章，允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制，前提是注明原始作者和来源。

癌症驱动基因的鉴定对于癌症的早期发现、有效治疗和精准医疗至关重要。癌症是由多个基因在不同调节水平上的失调引起的。然而，当前的技术只能捕获有限数量的监管信息，这可能会阻碍其有效性。在本研究中，我们提出了 IMI-driver 模型，该模型将多组学数据集成到八个生物网络中，并应用多视图协作网络嵌入将生物网络中的基因调控信息嵌入到低维向量空间中以识别癌症司机。我们将 IMI 驱动程序应用于癌症基因组图谱 (TCGA) 中的 29 种癌症类型，并在 9 个基准数据集上将其性能与其他 9 种方法进行比较。 IMI-driver 优于其他方法，证明多级网络集成提高了预测准确性。我们还使用 IMI-driver 识别的基因进行泛癌分析，这证实了我们选择的几乎所有候选基因都是已知或潜在的驱动基因。新阳性基因的案例研究表明它们在癌症发生和进展中的作用。版权所有：© 2024 Shi et al.这是一篇根据知识共享署名许可条款分发的开放获取文章，允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制，前提是注明原始作者和来源。

在许多低收入和中等收入国家，结直肠癌的发病率和死亡率仍在快速上升，这与当前的社会和经济状况有关。结直肠癌是埃塞俄比亚的主要癌症，其生存率相对较低。然而，埃塞俄比亚南部结直肠癌患者的生存时间和预测因素尚未得到充分研究。本研究旨在评估埃塞俄比亚哈瓦萨综合专科医院结直肠癌患者的五年生存率和死亡率预测因素。基于设施的回顾性队列研究对2017年5月1日至2022年4月30日访问哈瓦萨综合专科医院的323名患者进行了研究。采用Log-rank检验的Kaplan-Meier生存曲线来估计生存时间。采用双变量和多变量 Cox 比例风险回归模型来确定每个自变量对诊断后死亡时间的净效应。在 5 年观察期内，总体死亡率为 38.5%，发病密度为每年 31 人死亡。 100人年观察。 1年、2年、3年、4年和5年的生存率分别为78%、53、32.4%、23.3%和18.7%。多变量分析显示，转移性疾病（AHR=4.2，CI：1.5-11.5），基线癌胚抗原水平≥5ng/ml（AHR：2.4，CI：1.2-5.8），居住在农村地区（AHR=2.2，CI： 1.03-4.8）和粘液癌（AHR = 0.33，CI：0.13-0.87）是结直肠癌死亡率的独立预测因子。与发展中国家和发达国家的类似研究相比，该研究中结直肠癌患者的总生存率较低。晚期、癌胚抗原水平升高和农村居民的生存率明显较低，这表明早期发现和及时开始治疗对于提高结直肠癌患者的生存和生活质量至关重要。版权所有：这是开放获取文章，不受任何版权限制，任何人都可以出于任何合法目的自由复制、分发、传播、修改、构建或以​​其他方式使用。该作品在知识共享 CC0 公共领域奉献下提供。

炎症是肾损伤的主要原因。白细胞介素 (IL)-1 家族细胞因子 IL-33 从受损细胞中释放出来，并通过在许多细胞类型（包括调节性 T 细胞 (Treg)）上表达的受体 ST2 调节免疫反应。虽然已提出 IL-33 具有促炎作用，但外源性 IL-33 可以扩大 Tregs 并抑制肾脏炎症。然而，内源性 IL-33/ST2 对 Tregs 在肾损伤缓解中的作用尚未进行研究。我们使用小鼠肾缺血再灌注损伤和肾类器官来描述 ST2 和双调蛋白 (AREG) 的作用特别是在 Treg 细胞中使用靶向删除。分别对来自脾脏的流式分选的 Tregs 和来自缺血后肾脏的 CD4 T 细胞进行了批量和单细胞 RNA 测序。使用同基因肾类器官和 Treg 细胞在低氧条件下的新型共培养系统分析了 ST2 充足的 Tregs 的保护作用。脾脏的批量 RNA 测序和肾 T 细胞的单细胞 RNA 测序表明 ST2 Treg 富含与 Treg 增殖和功能相关的基因。 ST2 Tregs 中也富集了 AREG 等修复因子的基因。在单侧缺血再灌注损伤模型中，Treg 特异性删除 ST2 或 AREG 会加剧肾损伤和纤维化。在共培养研究中，WT（而非 ST2 缺陷型）Treg 保留了缺氧引起的肾类器官活力丧失，通过补充 AREG 可恢复这种活力。我们的研究确定了 IL-33/ST2 通路在 Tregs 中的作用，以解决肾损伤。 ST2 Tregs 的转录组富含包括 AREG 在内的修复因子。 Tregs 中 ST2 或 AREG 的缺乏会加重肾损伤。 Tregs 以 ST2 和 AREG 依赖性方式保护肾脏类器官免受缺氧影响。因此，基于 Treg 的方法可能有益于解决肾损伤。美国肾脏病学会版权所有 © 2024。

