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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 15

HitarthVPatel,JignaS...
A clinicopathological exploration of Hedgehog signaling: implications in oral carcinogenesis.
Stem Cell Research & Therapy
「刺猬信号通路」是一种基本的癌症干细胞通路,在胚胎发育中起着重要作用,并被认为在成年人中起抑制作用。然而,成年人中「刺猬信号通路」的异常激活已被证明在癌症发展中起作用。因此,本研究的目的是确定「刺猬信号通路」在口腔癌中的作用。通过定量实时聚合酶链式反应(qRT-PCR),评估了124名患者刺猬信号通路的表达情况。利用Pearson卡方检验分析基因表达与临床病理参数之间的关联,并利用Kaplan-Meier分析进行生存分析。发现SHH和GLI1与淋巴结状态显著相关,SUFU与年龄显著相关。在口腔癌患者中,SMO和SUFU的预后较差。根据我们的发现,IHH在口腔癌中发挥了激活HH信号通路的关键作用。这些发现证实了「刺猬信号通路」作为口腔癌早期疾病预测的生物标志物的使用,以及其在肿瘤侵袭和恶性程度中的作用。© 2023. 作者授权给德国Springer Nature旗下的Springer-Verlag GmbH。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 15

RodrickBabakhanlou,M...
A case of sudden hearing loss in a patient with chronic myelomonocytic leukemia.
Stem Cell Research & Therapy
慢性骨髓单核细胞白血病(Chronic myelomonocytic leukemia,CMML)是一种髓系干细胞疾病,其特点是单核细胞异常增生和积累,并伴有其他骨髓增殖症状。CMML通常会导致脾脏、肝脏、皮肤和淋巴结等器官出现外骨髓表现。然而,耳部表现极为罕见,可能是由于白血病细胞直接浸润、耳蜗、迷路出血、白血病细胞滞留或感染引起的。目前慢性骨髓单核细胞白血病患者的感音神经性听力损失尚没有标准的治疗方案。需要进行更多的研究以改善对该病病因的理解,以提供更好的治疗选择。© 2023. 该作者或作者独家许可给德国施普林格自然出版集团下属公司。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 15

SachinHPatel,DeepakA...
Factors Affecting Stem Cell-Based Regenerative Approaches in Retinal Degeneration.
Stem Cell Research & Therapy
遗传性和与年龄相关的视力丧失通常与视网膜细胞退化有关,这些细胞位于眼睛后方的感光层。哺乳动物的视网膜是一个后分裂神经组织,无法通过内源性再生来修复自身。自从人类多能干细胞的分离和培养方法的发展以及诱导多能干细胞的生成出现以来,对细胞替代方法的开发引起了相当大的兴奋。现在,这种方法已与模拟体外人类视网膜发育的新型三维器官培养系统结合起来。在本综述中,我们重点介绍该领域的当前状态,包括细胞输送挑战、接受者免疫微环境的作用以及与移植细胞与宿主电路之间的局部和整体连接的挑战。
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Stem Cell Research & Therapy
2023 Sep 15

SounakSahu,TeresaLSu...
Saturation genome editing of 11 codons and exon 13 of BRCA2 coupled with chemotherapeutic drug response accurately determines pathogenicity of variants.
Stem Cell Research & Therapy
肿瘤相关基因中大量变异的致病性未知,这归因于流行病学数据有限,因此将其归类为具有不确定意义的变异体(VUS)。迄今为止,乳腺癌基因2型(BRCA2)拥有最多的VUS,这促使我们开发了几种强大的功能性试验来确定它们的功能意义。本文报告了一种利用人化小鼠胚胎干细胞(mESC)系表达单一拷贝人BRCA2的CRISPR-Cas9基于高通量功能性试验的方法。作为原理的验证,我们饱和了BRCA2外显子3、18、19中编码的11个密码子和外显子13中所有可能的单核苷酸变异,并使这些变异体进行功能分类。具体来说,我们使用一个180碱基长的单链供体DNA池来生成所有可能的变异体组合。使用基于高通量测序的方法,我们显示非功能性变异体的频率显著降低,而功能性变异体在细胞池中富集。我们进一步展示了这些变异体对DNA损伤药物顺铂和奥拉帕尼的反应,使我们可以使用细胞存活和药物反应作为变异体分类的参数。利用该方法,我们已经对599个BRCA2变异体进行了分类,其中包括11个密码子中的93个单核苷酸变异(SNVs),其中28个在ClinVar中有报道。我们还对来自外显子13的252个SNVs进行了功能性分类,其中188个是功能性的,60个是非功能性的,这表明饱和基因组编辑(SGE)结合药物敏感度试验可以增强BRCA2 VUS的功能注释。
版权:本文为开放获取文章,无版权限制,任何人都可以自由复制、分发、传播、修改、建立相关内容,或以任何合法用途使用。该作品以创作共用CC0公共领域奉献的方式提供。
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 15

