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GENES & DEVELOPMENT
2024

JianwenHu,YingzeNing...
Characterization of RNA Processing Genes in Colon Cancer for Predicting Clinical Outcomes.
GENES & DEVELOPMENT
结肠癌与多个水平的分子异质性相关。 RNA 加工将初级转录 RNA 转化为成熟 RNA,从而驱动肿瘤发生及其维持。结肠癌中RNA加工基因的特征亟待阐明。在本研究中,我们从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库中获取了1033个相关样本,以探讨结肠癌中RNA加工表型的异质性癌症。首先,通过对 485 个 RNA 加工基因的分析,无监督层次聚类分析检测出具有特定临床结果和生物学特征的 4 个亚型。接下来,我们采用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)以及带有惩罚的Cox回归模型来表征RNA加工相关的预后特征。基于FXR1、MFAP1、RBM17等10个基因的RNA加工相关的预后风险模型最终鉴定出SAGE1、SNRPA1、SRRM4、ADAD1、DDX52、ERI1和EXOSC7。通过将此特征与其余临床变量(包括 TNM、年龄、性别和分期)相结合,构建了复合预后列线图。还通过生物信息学方法分析了遗传变异、通路激活和具有风险特征的免疫异质性。结果表明,与低风险组相比,高风险亚组与较高的基因组不稳定性、增加的增殖和周期特征、减少的肿瘤杀伤性 CD8 T 细胞和较差的临床预后相关。这种基于 RNA 编辑基因的预后分类器有助于分层根据 TNM 和临床结果、遗传变异、通路激活和免疫异质性,将结肠癌分为特定亚组。它可用于与当前精准医学标准相当的诊断、分类和靶向治疗策略。它为阐明 RNA 编辑基因的作用及其作为预后标志物在结肠癌中的临床意义提供了基本原理。© The Author(s) 2024。
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EXPERT OPINION ON THERAPEUTIC TARGETS
2024 Aug 19

PaoloMaione,Valentin...
Targeting ALK receptors in non-small cell lung cancer: what is the road ahead?
EXPERT OPINION ON THERAPEUTIC TARGETS
约 3-5% 的非小细胞肺癌 (NSCLC) 中发现了间变性淋巴瘤激酶 (ALK) 基因重排,ALK 重排 NSCLC 被认为是一种具有独特临床特征的癌基因成瘾性癌症。 几种 ALK 抑制剂已被研究并批准用于治疗晚期 ALK 重排 NSCLC,与化疗相比,其在疗效和安全性方面具有优越性。第二代和第三代 ALK 抑制剂(alectinib、brigatinib 和 lorlatinib)为 NSCLC 患者提供了具有临床意义的生存期延长和非常好的生活质量。然而,对这些药物的耐药性总是会发生,二线治疗的选择不太令人满意。这些药物之间无法进行直接比较,并且选择布加替尼、艾来替尼和劳拉替尼作为一线治疗仍然具有挑战性。最近,在切除的 IB-IIIA 期 ALK 重排 NSCLC 中,艾来替尼已被证明与化疗相比可以改善疗效,将 ALK 抑制剂提供的临床益处扩展到辅助治疗。 ALK 抑制剂在 NSCLC 治疗中的未来发展包括寻找一线治疗获得性耐药的最佳管理方法,并将 ALK 抑制剂的使用扩展到新辅助治疗,最好是围手术期治疗。
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EMBO REPORTS
2024 Aug 19

WonyoungJeong,Hyeryu...
Retinoic acid-induced protein 14 links mechanical forces to Hippo signaling.
EMBO REPORTS
细胞主要通过调节肌动蛋白细胞骨架来感知和响应来自细胞外基质的各种机械力。机械力可以通过称为机械转导的过程转化为生化信号。 Yes相关蛋白(YAP)是Hippo信号传导的效应子和机械转导的介质,但机械力如何调节Hippo信号传导仍然是一个悬而未决的问题。我们提出视黄酸诱导蛋白 14 (RAI14) 对机械力做出反应并调节 Hippo 信号传导。 RAI14 正向调节 YAP 的活性。 RAI14 与 Hippo 通路的关键组成部分 NF2 相互作用,并且相互作用发生在丝状肌动蛋白上。当细胞内的机械力保持较低水平时,NF2 与 RAI14 和丝状肌动蛋白分离,导致与 LATS1 的相互作用增加并激活 Hippo 通路。临床数据表明,肿瘤组织中的组织硬度以及 RAI14 和 YAP 的表达上调,并且 RAI14 与胃癌患者的不良结局密切相关。我们的数据表明,RAI14 将机械转导与 Hippo 信号传导联系起来,并介导 Hippo 相关的生物功能,例如癌症进展。© 2024。作者。
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Disease Models & Mechanisms
2024