结直肠癌（CRC）是全球第三大癌症。乳酸菌可以调节肠道屏障和肠道微生物群。然而，乳酸菌缓解结直肠癌的机制仍不清楚。本研究旨在探讨植物乳杆菌对结直肠癌的调节作用及其潜在机制。与 ApcMin/ 小鼠的磷酸盐缓冲溶液 (PBS) 治疗相比，CCFM8661 治疗显着改善了 CRC。此外，通过分子生物学技术证明共轭亚油酸（CLA）是CCFM8661改善结直肠癌的关键代谢物。抑制剂干预实验证明过氧化物酶体增殖物激活受体γ（PPAR-γ）是改善结直肠癌的关键受体。此外，补充 CCFM8661 通过产生 CLA 抑制 NF-κB 通路和促炎细胞因子，上调 ZO-1、Claudin-1 和 MUC2，并以 PPAR-γ 依赖性方式促进肿瘤细胞凋亡，从而改善 CRC。宏基因组分析表明，CCFM8661 治疗显着增加了内脏恶臭杆菌，可以通过修复肠道屏障来改善结直肠癌。临床结果显示，CRC患者肠道CLA、丁酸、PPAR-γ、乳酸菌明显下降，且这些指标与CRC呈显着负相关。 CCFM8661 通过 CLA-PPAR-γ 轴改善肠道屏障，从而缓解 CRC。这些结果将促进结直肠癌膳食益生菌补充剂的开发。

细胞培养的结构（二维 (2D) 与三维 (3D)）显着影响各种细胞因素，包括细胞间相互作用、营养和氧气梯度、代谢活动和基因表达谱。这可能会导致癌症药物治疗期间不同的细胞反应，3D 培养的细胞通常对化疗药物表现出更高的耐药性。虽然各种遗传和蛋白质组分析已被用来研究这种耐药性增加的潜在机制，但提供空间分子分析数据实验证据的补充技术是有限的。受激拉曼散射 (SRS) 显微镜已证明其能够测量细胞内药物摄取和生长抑制。在这项工作中，我们将三波段（C-D、C-H 和指纹区域）SRS 成像应用于 2D 和 3D 细胞培养物，并对药物摄取和反应进行比较分析，目的是了解药物摄取的差异是否可以解释药物与 2D 培养相比，3D 培养中的耐药性。我们的研究表明，尽管拉帕替尼治疗期间 2D 和 3D A549 细胞的细胞内药物水平相似，但 3D 球体的生长受到的影响较小，支持 3D 微环境中药物耐受性的增强。我们进一步阐明了药物渗透模式以及由此产生的跨不同球体层的异质细胞反应。此外，我们研究了细胞外基质在调节药物递送和细胞反应中的作用，并发现 3D 中有限的药物渗透也可能导致药物反应降低。我们的研究为癌症药物治疗期间 3D 肿瘤模型中耐药性增加的复杂机制提供了宝贵的见解。

结直肠癌 (CRC) 是全球第三大常见癌症，也是癌症相关死亡的第二大主要原因。最近，新兴研究强调了全细胞凋亡（PANoptosis）在肿瘤发展和抗肿瘤治疗中的作用。在本研究过程中，我们仔细鉴定了CRC中与PANoptosis相关的差异表达基因（CPAN_DEGs）与免疫细胞比例之间的相关性分析。随后，我们根据 CPAN_DEG 制定了预后评分。进一步我们的分析显示，经 qRT-PCR 测定验证，HCT116、HT29 和 SW480 细胞内 UNC5D mRNA 表达显着减少。此外，仔细检查 TCGA 数据库揭示了一个独特的趋势，其中 UNC5D 表达低的个体与 UNC5D 水平高的个体相比，总体生存率显着降低。进一步对UNC5D进行药敏分析，结果表明UNC5D与CRC对6-硫鸟嘌呤的敏感性相关。我们的调查结果强调了 PANoptosis 影响免疫失调以及 CRC 预后结果的机制。版权所有：© 2024 张等人。这是一篇根据知识共享署名许可条款分发的开放获取文章，允许在任何媒体上不受限制地使用、分发和复制，前提是注明原始作者和来源。