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Epigenetics & Chromatin
2024
SonghuaQuan,HaoHuang
Epigenetic contribution to cancer.
Epigenetics & Chromatin
表观遗传学改变了我们对癌症的理解,它揭示了基因活性的变化(不改变 DNA 本身)如何引发和进展疾病。这些变化包括 DNA 甲基化、组蛋白构型和非编码 RNA 活性的调整。例如,DNA 甲基化可以使通常预防癌症的基因失活,从而导致更广泛的基因组不稳定。组蛋白修饰可以改变 DNA 缠绕的紧密程度,从而影响哪些基因处于活跃或沉默状态;而非编码 RNA 会干扰指导蛋白质生成的信息,从而影响癌症相关过程。与永久且不可逆的基因突变不同,表观遗传变化为治疗干预提供了可塑的目标,允许对基因表达模式进行潜在的可逆调整。这种灵活性对于复杂的癌症领域至关重要,因为静态遗传解决方案可能是不够的。此外,表观遗传学弥合了遗传倾向和环境对癌症的影响之间的差距,为了解生活方式因素和外部暴露如何影响癌症风险和进展提供了一个全面的框架。将表观遗传学整合到癌症研究中不仅增强了我们对这种疾病的理解,而且还开辟了以前在传统的以基因为中心的研究中未曾探索过的干预创新途径。先进测序和精确表观遗传修饰等技术正在为早期癌症检测和更加个性化的治疗方法铺平道路,凸显表观遗传学在现代癌症护理中的关键作用。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024
HamdaKhan,ZeeshanRaf...
Epigenetic contributions to cancer: Exploring the role of glycation reactions.
Epigenetics & Chromatin
晚期糖基化终产物(AGE)在人体内的半衰期较长,正在成为有效的诊断指标。专注于 AGE 交联破坏剂的早期干预研究在心力衰竭患者中显示出令人鼓舞的结果,为疾病进展监测和治疗效果评估铺平了道路。 AGE 是糖与蛋白质、脂质和核酸相互作用的非酶反应的副产物。这些化合物具有改变许多生物过程的能力,从破坏分子构象和促进交联到改变酶活性、减少清除和损害受体识别。 AGEs 通过刺激细胞内信号通路造成的损害与各个器官系统慢性疾病的发作有关。本综述综合了 AGE 的特征以及它们在不同生理和病理状态下表达所带来的挑战。此外,它还强调了 AGE 的临床相关性以及旨在减少 AGE 积累的最新研究突破。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024
Yen-VyNguyenThi,Thuy...
Epigenetic contribution to the relationship between obesity and cancer.
Epigenetics & Chromatin
肥胖和癌症因其患病率较高而成为世界各地的两大健康问题。多项实验和流行病学研究已经证明了肥胖与癌症之间的关系,其中肥胖被认为是癌症发生的危险因素。了解表观遗传对肥胖与癌症关系的贡献的最终目的是找到干预或治疗肥胖与癌症的方法。因此,有必要提供关于表观遗传对肥胖与癌症之间关系的贡献的最普遍的观点。肥胖与目前遇到的一些常见癌症密切相关,包括乳腺癌、食道癌、肝癌、肾癌、子宫癌、结直肠癌、胰腺癌和胆囊癌。肥胖会增加癌症死亡的风险,从而间接影响治疗的选择。据估计,大约 4-8% 的癌症病例是由肥胖引起的。尤其是了解癌症之间关系的基本机制非常复杂,尚未完全了解。这项工作旨在总结目前关于表观遗传调控在肥胖之间的关系中的作用的知识以及潜在的应用。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024
KouroshHayatigolkhat...
Epigenetic alterations in AML: Deregulated functions leading to new therapeutic options.
Epigenetics & Chromatin
急性髓系白血病 (AML) 会导致造血分化过程中断。 AML 的新治疗策略已经取得了重要进展。然而,诱导化疗仍然是大多数 AML 患者的主要选择。表观遗传失调在 AML 发病机制中发挥着核心作用,支持白血病发生和白血病干细胞的维持。在这里,我们概述了 AML 发展中表观遗传机制改变的复杂相互作用,包括 DNA 甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑。我们探索表观遗传调节因子(例如 DNMT、HMT、KDM 和 HDAC)在介导基因表达模式推动白血病细胞转化中的作用。此外,我们讨论了细胞遗传学损伤对表观基因组重塑的影响以及针对表观遗传脆弱性作为治疗策略的潜力。了解 AML 的表观遗传景观可以深入了解新的治疗途径,包括表观遗传修饰剂,特别是它们在联合疗法中的应用,以改善治疗结果并克服耐药性。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024
HueVuThi,Anh-DaoNgo,...
