研究动态
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npj Genomic Medicine
2023 Sep 14
RadwaSharaf,DexterXJ...
A pan-sarcoma landscape of telomeric content shows that alterations in RAD51B and GID4 are associated with higher telomeric content.
npj Genomic Medicine
肿瘤细胞需要激活端粒维持机制,实现无限复制。大部分证据支持肉瘤主要使用替代端粒长度调节(ALT)机制,常伴随ATRX和DAXX的改变。在我们的数据集中,只有12.3%的肉瘤携带这些基因的变异。因此,我们检查了肉瘤中高端粒含量的其他基因决定因素的存在。我们的数据集包括13555个肉瘤样本,作为基金会一血病平台的例行临床护理的一部分进行测序。我们观察到所有样本中的媒体端粒含量为每个GC匹配百万个读数的622.3个端粒读数(TRPM)。与先前的研究一致,ATRX和POT1改变的肉瘤的端粒含量显著较高。我们进一步观察到,在RAD51B或GID4改变的肉瘤中,存在高端粒含量的样本富集,尤其是在子宫平滑肌肉瘤中的RAD51B改变和软组织肉瘤(未明确指定,nos)中的GID4改变。此外,RAD51B和POT1的改变与ATRX和DAXX的改变互斥,暗示它们功能上的冗余性。我们的结果提示了RAD51B和GID4在肉瘤中端粒伸长中的作用,并为致力于靶向肿瘤发生的这一关键途径的药物提供了研究机会。© 2023年。Springer Nature 有限公司和阿卜杜勒阿齐兹大学基因医学研究卓越中心。
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CANCER IMAGING
2023 Sep 14
ThereseSjöholm,Sambi...
A whole-body diffusion MRI normal atlas: development, evaluation and initial use.
CANCER IMAGING
统计图谱可以提供健康志愿者和/或患者的基于人口的描述,并可用于区域和体素分析。本研究旨在开发1.5T和3T扫描的健康志愿者的全身扩散图谱。进一步的目标包括通过建立健康组织的全身明显扩散系数(ADC)值并将健康组织偏差纳入自动肿瘤分割任务的评估中。通过多站全身扩散加权成像(DWI)和水-脂肪磁共振成像(MRI)获得了健康志愿者(n = 45)的数据,其中1.5T(n = 38)和/或3T(n = 29)进行了测试再测成像。使用变形图像配准,将整个身体的MRI数据进行配准并组成正常图谱。手动测量了十个组织的健康组织ADCmean,评估了测试再测可重复性系数(%RC)以及年龄、性别和扫描仪的影响。使用正常图谱进行基于体素的全身分析,通过ADC相关性分析和自动肿瘤分割任务进行研究。对于后者,将具有和不具有关于健康组织偏差信息的淋巴瘤患者的MRI扫描(n = 40)输入到3D U-Net体系结构中。 在1.5T和3T分别创建了根据性别和体重指数(BMI)分层的全身高b值DWI和ADC正常图谱。在1.5T和3T,健康组织ADCmean的%RC在所评估的组织上有所不同(1.5T为4-48%,3T为6-70%)。通过对双重扫描的受试者进行布兰德-奥特曼(Bland-Altman)分析,可视化了ADCmean在扫描仪之间的差异。在1.5T,肝脏、肌肉和骨骼的性别差异可测量,在3T,肌肉的性别差异可测量。基于兴趣区(VOI)的多元线性回归和正常图谱空间中的基于体素的相关性显示,年龄与1.5T的肝脏和骨骼的ADC呈负相关,与1.5T和3T的脑组织呈正相关。在自动肿瘤分割任务中添加关于健康组织偏差的体素信息可以在分割指标Dice分数、敏感性和精度方面获得数值改善。 在1.5T和3T分别创建了全身DWI和ADC正常图谱,并应用于全身基于体素的分析。 © 2023. 国际癌症影像学会(ICIS)。
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BLOOD REVIEWS
2023 Sep 09
AlessandroBosi,Wilma...
