研究动态
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NATURE IMMUNOLOGY
2024 Aug 23
ChristineYiwenYeh,Ka...
Mapping spatial organization and genetic cell-state regulators to target immune evasion in ovarian cancer.
NATURE IMMUNOLOGY
免疫逃避的驱动因素尚不完全清楚,这限制了癌症免疫疗法的成功。在这里,我们应用单细胞空间和微扰转录组学来描述高级别浆液性输卵管卵巢癌的免疫逃避。为此,我们首先通过对 94 名患者的 130 个肿瘤中超过 250 万个原位细胞进行分析,绘制了高级浆液性输卵管卵巢癌的空间组织图。这揭示了一种反映肿瘤遗传学的恶性细胞状态,并可预测 T 细胞和自然杀伤细胞的浸润水平以及对免疫检查点封锁的反应。然后,我们进行了 Perturb-seq 筛选并鉴定了触发这种恶性细胞状态的遗传扰动(包括敲除 PTPN1 和 ACTR8)。最后,我们表明,正如预测的那样,这些扰动以及 PTPN1/PTPN2 抑制剂使卵巢癌细胞对 T 细胞和自然杀伤细胞的细胞毒性敏感。因此,本研究确定了通过将遗传变异、细胞状态调节器和空间生物学联系起来来研究和瞄准免疫逃避的方法。© 2024。作者。
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MOLECULAR CELL
2024 Aug 14
SimoneTamburri,Saman...
Navigating the complexity of Polycomb repression: Enzymatic cores and regulatory modules.
MOLECULAR CELL
多梳蛋白是一种基本的抑制系统,通过协调控制细胞身份的细胞类型特异性转录程序来发挥至关重要的发育作用。 Polycomb 活性的直接改变确实与人类病理有关,包括发育障碍和癌症。一般性 Polycomb 抑制由三种不同的活性协调,调节两种组蛋白翻译后修饰的沉积:组蛋白 H3 赖氨酸 27 (H3K27me3) 和组蛋白 H2A 赖氨酸 119 (H2AK119ub1) 的三甲基化。这些活性存在于大型且异质的多蛋白整体中,该整体由共同的酶核心组成,并受到异质非催化模块的调节,而异质非催化模块由大量具有不同生化特性的辅助蛋白组成。在这里,我们分析了当前的分子知识,重点关注核心酶活性及其由不同辅助模块介导的调节之间的功能相互作用。这提供了对控制 Polycomb 抑制的建立和维持的分子细节的全面分析,检查其潜在的协调并突出显示缺失的信息和 Polycomb 介导的转录控制的新特征。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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MOLECULAR CELL
2024 Aug 16
NirmalyaDasgupta,Xue...
Histone chaperone HIRA, promyelocytic leukemia protein, and p62/SQSTM1 coordinate to regulate inflammation during cell senescence.
MOLECULAR CELL
细胞衰老是一种与炎症衰老相关分泌表型 (SASP) 相关的应激诱导的稳定增殖停滞,是衰老的一个原因。在衰老细胞中,细胞质染色质片段 (CCF) 通过抗病毒 cGAS/STING 途径激活 SASP。早幼粒细胞白血病 (PML) 蛋白组织 PML 核体 (NB),其也参与衰老和抗病毒免疫。 HIRA 组蛋白 H3.3 伴侣定位于衰老细胞中的 PML NB。在这里,我们表明 HIRA 和 PML 对于 SASP 表达至关重要,与 HIRA 对 PML NB 的定位紧密相关。 HIRA 失活不会直接阻断核因子 κB (NF-κB) 靶基因的表达。相反,H3.3 独立的 HIRA 功能通过 CCF-cGAS-STING-TBK1-NF-κB 途径激活 SASP。 HIRA 与 p62/SQSTM1(一种自噬调节因子和负 SASP 调节因子)发生物理相互作用。 HIRA 和 p62 共定位于 PML NB,与其对 SASP 的拮抗调节有关,PML NB 控制其空间配置。这些结果概述了 HIRA 和 PML 在 SASP 监管中的作用。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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JOURNAL OF PAIN AND SYMPTOM MANAGEMENT
2024 Aug 21
PaigeComstockBarker,...
