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DIABETES & METABOLISM
2023 Oct 25

JinXu,He-LiXu,Yi-Nin...
The performance of deep learning on thyroid nodule imaging predicts thyroid cancer: A systematic review and meta-analysis of epidemiological studies with independent external test sets.
DIABETES & METABOLISM
根据最近的现有证据,深度学习(DL)系统是否可以提高甲状腺结节影像分类的准确性仍存在争议。我们进行这项研究是为了分析内部和外部测试集中 DL 在甲状腺结节影像诊断中的现有证据。截至 2022 年 12 月底,检索了 PubMed、IEEE、Embase、Web of Science 和 Cochrane Library。我们在基于图像的甲状腺结节评估中纳入了使用外部验证的深度学习技术进行的初步流行病学研究。该系统评价已在 PROSPERO 上注册 (CRD42022362892)。我们在基于图像的甲状腺结节评估中使用外部验证的 DL 技术评估了 17 项主要流行病学研究的证据。十四项研究被认为有资格进行荟萃分析。这些 DL 算法的汇总灵敏度、特异性和曲线下面积 (AUC) 分别为 0.89(95% 置信区间 0.87-0.90)、0.84(0.82-0.86)和 0.93(0.91-0.95)。对于内部验证集,汇总的敏感性、特异性和 AUC 分别为 0.91 (0.89-0.93)、0.88 (0.85-0.91) 和 0.96 (0.93-0.97)。在外部验证集中,汇总的敏感性、特异性和 AUC 分别为 0.87 (0.85-0.89)、0.81 (0.77-0.83) 和 0.91 (0.88-0.93)。值得注意的是,在亚组分析中,DL 算法仍然表现出卓越的诊断有效性。当前证据表明,基于 DL 的成像在内部和外部测试集中区分甲状腺结节的诊断性能与临床医生相当。版权所有 © 2023 Research Trust of DiabetesIndia (DiabetesIndia)和国家糖尿病、肥胖和胆固醇基金会 (N-DOC)。由爱思唯尔有限公司出版。保留所有权利。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Oct 17

YumengZhang,LeiJi,Hu...
Pan-cancer analyses reveal the stratification of patient prognosis by viral composition in tumor tissues.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
癌症与细菌/真菌之间的关联已被广泛研究,但癌症相关病毒的影响尚未得到彻底研究。在这项研究中,我们全面表征了 31 种癌症类型的组织样本以及 23 种癌症类型的血液样本的癌症病毒组。我们的研究结果表明,在主要人类癌症的组织和血液中都存在低丰度的病毒 DNA,并且在不同癌症类型之间观察到病毒群落组成存在显着差异。此外,对头颈鳞状细胞癌 (HNSC)、肾透明细胞癌 (KIRC)、胃癌 (STAD) 和子宫体子宫内膜癌 (UCEC) 四种癌症进行的 Cox 回归分析显示,病毒感染与癌症之间存在很强的相关性。组织的组成/丰度和患者的存活率。此外,我们还确定了这四种癌症的病毒相关预后特征(VAPS),并发现了具有不同生存风险的患者中 VAPS 与组织中优势细菌之间相互作用的差异。值得注意的是,临床相关分析揭示了 VAPS 对这四种癌症的预后能力。总而言之,我们的研究为组织中病毒在多种癌症预后中的作用提供了新的见解,并为使用组织病毒对癌症患者的预后进行分层提供了指导。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd. 保留所有权利。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Oct 31

