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Cell Discovery
2023 Sep 15

ShuyuZhai,JieweiLin,...
A microprotein N1DARP encoded by LINC00261 promotes Notch1 intracellular domain (N1ICD) degradation via disrupting USP10-N1ICD interaction to inhibit chemoresistance in Notch1-hyperactivated pancreatic cancer.
Cell Discovery
胰腺癌细胞中显著激活的Notch信号通路在癌变、化疗抗性和复发中起重要作用。靶向该通路是胰腺癌的一个有前途的治疗策略,然而目前已报道的成功途径很少,目前使用的该通路的分子抑制剂在临床上的益处有限。在本研究中,我们鉴定了一个以前尚未表征的微小蛋白,Notch1降解相关调控多肽(N1DARP),由LINC00261编码。N1DARP敲除加速了胰腺癌器官样体和LSL-Kras、LSL-Trp53、Pdx1-Cre(KPC)小鼠中的肿瘤进展,并增强了其干细胞特性。机制上,N1DARP通过竞争性破坏N1ICD和泛素特异性肽酶10(USP10)之间的相互作用,抑制了Notch1经典和非经典通路,从而促进了N1ICD的K11和K48链聚泛素化。为评估N1DARP的治疗潜力,我们设计了一种可细胞穿透的稳定多肽SAH-mAH2-5,其螺旋结构与N1DARP相似,具有出色的物理化学稳定性。SAH-mAH2-5与N1ICD相互作用,并促进了N1ICD的蛋白酶体介导降解。在Notch1激活的胰腺癌模型中,SAH-mAH2-5注射提供了实质性的治疗效益,同时具有有限的非靶向和系统性不良反应。综上,这些发现确认了N1DARP通过调控USP10-Notch1致癌信号通路来发挥肿瘤抑制和化敏作用,并暗示了通过靶向N1DARP-N1ICD相互作用的有前途的胰腺癌治疗策略。 © 2023. 中国科学院分子细胞科学卓越中心。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 15

RongfenTai,JinjunLen...
Construction of the metabolic reprogramming-associated gene signature for clear cell renal cell carcinoma prognosis prediction.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
代谢重编程是肿瘤生长、转移、进展和预后不佳的标志。然而,在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中,代谢相关分子模式和机制仍不清楚。本研究的目的是鉴定代谢相关分子模式,并调查代谢相关聚类的特征和预后价值。我们在TCGA数据库上综合分析了ccRCC的差异表达基因(DEGs)和代谢相关基因(MAGs)。采用一致性聚类方法构建了代谢相关的分子模式。然后,分析了生物功能、分子特征、评估/免疫/基质评分、免疫细胞浸润、免疫治疗和化疗的反应。我们还鉴定了亚聚类之间的DEGs,并基于LASSO回归cox分析、单变量和多变量cox回归分析构建了一个预测不良风险的签名和风险模型。然后,通过校准曲线构建和验证了一个预测的诊断图表。我们鉴定了1942个ccRCC肿瘤与正常样本之间的DEGs(1004个上调和838个下调),并从这些DEGs中筛选出了254个MAGs。然后,将526个ccRCC患者分为两个亚聚类。在第2聚类中富集了7个与代谢相关的通路。第2聚类具有较高的评估/免疫/基质评分和较差的生存率。而第1聚类具有更高的免疫细胞浸润、免疫检查点、IFN、HLA、免疫激活相关基因的表达、对抗CTLA4治疗和化疗的反应。此外,我们鉴定了两个代谢相关亚聚类之间的295个DEGs,并构建了一个15个基因的签名和9个风险因素。然后,计算了一个风险评分,并将患者分为TCGA-KIRC和E-MTAB-1980数据集中的高风险组和低风险组。通过ROC曲线验证了风险评分的预测能力。最后,临床病理特征(年龄和分期)、风险评分和分子聚类被鉴定为独立的预后变量,并用于构建1年、3年、5年的整体生存预测诊断图。校准曲线用于验证诊断图的预测能力。我们的发现鉴定了ccRCC的两个代谢相关分子亚聚类,有助于估计免疫治疗和化疗后的反应以及预后。© 2023年 BioMed Central Ltd., part of Springer Nature.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 15

