研究动态
Articles below are published ahead of final publication in an issue. Please cite articles in the following format: authors, (year), title, journal, DOI.
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ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
2023 Sep 13
RulanMa,TuanheSun,Xu...
Chronic exposure to low-dose deltamethrin can lead to colon tissue injury through PRDX1 inactivation-induced mitochondrial oxidative stress injury and gut microbial dysbiosis.
ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY
迄今为止,仍不清楚溴氰菊酯(DLM)的摄入是否会对结肠组织造成损害。因此,本研究旨在阐明长期暴露于低剂量DLM对结肠组织的影响及其潜在机制。小鼠经DLM(0.2 mg/kg/天)或DLM联合N-乙酰-L-半胱氨酸(NAC)(50 mg/kg/天)处理8周。人结肠癌细胞(HCT-116)被处理DLM(0、25、50或100µM)、NAC(2mM)或过表达过氧化还蛋白1(PRDX1)靶向质粒48小时。使用DLM快速检测卡检测DLM。使用苏木精-伊红染色和透射电镜评估结肠损伤。使用免疫荧光染色(IF)、免疫印迹(WB)和流式细胞术(FC)测定细胞凋亡。使用MitoTracker、JC-1和谷胱甘肽(GSH)检测来检测线粒体氧化应激。通过16S rDNA测序,鉴定肠道菌群。长期经口给予小鼠DLM后,DLM积聚在结肠组织和粪便中。有趣的是,我们的结果显示,即使在低剂量下,长期摄入DLM会导致严重的体重减轻,并减少疾病活动指数评分和结肠长度。IF、WB和FC的结果显示,DLM诱导了结肠组织和细胞的凋亡。MitoTracker、JC-1和GSH检测显示,DLM增加了结肠上皮细胞的线粒体应激。机制研究表明,线粒体应激和凋亡的增加是由PRDX1抑制介导的。进一步实验显示,PRDX1的过表达显著减轻了DLM诱导的氧化应激损伤和凋亡。此外,我们观察到,长期暴露于DLM改变了小鼠肠道菌群的组成,包括Odoribacter和Bacteroides的增加以及Lactobacillus的减少。DLM暴露后,小鼠肠道微生物的种群丰富度减少。体内外NAC补充剂缓解了DLM诱导的氧化应激损伤、结肠上皮细胞凋亡和肠道菌群失调。长期暴露于DLM,即使在低剂量下,也会对结肠组织造成损害,这是不能忽视的。应严格控制类似DLM的农药在农业生产过程中的生产和使用。Copyright © 2023 The Authors. Published by Elsevier Inc. All rights reserved.
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DRUG DISCOVERY TODAY
2023 Sep 13
YanyanQu,TingLi,Zhic...
DICTrank: The largest reference list of 1318 human drugs ranked by risk of drug-induced cardiotoxicity using FDA labeling.
DRUG DISCOVERY TODAY
药物诱导心脏毒性(DICT)是药物试验失败和中止的主要原因。当前的心脏毒性药物标注主要关注个别结果或机制。考虑到广泛的心脏不良事件谱系,我们利用FDA标签开发了药物诱导心脏毒性排名(DICTrank),并将1318种人用药分为四个类别:大部分DICT相关(341例),较少DICT相关(528例),无DICT相关(343例)和模糊DICT相关(106例)。值得注意的是,DICTrank涵盖了多种治疗类别,其中有几种富含大部分DICT相关的药物,如抗肿瘤药物、性激素、抗炎药物、β受体阻断剂和心脏疗法。DICTrank目前提供了最大的DICT标注药物清单,并且它在药物研发以及其他方面的DICT风险早期识别的新方法开发方面具有潜力。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Sep 15
RodrigoRodriguesPess...
Relative impact of lymph-node metastasis and seminal vesical invasion on oncologic outcomes following radical prostatectomy.