PengXu,BinZhang
Multiscale network modeling reveals the gene regulatory landscape driving cancer prognosis in 32 cancer types.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
癌症是一种复杂的疾病,具有影响患者预后的多种分子机制。基于网络的方法可以有效揭示癌症预后和基因相互作用的整体情况。然而,跨多种癌症类型的共表达网络和预后基因模块的全面景观仍然难以捉摸。在这项研究中,我们对 32 种癌症类型的共表达网络进行了系统分析。我们的分析确定了 4749 个预后模块,它们在调节癌症进展中发挥着至关重要的作用。综合表观基因组分析表明,这些模块受到基因表达和甲基化之间相互作用的调节。网络模块的共调控基因在染色体细胞带中富集,并优先位于开放染色质区域。保留的网络模块形成了 330 个位于染色体热点的模块簇。癌症类型特异性预后模块参与不同癌症类型中独特的重要生物过程。总体而言,我们的研究提供了丰富的流行基因网络资源和驱动癌症预后的潜在多尺度调控机制,为生物标志物发现和治疗靶点开发奠定了基础。© 2023 Xu和Zhang;由冷泉港实验室出版社出版。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Oct 29

AbhinayTumati,Caitli...
Clinical utility of a microRNA classifier in cytologically indeterminate thyroid nodules with RAS mutations: A multi-institutional study.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
分子检测指导细胞学不确定的甲状腺结节的治疗。我们评估了市售甲状腺突变组合加上 microRNA 风险分类器在对 RAS 突变结节进行分类时的实际临床效益。我们使用 ThyGenX/ThyGeNEXT-ThyraMIR 对 Bethesda III/IV 结节的分子检测结果进行了亚组分析2017 年至 2021 年间,在 3 个三级护理中心的平台上,将阳性结果定义为 10% 或更高的恶性肿瘤风险。我们从接受检测的 375 名患者(70.7% 女性,中位年龄 59.3 岁)中发现了 387 个结节。与阴性模块相比,阳性结节 (32.3%) 与手术干预次数增加 (74.4% vs 14.9%,P < .0001) 和手术病理学上的癌相关 (46.4% vs 3.4%,P < .0001)。 RAS 突变是最常见的突变,在 380 个结节中的 71 个(18.7%)中发现,并被分类为 ThyraMIR-(71 个结节中的 28 个;39.4%)或 ThyraMIR(71 个结节中的 43 个;60.6%)。在 RAS 突变结节中,ThyraMIR 组和 ThyraMIR- 组之间的手术率 (P = .2212) 或癌症诊断 (P = .6277) 以及敏感性、特异性、阴性预测值和阳性预测值没有显着差异ThyraMIR 的值分别为 64.7%、34.8%、40.0% 和 59.5%。尽管检测阳性与外科病理学中的恶性肿瘤相关,但 ThyraMIR 分类器无法区分良性和恶性 RAS 突变结节。无论 microRNA 表达状态如何,都应考虑对 RAS 突变结节进行诊断性肺叶切除术。版权所有 © 2023 Elsevier Inc. 保留所有权利。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Oct

JingZhang,HuiDai,Lei...
Cytosolic DNA accumulation promotes breast cancer immunogenicity via a STING-independent pathway.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
免疫检查点阻断(ICB)彻底改变了癌症治疗。然而,仅 ICB 已证明仅对一小部分乳腺癌患者有益处。最近的研究表明,针对 DNA 损伤反应的药物可提高 ICB 的功效并促进细胞质 DNA 积累。然而,最近的临床试验表明这些药物与血液学毒性有关。迫切需要更有效的治疗策略。使用多重免疫组织化学染色对原发性三阴性乳腺癌肿瘤进行胞质单链 DNA (ssDNA) 染色。为了增加胞质 ssDNA,我们对 TREX1 进行了基因沉默。利用小鼠乳腺癌模型评估了肿瘤细胞质 ssDNA 在促进肿瘤免疫原性和抗肿瘤免疫反应中的作用。我们发现肿瘤细胞质 ssDNA 与三阴性乳腺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞相关。 TREX1 缺陷通过 DDX3X 触发不依赖于 STING 的先天免疫反应。 TREX1 缺失导致肿瘤中胞浆 ssDNA 的积累足以大幅提高 ICB 的疗效。我们进一步鉴定了一种胞质 ssDNA 诱导剂 CEP-701,它使乳腺肿瘤对 ICB 敏感,而没有与抑制 DNA 损伤反应相关的毒性。这项工作表明,胞质 ssDNA 积累促进乳腺癌免疫原性,可能是一种提高乳腺癌疗效的新治疗策略。 ICB 毒性最小。© 作者(或其雇主)2023。根据 CC BY-NC 允许重复使用。不得商业再利用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Oct