Predictors of Specialty Outpatient Palliative Care Utilization Among Persons with Serious Illness.
JOURNAL OF PAIN AND SYMPTOM MANAGEMENT
门诊姑息治疗 (OPC) 使患有严重疾病的人受益,但在使用中存在障碍。旨在确定与 OPC 诊所使用相关的因素。急诊医学姑息治疗访问是一项多中心、随机对照试验,比较了从以下机构招募的患者的两种姑息治疗模式:急诊科 (ED):护士主导的电话病例管理和 OPC(每月一次就诊,持续 6 个月)。患者年龄为 50 岁,患有晚期癌症或终末期器官衰竭,从 19 名急诊室招募。使用混合效应障碍模型,我们分析了与 OPC 使用相关的患者、提供者、诊所和医疗保健系统因素。在随机接受 OPC 的 603 名患者中,约一半 (53.6%) 的患者至少参加过一次门诊就诊。与具有大学或更高学历的患者相比,高中以下学历的患者参加初次就诊的可能性较小(aOR 0.44;CI 0.23,0.85),需要大量帮助的患者(aOR 0.45;CI 0.25,0.82)或仅患有充血性心力衰竭(aOR 0.46;CI 0.26,0.81)。症状负担较高的患者首次就诊的就诊率较高(aOR 1.05;CI 1.00,1.10)。老年人(aRR 0.90;CI 0.82,0.98)、女性(aRR 0.84;CI 0.71,0.99)和从未结婚的人(aRR 0.62;CI 0.52,0.87)的随访率降低。提高 OPC 利用率的努力应集中于那些教育程度较低、功能受限较多、年龄较大、女性和社会支持较少的人。试验注册 CLINICALTRIALS.NCT03325985.版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY
2024 Aug 21
XiaoaiZhang,JianYang...
Antiviral activity of Morus alba L. extract against pseudorabies virus.
JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY
桑树在中国、日本、韩国等亚洲国家广泛用作民族药和功能食品。桑树具有抗病毒、抗氧化、抗胆固醇、抗癌、降血糖、神经保护等多种药理活性。桑树已表现出对流感病毒、SARS-CoV-2等病毒的抗病毒功效,但其抗伪狂犬病病毒(PRV)的潜在活性仍不确定。本研究致力于深入研究桑树的抗伪狂犬病病毒(PRV)潜力。桑叶乙醇提取物(MLE),同时阐明其潜在作用机制。通过qPCR和免疫印迹法评估不同浓度桑树提取物的抗PRV活性。通过 qPCR 和间接免疫荧光测定检测 MLE 在三种不同治疗模式(预处理、联合治疗和后治疗)中对 PRV 复制的抑制作用。 qPCR 用于研究 MLE 对 PRV 感染细胞中 PRV 附着、进入和细胞因子表达的影响。通过UPLC-MS/MS对MLE中的化学成分进行分析。MLE以剂量依赖的方式显着抑制PRV复制和蛋白表达。 MLE 在三种不同的治疗模式下显示出对 PRV 的抑制作用。 MLE在联合治疗模式下的抑制效果最为显着,抑制率为99.42%。 MLE 在早期阶段抑制 PRV 感染。 MLE 通过影响病毒附着和病毒进入来抑制 PRV 感染。此外,MLE 通过减轻 PRV 引发的细胞因子(TNF-α 和 IFN-α)表达升高来抑制 PRV 复制。对其化学成分的分析表明,酚酸和黄酮类化合物是MLE的主要成分。结果表明,MLE通过抑制病毒吸附和进入,同时抑制抗病毒细胞因子的表达,有效阻止PRV感染。因此,MLE 可能是开发治疗人类和动物 PRV 感染的新药物的潜在资源。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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JOURNAL OF CLINICAL EPIDEMIOLOGY
2024 Aug 21
BaihuiYan,MinLi,Jiax...
Adherence to PRISMA-A and reporting was suboptimal in meta-analysis abstracts on drug efficacy for tumors: a literature survey.