YangCao,Ying-LeiLiu,...
Integrative analysis from multi-center studies identifies a weighted gene co-expression network analysis-based Tregs signature in ovarian cancer.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
卵巢癌(OC)是一种与预后不良相关的恶性肿瘤,并与调节性T细胞(Tregs)在免疫微环境中有关。然而,Tregs相关基因(TRGs)与OC预后之间的关联尚不完全了解。本研究使用xCell算法分析了多个队列中的Tregs得分。采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定潜在的TRGs和分子亚型。此外,我们采用九种机器学习算法建立了预后指标的风险模型。采用逆转录定量聚合酶链反应和免疫荧光染色对临床样本中的Tregs的免疫抑制能力和关键TRGs的表达进行了验证。研究发现较高的Tregs得分与较差的总生存率显著相关。复发患者表现出增加的Tregs浸润和减少的CD8+ T细胞。此外,使用七个关键TRGs进行的分子分型表明,B型亚型多个致癌通路富集且预后较差。值得注意的是,B型亚型显示出高Tregs水平,表明免疫抑制。此外,我们验证了基于机器学习的预后模型在多个平台队列中的预后模型以更好地区分患者生存和预测免疫治疗效果。最后,通过临床样本验证了关键TRGs的差异表达。本研究为我们对OC免疫微环境中Tregs的作用提供了新的洞察。我们确定了从Tregs衍生的潜在治疗靶点(CD24、FHL2、GPM6A、HOXD8、NAP1L5、REN和TOX3),以供个体化治疗,并建立了基于机器学习的OC患者预后模型,这在临床实践中可能很有用。© 2023 Wiley Periodicals LLC.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 15

UditNindra,AbhijitPa...
Utility of multigene panel next-generation sequencing in routine clinical practice for identifying genomic alterations in newly diagnosed metastatic nonsmall cell lung cancer.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
新诊断的转移性非小细胞肺癌(NSCLC)的标准护理是检测ALK、ROS1和表皮生长因子受体(EGFR)三个基因的驱动突变,同时进行免疫组化检测以评估程序性死亡配体-1的表达水平。下一代测序(NGS)越来越多地被应用于标准临床实践中,用于识别可能存在可行动突变的患者,其中可以包括RNA融合测试。目前,NGS突变分层基于欧洲医学肿瘤学会分子靶点临床可操作性分层(ESCAT)I-V和X。我们的目的是分析NSCLC 肿瘤样本中I-V级突变的患病率,为具有转移性疾病的患者提供当前和新的治疗指导。我们使用Oncomine Precision试剂盒(未进行RNA融合测试)进行了NGS检测,该试剂盒检测45个基因中的热点变异体,对2021年6月至2022年3月期间悉尼的六家医院共收集到的210份NSCLC组织样本进行筛查。在我们的队列中,161份(77%)的样本至少发现了一种基因突变,41份(20%)样本同时存在两种或更多突变。其中,I级突变包括210份样本中的42例(20%)EGFR突变(EIA)和5例(3%)MET外显子14剪接突变(EIB)。非I级变异体包括210份样本中的22例(11%)KRAS G12C热点突变(EIIB),另有47例(22%)存在非G12C KRAS(EX)突变(EIIB)。NGS检测显示,在NSCLC中,15%的病例存在II级ESCAT突变。此外,还有46%的患者表现出潜在的III级和IV级突变,目前这些突变正在早期临床试验中进行研究。除了识别适合临床证实的标准治疗方案的基因变异的患者,45基因NGS面板在识别可能可行但非I级突变方面具有重要潜力,这些突变可能会成为NSCLC的未来标准临床实践。© 2023 Royal Australasian College of Physicians.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 15