Disease Models & Mechanisms
虽然在进行根治性前列腺切除术(RP)的男性中,精囊(SVI)和淋巴结侵犯(LNI)都被认为是不良预后因素,但这些特征对随后的肿瘤学结果的相对影响尚未明确定义。我们评估了LNI对RP患有SVI的患者长期肿瘤学结果的影响。我们对19519名接受RP的患者进行了回顾性研究,并发现其中2043例患有SVI。对于SVI患者,根据盆腔淋巴结转移的存在和数量,估计了无转移生存期(MFS)、仅癌症相关生存期(CSS)和总生存期(OS)。应用Cox比例风险模型,评估了SVI患者中转移节点数量和淋巴结密度与肿瘤学结果的独立关联,同时控制年龄、手术年份、切缘状况、术前PSA、病理格里森分级、前列腺外扩展和辅助治疗的使用。 在中位随访12.1年(IQR 7.0,18.6)后,有548名患者出现转移性疾病并且1331名患者死亡,其中包括406名死于前列腺癌(PCa)的患者。我们发现,在SVI患者中,单个阳性淋巴结的存在与RP时没有淋巴结转移相比,并不导致进一步不利的肿瘤学结果,其中10年的MFS、CSS和OS分别为81.3%与78.3%(p = 0.18),86.5%与89.8%(p = 0.32)和72.8%与76.7%(p = 0.53)。相反,在多变量分析中,≥2个转移节点的存在和20%淋巴结密度截断仍然与更差的生存率相关。 SVI代表一种不良的病理特征,单个盆腔淋巴结的存在不会进一步不利地影响预后。与此同时,大量受累节点与生存率降低相关。这些发现可能有助于对此类高危患者进行风险分层和临床试验设计。
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Disease Models & Mechanisms
2023 Sep 16
Jia-WeiShi,Jiang-Nan...
Association of serum 25-hydroxyvitamin D levels with all-cause and cause-specific mortality among postmenopausal females: results from NHANES.
Disease Models & Mechanisms
维生素D缺乏在人群中很常见,但其与绝经后女性的死亡率之间的关系尚不清楚。本研究的目的是探讨血清25-羟基维生素D(25(OH)D)与美国绝经后妇女的总体和特定死亡率之间的关联。本研究纳入了来自国家健康与营养调查(NHANES)的6812名绝经后女性参与者(2001-2018年)。通过与国家死亡指数(NDI)记录的连接,确认了随访的死亡状况,截至2019年12月31日。我们使用Cox比例风险模型估计血清25(OH)D浓度与绝经后女性的死亡率的关联。血清25(OH)D的平均水平为72.57±29.93 nmol/L,65.34%的人缺乏维生素D。绝经后女性中,血清25(OH)D浓度较低与糖化血红蛋白、血糖水平较高以及高密度脂蛋白水平较低显著相关。随访期间,发生了1448例总体死亡,其中包括393例心血管疾病(CVD)相关死亡和263例癌症死亡。多变量调整后,血清25(OH)D水平升高与总体和CVD死亡率降低显著相关。此外,血清25(OH)D与总体死亡率呈L型关系,而与CVD死亡率呈U型关系,截断值分别为73.89 nmol/L和46.75 nmol/L。绝经后女性中低血清25(OH)D水平与更高的总体和CVD死亡风险相关。这些发现为绝经后妇女的健康管理提供了新的思路和目标。© 2023. BioMed Central Ltd., Springer Nature的一部分。
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CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
2023 Sep 13
RuiyuWang,HuiYe,Bowe...
m6A-modified circNFIX promotes ovarian cancer progression and immune escape via activating IL-6R/JAK1/STAT3 signaling by sponging miR-647.
CYTOKINE & GROWTH FACTOR REVIEWS
卵巢癌(OC)是最常见的妇科恶性肿瘤之一。我们先前的研究证实,circNFIX在OC中起着癌基因的作用,能够促进恶性增殖、转移和血管生成。然而,circNFIX在OC免疫逃脱中的作用和机制仍然不清楚。通过qRT-PCR和蛋白质免疫印迹法测定RNA和蛋白质水平,通过细胞计数试剂盒-8、EdU染色、流式细胞术和转移试验测试恶性表型,通过ELISA分析测量免疫细胞因子水平。通过RNA免疫共沉淀、meRIP和双荧光酶方法验证分子相互作用。通过异种移植瘤和肺转移模型进行体内验证。通过苏木精-伊红染色和免疫组织化学染色观察病理变化。circNFIX、PD-L1和IL-6R水平在OC组织和细胞系中上调,而miR-647下调。功能实验显示,circNFIX的丧失抑制了OC细胞的增殖、转移和免疫逃脱。在分子水平上,circNFIX的m6A修饰在OC细胞中上调,并且其表达与m6A修饰呈正相关,依赖于IGF2BP1 ∼ 3的识别。此外,circNFIX作为一个竞争性内源性RNA,通过上调IL-6R表达,从而激活JAK/STAT3信号通路,提高PD-L1表达。救援实验证明,共沉默miR-647可以逆转circNFIX敲除对OC细胞增殖、转移和免疫逃脱的抗肿瘤效应。本研究对于circNFIX在OC中的分子机制提供了综合的理解,证明m6A活化的circNFIX通过调节miR-647/IL-6R/PD-L1通路促进OC的发展和免疫逃脱。版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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Biology of Sex Differences
2023 Sep 15
KangNing,YuluPeng,Yu...
