研究动态
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Sep
VikramMNarayan,Despi...
Evaluation of a Natural Language Processing Model to Identify and Characterize Patients in the United States With High-Risk Non-Muscle-Invasive Bladder Cancer.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
非肌层浸润性膀胱癌 (NMIBC) 的治疗以临床和病理标准的风险分层为指导。本研究旨在开发一种自然语言处理 (NLP) 模型,用于从非结构化电子病历 (EMR) 中回顾性识别高风险 NMIBC 患者,并应用该模型来描述患者和肿瘤特征。我们使用了三个独立的 EMR 衍生数据数据集包括 2011-2020 年诊断为膀胱癌的成年患者,用于 NLP 模型开发和训练 (n = 140)、验证 (n = 697) 以及回顾性队列分析的应用 (n = 4,402)。采用深度学习方法训练NLP对病历术语的识别,识别七种高危NMIBC标准;使用 F1 分数评估模型性能,并根据特征进行加权。然后使用算法将每位患者分类为高风险 NMIBC(是/否)。手动审核的记录是黄金标准。模型训练后,除一个不常见特征(前列腺尿道受累)外,所有特征的 F1 分数均 >0.7。 Ta (0.897) 和 T1 (0.897) 的受试者工作曲线下面积 (AUC) 最高;原位癌的 AUC 最低(CIS;0.617)。对于高危NMIBC分类,阳性预测值为79.4%,阴性预测值为93.2%,假阳性率为8.9%。敏感性和特异性分别为 83.7% 和 91.1%。在748名手动确认为高危NMIBC的患者中,196名(26%)患有CIS(其中19%还患有T1,23%还患有Ta病); 552 个肿瘤 (74%) 没有相关的 CIS。NLP 模型与基于规则的算法相结合,识别出具有良好性能的高风险 NMIBC,并使未来的工作能够研究高风险的真实治疗模式和临床结果NMIBC。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Oct 31
BeateRau,HaukeLang,A...
Effect of Hyperthermic Intraperitoneal Chemotherapy on Cytoreductive Surgery in Gastric Cancer With Synchronous Peritoneal Metastases: The Phase III GASTRIPEC-I Trial.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
对于胃癌 (GC) 腹膜转移 (PM) 患者,化疗是首选治疗方法。细胞减灭手术(CRS)和腹腔热灌注化疗(HIPEC)仍在争论中。这项随机、对照、开放标签、多中心 III 期试验(EudraCT 2006-006088-22;ClinicalTrials.gov 标识符:NCT02158988)探讨了 CRS 后 HIPEC 对总生存期 (OS) 的影响。患有 GC 和组织学证明 PM 的成年患者随机分配 (1:1) 接受围手术期化疗和单独 CRS (CRS-A) 或 CRS 加 HIPEC (CRS H)。 HIPEC 包含丝裂霉素 C 15 mg/m2 和顺铂 75 mg/m2,溶于 5 L 盐水中,在 42°C 下灌注 60 分钟。主要终点是 OS;次要终点包括无进展生存期(PFS)、其他无远处转移生存期(MFS)和安全性。分析遵循意向治疗原则。2014年3月至2018年6月期间,105名患者被随机分配(53名患者接受CRS-A,52名患者接受CRS H)。由于招募缓慢,试验提前停止。 55 名患者在 CRS 之前停止治疗,主要是由于疾病进展/死亡。两组的中位 OS 相同(CRS H,14.9 [97.2% CI,8.7 至 17.7] 个月 vs CRS-A,14.9 [97.2% CI,7.0 至 19.4] 个月;P = .1647)。 CRS-A 组的 PFS 为 3.5 个月(95% CI,3.0 至 7.0),CRS H 组的 PFS 为 7.1 个月(95% CI,3.7 至 10.5;P = 0.047)。 CRS H 组表现出更好的 MFS(10.2 个月 [95% CI,7.7 至 14.7],而 CRS-A 组为 9.2 个月 [95% CI,6.8 至 11.5];P = .0286)。各组间 ≥3 级不良事件 (AE) 的发生率相似(CRS-A,38.1% vs CRS H,43.6%;P = .79)。本研究显示 CRS H 和 CRS-A 之间的 OS 没有差异。 CRS H组的PFS和MFS明显更好,这需要进一步探索。 HIPEC 并未增加 AE。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Oct 31
RebeccaCArend,Bradle...