Androgen use in bone marrow failures and myeloid neoplasms: Mechanisms of action and a systematic review of clinical data.
BLOOD REVIEWS
尽管近年来取得了进展,但骨髓衰竭(BMF)和骨髓性肿瘤引起的细胞减少的治疗仍然具有挑战性。雄激素促进血细胞的更新和成熟,可能在这些病症中有益。本文报告了雄激素在血液学疾病中作为单一药物的系统评价。共纳入了46项研究,主要为回顾性研究,使用不同类型和剂量的雄激素:12项关于后天性再生障碍性贫血(AA),11项关于遗传性BMF,17项关于骨髓增生异常综合征(MDS),以及7项关于骨髓纤维化。遗传性BMF的反应范围为50%至70%,后天性AA和MDS的反应范围为40%至50%,而对于依赖输血的贫血,仅有有限的证据表明雄激素有益。副作用主要包括男性化和肝酶升高,而白血病进展的风险仍然存在争议。版权所有 © 2023 Elsevier Ltd.
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BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
2023 Oct 16
NaLi,LingfeiZhang,Ha...
Label-free and sensitive detection of N6-methyladenosine demethylase activity in crude cell extracts and clinical cancer tissues based on demethylation-triggered exponential signal amplification.
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
N6甲基腺嘌呤酸脱甲基酶(m6A demethylase)催化去除m6A修饰以建立适当的RNA甲基化模式,其已被发现为有前景的疾病生物标志物和治疗靶点。已报道的m6A脱甲基酶测定常受困于繁琐的制剂、昂贵的试剂、放射性风险、有限的灵敏度和较差的特异性。在此我们开发了一种基于脱甲基引发指数信号放大的简单、选择性、无标记、高灵敏度的荧光生物传感器来进行m6A脱甲基酶测定。在该生物传感器中,m6A脱甲基酶催化的脱甲基反应可以保护环状DNA免受DpnI的消化,随后引发超支化滚动环形扩增,实现对ssDNA和dsDNA产物的指数信号放大。扩增的DNA信号可以通过SYBR Gold在无标记的方式下被敏感地和简单地检测到。该生物传感器避免了任何抗体、洗涤/分离步骤和荧光探针/猝灭器的使用,极大地简化了测定步骤并降低了测定成本。此外,该生物传感器具有良好的特异性和优异的灵敏度,检测限为1.2 fg/μL,优于传统的ELISA(36.3 pg/μL)。特别值得注意的是,该生物传感器能够在粗细胞提取物中直接监测m6A脱甲基酶活性,具有较高的准确性,并可进一步应用于m6A脱甲基酶抑制剂的筛选、不同细胞系中的m6A脱甲基酶活性测量以及在临床癌症和健康组织中区分m6A脱甲基酶水平,为RNA甲基化相关的生物医学研究、疾病诊断和药物发现提供了一种简便且可靠的平台。版权所有©2023,Elsevier B.V.出版。
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BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
2023 Oct 16
WenlongZhu,QianhuaLi...
Cell membrane targetable NIR fluorescent polarity probe for selective visualization of cancer cells and early tumor.
BIOSENSORS & BIOELECTRONICS
早期癌症诊断方法的开发十分重要,因为及早诊断癌症对于防止癌细胞扩散和提高患者生存率至关重要。近期研究表明,癌细胞膜的极性低于正常细胞膜,为细胞膜水平的癌症诊断提供了新的方法。我们在此开发了一种高灵敏度的细胞膜极性探针(Cal-M),用于早期癌症诊断。该探针具有低细胞毒性、良好的光稳定性、近红外(NIR)荧光发射(>700 nm)能力、大的斯托克斯偏移、对极性具有高灵敏度、优异的细胞膜定位表现以及选择性照亮癌细胞的能力。使用该探针染色,癌细胞的荧光强度约为正常细胞的63倍,表明Cal-M具有优异的灵敏度和选择性。该探针还成功用于检测癌细胞膜上的极性变化并在小鼠体内选择性可视化肿瘤。值得注意的是,该探针能够以1.37 mm3的小尺寸灵敏地可视化肿瘤,表明Cal-M在早期肿瘤诊断方面具有潜力。版权所有 ©2023 Elsevier B.V. 保留所有权利。
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2023 Sep 14
MaiAbdelMouti,SiweiD...