Sex differences in renal cell carcinoma: a single-cell analysis reveals exhausted CD8+ T-cells highly infiltrated in males.
Biology of Sex Differences
尽管已报道肾细胞癌(RCC)的发展和进展存在性别偏差,但其潜在机制仍然神秘。在这里,我们调查了 RCC 肿瘤微环境(TME)中的性别差异,并探索了一种有效增强免疫疗法疗效的药物组合方案。我们分析了四个已发表数据集的单细胞 RNA 测序(scRNA-seq)数据,以调查 RCC 患者的性别差异,并通过多重免疫荧光(MxIF)和流式细胞术(FCM)收集肿瘤组织以验证性别差异。在体内和体外实验中探究了雄激素 - 雄激素受体轴在性别差异中的作用。我们对来自220,156个细胞的scRNA-seq数据进行了分析,以及MxIF和FCM试验,发现CD8 + T细胞高度浸润在男性 RCC 的 TME 中,但大部分处于一种衰竭和功能不全的状态。体内和体外实验表明,男性 TME 中 CD8 + T 细胞的功能不全和衰竭是由雄激素诱导的。临床上,较高的血清雄激素与男性 RCC 患者接受免疫疗法的预后较差显著相关。雄激素受体抑制剂能够激活肿瘤浸润的 CD8 + T 细胞,在体内增强 RCC 的免疫疗法疗效。我们的研究揭示了男性和女性 RCC 患者之间 TME 的差异,并证明雄激素 - 雄激素受体轴在男性 RCC 的免疫抑制中起重要作用。我们的发现表明,雄激素受体抑制剂与免疫疗法的联用可能是男性 RCC 患者的一种有前途的治疗选择。© 2023. Society for Women's Health Research and BioMed Central Ltd.
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 15
AndreaNuschke,Caitri...
Use of Magnetotactic Bacteria as an MRI Contrast Agent for In Vivo Tracking of Adoptively Transferred Immune Cells.
Stem Cell Research & Therapy
体内免疫细胞追踪技术利用磁共振成像(MRI)是研究癌症治疗成功机制的有价值工具。目前使用超顺磁铁氧化物(SPIO)标记细胞的方法缺乏持久性,无法长期追踪移植细胞的命运和位置。Magnetospirillum magneticum 是一种商业可用、产生铁的细菌,可以被哺乳动物细胞作为磁共生体(MEs)摄取并和谐共存。MEs在体内干细胞和癌细胞追踪方面表现出潜力,但在免疫细胞方面尚未得到评估。该初步研究探讨了将MEs标记应用于髓源性抑制细胞(MDSCs)、细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)和树突状细胞(DCs)的效果,并对细胞纯度、功能和MRI对比度进行了评估。MDSCs、CTLs和DCs与MEs在不同的ME标记比例(MLR)下共培养,评估了各种生物学指标和铁摄取。MDSCs在体内成像时,采用MEs或SPIO(Molday ION Rhodamine B)进行了标记,然后通过尾静脉注射到C3肿瘤携带的小鼠体内,并在植入后的第24天开始每天使用MRI进行扫描,以评估细胞定量。培养后,MDSCs的铁含量超过0.6 pg Fe/细胞。CTLs的铁载荷小于0.5 pg/细胞,而DCs的铁载荷约为1.4 pg/细胞。MDSCs在1000 MLR下的抑制功能受ME标记的影响不大,但在2000 MLR下受到影响。CTL功能异常标记物受ME标记的影响不大,DC标记物也没有明显受到影响。体内数据显示,用MEs标记的MDSCs在TurboSPI中生成足够的对比度,与SPIO标记的细胞类似。细胞可以标记足够数量的MEs以在MRI中可检测,同时不影响细胞存活。需注意在较高浓度的MEs下,可能会影响某些细胞类型的功能活性和/或形态。对于具有最小吞噬行为的免疫细胞,在与MEs共培养后,每个细胞的铁含量较低,相比于SPIO。然而,MEs可以成功用作吞噬性免疫细胞的对比剂。©2023. 作者,独家授权给World Molecular Imaging Society.
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 09
ShashaCheng,CuilingZ...
Ultrasensitive determination of surface proteins on tumor-derived small extracellular vesicles for breast cancer identification based on lanthanide-activated signal amplification strategy.