Epigenetic regulation in ovarian cancer.
Epigenetics & Chromatin
卵巢癌是女性尤其是50岁以上女性死亡率最高的疾病之一。未来,预计人类发展指数较低的国家的发病率和死亡率将会上升。遗传因素结构和功能的不稳定长期以来被认为是癌症(包括卵巢癌)的一个原因。除了了解基因突变之外,表观遗传改变已成为导致卵巢肿瘤发病机制的另一个方面。人们发现这种致命疾病的发生和进展与表观遗传调控异常有关。 DNA 甲基化、组蛋白修饰和基于非编码 RNA 的基因沉默是卵巢癌发展中令人感兴趣的过程,也是癌症检测或治疗的新靶标。版权所有 © 2024 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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Epigenetics & Chromatin
2024
AtanuMondal,Agniswar...
Epigenetic orchestration of the DNA damage response: Insights into the regulatory mechanisms.
Epigenetics & Chromatin
DNA 损伤反应 (DDR) 是一种重要的细胞机制,可保护基因组完整性并防止有害 DNA 损伤的积累。越来越多的证据强调了 DDR 信号传导与表观遗传调控之间的交叉,为包括肿瘤发生在内的细胞功能的各个方面提供了深刻的见解。这篇综合综述探讨了表观遗传修饰与 DDR 激活之间的复杂关系,特别关注病毒感染的影响。致癌病毒,如人乳头瘤病毒、肝炎病毒(HBV 或 HCV)和 Epstein-Barr 病毒已被证明可以激活 DDR。因此,这些 DNA 损伤事件引发一系列表观遗传改变,包括 DNA 甲基化模式、组蛋白修饰和非编码 RNA 表达的变化。这些表观遗传变化对染色质结构、基因表达和基因组稳定性的维持产生深远影响。重要的是,阐明 DDR 背景下病毒诱导的表观遗传改变对于理解癌症的复杂性具有重要意义,并为治疗干预提供潜在目标。版权所有 © 2024。由 Elsevier Inc. 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 23
MatteoSpinelli,Franc...
High fat diet affects the hippocampal expression of miRNAs targeting brain plasticity-related genes.
Epigenetics & Chromatin
胰岛素抵抗和 2 型糖尿病等代谢紊乱与脑功能障碍和认知缺陷有关,尽管其基本分子机制仍然难以捉摸。据报道,表观遗传因素(例如非编码 RNA)可介导营养相关信号的分子效应。在这里,我们研究了高脂饮食(HFD)诱导的代谢疾病的成熟实验模型的海马体中 miRNA 表达谱的变化。与标准饮食喂养的对照组相比,我们观察到 HFD 小鼠海马体中 69 种 miRNA 的表达增加,63 种 miRNA 的表达减少。通过生物信息学分析,我们确定了失调 miRNA 的许多潜在靶标,精确定位了多个差异调节 miRNA 靶向的调节神经可塑性的基因子集。我们还验证了这些突触和非突触蛋白的表达,证实了突触结合蛋白 1 (SYT1)、钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶 I δ (CaMK1D)、N-甲基-D-天冬氨酸谷氨酸受体 2B 亚基 (GRIN2B) 的下调HFD 海马中的 DNA 结合蛋白特殊 AT 丰富序列结合蛋白 2 (SATB2) 和 RNA 结合蛋白细胞质多腺苷酸化元件结合蛋白 1 (CPEB1) 和神经肿瘤腹侧抗原 1 (NOVA1)老鼠。总之,我们的研究提供了与 HFD 相关的 miRNA 景观的快照,这些 miRNA 可能参与与代谢紊乱相关的大脑功能的改变。通过阐明特定的 miRNA-mRNA 相互作用,我们的研究有助于更深入地了解 HFD 对突触功能影响的分子机制。© 2024。作者。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 23
YueSun,YushuangWu,Gu...
STING is crucial for the survival of RUNX1::RUNX1T1 leukemia cells.