XueyiZhao,LiuYang,Co...
The prognostic analysis of further axillary dissection in breast cancer with 1-2 positive sentinel lymph nodes undergoing mastectomy.
Disease Models & Mechanisms
ACOSOG Z0011 研究表明,对于有 1-2 个转移性前哨淋巴结 (SLN) 并同时进行保乳和术后放疗的患者,可以考虑进行腋窝淋巴结清扫术 (ALND)。然而,这种方法对于接受乳房切除术的患者的适用性仍存在争议。我们研究的目的是确定患有 1-2 个转移性 SLN 并接受乳房切除术的乳腺癌患者选择 ALND 的预后差异和风险因素。该研究对诊断为 cT1- 的患者进行了回顾性分析。 2016年1月至2021年12月期间在河北医科大学第四医院接受治疗的2N0乳腺癌患者,根据前哨淋巴结活检(SLNB)后是否进行ALND分为两个队列:SLNB队列和SLNB ALND队列。结果包括局部复发率(LRR)、无病生存率(DFS)和总生存率(OS)。进行倾向评分匹配(PSM)以确保两个队列之间变量的平衡。采用Cox比例风险模型来确定与生存相关的单变量和多变量相对风险。共纳入812例病例。 PSM之后,匹配了234个接收ALND和234个未接收ALND。观察到的中位随访期为 56.72 ± 20.29 个月。在此期间,SLNB ALND 队列和 SLNB 队列的 DFS 和 OS 没有显着差异(P = 0.208 和 P = 0.102),除了 40 岁以下的患者外,SLNB ALND 组与 SLNB 组相比 LRR 有所降低。 SLNB 组(11.1% vs. 2.12%,P = 0.044)。多变量 Cox 分析显示,年轻(≤ 40 岁)、孕激素受体(PR)阴性和单独 SLNB 是 LRR 的独立危险因素;神经周围侵犯是一个危险因素,而内分泌治疗是激素受体阳性患者 DFS 和 OS 的有益预后指标。ALND 不会影响已完成乳房切除术的 1-2 个转移性 SLN 患者的 DFS 和 OS。年龄较小(≤ 40 岁)、PR 阴性以及单独接受 SLNB 是 LRR 的独立危险因素。鉴于这一发现,我们建议对没有危险因素的患者避免进行腋窝治疗,例如 ALND 或放射治疗。版权所有 © 2024 赵、杨、曹和宋。
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Disease Models & Mechanisms
2024

YaxinJiang,ZimengLi,...
Risk prediction model for postoperative pneumonia in esophageal cancer patients: A systematic review.
Disease Models & Mechanisms
许多研究已经开发或验证了预测模型来估计食管癌(EC)患者术后肺炎(POP)的可能性。这些模型的质量及其对临床实践和未来研究的适用性评估仍然未知。本研究系统评估了食管癌手术患者发生 POP 的风险预测模型的偏倚风险和适用性。PubMed、Embase、Web of Science、Cochrane Library、Cumulative Index to Nursing and Allied Health Documentation (CINAHL)、China National Knowledge检索中国知网(CNKI)、中国科技期刊数据库(维普)、万方数据库和中国生物医学文献数据库,检索时间为建库至2024年3月12日。两名研究者独立筛选文献并提取数据。采用预测模型偏倚风险评估工具(PROBAST)检查表来评估偏倚风险和适用性。共纳入14项研究,涉及23个模型。这些研究主要发表于2014年至2023年之间。所有研究的适用性都很好。然而,所有研究都存在较高的偏倚风险,主要原因是数据来源不当、样本量不足、变量处理不合理和数据缺失以及缺乏模型验证。食管癌手术患者POP发生率为14.60%~39.26%。最常用的预测因素是吸烟、年龄、慢性阻塞性肺病(COPD)、糖尿病和开胸手术方法。模型间区分度范围为 0.627 至 0.850,敏感性范围为 60.7% 至 84.0%,特异性范围为 59.1% 至 83.9%。 在所有纳入的研究中,食管癌手术患者 POP 风险预测模型均具有良好的区分度,表明模型性能稳定。然而,根据 PROBAST 检查表,所有研究都存在很高的偏倚风险。未来的研究应使用预测模型评估工具来改进研究设计并开发具有更大样本和多中心外部验证的新模型。https://www.crd.york.ac.uk/prospero,标识符 CRD42024527085。版权所有 © 2024 Jiang, Li 、蒋、魏、陈。
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug

AkramIAhmed,AhmedElS...
Gastric intestinal metaplasia regression in United States population: A retrospective longitudinal study.
Disease Models & Mechanisms
胃癌是一个健康问题,并导致与癌症相关的死亡。胃肠化生(GIM)是胃癌的癌前病变。目前,与 GIM 回归相关的因素尚未得到充分研究。本研究旨在评估 GIM 消退率并确定与其相关的因素。本研究在 Medstar 华盛顿医院中心进行。我们纳入了 2015 年 1 月至 2020 年 12 月期间患有 GIM 的患者。人群分为 GIM 持续期或消退期。数据包括人口统计、食管胃十二指肠镜检查结果、幽门螺杆菌状况和实验室结果。统计分析包括 Kaplan-Meier 和 Cox 比例模型,以探索 GIM 回归的预测因素。在 2375 名患者中,9.1% 患有 GIM。值得注意的是,85 名患者出现 GIM 消退,132 名患者出现持续性 GIM。非裔美国人构成回归组(75%)和坚持组(76%)。回归组中,基线时有 12.9% 的人患有消化性溃疡 (PUD),随访时这一比例为 5.9%;坚持组基线时为 11.4%,随访时为 5.3%(P = 0.89)。回归分析显示,PUD 的存在与较高的回归率相关(风险比 [HR] 2.46,P = 0.013)。吸烟状况显示回归率较低(HR 0.54 和 0.62,P = 0.038 和 0.169)。在胃图上,非裔美国人、西班牙裔和其他种族/族裔的个体显示出较低的 GIM 回归率(HR 0.68、0.78 和 0.69)。PUD 与较高的 GIM 回归率相关,而吸烟则表现出较低的回归率。结果提供了对影响非裔美国人群体 GIM 消退的因素的见解,并可能为未来的监测和治疗策略提供信息。© 2024 作者。 JGH Open 由 Journal of Gastroenterology and Hepatology Foundation 和 John Wiley 出版
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Disease Models & Mechanisms
2024 Aug 20

YashuhiroArakawa,Fat...
A Database Tool Integrating Genomic and Pharmacologic Data from Adrenocortical Carcinoma (ACC) Cell Lines, PDX, and Patient Samples.
Disease Models & Mechanisms
肾上腺皮质癌(ACC)是一种罕见且高度异质性的疾病,由于诊断和治疗面临巨大挑战,预后极差。强调精准医学的重要性,人们越来越需要全面的基因组资源以及完善的实验模型来制定个性化的治疗策略。我们推出了 ACC_CellMinerCDB,这是一个实质性基因组和药物敏感性数据库(可在 https://discover.nci.nih.gov/acc_cellminercdb 获取),包含 ACC 细胞系、患者来源的异种移植物、手术样本,以及对 2,400 多种药物检查的反应NCI 和 NCATS。该数据库揭示了 ACC 细胞系和手术样本之间共享的基因组通路,从而验证了细胞系作为研究模型的有效性。它还允许探索相关的治疗标志物,如 MDR-1、SOAT1、MGMT、MMR 和 SLFN11,并引入重新利用替莫唑胺等药物用于 ACC 治疗的潜力。 ACC_CellMinerCDB 为探索更大的临床前 ACC 模型提供了基础。
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DIABETES & METABOLISM
2024 Dec

CatherineDearie,Chri...
Adult mortality from non-communicable diseases in Fiji's major ethnic groups 2013-17.
DIABETES & METABOLISM
可持续发展目标 3.4.1 (SDG3.4.1) 的目标是到 2030 年(相对于 2015 年)将 30-69 岁非传染性疾病 (NCD) 死亡率降低三分之一。指导干预措施以实现这一目标需要对根本死因(UCoD)进行可靠的估计。当心血管疾病(CVD)和糖尿病同时存在时,由于此类死亡的证明缺乏一致性,这可能会出现问题。我们根据经验估计斐济 2013-17 年非传染性疾病死亡率,按性别和种族划分,包括 CVD、糖尿病、癌症和慢性下呼吸道疾病 (CRD),并汇总为 NCD4。UCoD 根据死因医学证明确定( MCCD)由斐济卫生部在对存在糖尿病和/或高血压的死亡率数据进行预处理后生成,以生成具有国际可比性的 UCoD。如果 MCCD 第 I 部分(直接原因)中的这些原因没有伴随糖尿病或高血压的潜在致命并发症,则这些情况将重新分配到第 II 部分(促成原因)。按原因计算了 30 岁的人在 70 岁之前死亡的概率 (PoD30-70)。 2013-17 年 NCD4 的 PoD30-70 因性别和种族而异:女性为 36 i-Taukei 为 % (95%CI 35-37%),印度裔斐济人 (FID) 为 27% (26-28%);男性中,i-Taukei 和 FID 中的这一比例均为 41% (40-42%)。女性中 CVD、糖尿病、癌症和 CRD 的 PoD30-70 比例为:18%、10%、13% 和 1·0% i-Taukei; FID 中为 13%、10%、5·6% 和 1·1%;男性中 i-Taukei 的比例为:28%、8.4%、7·6% 和 2·2%; FID 为 31%、8.3%、3.5% 和 3·1%。为了到 2030 年在斐济实现 SDG3.4.1 目标,需要针对多种非传染性疾病采取有效的全民和特定种族干预措施,以将 PoD30-70 从 NCD4 减少:从 36 i-Taukei 女性为 % 至 24%,FID 女性为 27% 至 18%; i-Taukei 和 FID 男性中的比例从 41% 降至 27%。不适用。© 2024 作者。由爱思唯尔公司出版
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024