RomLeidner,KevinConl...
First-in-human phase I/Ib study of NIZ985, a recombinant heterodimer of IL-15 and IL-15Rα, as a single agent and in combination with spartalizumab in patients with advanced and metastatic solid tumors.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
临床前,白介素 15 (IL-15) 单一疗法可促进抗肿瘤免疫反应,当 IL-15 与免疫检查点抑制剂 (ICIs) 联合使用时,抗肿瘤免疫反应会增强。这项首次人体研究研究了 NIZ985(一种包含生理活性 IL-15 和 IL-15 受体 α 的重组异二聚体)作为单一疗法以及与斯帕他珠单抗(一种抗程序性细胞死亡蛋白 1(抗 PD-1))联合使用的情况单克隆抗体,用于晚期实体瘤患者。这项 I/Ib 期研究有两个剂量递增组:单药 NIZ985 皮下注射,每周三次(TIW,用药 2 周/停药 2 周)或每周一次(QW,3 周)开/关 1 周),以及皮下注射 NIZ985 TIW 或 QW 联合斯帕他珠单抗(每 4 周静脉注射 400mg (Q4W))。剂量扩展阶段研究了 NIZ985 1 µg/kg TIW/spartalizumab 400 mg Q4W 在根据批准的适应症分层的抗 PD-1 敏感或抗 PD-1 耐药肿瘤类型患者中的情况。主要目标是剂量扩展阶段NIZ985的安全性、耐受性以及最大耐受剂量(MTD)和/或扩展推荐剂量(RDE)。 截至2020年2月17日,83名患者(中位年龄:63岁)年;范围:28-85)接受剂量递增(N=47;单药 NIZ985:n=27;NIZ985/spartalizumab n=20)和剂量扩展(N=36)治疗。没有发生剂量限制性毒性,也没有确定 MTD。最常见的治疗相关不良事件 (TRAE) 是注射部位反应(主要为 1-2 级;单药 NIZ985:85% (23/27)); NIZ985/斯帕他珠单抗:89% [50/56])。最常见的 3-4 级 TRAE 是淋巴细胞计数减少(单药 NIZ985:7% [2/27];NIZ985/spartalizumab:5% [3/56])。最佳总体缓解是单药组疾病稳定(30% (8/27)),NIZ985/spartalizumab 组部分缓解(5% [3/56];黑色素瘤、胰腺癌、胃癌)。在剂量扩展中,抗PD-1敏感肿瘤类型队列的疾病控制率为45%(5/11),抗PD-1耐药肿瘤类型队列的疾病控制率为20%(5/25)。各臂的药代动力学参数相似。单药和联合治疗产生了 CD8 T 细胞和自然杀伤细胞增殖的短暂增加以及多种细胞因子的诱导。NIZ985 在单药和 NIZ985/spartalizumab 方案中具有良好的耐受性。 RDE 设定为 1μg/kg TIW。观察到该组合针对已知对 ICI 反应较差的肿瘤类型的抗肿瘤活性。NCT02452268.© 作者(或其雇主)2023。根据 CC BY-NC 允许重复使用。不得商业再利用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct 31