LijingYan,HuanhuanSu...
FOXP2 suppresses the proliferation, invasion, and aerobic glycolysis of hepatocellular carcinoma cells by regulating the KDM5A/FBP1 axis.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
华氏堡效应是癌细胞更倾向于使用糖酵解而不是氧化磷酸化来产生能量的特点。越来越多的证据表明,有氧糖酵解在肝细胞癌(HCC)中普遍存在,并与肿瘤发生密切相关。本研究的目的是探讨Forkhead Box P2 (FOXP2) 在HCC的有氧糖酵解和肿瘤发生中的作用和机制。我们发现 FOXP2 在HCC组织和细胞中的表达较非肿瘤组织和正常肝细胞低。FOXP2 的过表达抑制了体外HCC细胞的增殖和侵袭,促进了细胞凋亡,并抑制了小鼠异种移植瘤的生长。进一步的研究表明,FOXP2 抑制了HCC细胞的华氏堡效应。此外,我们证明了FOXP2 上调果糖-1,6-二磷酸酶(FBP1)的表达,而FOXP2 对糖酵解的抑制作用依赖于FBP1。在机制上,作为转录因子,FOXP2 负调控了赖氨酸特异性去甲基化酶5A(KDM5A)的转录,并阻断了KDM5A 引起的FBP1启动子区域H3K4me3去甲基化,从而促进了FBP1的表达。一致地,过表达KDM5A或沉默FBP1有效地逆转了FOXP2 对HCC进展的抑制作用。综上所述,我们的研究发现了FOXP2/KDM5A/FBP1轴在HCC细胞的糖酵解和恶性进展中的机制作用,为HCC治疗提供了潜在的分子靶点。© 2023 Wiley Periodicals LLC.
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MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
2023 Sep 09

TianyuLiu,JianChen,J...
Role of the tripartite motif (TRIM) family in female genital neoplasms.
MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS
三分结构域蛋白(TRIMs)家族代表了一类高度保守的蛋白质,它们在分子过程中扮演着重要的调控角色。最近的证据越来越多地证明了TRIMs在女性生殖系统肿瘤中的作用。因此,我们的综述旨在概述TRIMs在女性生殖系统肿瘤中的生物参与,以更好地理解其在这些疾病的发展和进展中的作用,并强调其作为靶向癌症治疗的潜力。总的来说,我们的综述突显了TRIMs的广泛作用,不仅包括靶向蛋白泛素化、肿瘤迁移和/或侵袭、上皮间质转变、干细胞特性、细胞黏附、增殖、细胞周期调控和凋亡,还包括对雌激素作用和化疗反应的影响。版权所有 © 2023。Elsevier GmbH出版。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 15

HaoZhou,FangWang
TNS1 regulated by HLF represses the progression of prostate cancer.
Epigenetics & Chromatin
肝白血病因子(HLF)是一种转录因子,在许多癌症中发生异常调节。本研究调查了HLF在前列腺癌(PCa)中的功能以及其与TNS1的关系。共收集了24个PCa患者的临床组织标本。建立了过表达HLF的DU145和PC3细胞系。与相邻组织相比,PCa组织中的HLF信号下调,与前列腺上皮细胞RWPE-1和前列腺基质细胞WPMY-1相比,DU145和PC3细胞中的HLF信号也下调。过表达HLF的PCa细胞系具有较低的增殖、迁移和侵袭活性,较高的细胞凋亡率,并且细胞有更多的在G0/G1期进行有丝分裂。HLF促进TNS1转录以激活p53通路。TNS1的耗竭逆转了HLF对PCa细胞和体内肿瘤生长和转移的抗肿瘤效果。总之,我们的研究发现表明,HLF通过上调TNS1表达和激活p53通路抑制PCa的发展,这可能为对抗PCa提供了新的策略。© 2023年作者。由牛津大学出版社代表英国环境变异学会出版。保留所有权利。有关权限,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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Epigenetics & Chromatin
2023 Sep 15

DeepakKumarMishra,De...
Preclinical Pediatric Brain Tumor Models for Immunotherapy: Hurdles and a Way Forward.
Epigenetics & Chromatin
脑肿瘤是儿童中最常见的实体瘤,也是癌症相关死亡的主要原因。过去几年来,对中枢神经系统肿瘤患儿的诊断和治疗取得了改进。然而,对许多高级别肿瘤患者而言,总体预后仍然较差。较低的生存率部分归因于缺乏有效的治疗方法。在成人身上,免疫检查点抑制剂(ICIs)的问世和成功引发了对这些治疗方法在儿童患者中单独应用或与其他药物治疗相结合的研究兴趣。然而,要实现改善的临床预后,建立和选择相关而强有力的临床前儿童高级别脑肿瘤模型至关重要。在这里,我们回顾了影响模型选择的信息,因为我们开始了一项国际合作研究,测试ICIs与表观遗传修饰剂的联合应用,以增强适应性免疫力,用于治疗儿童脑肿瘤。我们还分享了我们所面临的挑战和潜在解决方案。© 作者们 2023. 版权归牛津大学出版社代表神经肿瘤学会所有。保留所有权利。如需许可,请发送电子邮件至:journals.permissions@oup.com。
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