KMT2A associates with PHF5A-PHF14-HMG20A-RAI1 subcomplex in pancreatic cancer stem cells and epigenetically regulates their characteristics.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
胰腺癌(PC)是最具侵袭性和威胁生命的恶性肿瘤之一,以对细胞毒性治疗的抗药性闻名。这种抗药性越来越被归因于未分化细胞亚群,即胰腺癌干细胞(PCSCs)。相较于其他肿瘤细胞,PCSCs具有更强的进化适应能力,能够逃避化疗的细胞毒性效应。PCSCs对于肿瘤复发至关重要,因为它们具备"类干细胞"特征,表现为自我更新和分化。然而,维持PCSCs独特特征的分子机制尚不明确。在这里,我们鉴定到组蛋白甲基转移酶KMT2A作为RNA聚合酶结合的PHF5A-PHF14-HMG20A-RAI1蛋白亚复合物的物理结合伴侣及PCSC特性和功能的表观遗传调节器。使用KMT2A-WDR5抑制剂靶向PCSCs的蛋白亚复合物可减弱其自我更新能力、细胞存活能力和体内致瘤能力。© 2023. Springer Nature Limited.
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BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
2023 Sep 12
AlessandroVaglica,An...
Seseli bocconei Guss. and S. tortuosum subsp. maritimum Guss. essential oils inhibit colon cancer cell viability.
BIOMEDICINE & PHARMACOTHERAPY
本研究调查了两种野生西西里岛特有植物Seseli bocconei Guss.和Seseli tortuosum subsp. maritimum Guss.不同部位(花、叶、茎和根)所提取的两种精油(EOs)的化学成分。结果显示,S. bocconei的精油主要成分包括单萜烃(花)、倍半萜烃(叶)和前两个类别的混合物(茎)。而S. tortuosum subsp. maritimum的精油无论是在花、茎还是根中,主要成分都是单萜烃,并含有一定比例的非萜类化合物。此外,我们评估了这些精油对结肠癌细胞HCT116的抗肿瘤效果。细胞活性实验显示,两种植物茎部的精油在低浓度下表现出强烈的细胞毒性效果,而其他植物器官的精油效果不显著。事实上,S. tortuosum subsp. maritimum的茎部精油在浓度为125μg/mL时细胞存活率降低了82%,而S. bocconei的茎部精油在浓度为250μg/mL时,97%的细胞死亡。对这些精油的主要植物成分(S-(-)-柠檬烯、R-(+)-柠檬烯、藿香烯、(1S)-(-)-α-蒎烯、(1R)-(+)-α-蒎烯、(-)-β-蒎烯和石菖蒲烯D)对结肠癌细胞的影响分析发现,石菖蒲烯D是一种具有抗癌性质的新型有前景的分子,值得在未来的研究中探索。版权所有©2023 Elsevier B.V. 发表。
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BIOELECTROCHEMISTRY
2023 Sep 06
YunZhang,ShiqiangLi,...
Dumbbell hybridization chain reaction coupled with positively charged Au@luminol nanoparticles for enhanced electrochemiluminescent sensing of exosomal miRNA-21.
BIOELECTROCHEMISTRY
在癌细胞源性外泌体中,微小RNA(miRNA)是重要的癌症生物标志物。本文首次建立了带有增强电化学发光(ECL)和极高稳定性的阳离子化金@发光胺基酚纳米颗粒((+)Au@luminol NPs),用于对外泌体中miRNA-21的敏感检测。在miRNA-21的存在下,通过使用二戈DNA燃料链(DHP1和DHP2)在金纳米颗粒和ZIF-67金属-有机框架修饰的玻碳电极(AuNP/ZIF-MOF/GCE)上进行了哑铃杂交链式反应(DHCR)。形成的DHCR聚合物带有负电荷,并能电静力吸附大量(+)Au@luminol NPs,产生强烈的ECL信号。将DHCR信号扩增与(+)Au@luminol NPs增强剂相结合,实现了对miRNA-21的敏感检测,其检测限为0.43 fM。此外,该方法成功地应用于健康人群和乳腺癌患者血清样本中miRNA-21的分析,显示了在早期临床诊断中的潜在应用价值。版权所有 © 2023 Elsevier B.V.。保留所有权利。
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BIOCHEMICAL PHARMACOLOGY
2023 Sep 12
Yen-DunTonyTzeng,Jui...