ShiraBuchrits,OfirWo...
Non-immunotherapy approaches for Relapsed or Refractory AML: an update for 2024.
Epigenetics & Chromatin
复发性或难治性 (R/R) 急性髓系白血病 (AML) 是一种具有挑战性、高风险的临床情况,结果令人沮丧。最近对驱动克隆进展的遗传、表观遗传和代谢事件的见解以及新疗法的出现导致在 R/R 环境中单独或组合地结合了几种新的靶向疗法,目的是提高反应率和生存。在此,我们回顾了非免疫治疗方法治疗 R/R AML 的当前挑战和未来机遇。FLT3 和 IDH 1/2 抑制剂现已获得 FDA 批准用于患有 R/R 疾病和相应突变的患者。这些药物还与强化和低强度平台结合使用,试图提高反应和生存率。目前正在早期试验中单独或组合测试几种靶向药物。其中包括针对细胞凋亡途径的药物、干扰 R/R 白血病细胞关键生存途径的药物以及针对白血病骨髓微环境的疗法。 Menin 抑制剂是治疗 NPM1 和 KMT2A 重排 AML 的一类很有前途的活性药物。关键信息:几种新的免疫学和非免疫学靶向疗法正在研究中,并正在进入临床前和临床管道。剩下的重大挑战包括开发适合患者特定生物学和临床背景的协同联合疗法,以及重新定义同种异体移植在 R/R 疾病患者中的作用和时机。作者。由巴塞尔 S. Karger AG 出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Oct 31

FeiMa,MinYan,WeiLi,Q...
Pyrotinib versus placebo in combination with trastuzumab and docetaxel as first line treatment in patients with HER2 positive metastatic breast cancer (PHILA): randomised, double blind, multicentre, phase 3 trial.
Epigenetics & Chromatin
评估吡咯替尼(一种不可逆泛 HER(人表皮生长因子受体)抑制剂)、曲妥珠单抗和多西他赛与安慰剂、曲妥珠单抗和多西他赛相比,对于未经治疗的 HER2 阳性转移性乳腺癌的疗效和安全性。随机、双盲、安慰剂对照、多中心、3 期试验。2019 年 5 月 6 日至 2022 年 1 月 17 日期间,中国 40 个中心研究了 590 名未经治疗的 HER2 阳性转移性乳腺癌女性患者(中位年龄 52(四分位距 46-58)岁)。符合条件的患者按 1:1 随机分配接受口服吡咯替尼(每天一次 400 毫克)或安慰剂,并在每 21 次治疗的第一天联合静脉注射曲妥珠单抗(第 1 周期为 8 毫克/公斤,后续周期为 6 毫克/公斤)和多西紫杉醇(75 毫克/平方米)日循环。根据(新)辅助治疗中曲妥珠单抗的治疗史和激素受体状态对随机分组进行分层。患者、研究者和申办者的研究团队对治疗分配情况不知情。主要终点是研究者评估的无进展生存期。在 590 名随机患者中,297 名接受了吡咯替尼、曲妥珠单抗和多西紫杉醇治疗(吡咯替尼组),并且293 人接受安慰剂、曲妥珠单抗和多西他赛治疗(安慰剂组)。截至 2022 年 5 月 25 日数据截止,中位随访时间为 15.5 个月。根据研究者的说法,吡咯替尼组的中位无进展生存期显着长于安慰剂组(24.3(95% 置信区间 19.1 至 33.0)个月 vs 10.4(9.3 至 12.3)个月;风险比 0.41(95% 置信区间)区间0.32至0.53);单侧P<0.001)。吡咯替尼组 297 名患者中有 267 名(90%)报告了 3 级或以上治疗相关不良事件,安慰剂组 293 名患者中有 224 名(76%)报告了治疗相关不良事件。吡咯替尼组未发生治疗相关死亡,安慰剂组发生 1 例(<1%;糖尿病高渗性昏迷)治疗相关死亡。生存和毒性仍在评估更长的随访时间。与安慰剂、曲妥珠单抗和多西他赛相比,吡咯替尼、曲妥珠单抗和多西他赛在未经治疗的 HER2 阳性转移性乳腺癌患者中显示出优越性,可显着改善无进展生存期。毒性是可控的。研究结果支持这种双重抗 HER2 方案作为该患者群体的替代一线治疗选择。ClinicalTrials.gov NCT03863223.© 作者(或其雇主)2019。CC BY-NC 允许重复使用。不得商业再利用。请参阅权利和权限。英国医学杂志出版。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Oct 24