JOURNAL OF CLINICAL EPIDEMIOLOGY
为了评估关于 PRISMA-A 依从性方面的肿瘤药物疗效荟萃分析摘要的报告,并确定与 PRISMA-A 依从性相关的潜在因素。使用改编自 PRISMA-A 的清单评估了总共 3211 份合格的荟萃分析摘要。 PRISMA-A 声明。通过 PRISMA-A 总评分和依从率 (AR) 分析对 PRISMA-A 的依从性。采用独立样本t检验比较不同特征的两组间总分的差异,多组间采用方差分析(ANOVA)或Kruskal-Wallis检验。采用Pearson相关系数衡量字数与PRISMA-A总分之间的相关性。总分平均为8.11(±1.76),依从率(AR)为57.94%。 AR 较低的项目是资金(AR=0.93%)、注册(AR=3.86%)和偏倚风险(AR=7.85%)。 PRISMA-A 发布后发表的荟萃分析表明 PRISMA-A 具有更好的依从性。与非结构化摘要相比,结构化摘要在 PRISMA-A 中的每个项目都有更高的 AR。摘要字数与 PRISMA-A 总分呈正相关(r = 0.358,P < 0.001)。在肿瘤药物疗效的荟萃分析摘要中,PRISMA-A 的依从性不是最理想的,尽管 PRISMA-A 的依从性在PRISMA-A 的发布。应采取各种措施来提高 PRISMA-A 的合规性并加强荟萃分析摘要的报告,包括 PRISMA-A 的期刊认可、更严格遵守 PRISMA-A 的要求、放宽摘要字数限制等。版权所有 © 2024爱思唯尔公司出版。
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JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE
2024 Aug 23
AdamGermain,AlexSabo...
Machine learning enabled classification of lung cancer cell lines co-cultured with fibroblasts with lightweight convolutional neural network for initial diagnosis.
JOURNAL OF BIOMEDICAL SCIENCE
肺癌亚型的识别对于患者(尤其是晚期患者)的成功治疗至关重要。许多先进的个人治疗需要了解特定突变以及基因的上调和下调,才能有效靶向癌细胞。虽然许多研究侧重于单个细胞结构并深入研究基因测序,但本研究提出了一种基于 2D 共培养环境中低放大倍数癌症生长模式的肺癌分类机器学习方法。使用磁力孔板支架,在成纤维细胞中生成圆形肺癌细胞簇,并每天捕获图像以监测 9 天内的癌症生长情况。然后对这些生长图像进行增强,并用于训练基于轻量级 TinyVGG 架构的卷积神经网络 (CNN) 模型。该模型使用代表 NSCLC 三种亚型的成对类别进行训练:A549(腺癌)、H520(鳞状细胞癌)和 H460(大细胞癌)。目的是评估这种轻量级机器学习模型是否能够准确地对处于癌症生长不同阶段的三种肺癌细胞系进行分类。此外,还使用 ​​CNN 模型捕获并分类了两种源自患者的肺癌细胞的癌症生长图像,其中一种带有 KRAS 癌基因,另一种带有 EGFR 癌基因。该演示旨在研究机器学习支持的肺癌分类的转化潜力。轻量级 CNN 模型在 A549、H460 和 H520 生长 1 天时实现了超过 93% 的分类准确率,并在生长 7 天时达到 100% 的分类准确率。生长出来的。此外,该模型在 4 天后对患者来源的肺癌细胞实现了 100% 的分类准确率。尽管这些细胞被归类为腺癌,但它们的生长模式根据其癌基因表达(KRAS 或 EGFR)而有所不同。这些结果表明,在没有网络或云连接的笔记本电脑上本地运行的轻量级 CNN 架构可以有效地创建机器学习-该模型能够根据肺癌细胞亚型(包括来自患者的肺癌细胞亚型)在周围成纤维细胞存在的情况下的生长模式进行准确分类。这一进展强调了机器学习增强早期肺癌亚型分型的潜力,为改善晚期患者的治疗结果提供了有希望的途径。© 2024。作者。
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Int J Biol Macromol
2024 Aug 21
SenmiaoZhang,NaLiu,P...