Ofranergene Obadenovec (Ofra-Vec, VB-111) With Weekly Paclitaxel for Platinum-Resistant Ovarian Cancer: Randomized Controlled Phase III Trial (OVAL Study/GOG 3018).
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
评估将 ofranergene obadenovec(ofra-vec,VB-111)(一种新型的基于基因的抗癌靶向疗法)添加到每周一次的紫杉醇治疗复发性铂耐药性卵巢癌 (PROC) 患者中。这种安慰剂对照、双倍治疗- 盲法 III 期试验(ClinicalTrials.gov 标识符:NCT03398655)随机分配 PROC 1:1 的患者每 8 周接受静脉注射 ofra-vec 并每周静脉注射一次紫杉醇或安慰剂加紫杉醇直至疾病进展。双重主要终点是通过盲法独立中央审查评估的总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)。2017年12月至2022年3月期间,409名患者被随机分配。 ofra-vec 组的中位 PFS 为 5.29 个月,对照组为 5.36 个月,风险比 (HR) 1.03(CI,0.83 至 1.29;P = .7823)。 ofra-vec 的中位 OS 为 13.37 个月 vs 13.14 个月,HR 0.97(CI,0.75 至 1.27;P = .8440)。根据 RECIST 1.1 的客观缓解率 (ORR) 在两组中相似:ofra-vec 组为 28.9%,对照组为 29.6%。在两个治疗组中,对 CA-125 的反应是 PFS 和 OS 的重要预后因素。在 ofra-vec 组中,CA-125 应答者与无应答者相比,PFS 的 HR 为 0.2428(CI,0.1642 至 0.3588),OS 的 HR 为 0.3343(CI,0.2134 至 0.5238)。安全性特征是常见的短暂性流感样症状,例如发烧和寒战。在紫杉醇中添加 ofra-vec 并没有改善 PFS 或 OS。对照组的 PFS 和 ORR 超出了 AURELIA 化疗对照组的预期结果。 CA-125 反应是紫杉醇治疗的 PROC 患者 PFS 和 OS 的重要预后生物标志物。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2023 Feb
RafaelBenavente,Cami...
An elevated HScore is associated with poor clinical outcomes in COVID-19.
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2019 年冠状病毒病 (COVID-19) 患者经常会出现过度炎症综合征,从而导致不良结果。这种情况类似于肿瘤、风湿病和其他传染病中描述的继发性噬血细胞性淋巴组织细胞增多症 (sHLH)。评估潜在免疫抑制、体温、器官肿大、血细胞减少、铁蛋白、甘油三酯、纤维蛋白原和 AST 的评分系统 (HScore) 已针对 sHLH 进行了验证,最近提议用于评估 COVID-19 中的过度炎症。评估 COVID 患者中是否存在 sHLH -19 人入院治疗,并评估 Hscore 作为不良结果的预后工具。 143 名年龄在 21-100 岁之间的患者(64% 男性)因 COVID-19 入院参加了一项前瞻性研究。 HScore 是在入学 72 小时内计算的。评估住院期间 sHLH 的发生率。此外,还探讨了 HScore ≥ 130 分与机械通气需求或 60 天死亡率之间的关系。HScore 中位数为 96 (33-169)。一名患者被诊断为 SHLH(发生率为 0.7%),其 HScore 为 169。在调整年龄、性别、合并症和肥胖后,HScore ≥ 130 与复合临床结果独立相关(危险比 2.13,p = 0.022)。 sHLH 在 COVID-19 患者中并不常见。 HScore 可用于预测不良结果的风险。
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MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
2022 May
AlejandraPalma,Ferna...
[Hospital palliative medicine. Revision of a care model implemented at a university hospital].
MEDICINE & SCIENCE IN SPORTS & EXERCISE
姑息医学 (PM) 是一门专业,其目标是预防和减轻与晚期疾病相关的痛苦。医院姑息治疗在症状控制、生活质量和成本控制方面有好处。作为转诊专家的医院 PM 支持团队负责 PM 护理模式。描述智利三级医院 PM 支持团队的临床经验。回顾 3 月份期间转介到医院 PM 支持团队的患者的临床记录2015 年和 2018 年 7 月。描述了转诊的管理数据、患者的社会人口统计和临床特征、调查的问题以及 PM 团队提出的干预措施。在研究期间,登记了 790 例转诊,其中大多数来自内科( 31%)或重症监护(24%)。研究期间,每年转诊的人数从 177 人增加到 237 人,入院后的时间从 5 天减少到 3 天。患者的平均年龄为 65.8 岁,81% 的主要诊断是肿瘤疾病。最常见的症状是 71% 的患者感到疲劳,68% 的患者感到抑郁,60% 的患者感到疼痛。 PM 团队提出的主要干预措施是对 64% 的患者进行沟通支持,对 62% 的患者进行镇痛,对 49% 的家庭护理人员进行教育。医院 PM 团队提出了一种护理模式,可以对患有以下疾病的患者进行评估和治疗方法晚期疾病,使用包括其家人在内的多维视角。
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JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
2023 Oct 31
SaileeRasam,Qingxian...