Stem Cell Research & Therapy
小体外囊泡(sEVs)携带着从母细胞继承而来的多种与肿瘤相关的蛋白质,在非侵袭性乳腺癌(BC)诊断中起到关键作用。然而,由于高度异质性的BC,评估sEV膜表面蛋白质的微小变异是具有挑战性的。因此,基于镧系(Ln3+)激活的荧光信号放大机制,我们开发了一种简单而超灵敏的检测方法,能够检测到BC来源的sEV上的多个表面蛋白质。通过NaEuF4基纳米探针的溶解放大荧光信号,能够以高灵敏度和特异性很好地识别sEVs上的多个蛋白生物标志物。我们运用线性判别分析成功区分三阴性BC细胞(MDA-MB-231细胞)来源的sEVs与其他乳腺细胞系(MCF-7、SK-BR-3、BT474和MCF-10A细胞)。此外,该策略还能够高准确度地区分BC患者和健康供体的进展阶段。这种简单而敏感的信号放大策略在通过对sEVs进行精确蛋白质分析方面展现了巨大的潜力,可用于早期临床诊断。版权所有©2023 Elsevier B.V.保留所有权利。
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COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
2023 Sep 09
JiayuanZhang,Yunqing...
Constructing heterogeneous single-cell landscape and identifying microenvironment molecular characteristics of primary and lymphatic metastatic head and neck squamous cell carcinoma.
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE
头颈鳞状细胞癌(HNSCC)占头颈肿瘤的超过一半,大约90%。本研究重点是利用单细胞和批量转录组数据构建异质性景观,以识别原发性和淋巴转移性头颈鳞状细胞癌微环境的分子特征。本研究纳入了23例具有scRNA-seq数据的HNSCC样本和546例TCGA的HNSCC样本。我们使用了Monocle对细胞进行排序,并使用CellPhoneDB来探索细胞间的相互作用。Infercnv是用来根据单细胞测序转录组数据推断出具有明显拷贝数变异的细胞的工具。我们重新评估了HNSCC批量RNA转录组数据,以表征不同细胞类型在塑造HNSCC的免疫微环境中的功能。我们结合了谱系重构、CNV推断和细胞相互作用来揭示不同疾病状态下不同细胞群体的特征,癌细胞和免疫细胞系谱的分化轨迹以及非免疫和免疫细胞之间的相互作用。PD-1和PD-L1/PD-L2在T细胞中表达非常罕见,免疫检查点分子KLRB1-CLEC2D达到高水平表达。我们鉴定了与HNSCC患者预后相关的基于微环境的三种HNSCC亚型。总之,本研究对原发性和转移性HNSCC的肿瘤内异质性和免疫微环境进行了解剖,对揭示不同疾病状态下HNSCC对免疫疗法抵抗机制的重要性至关重要,并有望有助于进一步研究HNSCC细胞转移机制和指导临床患者的治疗。版权所有©2023 Elsevier Ltd.
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Comput Meth Prog Bio
2023 Aug 19
JingLi,HuayuGao,Nany...
High-security automatic path planning of radiofrequency ablation for liver tumors.
Comput Meth Prog Bio
射频消融(RFA)是治疗肝肿瘤的有效方法。术前路径规划在RFA治疗中扮演着关键角色,需要医生具备丰富的经验和能力。具体而言,正确且高效的术前路径规划应确保穿刺过程的整体安全性、肿瘤完全消融以及对健康组织的最小损伤。本文提出了一种针对肝肿瘤的高安全性自动多点穿刺路径规划方法,研究了在综合临床约束下优化消融次数、穿刺次数、目标位置和穿刺点位置的问题。特别地,考虑了穿刺路径的安全性和消融椭球体的分布。详细讨论了每个约束对整个穿刺过程安全性的影响。在此基础上,通过简化计算数据和优化变量明显提高了规划方法的效率。此外,还对所提出的方法在大小肿瘤上的性能和适应性进行了比较和总结。本文在7例患者的10个具有不同几何特征的肝肿瘤上进行了评估。测试结果显示,平均路径规划时间为41.4秒,平均消融效率为60.19%。对于不同大小的肿瘤,所提出的方法得到的规划结果具有相似的健康组织覆盖率。经过医生的临床评估,规划结果满足RFA治疗肝肿瘤的需求。所提出的方法能够提供合理的RFA规划穿刺路径,有助于确保肝肿瘤消融的安全性和效率。版权所有 © 2023 Elsevier B.V. 发表。
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