LncRNA BC200 promotes the development of EBV-associated nasopharyngeal carcinoma by competitively binding to miR-6834-5p to upregulate TYMS expression.
Int J Biol Macromol
鼻咽癌(NPC)与EB病毒(EBV)感染密切相关。长链非编码 RNA (lncRNA) 在癌症中发挥着重要作用。然而,lncRNA 在 EBV 相关 NPC 中作用的分子机制仍不清楚。在这项研究中,我们证实了lncRNA脑细胞质200(BC200)的表达在EBV感染的NPC细胞和组织中显着增加。 BC200 促进 NPC 细胞的生长和迁移,表明它通过作为癌基因参与 NPC 的进展。从机制上讲,BC200 通过海绵和抑制 miR-6834-5p 发挥 ceRNA 的作用。据报道,胸苷酸合成酶(TYMS)的高表达通过未知机制成为鼻咽癌预后不良的独立指标,在本研究中被确定为 miR-6834-5p 的靶基因。 BC200 以依赖于 miR-6834-5p 的方式上调 TYMS 表达。 TYMS在EBV阳性的鼻咽癌细胞和组织中异常表达,异位表达有助于鼻咽癌细胞的增殖和迁移。本研究强调了 EBV 上调的 lncRNA BC200 在促进 NPC 发展中的作用,表明 BC200 介导的 ceRNA 网络可能是诊断和治疗 EBV 相关 NPC 的有价值的生物标志物。版权所有 © 2024。出版者爱思唯尔有限公司
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Int J Biol Macromol
2024 Aug 21
HuixinXu,HeMa,Yannan...
Propylene glycol alginate sodium sulfate suppressed lung metastasis by blocking P-selectin to recruit CD4 regulatory T cells.
Int J Biol Macromol
P-选择素已被证明可以通过促进调节性 T 细胞 (Treg) 浸润到肿瘤中来增强小鼠肿瘤的生长和转移。理论上,P-选择素拮抗剂可以抑制这一过程。海藻酸丙二醇酯硫酸钠(PSS)是一种肝素类海洋药物,最初在中国被批准用于治疗心血管疾病。此前,我们报道 PSS 是一种有效的体外 P-选择素拮抗剂。然而,PSS是否能够在体内调节Treg浸润及其对肺转移的影响尚不清楚。我们的结果表明,30mg/kg 的 PSS 显着抑制肺转移并提高总体生存率,其效力与阳性对照 LMWH 相当。机理研究表明,PSS通过直接与活化血小板的P-选择素结合来阻断肿瘤细胞粘附并活化血小板。与模型组相比,PSS治疗21天后,肺部Tregs的百分比降低了63%,同时增加了CD8 T细胞(1.59倍)和颗粒酶B CD8 T细胞(2.08倍)的百分比,以产生适应性反应用于全身性肿瘤抑制。研究表明,P-选择素拮抗剂 PSS 通过抑制调节性 T 细胞 (Treg) 浸润肿瘤来抑制肺转移。版权所有 © 2024。由 Elsevier B.V. 出版。
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Int J Biol Macromol
2024 Aug 21
KondaiahSeku,GBhagav...
Modified frankincense resin stabilized gold nanoparticles for enhanced antioxidant and synergetic activity in in-vitro anticancer studies.
Int J Biol Macromol
乳香树脂 (FR) 首次被羧甲基化产生 CMFR - AuNP,并将该缀合物用于阿霉素药物负载。 FR的羧基、酚基和羟基官能团的羧甲基化已开发成羧甲基化乳香树脂(CMFR)。使用开发的 CMFR 作为稳定剂和还原剂合成了一种新型 CMFR-AuNPs。利用CMFR-AuNPs和CMFR-AuNPs@DOX研究了抗菌、抗氧化和体外抗癌活性。 CMFR-AuNPs 通过有效猝灭 DPPH 自由基而表现出抗氧化特性。 CMFR-AuNPs 和 DOX@CMFR-AuNPs 对肺炎克雷伯菌、金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌和大肠杆菌表现出强大的抗菌活性。在不同浓度的负载 Dox 的 CMFR-AuNP(CMFR-AuNPs Dox1、CMFR-AuNPs Dox 2、
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