NaLi,Yue-XiangRen,He...
Prognostic Value of Anti-Chlamydia Trachomatis IgG in Breast Cancer and the Modification Effects of Pro-Inflammatory Cytokines: A 13-Year Prospective Cohort Study.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
沙眼衣原体(C. trachomatis)与多种妇科肿瘤有关;但其在乳腺癌中的预后作用仍不清楚。因此,我们研究了抗 C 蛋白的预后作用。乳腺癌患者沙眼衣原体免疫球蛋白G(IgG)及其促炎细胞因子的修饰作用。检测血清沙眼衣原体IgG和4种促炎细胞因子的水平。使用Cox回归计算风险比(HR)和95%置信区间(CI),包括乘积术语来评估促炎细胞因子对沙眼衣原体IgG与乳腺癌预后之间关联的修改效果。2008年至2018年,招募了1121名乳腺癌患者并随访至2021年12月31日,中位随访时间为63.91个月(四分位距:39.16-90.08个月)。与阴性患者相比,沙眼衣原体 IgG 呈阳性的患者总生存期 (OS) 的 HR 为 1.09 (95% CI,0.67-1.78),无进展生存期 (PFS) 的 HR 为 1.24 (0.87-1.78)。这些关联在 50 岁或以下的女性中变得具有统计学意义(OS 的 HR=1.43,95% CI=0.79-2.58;PFS 的 HR=1.79,95% CI=1.16-2.77)。沙眼衣原体 IgG 血清学阳性与促炎细胞因子(IL-6、TNF-α、IL-8 和 IL-1β)水平较高的患者的不良预后影响相关,但对于促炎细胞因子(IL-6、TNF-α、IL-8 和 IL-1β)水平较低的患者则具有良好的预后影响。水平。这些相互作用在 50 岁或以下的患者中尤其显着。在 50 岁以下或促炎细胞因子水平较高的乳腺癌患者中,沙眼衣原体感染似乎会对预后产生负面影响。这些发现强调了沙眼衣原体在预测乳腺癌患者预后和个性化治疗方面的重要性。© 2024 Li et al.
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2024 Aug

GoKamoshida,DaikiYam...
Development of a novel bacterial production system for recombinant bioactive proteins completely free from endotoxin contamination.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
内毒素或脂多糖 (LPS) 是细菌重组蛋白表达系统中备受关注的有效免疫刺激分子。革兰氏阴性细菌鲍曼不动杆菌表现出有趣且独特的表型,其特征是 LPS 完全丧失。在这项研究中,我们开发了一种新的系统,使用 LPS 缺陷的鲍曼不动杆菌生产完全没有内毒素污染的重组蛋白。我们纯化了无内毒素的功能性绿色荧光蛋白,将内毒素污染减少了大约三个数量级,并且还纯化了功能性细胞因子肿瘤坏死因子(TNF)-α。此外,利用鲍曼不动杆菌的Omp38信号肽能够在细胞外产生重链抗体的重链可变域(VHH)。凭借这些优势,从培养上清液中纯化出与严重急性呼吸综合征冠状病毒2型刺突蛋白特异性结合的多价VHH mNb6-tri-20aa,内毒素污染比传统方法减少约2×105倍。传统表达系统中的情况。病毒中和试验证明了纯化抗体在抑制病毒感染方面的功能。此外,我们应用我们的系统生产 ozoralizumab,这是一种多特异性 VHH,可与人 TNF-α 和白蛋白结合,并作为类风湿关节炎药物上市。我们成功地从内毒素污染中纯化出功能性抗体。该系统建立了一个新的、完全无内毒素的重组蛋白表达平台,这使其有别于其他细菌表达系统,并为未来的应用带来了希望。© 作者 2024。由牛津大学出版社代表美国国家科学院。
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