Epigenetics & Chromatin
尽管具有 RUNX1::RUNX1T1 (AE) 融合的急性髓系白血病 (AML) 患者预后相对较好,但约 50% 的患者会在 2.5 年内复发并对后续化疗产生耐药性 [1]。因此,必须确定 AE 白血病的新治疗靶点以改善预后。在这项研究中,我们发现靶向 STING 可有效抑制 AE 白血病细胞的生长。 STING 的遗传和药理学抑制都会导致 AE 白血病细胞的减少。重要的是,在小鼠原发性 AE 白血病模型中,STING 缺失显着减弱了白血病的发生并延长了动物的寿命。阻断 STING 的下游炎症通路会产生与 AE 白血病细胞中 STING 抑制相似的效果,凸显了 STING 依赖性炎症反应在维持 AE 白血病细胞存活中的关键作用。此外,通过全基因组 CRISPR 筛选,我们发现脂肪酸去饱和酶 2 (FADS2) 是介导细胞死亡的 STING 抑制下游的非典型因子。抑制 STING 会释放 FADS2 活性,从而诱导多不饱和脂肪酸 (PUFA) 的合成并引发脂质过氧化相关的细胞死亡 [2]。总而言之,这些发现揭示了 STING 在 AE 阳性 AML 细胞存活中的关键功能,并表明 STING 是这些患者临床干预的潜在治疗靶标。© 2024。作者获得 Springer 独家许可自然有限公司。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 23
EleftheriaVasilaki,Y...
ΔNp63 bookmarks and creates an accessible epigenetic environment for TGFβ-induced cancer cell stemness and invasiveness.
Epigenetics & Chromatin
p63 是一种具有内在先锋因子活性和多效性功能的转录因子。通过经典、SMAD 和非经典 MAP 激酶 (MAPK) 途径的激活和协同作用来转化生长因子 β (TGFβ) 信号传导,从而引发抗肿瘤和促肿瘤发生特性,包括细胞干性和侵袭性。 TGFβ 激活癌细胞中的 ΔNp63 转录程序;然而,TGFβ 和 p63 在揭示肿瘤进展过程中的表观遗传景观(允许染色质可及性和基因转录)方面的联系尚未报道。小分子抑制剂,包括蛋白激酶抑制剂和 RNA 沉默,提供了功能丧失分析。利用癌细胞中的球体形成测定、染色质免疫沉淀和 mRNA 表达测定来获得机制证据。质谱分析与免疫共沉淀分析相结合,揭示了新型 p63 相互作用因子及其参与 p63 依赖性转录。乳腺癌细胞的球形形成能力在 TGFβ 刺激后增强,在 ΔNp63 耗尽后显着降低。通过 p38 MAPK 信号传导激活 TGFβ 信号传导诱导 ΔNp63 Ser 66/68 磷酸化,从而产生具有增强 DNA 结合特性的稳定 ΔNp63 蛋白。 TGFβ 刺激改变了 H3K27ac 和 H3K27me3 组蛋白修饰标记的比例,表明 H3K27ac 更高,并增加了 p300 乙酰转移酶向染色质的募集。通过沉默 ΔNp63 的表达,TGFβ 对染色质重塑的影响被消除。 H3K27me3 的抑制揭示了 TGFβ 作为引导 ΔNp63 到达 TGFβ/SMAD 基因位点的上游信号的重要作用,以及 ΔNp63 在将组蛋白修饰酶(如 p300)招募到这些基因组区域、调节染色质方面不可或缺的作用可及性和基因转录。从机制上讲,TGFβ通过SMAD激活诱导ΔNp63从NURD或NCOR/SMRT组蛋白脱乙酰化复合物上解离,同时促进ΔNp63-p300复合物的组装,影响组蛋白乙酰化水平和ΔNp63依赖性转录的结果。ΔNp63被磷酸化并招募通过 TGFβ 连接到 TGFβ/SMAD/ΔNp63 基因位点,促进与干性和细胞侵袭相关的靶基因的染色质可及性和转录。© 2024。作者。
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Epigenetics & Chromatin
2024 Aug 23
PeterHersey,Hsin-YiT...
X and Y Differences in Melanoma Survival Between the Sexes.
Epigenetics & Chromatin
男性和女性之间黑色素瘤的生存率存在显着差异,但不能用行为差异来解释。我们和其他人提供的证据表明,这种差异可能是由于 X 失活失败导致第二条 X 染色体免疫相关基因表达增加所致。在本综述中,我们检查了相反观点的证据,即生存差异是由于男性免疫反应较弱造成的。造成这种情况的原因之一可能是 Y 染色体 (LOY) 丢失,尤其是老年男性。所涉及的基因可能在免疫反应中具有直接作用,或者是调节参与免疫反应或肿瘤生长的性别和常染色体基因的非编码RNA。 KDM6C 和 KDM5D 去甲基酶的缺失似乎涉及常见基因。第二个因素似乎是黑色素瘤细胞上雄激素受体(AR)的激活,这增加了黑色素瘤细胞的侵袭性和生长。 AR 诱导 T 细胞耗竭,从而限制针对黑色素瘤的免疫反应,这似乎是一个常见的发现。克服 Y 基因丢失相关影响的治疗方法的开发提出了挑战,但与 AR 信号传导相关的几种途径似乎值得在转移性疾病的治疗中进一步研究。© 2024 作者。色素细胞
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