Breast Cancer Organoids Derived from Patients: A Platform for Tailored Drug Screening.
BIOCHEMICAL PHARMACOLOGY
乳腺癌是全球影响女性最普遍和异质性最严重的恶性肿瘤,构成了重要的健康问题。深入理解肿瘤病理学和开发新的治疗方法对于推进乳腺癌治疗至关重要。当代乳腺癌研究主要依赖于体内模型和传统细胞培养技术。然而,这些方法往往在临床试验中遇到较高的失败率,原因是物种差异和组织结构变异。为了解决这个问题,三维培养器官样体,模拟器官样结构,已经成为一种有前景的替代方法。器官样体是创新的体外模型,可以模拟体内组织微环境。它们保留了原始肿瘤的多样性,并促进了来自不同来源的肿瘤样本的扩增,使得能够代表不同的肿瘤阶段。在精确的培养条件下优化的乳腺癌器官样体模型具有方便的样本获取、缩短培养时间和遗传稳定性等优点。这些特点确保了对乳腺癌细胞体内特征的忠实复制。作为具有空间排列的复杂细胞实体,乳腺癌器官样体模型在精准医学、器官移植、建模复杂疾病、基因疗法和药物创新方面具有重要潜力。本综述提供了器官样体培养技术的概述,并勾勒了器官样体模型的未来前景。版权所有 © 2023 Elsevier Inc. 发表。
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Best Pract Res Cl Ob
2023 Sep 14
MyriamGracia,ElenaRo...
Impact of the Covid-19 pandemic on the management of gynecologic cancer: a Spanish survey. Observational, multicenter study.
Best Pract Res Cl Ob
新型冠状病毒2型(SARS-CoV-2)大流行改变了医疗资源的分配,导致许多非必要治疗和手术被暂停,给医务人员带来了挑战。本研究的目的是评估妇科肿瘤学护理的临床协议是否因大流行而发生修改,并评估外科医生对妇科癌症管理的认知。通过电子邮件发送匿名自愿调查表,收集在西班牙妇科肿瘤学领域的医疗专业人员的数据。共有75名妇科肿瘤学家完成了在线调查。其中,93.2%(69人)报告在公立医院工作,62.5%(45人)在三级医院工作。有97.3%(71人)的医生与治疗SARS-CoV-2感染患者的医院有所关联。85.1%(63人)的受访者对SARS-CoV-2大流行表示担忧,52.1%(38人)表示大流行对癌症患者的诊断和治疗质量产生了影响。97.3%(71人)的医生在手术前始终进行SARS-CoV-2鼻咽拭子PCR(聚合酶链反应)测试,94.4%(68人)认为这是一种分流的最佳实践。87.5%(63人)报告在大流行期间未改变手术方式。62.5%(45人)在获得用于SARS-CoV-2的特殊个人防护装备方面遇到了限制。70.4%(50人)报告由于大流行对妇科癌症患者的随访产生了影响。对我们调查的西班牙妇科肿瘤学家中的大多数人来说,SARS-CoV-2大流行影响了他们的临床实践。实施的主要措施包括增加远程医疗,在门诊中限制高风险或有症状的患者的访问,并在手术前进行SARS-CoV-2筛查。据报道,SARS-CoV-2大流行期间对卵巢、子宫内膜或宫颈癌的手术方法或治疗管理没有发生重大变化。© 2023. BioMed Central Ltd.,Springer Nature的一部分。
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