Highly Reproducible Quantitative Proteomics Analysis of Pancreatic Cancer Cells Reveals Proteome-Level Effects of a Novel Combination Drug Therapy That Induces Cancer Cell Death via Metabolic Remodeling and Activation of the Extrinsic Apoptosis Pathway.
JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
胰腺癌患者的生存率很低,经常使用吉西他滨 (Gem) 进行治疗。然而,最初的肿瘤敏感性常常让位于快速发展的耐药性。基于宝石的药物组合用于提高疗效和减轻耐药性,但我们对分子水平药物相互作用的理解有限,这有助于开发更有效的治疗方案。整体定量蛋白质组学分析可以为药物组合相互作用提供新的机制见解,但对药物组合研究通常所需的大样本集进行高质量的定量蛋白质组学分析具有挑战性。在这里,我们使用 IonStar(一种稳健的大规模蛋白质组学方法,采用良好控制的方法)在多个治疗组(N = 42 个样本)中研究了 Gem 与 BGJ398(infigratinib)(一种最近批准的泛 FGFR 抑制剂)的分子水平时间相互作用。 ,超高分辨率 MS1 定量。对样本集中总共 5514 个蛋白质进行了无缺失数据的定量,要求 >2 个独特肽/蛋白质、<1% 蛋白质错误发现率 (FDR)、<0.1% 肽 FDR 和 CV < 10%。对差异改变的蛋白质的功能分析揭示了药物失调的过程,例如代谢、细胞凋亡和抗原呈递途径。使用海马代谢测定和免疫测定对这些变化进行了实验验证。总体而言,对大规模蛋白质组学数据的深入分析为 FGFR 抑制剂补充和增强胰腺癌中 Gem 活性的可能机制提供了新的见解。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Oct 30
YunchengLiu,YuanPeng...
PD-L1-mediated immune evasion in triple-negative breast cancer is linked to the loss of ZNF652.
GENES & DEVELOPMENT
程序性死亡配体 1 (PD-L1) 表达的内在调节仍不清楚。在这里,我们报告锌指蛋白 652 (ZNF652) 是 PD-L1 的有效转录抑制因子。 ZNF652 在各种癌症中经常出现杂合性丢失 (LOH)。较高的 LOH 率和雌激素诱导转录的缺乏导致三阴性乳腺癌 (TNBC) 中 ZNF652 的表达受到抑制。从机制上讲,ZNF652 与 NuRD 转录共阻遏物复合物物理相关,可抑制包括 PD-L1 在内的一组基因。 ZNF652 的过表达会抑制 PD-L1 转录,而 ZNF652 的缺失则会上调 PD-L1。 TNBC 中 ZNF652 的缺失会在体外和体内释放 PD-L1 介导的免疫逃避。值得注意的是,ZNF652 表达在乳腺癌进展过程中逐渐丧失,低 ZNF652 水平与 PD-L1 表达升高、浸润的 CD8 T 细胞较少以及 TNBC 预后不良相关。我们的研究提供了对 PD-L1 调控的见解,并支持将 ZNF652 作为乳腺癌免疫治疗的潜在生物标志物和药物靶标。版权所有 © 2023 作者。由爱思唯尔公司出版。保留所有权利。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Oct 31
HiteshKumar,PallaviC...
Fisetin-Loaded Nanostructured Lipid Carriers: Formulation and Evaluations against Advanced and Metastatic Melanoma.