SoniaJaramillo,Lucia...
Q-HAM: a multicenter upfront randomized phase II trial of quizartinib and high-dose Ara-C plus mitoxantrone in relapsed/refractory AML with FLT3-ITD.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
急性髓系白血病(AML)的老年患者中,约有50%无法通过胞嘧啶加蒽环类化疗方案实现完全缓解(CR)。救治化疗方案基于高剂量胞嘧啶(HiDAC),常与米托蒽醌(HAM方案)联合使用。然而,CR率仍然较低,不足三分之一的患者实现CR。FLT3-ITD在复发和难治(r/r)AML中一直被认为是一个不利的分子标记。四分之一接受米多吡喹酮的患者对诱导治疗难以奏效,并且2年复发率超过40%。口服二代联芳基尿素酪氨酸激酶抑制剂奎扎替尼是一种非常选择性的FLT3抑制剂,具有持久的FLT3抑制能力,并具有可接受的毒副作用。在这个多中心、上位随机分组的II期试验中,所有患者在救治疗法中接受奎扎替尼与HAM(胞嘧啶每天三次3g/m2,第一天到第三天;米托蒽醌每天10mg/m2,第二天和第三天)联合治疗。通过与历史对照组比较,采用匹配阈值交叉的方法评估疗效,以CR、具有不完全血液学恢复的完全缓解(CRi)以及外周血细胞计数部分恢复的完全缓解(CRh)作为主要终点。在巩固治疗期间(化疗和异基因造血干细胞移植),根据上位随机分组,患者接受预防性奎扎替尼治疗或根据可测残留病变触发的奎扎替尼预防性持续治疗。匹配阈值交叉方法是一种新颖的研究设计,可以通过包括历史对照研究中的匹配控制组来加强经典的单臂试验设计。它克服了单臂试验和小规模随机试验的常见缺点,因为观察到的研究人群预期结果可以根据具有可比已知预后和预测因素分布的匹配对照进行调整。此外,平衡的治疗组可以产生稳定的统计模型。然而,本研究的局限之一是无法调整未观察到或未知的混杂因素。对于解决主要终点,在救治疗法后的CR/CRi/CRh,评估了最大样本量为80例患者,由使用的自适应设计生成期望功率,假设在单侧显著性水平α=0.05下进行逻辑回归,期望功率是0.8,并且每个干预患者的匹配配对数至少为1。在纳入20例患者后,将根据条件功效论对试验样本量进行中期分析和重新计算。目前,还没有被普遍认可的救治化疗标准。救治疗法的目的是降低白血病负荷,实现可能的最佳缓解,并进行造血干细胞移植。因此,在FLT3-ITD突变患者中,将奎扎替尼与强化救治疗法相比较,与单独化疗相比,从疗效和安全性方面看是一种合乎逻辑的结果。已经获得了伦理批准和当地及联邦主管机关的批准。试验结果将通过同行评审期刊发表,并在会议和科学会议上报告。ClinicalTrials.gov注册编码:NCT03989713;EudraCT号:2018-002675-17. © 2023. BioMed Central公司,Springer Nature旗下。
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Journal for ImmunoTherapy of Cancer
2023 Sep

NicholasLucchesi,Jen...
Complete response to immunotherapy in a patient with high-risk stage III colorectal cancer after ctDNA-guided detection of early adjuvant treatment failure.
Journal for ImmunoTherapy of Cancer
III期结直肠癌(CRC)的标准治疗是行根治性切除手术并辅以辅助化疗(ACT)。尤其对于高危患者,III期疾病有很高的复发风险,因此密切监测疾病非常重要。现已确立外周血循环肿瘤DNA(ctDNA)作为早期检测疾病复发以及术后风险分层的有效方法。然而,目前还缺乏使用ctDNA评估ACT疗效以及根据这些数据实时调整治疗的成熟方案。本文描述了一例高危III期结直肠癌患者,早期检测到ACT失败,并根据上升的ctDNA水平迅速改变了治疗方案。该患者经过检查点抑制剂免疫疗法,出现了完全的放射学和临床反应,在18个月后仍无疾病复发。该例表明了ctDNA如何在评估正在进行的治疗的有效性以及推动实时改变治疗而减少不必要的化疗毒性方面具有良好的前景。© 作者(或其雇主)2023年。在CC BY-NC许可下可重复使用。不可商业复制。由BMJ出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 11