JialiangLu,YuGuo,Hui...
Targeted delivery of cathepsin-activatable near-infrared fluorescence probe for ultrahigh specific imaging of peritoneal metastasis.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
不充分的细胞减灭术(CRS)已被确定为腹膜转移病例患者预后不良的一个预后因素。虽然成像探针用于识别腹膜转移以促进 CRS,但许多探针表现出高背景信号,由于清除时间延长,导致显着延迟实现令人满意的肿瘤与正常比率 (TNR)。在本研究中,我们设计了一种名为 Tras-AA-Cy NH2 的新型荧光探针,它能够相对快速地对皮下肿瘤和腹膜肿瘤进行成像,同时保持较高的 TNR。从机制上讲,Tras-AA-Cy NH2 表现出选择性靶向癌细胞表面的人表皮生长因子受体 2。内化后,它会经历过度表达的组织蛋白酶催化的酶裂解,导致随后释放近红外荧光团。因此,Tras-AA-Cy NH2 在皮下肿瘤小鼠中,6 小时时的 TNR 为 7.8,24 小时时的 TNR 为 21.4。即使在体内循环 522 小时后,TNR 仍保持在 5 以上,表明超长的成像时间窗口。值得注意的是,Tras-AA-Cy NH2已成功用于腹膜肿瘤特异性成像,并进一步证实了其利用人体切除组织进行肿瘤组织特异性识别的能力。总之,这些发现强调了 Tras-AA-Cy NH2 用于腹膜肿瘤可视化的合理设计。版权所有 © 2023 Elsevier Masson SAS。版权所有。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Oct 29

BasveshwarGawali,Ais...
Preclinical pharmacokinetic and in vitro metabolic stability study of lysosomotropic autophagy inhibitor, IITZ-01 in mice by using UPLC-MS/MS.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
本研究使用超高效液相色谱-串联质谱 (UHPLC-MS-MS) 评估新型溶酶体自噬抑制剂 IITZ-01 的药代动力学和代谢稳定性。由于该先导分子在三阴性乳腺癌和肾癌中具有显着的治疗效果,因此需要进行临床前研究。使用 UPLC-MS/MS 技术开发了一种定量测定小鼠血浆中 IITZ-01 的生物分析方法。 UPLC-MS/MS 方法根据 US-FDA 生物分析指南进行验证,并成功应用于研究药代动力学和代谢稳定性。使用 Waters Acquity BEH C-18 色谱柱 (50 mm×2.1 mm, 1.7 μm) 以高选择性和灵敏度 (0.5 ng/mL) 从内源性成分中分离 IITZ-01 和 ZSTK474 (IS)。以 0.2 mL/min 的流速应用由 0.1% 甲酸水溶液和 0.1% 甲酸乙腈溶液组成的梯度流动相。电喷雾电离采用正离子模式进行检测,而定量则采用多反应监测(MRM)模式。这涉及对 IITZ-01 使用 m/z 483.19→235.09 处的 [M H] 碎片离子,对内标 (IS) 使用 m/z 418→138 处的 [M H] 碎片离子。该方法在 0.5-800 ng/mL 的校准范围内进行了验证。小鼠血浆中 IITZ-01 的 LLOQ 为 0.5 ng/mL。该方法在日内和日间精密度和准确度方面表现出良好的性能。发现基质效应可以忽略不计,稳定性数据在可接受的限度内。经过验证的技术支持 IITZ-01 小鼠药代动力学和人肝微粒体代谢稳定性临床前研究的适用性、可靠性、重现性和敏感性。版权所有 © 2023。由 Elsevier Inc. 出版。
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