GENES & DEVELOPMENT
漆黄素 (Fis) 是一种具有抗癌作用的天然黄酮类化合物,但其输送受到限制。采用实验设计 (DoE) 方法,开发了非瑟酮纳米结构脂质载体 (NLC),以更好地对抗转移性黑色素瘤。优化后的 NLC 粒径为 135.0 ± 5.5 nm,多分散指数 (PDI) 为 0.176 ± 0.035,包封率为 78.16 ± 1.58%。该制剂在 60 天内保持稳定,并在 96 小时内持续释放药物 (74.79 ± 3.75%)。与 Fis 相比,Fis-NLC 在 A-375 和 B16F10 细胞中 48 小时时的 IC50 值至少低约 3.2 倍,药物摄取高出约 1.8 倍。它还抑制黑色素瘤细胞的迁移性并诱导细胞周期停滞在 G1/S 期。逆转录酶聚合酶链反应 (RT-PCR) 和蛋白质印迹结果显示 Nrf2/NQO1 基因表达增强,并且通过上调 BAX mRNA 表达产生凋亡效应。 BAX 和 p53 的蛋白质水平比纯 Fis 高约 2 倍。体内研究表明,对黑色素瘤相关的肺和肝转移的抑制作用分别高出 5.9 倍和 10.7 倍。这项研究的结果证明 Fis-NLC 是对抗黑色素瘤的有效工具。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Jan
LorenzoGallicchio,Go...
Regulation and function of alternative polyadenylation in development and differentiation.
GENES & DEVELOPMENT
新生 mRNA 的替代加工在真核生物中广泛存在,并且极大地影响基因表达的输出。具体来说,选择性切割和多腺苷酸化 (APA) 是一种共转录分子过程,可切换新生 mRNA 切割的多腺苷酸化位点 (PAS),从而产生具有不同 3'UTR 长度和内容的 mRNA 亚型。 APA 可能会影响 mRNA 翻译效率、定位、稳定性和 mRNA 种子蛋白-蛋白相互作用。 APA 在发育和细胞分化过程中自然发生,大约 70% 的人类基因在特定组织和细胞类型中表现出 APA。例如,由于在比其他细胞类型中使用的其他 PAS 更远端的 PAS 上优先进行加工,神经元倾向于表达具有长 3'UTR 的 mRNA。此外,APA的变化标志着多种病理状态,包括许多类型的癌症,其中mRNA优先在更近端的PAS处裂解,导致具有短3'UTR的mRNA亚型的表达。尽管 APA 已被广泛报道,但 APA 在发育中的功能以及在正常和致病条件下调节 3' 末端切割位点选择的机制仍然知之甚少。在这篇综述中,我们总结了目前对 APA 在发育和细胞分化过程中如何调节以及由此产生的 3'UTR 含量变化如何影响基因表达的多个方面的理解。随着 APA 成为一种普遍现象、尖端科学技术的出现以及体内研究的迫切需要,现在是深入研究替代性裂解和多聚腺苷酸化的复杂机制的最佳时机。
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GENES & DEVELOPMENT
2023 Oct 31
JianxiaLi,HuabinHu,G...
Biomarkers of Pathological Complete Response to Neoadjuvant Immunotherapy in Mismatch Repair Deficiency Colorectal Cancer.
GENES & DEVELOPMENT
免疫检查点抑制剂 (ICIs) 已成为错配修复缺陷/微卫星不稳定性高 (dMMR/MSI-H) 结直肠癌 (CRC) 患者的标准治疗方法。然而,仍然缺乏对 ICI 反应的生物标志物。前瞻性入组了 42 名接受新辅助 PD-1 阻断治疗的 dMMR CRC 患者。为了确定新辅助治疗病理完全缓解(pCR)的生物标志物,我们分析了基于下一代测序的基因组和转录组图谱,以及基于多重免疫荧光(mIF)染色的免疫细胞密度。对我们之前的研究中的单细胞RNA测序和GSE178341以及mIF进行综合分析,以进一步探讨肿瘤微环境(TME)对pCR反应的重要性。肿瘤组织和血浆样本的肿瘤突变负担pCR 组和非 pCR 组之间的差异相当,而 HLA-DQA1 和 HLA-DQB1 在 pCR 组中显着过表达。基因特征富集分析显示,pCR组中T细胞受体途径、抗原呈递途径等途径显着富集。此外,较高的预先存在的 CD8 T 细胞密度与 pCR 反应相关(767.47/mm2 vs. 326.64/mm2,P=0.013 Wilcoxon 检验)。进一步整合分析显示,低PD-1表达的CD8 T细胞(PD-1lo CD8 T细胞)表达高水平的TRGC2、CD160、KLRB1以及低水平的增殖和耗竭基因,与pCR反应显着相关。 dMMR CRC 中的特征,特别是 CD8 T 细胞与 ICI 的 pCR 反应相关。 dMMR CRC 内 TME 的异质性可能有助于区分对新辅助 ICI 完全缓解的患者。
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