GuangHuang,DevonHuce...
Applications of oxetanes in drug discovery and medicinal chemistry.
Epigenetics & Chromatin
紧凑而多功能的氧杂环丙烷基团在药物发现和药物化学研究中引起了极大的关注。本综述文章概述了氧杂环丙烷在临床和临床前候选药物中的广泛应用,针对癌症、病毒感染、自身免疫性疾病、神经退行性疾病、代谢性疾病等各种人类疾病进行了目标定位。重点讨论了生物活性氧杂环丙烷基化合物及其与疾病相关的靶点,如激酶、表观遗传和非表观遗传酶以及受体。本综述还详细描述了氧杂环丙烷基团对一些重要性能的影响,包括溶解度、亲脂性、pKa值、P-糖蛋白(P-gp)外排、代谢稳定性、构象偏好、毒性特性(例如细胞色素P450(CYP)抑制和人类-麻痹-去相关基因(hERG)抑制)以及药物动力学(PK)性质、药效、靶向选择性。我们预计,本研究将提供有价值的见解,推动新型生物活性氧杂环丙烷基小分子的未来发现,使其能够有效应用于各种人类疾病的治疗。版权所有©2023 Elsevier Masson SAS。保留所有权利。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 09

LiangZhang,Qingzheng...
Regulation of main ncRNAs by polyphenols: A novel anticancer therapeutic approach.
Epigenetics & Chromatin
植物多酚在抗癌治疗方面显示出了令人充满希望的应用。越来越多的证据表明,多酚对多种癌症具有抗肿瘤潜力。非编码RNA(ncRNA),主要包括小型ncRNA(microRNA)和长ncRNA(lncRNA),在癌症的发生和发展中起着关键作用。为了确立多酚对ncRNA的调节作为一种新型和有希望的抗癌治疗方法,本研究利用ncRNA、miRNA、lncRNA和调控机制等关键词,从PubMed、Web of Science、Science Direct和Google Scholar检索文献,时间跨度为2003年至2023年的20年。本研究批判性地审查了当前的文献,并呈现了多酚对突出的ncRNA的调控情况。共检索到169篇关于多酚及其相关ncRNA在癌症中的文献。ncRNA,主要包括miRNA和lncRNA,在癌症的发生和发展中起着关键作用,这些ncRNA是生物活性多酚,如白藜芦醇、异黄酮、姜黄素、EGCG、槲皮素在癌症管理中潜在的调控靶点。多酚介导的ncRNA调控的机制包括表观遗传和转录修饰以及转录后加工。调控性的ncRNA是生物活性多酚的潜在治疗靶点,并且这些植物化合物可以直接和间接地改变这些ncRNA的水平。对多酚在癌症中通过ncRNA调控的更好理解,以及其对肿瘤病理生理学和调控分子机制的功能结果,可能有助于制定有效的抗击这一毁灭性疾病的策略。版权所有©2023. Elsevier GmbH出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 15

JialuLiang,RuihaoLia...
Comparative analysis of single-cell transcriptome reveals heterogeneity in the tumor microenvironment of lung adenocarcinoma and brain metastases.
Epigenetics & Chromatin
肺腺癌等固体肿瘤不仅包括肿瘤细胞本身,还包括肿瘤细胞持续与相互作用的肿瘤微环境。对肺腺癌和脑转移瘤的肿瘤学特征和肿瘤微环境(TME)进行单细胞水平的深入理解,能为肺腺癌脑转移瘤提供新的治疗策略。为了解决这个问题,我们对15例肺腺癌样本和10例脑转移样本进行了单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析。共获得86,282个单细胞,并分为8个细胞类型,包括上皮细胞、内皮细胞、纤维母细胞、少突胶质细胞、T/NK细胞、B细胞、肥大细胞和巨噬细胞。在脑转移瘤中,我们发现T/NK细胞和肥大细胞的比例显著较低,免疫调节严重紊乱。此外,我们在脑转移组织中发现一亚群高表达转移促进相关基因的巨噬细胞。此外,在脑转移瘤中,我们发现肌成纤维细胞癌相关纤维母细胞(myCAFs)的比例显著增加,内皮细胞的血管生成能力更高。脑转移瘤的上皮细胞更具恶性并经历了基因重编程。接下来,我们发现DNA损伤诱导转录因子4(DDIT4)在脑转移瘤的上皮细胞中上调表达,与预后不良相关。最后,我们通过实验证实DDIT4的下调抑制了肺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。本研究通过scRNA-seq描绘了肺腺癌和脑转移瘤的单细胞图谱,并为发展肺癌脑转移瘤的未来治疗靶点铺平了道路。© 2023. Springer Science+Business Media, LLC.
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 15

KaiLiu,YingxueGao,Qu...
Prognostic significance of MALAT1 in clear cell renal cell carcinoma based on TCGA and GEO.
Epigenetics & Chromatin
长链非编码RNA转移相关肺腺癌转录本1(MALAT1)可以调控多种癌症的肿瘤发生和进展。然而,在清除型肾细胞癌(ccRCC)中,关于MALAT1的肿瘤生物学和调控机制的了解很少。本研究的目的是基于癌症基因组图谱评估MALAT1在ccRCC中的预后价值和潜在功能。通过生物信息学研究,我们分析了ccRCC中MALAT1的表达,并与临床病理特征、总体生存率和免疫细胞浸润的关系进行了分析,并建立了预后模型。结果显示MALAT1在ccRCC组织中高度表达,并且预测了ccRCC患者的不良预后。MALAT1的表达水平与组织学分级、病理分级、T分期和M分期显著相关。ROC曲线显示MALAT1具有良好的诊断准确性,曲线下面积为0.752。单变量和多变量Cox回归分析显示高MALAT1表达是癌症基因组图谱中总体生存的独立预后因素(风险比=2.271,95%可信区间:1.435-3.593,P<0.001)。基因集富集分析显示MALAT1表达与DNA甲基化、基因表达表观遗传调控信号通路相关。此外,我们建立了预测1年、3年和5年生存的预后模型。本研究表明,MALAT1的高表达可能是一个潜在的诊断和预后生物标志物。《2023年版权所有作者。由Wolters Kluwer Health,Inc.出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 15

KhalilElGendy,FionaC...
Effects of obesity, and of weight loss following bariatric surgery, on methylation of DNA from the rectal mucosa and in cell-free DNA from blood.
Epigenetics & Chromatin
DNA甲基化是一种表观遗传机制,通过它,包括营养和炎症在内的环境因素可以影响健康。肥胖是许多常见疾病的一个主要可改变危险因素,包括心血管疾病和癌症。具体而言,由于异常甲基化的炎症基因所导致的肥胖诱发炎症可能会增加数种非传染性疾病的风险,包括结直肠癌(CRC)。本研究首次探讨了通过胃肠吻合手术(BS)引起的减重对直肠和血液中细胞游离DNA(cfDNA)DNA甲基化的影响。在肥胖参与者中,我们测量了28个参与者BS前后6个月的直肠黏膜活检和血清cfDNA中的DNA甲基化情况,同时还包括12个无肥胖的参与者(对照组),对照组参与者与肥胖者在年龄和性别上匹配,数据来自Biomarkers Of Colorectal cancer After Bariatric Surgery(BOCABS)研究。我们通过焦化测序法测定了LEP、IL6、POMC、LINE1、MAPK7和COX2的DNA甲基化情况。术前肥胖组BMI显著下降,从41.8 kg/m2下降到BS后6个月的32.3 kg/m2。与对照组相比,肥胖与直肠黏膜和血清cfDNA中LEP甲基化水平较低相关。BS使直肠黏膜DNA中LEP的甲基化水平恢复正常,而cfDNA中未能恢复。BS使直肠黏膜DNA和cfDNA中的LINE1的某些CpG位点甲基化水平降低到与无肥胖参与者相似的水平。BS使直肠黏膜DNA中的POMC甲基化在6个月后恢复正常。BS使肥胖患者的直肠粘膜中的LINE1、POMC和LEP甲基化水平恢复到与无肥胖个体相似的水平。这些发现支持BS引起的减重对其他组织DNA甲基化的可逆性的当前证据。直肠粘膜中的DNA甲基化变化有望成为客观评估减重干预对癌症和其他疾病风险影响的生物标志物。© 2023. 作者,Springer Nature Limited独家许可。
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CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
2023 Sep 01

RadovanKukobat,Ranko...
Enhanced dissolution of anticancer drug letrozole from mesoporous zeolite clinoptilolite.
CLINICAL PHARMACOLOGY & THERAPEUTICS
高生物利用度的药物输送系统对直接吸附在多孔载体上的抗癌药物的高溶解是不可或缺的。我们报道了在表面活化后将抗癌药物雷洛唑(LTZ)直接吸附/装载到伊利石(CLI)沸石上。体外实验表明,LTZ从CLI沸石中的溶解度在23小时内达到95%,在酸性介质中溶解速度比纯LTZ分子的溶解速度更快。快速溶解是因为LTZ均匀暴露于CLI沸石的外表面,易于与溶剂接触溶解。另一方面,LTZ分子隐藏在体积相中,呈现缓慢的溶解速率。CLI / LTZ吸附能的小正值为0.06 eV,表明在水介质中释放过程是有利的。CLI / LTZ系统的主要优点是其快速发挥作用和高生物利用度。本研究展示了从CLI沸石中增强溶解性较差的LTZ的溶解的可能性,这对进一步发展药物输送系统具有潜在的前景。版权©2023 Elsevier公司。保留所有权利。
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